Długoterminowe zastosowanie inhibitorów BRAF i MEK u chorej na czerniaka skóry z przerzutami do mózgowia

W ostatnich latach dzięki pojawieniu się nowych metod leczenia, przeżywalność chorych na uogólnionego czerniaka uległa istotnej poprawie. Szczególną grupą chorych, u których rokowanie wciąż pozostaje złe, mimo dostępnych nowych terapii, są chorzy z przerzutami do ośrodkowego układu nerwowego. W poniższej pracy prezentowany jest przypadek 40-letniej kobiety z rozpoznaniem uogólnionego czerniaka z przerzutami do mózgowia, u której z powodzeniem zastosowano ponownie terapię inhibitorami BRAF/MEK po progresji w trakcie immunoterapii i wcześniejszego leczenia ukierunkowanego. W ciągu siedmiu lat od postawienia diagnozy uogólnionego czerniaka z przerzutami do mózgowia, chora poza leczeniem systemowym została poddana radioterapii oraz leczeniu neurochirurgicznemu. Dzięki wielospecjalistycznej opiece pacjentka wciąż kontynuuje leczenie z dobrym efektem

Fungal infection of cystic fibrosis patients — single center experience

INTRODUCTION: Cystic fibrosis (CF) is the most common monogenetic autosomal recessive disease in the human population. This systemic disease is characterized by changes in multiple organs, mainly in the lung tissue and digestive tract. More than 59% of CF patients become sensitized to fungal spores, mostly Aspergillus fumigatus. 5−15% of CF patients develop allergic bronchopulmonary aspergillosis. The aim of the study was to analyse the occurrence of yeast and filamentous fungi of the respiratory infections in CF patients and evaluation of drug resistance. MATERIAL AND METHODS: Between 2006 and 2014, mycological evaluation of 42 patients hospitalized at the National Institute of Tuberculosis and Lung Diseases was carried out. RESULTS: 217 specimens from pulmonary tract were collected from 42 patients with cystic fibrosis. 205 (68%) strains of yeast and 96 (32%) filamentous fungi strains were cultured. The most common mould strain was A. fumigatus — 22,2% (67 species). All isolates of filamentous fungi were in vitro 100% susceptible to itraconazole, voriconazole, posaconazole and amphotericin B. CONCLUSIONS: A. fumigatus and C. albicans were the most common etiological agents of fungal respiratory pathogens associated with CF patients. A. fumigatus strains were in vitro 100% susceptible to azole and amphotericin B. Two strains of C. albicans and one strain of C. tropicalis were non-susceptible to azole (fluconazole, itraconazole and voriconazole). Scedosporium apiospermum was resistant to amphotericin B (MIC > 32 mg/l) and susceptible to voriconazole (MIC 0.094 mg/l).INTRODUCTION: Cystic fibrosis (CF) is the most common monogenetic autosomal recessive disease in the human population. This systemic disease is characterized by changes in multiple organs, mainly in the lung tissue and digestive tract. More than 59% of CF patients become sensitized to fungal spores, mostly Aspergillus fumigatus. 5−15% of CF patients develop allergic bronchopulmonary aspergillosis. The aim of the study was to analyse the occurrence of yeast and filamentous fungi of the respiratory infections in CF patients and evaluation of drug resistance. MATERIAL AND METHODS: Between 2006 and 2014, mycological evaluation of 42 patients hospitalized at the National Institute of Tuberculosis and Lung Diseases was carried out. RESULTS: 217 specimens from pulmonary tract were collected from 42 patients with cystic fibrosis. 205 (68%) strains of yeast and 96 (32%) filamentous fungi strains were cultured. The most common mould strain was A. fumigatus — 22,2% (67 species). All isolates of filamentous fungi were in vitro 100% susceptible to itraconazole, voriconazole, posaconazole and amphotericin B. CONCLUSIONS: A. fumigatus and C. albicans were the most common etiological agents of fungal respiratory pathogens associated with CF patients. A. fumigatus strains were in vitro 100% susceptible to azole and amphotericin B. Two strains of C. albicans and one strain of C. tropicalis were non-susceptible to azole (fluconazole, itraconazole and voriconazole). Scedosporium apiospermum was resistant to amphotericin B (MIC > 32 mg/l) and susceptible to voriconazole (MIC 0.094 mg/l)

Are students at Krakow universities turning to energy-boosting dietary supplements?

