Individual Nudix hydrolases affect diverse features of Pseudomonas aeruginosa

Nudix proteins catalyze the hydrolysis of pyrophosphate bonds in a variety of substrates and are ubiquitous in all domains of life. The genome of an important opportunistic human pathogen, Pseudomonas aeruginosa, encodes multiple Nudix proteins. To determine the role of nine Nudix hydrolases of the P. aeruginosa PAO1161 strain in its fitness, virulence or antibiotic resistance mutants devoid of individual enzymes were constructed and analyzed for growth rate, motility, biofilm formation, pyocyanin production, and susceptibility to oxidative stress and different antibiotics. The potential effect on bacterial virulence was studied using the Caenorhabditis elegans–P. aeruginosa infection model. Of the nine mutants tested, five had an altered phenotype in comparison with the wild-type strain. The ΔPA3470, ΔPA3754, and ΔPA4400 mutants showed increased pyocyanin production, were more resistant to the β-lactam antibiotic piperacillin, and were more sensitive to killing by H2O2. In addition, ΔPA4400 and ΔPA5176 had impaired swarming motility and were less virulent for C. elegans. The ΔPA4841 had an increased sensitivity to oxidative stress. These changes were reversed by providing the respective nudix gene in trans indicating that the observed phenotype alterations were indeed due to the lack of the particular Nudix protein

Cloning and characterization of the first member of the Nudix family from Arabidopsis thaliana.

The sequence motif commonly called a Nudix box, represented by (GX(5)EX(7)REVXEEXGU) is the marker of a widely distributed family of enzymes that catalyze the hydrolysis of a variety of nucleoside diphosphate derivatives. Here we describe the cloning and characterization of an Arabidopsis thaliana cDNA encoding a Nudix hydrolase that degrades NADH. The deduced amino acid sequence of AtNUDT1 contains 147 amino acids. The recombinant AtNUDT1 was expressed in Escherichia coli and purified. In the presence of Mn(2+) and the optimal pH of 7. 0, the recombinant AtNUDT1 catalyzed the hydrolysis of NADH with a K(m) value of 0. 36 mm. A V(max) of 12. 7 units mg (-1) for NADH was determined. The recombinant AtNUDT1 migrated as a dimer on a gel filtration column. Biochemical analysis of recombinant AtNUDT1 indicated that the first characterized member of the Nudix family from A. thaliana is a NADH pyrophosphatase

Wielopoziomowy system planowania produkcji na przykładzie wybranego przedsiębiorstwa

Tyt. z nagłówka.Bibliogr. s. 304.Dostępny również w formie drukowanej

Neuronowe modele decyzyjne w inwestowaniu w instrumenty pochodne na indeks WIG20 Giełdy Papierów Wartościowych rozprawa doktorska /

Tyt. z ekranu tytułowego.Praca doktorska. Akademia Górniczo-Hutnicza im. Stanisława Staszica (Kraków), 2012.Zawiera bibliogr.Dostępna także w wersji drukowanej.Tryb dostępu: Internet.Wybrane zagadnienia teorii instrumentów pochodnych, rynek finansowy, kapitałowy, pieniężny, walutowy, instrumentów pochodnych, rys historyczny rozwoju rynku instrumentów pochodnych, klasyfikacja instrumentów pochodnych, charakterystyka opcji, podstawowe rodzaje opcji, opcje na Giełdzie Papierów Wartościowych w Warszawie, kupna, sprzedaży na indeks WIG20, charakterystyka czynników kształtujących cenę opcji, wartość instrumentu bazowego, cena wykonania, zmienność instrumentu bazowego, czas pozostający do wygaśnięcia opcji, wolna od ryzyka stopa procentowa, stopa dywidendy, typ opcji, przegląd współczesnych zastosowań instrumentów pochodnych, obrót opcjami na GPW w Warszawie do 2010 roku, neuronowe modele decyzyjne w inwestowaniu w instrumenty pochodne na indeks WIG20 Giełdy Papierów Wartościowych, przegląd modeli wyceny opcji, procesy stochastyczne wykorzystywane w modelach finansowych, standardowy, arytmetyczny, geometryczny ruch Browna, lemat Itô, klasyczny model Blacka-Scholesa, jego modyfikacje, szacowanie wartości opcji przed 1973 rokiem, model Mertona wyceny europejskich opcji na indeksy giełdowe, ograniczenia zastosowania teorii Blacka-Scholesa, model Coxa-Rossa-Rubinsteina, modele alternatywne, zastosowanie sieci neuronowych do wyceny instrumentów pochodnych, sieci neuronowe, rys historyczny rozwoju sieci neuronowych, podstawowy model sztucznego neuronu, budowa, zasada funkcjonowania sztucznych sieci neuronowych, metody uczenia sztucznych sieci neuronowych, zastosowanie sztucznych sieci neuronowych w ekonomii, do wyceny opcji na indeksy giełdowe, modele sieci neuronowych do wyceny opcji kupna, sprzedaży na indeks WIG20, ich weryfikacja, budowa modelu, wybór rodzaju sieci neuronowej, dobór zmiennych wejściowych, algorytmy wyznaczania zmiennych wejściowych, algorytm wyznaczania wartości indeksu WIG20, wolnej od ryzyka stopy procentowej, stopy dywidendy, zmienności implikowanej WIG20, weryfikacja zaproponowanych modeli, wycena opcji na indeks WIG20 w okresie stabilnego wzrostu, wstępna analiza danych, szacowanie wartości opcji kupna na indeks WIG20, dobór danych wejściowych dla opcji kupna, neuronowe modele decyzyjne w inwestowaniu w instrumenty pochodne na indeks WIG20 Giełdy Papierów Wartościowych, poszukiwanie modelu neuronowego do wyceny opcji kupna z wykorzystaniem automatycznego projektanta sieci, poszukiwanie optymalnego modelu neuronowego MLP do wyceny opcji kupna, analiza wycen wybranych opcji kupna, szacowanie wartości opcji sprzedaży na indeks WIG20, dobór danych wejściowych dla opcji sprzedaży, poszukiwanie modelu neuronowego do wyceny opcji sprzedaży z wykorzystaniem automatycznego projektanta sieci, poszukiwanie optymalnego modelu neuronowego MLP do wyceny opcji sprzedaży, neuronowe modele decyzyjne dla niestabilnego okresu giełdy, wycena opcji w okresie wahań kursów giełdowych, analiza wycen opcji kupna, sprzedaży, wspomaganie decyzji inwestorów z wykorzystaniem modeli neuronowych, narzędzie do wspomagania decyzji inwestycyjnych na rynku opcji na indeks WIG20, opis interfejsu, algorytmy wykorzystane w aplikacji, język programowania, aktualizacja, propozycja dalszej rozbudowy aplikacji, standard opcji na WIG2

