Distribution of FSHR307 and FSHR680 allelic variants of FSH receptor gene exon 10 in females from Ukraine

The purpose of this study was to examine the distribution of two distinct follicle-stimulating hormone receptor (FSHR) variants, Asn680Ser and Thr307Ala, in normaly ovulated group of females from Ukraine. The FSHR gene variants, Asn680Ser and Thr307Ala, were analyzed by PCR and RFLP. The strong linkage disequilibrium between FSHR307 and FSHR680 loci was found (p < 0.0001). The following genotypes have been detected: NN (33.1 %), NS (52.3 %), SS (14.6 %) for Asn680Ser variant and TT (33.1 %), TA (55.4 %), AA (11.5 %) for Thr307Ala variant. Further study on the association of FSHR variant with ovarian dysfunction and individual susceptibility to FSH-stimulation considering our population data would clarify a possible functional role of FSHR307 and FSHR680 loci.Проаналізовано розподіл поліморфних варіантів Asn680Ser і Thr307Ala гена рецептора фолікулостимулювального гормону (FSHR) у жінок з нормальною овуляцією з України. Поліморфні варіанти гена FSHR досліджували методами ПЛР- та ПДРФ-аналізу. Виявлено нерівновагу за зчепленням між локусами FSHR307 та FSHR680 (p < 0,0001). Ідентифіковано генотипи NN (33,1 %), NS (52,3 %), SS (14,6 %) для варіанта Asn680Ser та TT (33,1 %), TA (55,4 %), AA (11,5%) – для варіанта Thr307Ala. Зважаючи на отримані популяційні дані, подальше вивчення асоціації поліморфних варіантів гена FSHR з дисфункцією яєчників та індивідуальною чутливістю до FSH-стимуляції, можливо, допоможе визначити функціональну роль локусів FSHR307 та FSHR680.Проанализировано распределение полиморфных вариантов Asn680Ser и Thr307Ala гена рецептора фоликуллостимулирующего гормона (FSHR) в группе женщин с нормальной овуляцией из популяции Украины. Полиморфные варианты Asn680Ser и Thr307Ala гена FSHR исследовали методами ПЦР- и ПДРФ-анализа. Выявлено неравновесие по сцеплению между локусами FSHR307 и FSHR680 (р < 0,0001). Идентифицированы генотипы NN (33,1 %), NS (52,3 %), SS (14,6 %) для варианта Asn680Ser и TT (33,1%), TA (55,4 %), AA (11,5 %) – для варианта Thr307Ala. Основываясь на популяционных данных, дальнейшее изучение ассоциации полиморфных вариантов гена FSHR с дисфункциями яичников и индивидуальной чувствительностью к FSH-стимуляции, возможно, прояснит функциональную роль локусов FSHR307 и FSHR680

Human genome mutation and rearrangement studies – the way to investigate monogenic and complex disease pathogenesis