Introduction. Recent studies have revealed an increase in the consumption of dietary supplements including frequency of use of caffeine, which is addictive and potentially harmful in higher doses. Energy drinks include high doses of caffeine and are particularly targeted at young people. Objective.The aim of the study was to investigate the frequency of use of caffeine-containing energy products, associated factors and understanding the associated side- effects in university students. Materials and method. A cross-sectional questionnaire-based survey was conducted among students of the 5 largest Universities in Krakow. Statistical significance was set at the 0.05 level. Results. Around 35% of respondents reported the use of different supplements including high doses of caffeine. Frequency of caffeine-containing products consumption was significantly higher in female students compering to males. Also, those respondents who originated from big cities were more likely to use caffeine-containing products. The study revealed that these substances were also more popular among those participants who study economics. Most students use these substances in order to reduce feeling tired and the duration of sleep, others mainly to increase concentration prior to examinations. Almost one fourth of the group who used these substances admitted to having experienced some side-effects in the past. They suffered mainly from insomnia, but also from excessive stimulation and muscle trembling. Almost half of the substances users did not know of any potential side-effects. Conclusions. Attempts should be made to increase public awareness of the side-effects of these substances, particularly among the student population. These campaigns should be targeted especially at female students who come from bigger cities. This study is a step towards drawing attention to this issue

Ziarnina stwierdzona w najądrzu chorego leczonego dopęcherzowymi wlewkami BCG — powikłanie leczenia BCG czy gruźlica?

We present a case of 72-year old man treated from 2007 for superficial bladder carcinoma. Patient had undergone surgical intervention for transitional cell carcinoma of the bladder, followed by BCG therapy. Two years later enlarged right testis and epididymis was observed. A resection was carried out. Histologic examination revealed in epididymis cauda granulomatous infiltration with eosinophillic necrosis. No bacteriologic tests of resected material were performed. Suspecting BCG infection or TB patient was referred to the Instititute of Tuberculosis and Lung Diseases in Warsaw for pulmonary evaluation. Chest X-ray, chest CT scan and bronchoscopy were performed but beside revealing scars in bronchi suggesting a history of TB did not contribute to the diagnosis. Tuberculin skin test was 21 mm. Diagnosis was determinated by spoligotyping which found bacille of Mycobacterium tuberculosis in specimen preserved in paraffin block. Tuberculosis of right epididymis and past pulmonary tuberculosis was diagnosed. Patient was treated with rifampin, isoniazid and pirazynamid. Pneumonol. Alergol. Pol. 2011; 79, 4: 305–308W pracy opisano przypadek 72-letniego mężczyzny leczonego od 2007 roku z powodu powierzchownego raka pęcherza moczowego. Pacjent miał wykonaną elektroresekcję zmian w pęcherzu, następnie otrzymywał dopęcherzowe wlewki BCG. Po 2 latach z powodu zmian obserwowanych w najądrzu i jądrze prawym wykonano resekcję. W badaniu histopatologicznym stwierdzono ziarninę z martwicą serowatą w ogonie najądrza. Nie wykonano posiewów bakteriologicznych z resekowanego materiału. Podejrzewając zakażenie BCG, skierowano chorego na diagnostykę w Instytucie Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie. Dalsza diagnostyka obejmowała badania radiologiczne klatki piersiowej i bronchoskopię, które, poza stwierdzeniem w oskrzelach blizn po przebiciach węzłowych sugerujących przebytą gruźlicę, nie przyczyniły się do ustalenia rozpoznania. Odczyn tuberkulinowy wynosił 21 mm. O rozpoznaniu przesądziło wykrycie metodą spoligotyping prątków należących do M. tuberculosis w wycinkach z bloczka parafinowego materiału operacyjnego. Na tej podstawie rozpoznano gruźlicę najądrza i wdrożono leczenie przeciwprątkowe. Pneumonol. Alergol. Pol. 2011; 79, 4: 305–30

