Anatomical Investigation of the Flexor Retinaculum Covering the Tarsal Tunnel in Formaldehyde-Fixed Cadavers

Aim: The flexor retinaculum lies between the medial malleolus of the tibia and the medial process of the calcaneus. It converts grooves on the tibia and calcaneus into the tarsal tunnel. The aim of this study was to analyze the morphometry, the course, and the shape of the flexor retinaculum covering the tarsal tunnel in formaldehyde-fixed cadavers. Material and Methods: Six lower extremities of four formaldehyde-fixed cadavers (four right sides, and 2 left sides) were examined to evaluate the morphometry of the flexor retinaculum. The cadavers were two females and two males with an age range of 60-89 years. A digital caliper (150 mm) and a light microscope were used for measuring parameters. The central length, proximal, midpoint, and distal width, thickness, course, and shape of the flexor retinaculum were examined in this study. Results: The mean central length of the flexor retinaculum was found 42.26±5.18 mm. The mean proximal, midpoint, and distal width of the flexor retinaculum were 29.29±7.29 mm, 29.92±3.66 mm, and 29.76±8.13 mm, respectively. The mean of the thickness was measured at 234.94 µm. The flexor retinaculum coursed vertically in four extremities and coursed obliquely in two extremities. The shape of the retinaculum was triangular in five extremities and quadrangular in only one extremity. Conclusion: The morphometric data obtained from this study can help surgeons during the operations of the tarsal tunnel syndrome. To our knowledge, the width and course of the flexor retinaculum were examined for the first time in this study

Parkinson Hastalığı Hücresel Modelinde İnflamasyonun ve İnflamasyon Sonrası Uygulanan N-Asetilsisteinin H4 Hücrelerindeki Lag3 ve Tlr2 Reseptörleri Üzerine Etkisi