The summarized results of 25-year studies of department of human genomics of IMBG NASU are presented. The investigations were focused on identification of molecular genetic nature of human genome coding and non-coding region mutations (genetic polymorphisms) and rearrangements, their spectrum, and origin in Ukrainian population. The role of genome heterogeneity in some severe monogenic and complex disorder pathogenesis has been shown. The data concerning correlation between certain determinator gene mutations and phenotypical manifestation of most common in Ukraine monogenic diseases have been demonstrated. Moreover, the role of modifying genes in specific clinical phenotype variations has been shown. Origin of particular mutant alleles and main mechanisms of their frequency maintenance in Ukrainian population have been investigated. The data about association of some polymorphic variants with infertility, cardiovascular diseases (ischemic stroke) as well as mass infectious diseases (hepatitis C, AIDS) outcome and standard therapy efficiency have been presented. The first results and prospects for candidate genes of neurodegenerative disorders and intellectual disability search using whole genome CNVs screening are shown.Підсумоввано результати 25-літніх досліджень співробітників відділу геноміки людини ІМБіГ НАН України, спрямованих на з’ясування молекулярно-генетичної природи, спектра і походження в популяції України мутацій (генетичних поліморфізмів) та реорганізацій кодуючих і некодуючих ділянок геному людини. Встановлено роль гетерогенності геному в патогенезі тяжких моногенних і мультифакторних патологій. Отримано дані щодо кореляції певних мутацій генів-детермінаторів з фенотиповими проявами моногенних захворювань, а також обговорено роль генів-модифікаторів у варіаціях клінічного фенотипу. Досліджено походження окремих мутантних алелів та знайдено основні закономірності процесів підтримання їхньої частоти в популяції України. Представлено дані стосовно асоціації деяких поліморфних варіантів з безпліддям, серцево-судинними захворюваннями (ішемічний інсульт), а також з масовими інфекційними хворобами (гепатит С, СНІД) та показано ефективність стандартної терапії. Продемонстровано перші результати і перспективи нової стратегії пошуку генів – маркерів нейродегенеративних захворювань та інтелектуальної недієздатності за рахунок повногеномного скринінгу геномних реорганізацій типу CNV.Обобщены результаты 25-летних исследований сотрудников отдела геномики человека ИМБиГ НАН Украины, направленных на выяснение молекулярно-генетической природы, спектра и происхождения в популяции Украины мутаций (генетических полиморфизмов) и реорганизаций в кодирующих и некодирующих участках генома человека. Установлена роль гетерогенности генома в патогенезе тяжелых моногенных и мультифакторных патологий. Получены данные о корреляции определенных мутаций генов-детерминаторов с фенотипическими проявлениями моногенных заболеваний, а также обсуждена роль генов-модификаторов в вариациях клинического фенотипа. Исследовано происхождение отдельных мутантных аллелей и установлены основные закономерности процессов поддержания их частоты в популяции Украины. Представлены данные об ассоциации некоторых полиморфных вариантов с бесплодием, сердечно-сосудистыми заболеваниями (ишемический инсульт), а также с массовыми инфекционными болезнями (гепатит С, СПИД) и показана эффективность стандартной терапии. Продемонстрированы первые результаты и перспективы новой стратегии поиска генов – маркеров нейродегенеративных заболеваний и интеллектуальной недееспособности за счет полногеномного скрининга геномных реорганизаций типа CNV

Distribution of FSHR307 and FSHR680 allelic variants of FSH receptor gene exon 10 in females from Ukraine

The purpose of this study was to examine the distribution of two distinct follicle-stimulating hormone receptor (FSHR) variants, Asn680Ser and Thr307Ala, in normaly ovulated group of females from Ukraine. The FSHR gene variants, Asn680Ser and Thr307Ala, were analyzed by PCR and RFLP. The strong linkage disequilibrium between FSHR307 and FSHR680 loci was found (p < 0.0001). The following genotypes have been detected: NN (33.1 %), NS (52.3 %), SS (14.6 %) for Asn680Ser variant and TT (33.1 %), TA (55.4 %), AA (11.5 %) for Thr307Ala variant. Further study on the association of FSHR variant with ovarian dysfunction and individual susceptibility to FSH-stimulation considering our population data would clarify a possible functional role of FSHR307 and FSHR680 loci.Проаналізовано розподіл поліморфних варіантів Asn680Ser і Thr307Ala гена рецептора фолікулостимулювального гормону (FSHR) у жінок з нормальною овуляцією з України. Поліморфні варіанти гена FSHR досліджували методами ПЛР- та ПДРФ-аналізу. Виявлено нерівновагу за зчепленням між локусами FSHR307 та FSHR680 (p < 0,0001). Ідентифіковано генотипи NN (33,1 %), NS (52,3 %), SS (14,6 %) для варіанта Asn680Ser та TT (33,1 %), TA (55,4 %), AA (11,5%) – для варіанта Thr307Ala. Зважаючи на отримані популяційні дані, подальше вивчення асоціації поліморфних варіантів гена FSHR з дисфункцією яєчників та індивідуальною чутливістю до FSH-стимуляції, можливо, допоможе визначити функціональну роль локусів FSHR307 та FSHR680.Проанализировано распределение полиморфных вариантов Asn680Ser и Thr307Ala гена рецептора фоликуллостимулирующего гормона (FSHR) в группе женщин с нормальной овуляцией из популяции Украины. Полиморфные варианты Asn680Ser и Thr307Ala гена FSHR исследовали методами ПЦР- и ПДРФ-анализа. Выявлено неравновесие по сцеплению между локусами FSHR307 и FSHR680 (р < 0,0001). Идентифицированы генотипы NN (33,1 %), NS (52,3 %), SS (14,6 %) для варианта Asn680Ser и TT (33,1%), TA (55,4 %), AA (11,5 %) – для варианта Thr307Ala. Основываясь на популяционных данных, дальнейшее изучение ассоциации полиморфных вариантов гена FSHR с дисфункциями яичников и индивидуальной чувствительностью к FSH-стимуляции, возможно, прояснит функциональную роль локусов FSHR307 и FSHR680