Zakażenia grzybicze u chorych na mukowiscydozę — wyniki badania jednoośrodkowego

WSTĘP: Mukowiscydoza (zwłóknienie torbielowate [CF]) to najczęstsza choroba monogenowa, dziedziczona w sposób autosomalny recesywny występująca wśród rasy kaukaskiej. Jest chorobą ogólnoustrojową, wielonarządową, w której decydujące dla jej przebiegu jest zajęcie układów oddechowego i pokarmowego. U ponad 59% chorych na mukowiscydozę stwierdza się przeciwciała dla alergenów zarodników grzybów głównie Aspergillus fumigatus. U 5−15% chorych dochodzi do rozwoju alergicznej aspergilozy oskrzelowo-płucnej. Celem pracy była analiza częstości występowania grzybów drożdżopodobnych i grzybów pleśniowych w drogach oddechowych chorych na CF oraz ocena lekooporności wyhodowanych szczepów. MATERIAŁ I METODY: Analizie poddano wyniki badań mikologicznych uzyskanych od 42 chorych hospitalizowanych i leczonych w Instytucie Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie w latach 2006−2014. WYNIKI: Z 217 materiałów z dróg oddechowych, otrzymanych od 42 chorych na mukowiscydozę, wyizolowano 205 (68%) szczepów grzybów drożdżopodobnych oraz 96 (32%) szczepy grzybów pleśniowych. Wśród grzybów pleśniowych dominował gatunek A. fumigatus 22,2% (67). Badane szczepy grzybów in vitro wykazywały 100% wrażliwość na itrakonazol, worykonazol, posakonazol oraz amfoterycynę B. WNIOSKI: Główne patogeny izolowane z materiałów z dróg oddechowych chorych na mukowiscydozę stanowiły A.fumigatus i C. albicans. Szczepy A. fumigatus wykazywały 100% wrażliwość in vitro na leki z grupy azoli oraz amfoterycynę B. Dwa szczepy C. albicans oraz 1 szczep C. tropicalis wykazywały oporność na azole (flukonazol, itrakonazol i worykonazol). Scedosporium apiospermum był oporny na amfoterycynę B (MIC > 32 mg/l) natomiast wykazywał wrażliwość na worykonazol (MIC 0,094 mg/l).WSTĘP: Mukowiscydoza (zwłóknienie torbielowate [CF]) to najczęstsza choroba monogenowa, dziedziczona w sposób autosomalny recesywny występująca wśród rasy kaukaskiej. Jest chorobą ogólnoustrojową, wielonarządową, w której decydujące dla jej przebiegu jest zajęcie układów oddechowego i pokarmowego. U ponad 59% chorych na mukowiscydozę stwierdza się przeciwciała dla alergenów zarodników grzybów głównie Aspergillus fumigatus. U 5−15% chorych dochodzi do rozwoju alergicznej aspergilozy oskrzelowo-płucnej. Celem pracy była analiza częstości występowania grzybów drożdżopodobnych i grzybów pleśniowych w drogach oddechowych chorych na CF oraz ocena lekooporności wyhodowanych szczepów. MATERIAŁ I METODY: Analizie poddano wyniki badań mikologicznych uzyskanych od 42 chorych hospitalizowanych i leczonych w Instytucie Gruźlicy i Chorób Płuc w Warszawie w latach 2006−2014. WYNIKI: Z 217 materiałów z dróg oddechowych, otrzymanych od 42 chorych na mukowiscydozę, wyizolowano 205 (68%) szczepów grzybów drożdżopodobnych oraz 96 (32%) szczepy grzybów pleśniowych. Wśród grzybów pleśniowych dominował gatunek A. fumigatus 22,2% (67). Badane szczepy grzybów in vitro wykazywały 100% wrażliwość na itrakonazol, worykonazol, posakonazol oraz amfoterycynę B. WNIOSKI: Główne patogeny izolowane z materiałów z dróg oddechowych chorych na mukowiscydozę stanowiły A.fumigatus i C. albicans. Szczepy A. fumigatus wykazywały 100% wrażliwość in vitro na leki z grupy azoli oraz amfoterycynę B. Dwa szczepy C. albicans oraz 1 szczep C. tropicalis wykazywały oporność na azole (flukonazol, itrakonazol i worykonazol). Scedosporium apiospermum był oporny na amfoterycynę B (MIC > 32 mg/l) natomiast wykazywał wrażliwość na worykonazol (MIC 0,094 mg/l)

