Characterization of Fusarium spp. associated with the basal rot of the green onion

The department of Nariño occupies the fourth place as producer of green onion nationwide. In recent years, its production and cultivation area has been reduced by multiple limitations, highlighting as the most important, the susceptibility to the attack of fungi causing radical problems, which harm the productive system and profitability. This study was carried out in order to morphologically and molecularly characterizes Fusarium populations associated with green onion basal rot disease. For this, in Pasto, Potosi and Buesaco municipalities, plants were collected with basal rot symptoms, tissue deterioration and root necrosis. In the Plant Health laboratory of the University of Nariño, tissues were planted in PDA medium and subsequently the isolates were purified for further morphological and molecular characterization. The morphological study was carried out using taxonomic keys for the genus Fusarium and molecular characterization with specific primers for the genus Fusarium, and by sequencing. Finally, a phylogenetic analysis of the intraspecific variability was carried out. Morphological and molecular characterization results corroborate the presence of two species within the genus associated with this pathology, F. oxusporum f sp.cepae and F. solani. Phylogenetic analyzes show high intraspecific variability between the isolates of F. oxysporum and F. solani, forming two Fusarium oxysporum (FOSC) complexes and Fusarium solani(FSSC), evidencing that these species do not start from a common ancestorEl departamento de Nariño ocupa el cuarto lugar como productor de cebolla de rama, a nivel nacional. En los últimos años, su producción y área de cultivo se han reducido por múltiples limitantes, destacándose, como la más importante, la susceptibilidad al ataque de hongos causantes de pudriciones radicales, los cuales, perjudican el sistema productivo y la rentabilidad. El objetivo del estudio fue caracterizar morfológica y molecularmente las poblaciones de Fusarium, asociados a la enfermedad de pudrición basal de cebolla de rama. Para ello, en los municipios de Pasto, Potosi y Buesaco, se colectaron plantas con síntomas de pudrición basal, acompañada de necrosis de raíces y ablandamiento de tejido. En el laboratorio de Sanidad Vegetal de la Universidad de Nariño, se sembraron tejidos en medio PDA y, a continuación, se purificaron los aislamientos para su posterior caracterización morfológica y molecular. El estudio morfológico, se realizó usando claves taxonómicas para el género Fusarium y la caracterización molecular con cebadores específicos para el género Fusarium y mediante secuenciación. Finalmente, se realizó un análisis filogenético de la variabilidad intraespecífica. Los resultados de la caracterización morfológica y molecular corroboran la presencia de dos especies dentro del género asociadas a esta patología, F. oxysporum f sp. cepae y F. solani. Los análisis filogenéticos muestran alta variabilidad intraespecífica entre los aislamientos de F. oxysporum y F. solani, formando dos complejos Fusarium oxysporum (FOSC) y Fusarium solani (FSSC), manifestando que estas especies no parten de un ancestro común.Incluye referencias bibliográfica