Human genome mutation and rearrangement studies – the way to investigate monogenic and complex disease pathogenesis

The summarized results of 25-year studies of department of human genomics of IMBG NASU are presented. The investigations were focused on identification of molecular genetic nature of human genome coding and non-coding region mutations (genetic polymorphisms) and rearrangements, their spectrum, and origin in Ukrainian population. The role of genome heterogeneity in some severe monogenic and complex disorder pathogenesis has been shown. The data concerning correlation between certain determinator gene mutations and phenotypical manifestation of most common in Ukraine monogenic diseases have been demonstrated. Moreover, the role of modifying genes in specific clinical phenotype variations has been shown. Origin of particular mutant alleles and main mechanisms of their frequency maintenance in Ukrainian population have been investigated. The data about association of some polymorphic variants with infertility, cardiovascular diseases (ischemic stroke) as well as mass infectious diseases (hepatitis C, AIDS) outcome and standard therapy efficiency have been presented. The first results and prospects for candidate genes of neurodegenerative disorders and intellectual disability search using whole genome CNVs screening are shown.Підсумоввано результати 25-літніх досліджень співробітників відділу геноміки людини ІМБіГ НАН України, спрямованих на з’ясування молекулярно-генетичної природи, спектра і походження в популяції України мутацій (генетичних поліморфізмів) та реорганізацій кодуючих і некодуючих ділянок геному людини. Встановлено роль гетерогенності геному в патогенезі тяжких моногенних і мультифакторних патологій. Отримано дані щодо кореляції певних мутацій генів-детермінаторів з фенотиповими проявами моногенних захворювань, а також обговорено роль генів-модифікаторів у варіаціях клінічного фенотипу. Досліджено походження окремих мутантних алелів та знайдено основні закономірності процесів підтримання їхньої частоти в популяції України. Представлено дані стосовно асоціації деяких поліморфних варіантів з безпліддям, серцево-судинними захворюваннями (ішемічний інсульт), а також з масовими інфекційними хворобами (гепатит С, СНІД) та показано ефективність стандартної терапії. Продемонстровано перші результати і перспективи нової стратегії пошуку генів – маркерів нейродегенеративних захворювань та інтелектуальної недієздатності за рахунок повногеномного скринінгу геномних реорганізацій типу CNV.Обобщены результаты 25-летних исследований сотрудников отдела геномики человека ИМБиГ НАН Украины, направленных на выяснение молекулярно-генетической природы, спектра и происхождения в популяции Украины мутаций (генетических полиморфизмов) и реорганизаций в кодирующих и некодирующих участках генома человека. Установлена роль гетерогенности генома в патогенезе тяжелых моногенных и мультифакторных патологий. Получены данные о корреляции определенных мутаций генов-детерминаторов с фенотипическими проявлениями моногенных заболеваний, а также обсуждена роль генов-модификаторов в вариациях клинического фенотипа. Исследовано происхождение отдельных мутантных аллелей и установлены основные закономерности процессов поддержания их частоты в популяции Украины. Представлены данные об ассоциации некоторых полиморфных вариантов с бесплодием, сердечно-сосудистыми заболеваниями (ишемический инсульт), а также с массовыми инфекционными болезнями (гепатит С, СПИД) и показана эффективность стандартной терапии. Продемонстрированы первые результаты и перспективы новой стратегии поиска генов – маркеров нейродегенеративных заболеваний и интеллектуальной недееспособности за счет полногеномного скрининга геномных реорганизаций типа CNV