Detection of mutation in NAT II gene as a method of determination of izoniazyd (INH) acetylation type in human population

Wstęp: Izoniazyd (INH) jest lekiem powszechnie stosowanym w leczeniu gruźlicy, metabolizowanym w wątrobie do acetyloizoniazydu przez enzym N-acetylotransferazę (NAT). Szybkość acetylacji leku jest cechą zdeterminowaną genetycznie. Enzym jest kodowany przez dwa geny: NAT1 i NAT2, który jest odpowiedzialny za występowanie różnic w szybkości acetylacji różnych związków. W przedstawionej pracy badano zastosowanie metody genotypowania w określaniu typu acetylacji (szybki, wolny acetylator). Materiał i metody: Stężenie izoniazydu w surowicy określano metodą biologiczną, gwarantującą wysoką dokładność i powtarzalność wyników. Genomowe DNA izolowano przy użyciu kitu firmy Qiagen, a następnie poddawano reakcji amplifikacji według Spurr [1]. Produkty PCR trawiono oddzielnie 4 enzymami restrykcyjnymi: Dde1, Kpn1, Tag1 i BamH1. Wyniki: W badanej grupie zidentyfikowano występowanie 4 alleli genu NAT2. Obecność dwóch zmutowanych alleli identyfikowała wolny typ acetylacji, natomiast szybcy acetylatorzy mieli 1 lub 2 allele dzikie (NAT2*4). Wnioski: Zastosowanie metody genotypowania w określaniu mutacji w NAT2 u człowieka umożliwia szybkie określanie typu acetylacji w monitorowaniu biodostępności izoniazydu.Introduction: Isoniazid (INH) is a drug widely used in the treatment of tuberculosis. INH is metabolized to acetylisoniazid by N-acetyltransferase (NAT) in the liver. The rate of INH acetylation is genetically determined. NAT isozymes are encoded at 2 loci; one encodes NAT1, formerly known as the monomorphic form of the enzyme, while the other encodes the polymorphic NAT2, which is responsible for individual differences in the ability to acetylate certain compounds. The objective of the present study was to apply the genotyping of the fast and slow acetylators for personalized therapeutic dose. Material and methods: Plasma concentrations of INH were determined with biological method in the authors modification. This method warrants high accuracy and secured repeatable results. Genomic DNA was isolated from the blood samples. DNA extracted by Blood DNA Kit and amplified by PCR by Spurr [1] with two primers. PCR product was cut separately with 4 different restriction enzymes: Dde1, Kpn1, Tag1, and BamH1. Results: Four different NAT 2 alleles were detected in the study population. The presence of any 2 mutant alleles defines the slow-acetylator genotype, whereas rapid acetylators have 1 or 2 wild-type NAT2*4 alleles. Conclusion: On the basis of our results we suggest the using of NAT 2 genotyping for discrimination of the fast and slow acetylators in monitoring of tuberculosis therapy