Arabidopsis thaliana Nudix hydrolase AtNUDT7 forms complexes with the regulatory RACK1A protein and Ggamma subunits of the signal transducing heterotrimeric G protein.

Arabidopsis thaliana AtNUDT7 Nudix pyrophosphatase hydrolyzes NADH and ADP-ribose in vitro and is an important factor in the cellular response to diverse biotic and abiotic stresses. Several studies have shown that loss-of-function Atnudt7 mutant plants display many profound phenotypes. However the molecular mechanism of AtNUDT7 function remains elusive. To gain a better understanding of this hydrolase cellular role, proteins interacting with AtNUDT7 were identified. Using AtNUDT7 as a bait in an in vitro binding assay of proteins derived from cultured Arabidopsis cell extracts we identified the regulatory protein RACK1A as an AtNUDT7-interactor. RACK1A-AtNUDT7 interaction was confirmed in a yeast two-hybrid assay and in a pull-down assay and in Bimolecular Fluorescence Complementation (BiFC) analysis of the proteins transiently expressed in Arabidopsis protoplasts. However, no influence of RACK1A on AtNUDT7 hydrolase catalytic activity was observed. In vitro interaction between RACK1A and the AGG1 and AGG2 gamma subunits of the signal transducing heterotrimeric G protein was also detected and confirmed in BiFC assays. Moreover, association between AtNUDT7 and both AGG1 and AGG2 subunits was observed in Arabidopsis protoplasts, although binding of these proteins could not be detected in vitro. Based on the observed interactions we conclude that the AtNUDT7 Nudix hydrolase forms complexes in vitro and in vivo with regulatory proteins involved in signal transduction. Moreover, we provide the initial evidence that both signal transducing gamma subunits bind the regulatory RACK1A protein

SELF Tool Platform in SaaS Model for Automation and Standardization of Solutions Generatione

W artykule zaprezentowano funkcjonalności oraz możliwości zastosowania platformy narzędziowej SELF. Omówiono cztery zdefiniowane warstwy platformy oraz przedstawiono proces wdrożenia rozwiązania oraz integrację poszczególnych warstw. Przedstawiono rynek systemów ERP w Polsce oraz dostępne na rynku alternatywne rozwiązania. Zaprezentowana platforma SELF, stworzona w modelu SaaS, jest jednym z kluczowych narzędzi technologicznych wprowadzonych w firmie Soneta w celu wdrożenia efektywnej metody organizacji pracy wewnątrz samego przedsiębiorstwa oraz z jego siecią autoryzowanych partnerów.In the article the functionalities and possibilities of using the SELF tool platform (Soneta Elevation LifeCycle Framework) are presented. The four defined layers of the platform are discussed, the process of implementing the solution and the integration of individual layers is presented. The market of ERP systems in Poland and alternative solutions available on the market are also discussed. The presented SELF platform, created in the SaaS (Software as a Service) model, is one of the key technological tools introduced in Soneta to implement an effective method of work organization within the firm and with its network of authorized partners

NudC Nudix hydrolase from Pseudomonas syringae, but not its counterpart from Pseudomonas aeruginosa, is a novel regulator of intracellular redox balance required for growth, motility and biofilm formation.

Nudix pyrophosphatases, ubiquitous in all organisms, have not been well studied. Recent implications that some of them may be involved in response to stress and in pathogenesis indicate that they play important biological functions. We have investigated NudC Nudix proteins from the plant pathogen Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000 and from the human pathogen Pseudomonas aeruginosa PAO1161. We found that these homologous enzymes are homodimeric and in vitro preferentially hydrolyse NADH. The P. syringae mutant strain deficient in NudC accumulated NADH and displayed significant defects in growth, motility and biofilm formation. The wild type copy of the nudC gene with its cognate promoter delivered in trans into the nudC mutant restored its fitness. However, introduction of the P. syringae nudC gene under the control of the strong tacp promoter into either P. syringae or P. aeruginosa cells had a toxic effect on both strains. Opposite to P. syringae NudC, the P. aeruginosa NudC deficiency as well as its overproduction had no visible impact on cells. Moreover, P. aeruginosa NudC does not compensate the lack of its counterpart in the P. syringae mutant. These results indicate that NudC from P. syringae, but not from P. aeruginosa is vital for bacteria