Nontuberculous mycobacteria strains isolated from patients between 2013 and 2017 in Poland. Our data with respect to the global trends

Introduction: During the last decades the prevalence of NTM infections has increased, especially in developed countries. The aim of the study was to provide an overview on all NTM isolated from clinical samples in Poland between 2013 and 2017. Material and methods: The study comprised 2799 clinical specimens, mostly respiratory accessed in the reference laboratory of National Tuberculosis and Lung Diseases Research Institute in Warsaw and in the Wielkopolska Center of Pulmonology and Thoracic Surgery, Poland, 2013–2017. Results: During the study period 35 species of NTM were isolated . The number of isolates increased almost 1.6-fold: from 420 in 2013 to 674 in 2017. M. kansasii, M. avium, M. xenopi, M. gordonae and M. intracellulare were the most common species. This NTM pattern was rather stable over the time. If the aggregated amount of all MAC species was taken into account they dominated over M. kansasii from 2015. M. avium and M. intracellulare were more often isolated from women, while M. kansasii, M. gordonae and M. xenopi predominated in men. Men and women were infected almost with the same frequency. In older patients 65+ women were in majority, quite opposite to those aged 25 to 64 years. Conclusion: In Poland, like in other countries increased the frequency of isolated NTM. M. kansasii and M. avium were the most frequently identified species from clinical samples. Men and women were infected with NTM with the same frequency

Molecular analysis of strains from tuberculosis patients in Polish prisons in 2004–2008. Initial analysis of the project

Introduction: Correctional facilities are recognised breeding ground for infectious diseases. As The World Health Organization reported, the incidence of infectious diseases in prisons population is 10100 times higher than in general population. The incidence of tuberculosis among correctional inmates in Poland in 2008 was 270/100000, that is around 10 times higher than among non-prisoners. Materials and methods: The study included 57 M. tuberculosis isolates from patients in Polish prisons in 20042008 (5% of all diagnosed TB patient in Polish prisons 20042008). Primary isolation was performed with Löwenstein-Jensen (L-J) medium, species identification was done with the niacin test and gene probes test. Bacterial DNA was extracted from the L-J medium slants with the cetyltrimethylammonium bromide (CTAB) method. Mycobacterium tuberculosis strains were analyzed with two methods: screening for epidemiological discrimination of M. tuberculosis spoligotyping and highthroughput MIRU/VNTR. Results: Isolates that are grouped in clusters (33 isolates) were analyzed by means of MIRU/VNTRs. In MIRU/VNTRs all strains showed different genetic patterns. Most isolates of the prisoners were grouped into two clusters: T1 53 and H3 50. Conclusions: 1. MIRU/VNTR is a high-throughput method. 2. MIRU/VNTR is a promising method to diagnose TB transmission in Polish jails. 3. To identify the probable source of transmission, molecular analysis of strains from patients of the general population is needed.Wstęp: Więzienia są uznawane za środowisko, w którym szczególnie łatwo dochodzi do transmisji chorób zakaźnych, w tym również gruźlicy. Według danych Światowej Organizacji Zdrowia częstość ich występowania w środowisku więziennym jest 10–100 razy większa niż w populacji ogólnej. W Polsce w 2008 roku zapadalność na gruźlicę wśród więźniów wynosiła 270 na 100 tys. i była około 10 razy wyższa niż w populacji ogólnej. Materiał i metody: Badaniu poddano 57 (5%) szczepów gruźlicy wyizolowanych od polskich więźniów w latach 2004–2008. Szczepy Mycobacterium tuberculosis identyfikowano za pomocą sondy genetycznej i testu niacynowego. Bakteryjne DNA izolowano za pomocą bromku cetylotrimetyloamoniowego. Szczepy M. tuberculosis analizowano dwiema metodami genetycznymi: przesiewową spoligotyping i wysoce różnicującą metodą MIRU/VNTR. Wyniki: Szczepy od więźniów, klastrujące się w metodzie spoligotyping (33 szczepy), analizowano metodą MIRU/VNTR. Dwie najliczniejsze grupy szczepów reprezentowały spoligotypy T1 53 i H3 50. Analiza ta pokazała, że wszystkie szczepy prątków gruźlicy od osadzonych posiadały różne wzory molekularne w metodzie MIRU/VNTR. Wnioski: 1. Metoda MIRU/VNTR jest metodą wysoce różnicującą. 2. MIRU/VNTR jest dobrą metodą do poszukiwania źródeł transmisji gruźlicy. 3. Zaplanowano dalszą analizę molekularną w populacji ogólnej, zgodnej z miejscem pochodzenia poszczególnych więźniów. Wyniki tych badań mają na celu ustalenie prawdopodobnego źródła zakażenia, poprzez analizę porównawczą szczepów więziennych i populacji ogólnej

Mycobacterium chimaera as an Underestimated Cause of NTM Lung Diseases in Patients Hospitalized in Pulmonary Wards

Mycobacterium chimaera is the newly described species belonging to Mycobacterium avium complex (MAC), with morphology and growth characteristics closely related to Mycobacterium intracellulare. The aim of this retrospective study was to analyze the frequency and clinical significance of M. chimaera identification in the population of patients with previous positive respiratory cultures for M. intracellulare or MAC. 200 strains of M. intracellulare or MAC, isolated from respiratory specimens of patients hospitalized in pulmonary wards, between 2011 and 2020, were retrospectively analyzed with GenoType NTM-DR test. 88 (44%) of strains were re-classified to M. chimaera species. Analysis of clinical data in 30 patients with positive M. chimaera isolates revealed that they were diagnosed with chronic obstructive pulmonary disease (COPD) – 27%, past tuberculosis – 20%, or interstitial lung diseases – 17%, respectively. Non-tuberculous mycobacterial lung disease (NTMLD) caused by M. chimaera has been recognized in 53% of patients, most often in those presenting with post-tuberculous lung lesions. M. chimaera was almost exclusively isolated from respiratory specimens of patients with underlying lung diseases, especially those with COPD and/or past tuberculosis. NTMLD due to M. chimaera was diagnosed predominantly in patients with past tuberculosis

Factors predisposing to non-tuberculous mycobacterial lung disease in the patients with respiratory isolates of non-tuberculous mycobacteria.

Introduction: An increasing incidence rate of respiratory isolates of non-tuberculous mycobacteria (NTM) has been noted recentlyin most European countries as well as in the US. Despite many publications, there is no consensus concerning the importance ofdifferent factors in promoting NTM lung disease (NTMLD).The aim of the present retrospective study was to analyse patients with positive NTM respiratory isolates in search of factorspredisposing to NTMLD. Material and methods: 73 patients, 23 males, 50 females, median age 62.2 years, in whom NTM have been cultured fromrespiratory specimen (sputum and/or bronchial washings), in the period 2010–2015, entered the study. Results: NTMLD (according to ATS/IDSA) has been recognised in 36 patients, airways colonisation by NTM — in 37 patients. NTMLDwas diagnosed more often in the patients infected with M. kansasii, M. abscessus and M. avium/M. intracellulare comparing to thoseinfected with M. xenopi, M. gordonae and M. fortuitum (p < 0.0001). The proportion of females to males was significantly higher inthe NTMLD group comparing to the colonisation group (p < 0.007). Previous tuberculosis or mycobacteriosis were noted significantlymore frequently in the group of patients with NTMLD comparing to the colonisation group (28% vs 8%, p = 0.038). Univariate regressionanalysis revealed M. kansasii, female gender, and previous tuberculosis or mycobacteriosis as significant predictors of NTMLD. Conclusions: The risk factors of NTMLD recognition in the presented group of patients were the following: female gender,M. kansasii isolation, as well as past tuberculosis or mycobacteriosis