Kaya, Z.B., The Effect of Inflammation and Post-Inflammatory Administration of N-Acetylcysteine on LAG3 and TLR2 Receptors on H4 Cells in the Cellular (In Vitro) Model of Parkinson's Disease, Hacettepe University Graduate School of Health Sciences, Histology and Embryology Program Doctor of Philosophy Thesis, Ankara, 2021. Parkinson's disease is a complex, multifactorial neurodegenerative disease that has prevalence of 1% over the age of 55. Pathological hallmarks of Parkinson's disease include the loss of dopaminergic neurons in the substantia nigra pars compacta and the accumulation of inclusion bodies that contain predominantly alpha-synuclein (α-syn) and ubiquitinated proteins, called Lewy bodies. Although the formation of α-syn occurs intracellular, it can also be translocalized to extracellular space and then taken into the other cells via receptor mediated endocytosis. TLR2 is a well known receptor which detects extracellular α-syn and modulates the uptake of the protein by other cells. Uptaken α-syn is known to trigger expression and secretion of inflammatory cytokines such as TNF-α, IL-1β, IL-2 and IL-6 and induce neuroinflammation, apoptosis and mitophagy that results in cellular death. N-Acetylcysteine ​​(NAC), an anti-inflammatory and anti-carcinogenic drug, has gained some focus to circumvent the detrimental effects of neuroinflammatory response. In this thesis, we hypothesized that, NAC treatment will result in anti-inflammatory response that restrict in vitro apoptotic and neuroinflammatory response by modulating transcription and expression of TLR2 and LAG3 receptors. In order to test this hypothesis, WT α-syn overexpressing human neuroglioma (H4) cell line was treated with TNF-α to induce inflammation and NAC, as anti-inflammatory drug to recover from deleterious effects of TNF-α induced inflammation and apoptosis. α-syn protein transcription and expression were validated by q-PCR and Western Blot, respectively. Cell viability was measured by Toxilight assay, and apoptosis was evaluated by Western Blot and TUNEL methods. We observed that NAC treatment diminishes inflammation mediated toxicity and cell death by altering transcription and expression of TLR2 and LAG3 receptors. Thereby, this study demonstrates NAC to be a promising candidate to recover from neuroinflammation that occurs in Parkinson’s Disease.Kaya, Z.B., Parkinson Hastalığı Hücresel Modelinde İnflamasyonun ve İnflamasyon Sonrası Uygulanan N-Asetilsisteinin H4 Hücrelerindeki LAG3 ve TLR2 Reseptörleri Üzerine Etkisi, Hacettepe Üniversitesi Sağlık Bilimleri Enstitüsü, Histoloji ve Embriyoloji Programı Doktora Tezi, Ankara, 2021. Parkinson hastalığı, bir çok sistemin etkilendiği nörodejeneratif bir hastalıktır. Hastalığın prevalansı genel popülasyonda binde 2-3, 55 yaş üzerinde ise %1 oranındadır. Parkinson hastalığındaki patolojik değişiklikler substantia nigra pars compacta'daki dopaminerjik nöronların kaybı ve hücrelerin içinde Lewy cisimciği olarak adlandırılan, ağırlıklı olarak alfa-sinüklein (α-syn) ve ubikutinlenmiş proteinler içeren küresel inklüzyon cisimciklerinin saptanması şeklindedir. α-syn proteinin nöronlarda hatalı katlanmalar sonucu hücre içinde çeşitli yerlerde birikebildiği gibi hücre dışı alana da geçebildiği bilinmektedir. Hücre dışı alana geçen α-syn proteini özellikle nöronlar ve glia hücreleri tarafından hücre içine endositoz yolu ile alınır. Endositozda TLR2 ve LAG3 reseptörlerinin rolünün açıklanabilmesi için çeşitli çalışmalar yapılmaktadır. α-syn proteininin endositozu, TNF-α, IL-1β, IL-2 ve IL-6 başta olmak üzere çeşitli inflamatuar sitokinlerin üretimine ve salınmasına sebep olmanın yanı sıra; hücre içinde mitokondriyal yolak üzerinden apoptoz ve mitofajiyi tetikleyerek hücre ölümünü yol açmaktadır. N-Asetilsistein (NAC), anti-oksidan, anti-inflamatuar ve anti-kanserojen etkilere sahip bir ilaçtır. Bu tez çalışmasında, inflamasyonun tetiklenmesi sonrası, LAG3 ve TLR2 reseptörlerinin ekspresyonunda artış görülebileceği ve inflamasyon NAC ile kontrol altına alındığında, inflamasyonun sebep olduğu hasarın azalması ve hücre canlılığında artış görülebileceği hipotezlerinde bulunuldu. Bu varsayımları test etmek amacı ile; in vitro koşullarda deney ve kontrol grupları içeren bir çalışma planlandı. α-syn proteinini aşırı eksprese eden insan nöroglioma (H4) hücre hattı kullanılarak inflamatuar bir Parkinson hastalığı modeli oluşturuldu. İnflamasyon, TNF-α ile tetiklendi ve NAC uygulanarak inflamasyon kontrol altına alındı. Çalışmada α-syn protein ekspresyonu ve transkripsiyonu, Western Blot ve q-PCR metotları ile ölçüldü. Hücre canlılığı Toxilight testi ile, apoptoz Western Blot tekniği ile apoptoz belirteçlerinin ölçülmesi ve TUNEL immunofloresan işaretleme metodu ile değerlendirildi. TLR2 ve LAG3 reseptörlerinin transkripsiyonları q-PCR metodu ile ölçüldü. Reseptörlerin protein düzeyleri immunofloresan işaretleme ve Western Blot tekniği ile saptandı. Elde edilen veriler ışığında, NAC tedavisinin, TLR2 ve LAG3 reseptörlerinin transkripsiyonunu ve ekspresyonunu değiştirerek inflamasyon aracılı toksisiteyi ve hücre ölümünü azalttığı belirlendi. Bu çalışma ile, NAC'nin Parkinson Hastalığında ortaya çıkan nöroinflamasyon süreci için umut vaat eden bir aday olduğu düşünüldü

Optimizing SH-SY5Y cell culture: exploring the beneficial effects of an alternative media supplement on cell proliferation and viability

Abstract In the quest to unravel the mysteries of neurological diseases, comprehending the underlying mechanisms is supreme. The SH-SY5Y human neuroblastoma cell line serves as a crucial tool in this endeavor; however, the cells are known for its sensitivity and slow proliferation rates. Typically, this cell line is cultured with 10% Fetal Bovine Serum (FBS) supplement. Nu-Serum (NuS), a low-protein alternative to FBS, is promising to advance cell culture practices. Herein, we evaluated the substitution of NuS for FBS to test the hypothesis that an alternative serum supplement can aid and promote SH-SY5Y cell proliferation and differentiation. Our findings revealed that the NuS-supplemented group exhibited a notable increase in adhered cells compared to both the FBS and serum-free (SF) groups. Importantly, cell viability remained high in both sera treated groups, with the NuS-supplemented cells displaying significantly larger cell sizes compared to the SF-treated group. Furthermore, cell proliferation rates were higher in the NuS-treated group, and neuroblast-like morphology was observed earlier than FBS group. Notably, both FBS and NuS supported the differentiation of these cells into mature neurons. Our data supports NuS as an alternative for SH-SY5Y cell culture, with the potential to elevate the quality of research in the neuroscience field

Histology Laboratory Guide Book

Histology and Embryology education and research are fundamental cornerstones of medical science. Histology, which is the basis of many fields of preclinical and clinical medicine, defines the visual components of cells, tissues and organs at the microscope level. This book, which we have published in the third extended version, provides students with a selection of micrographs created from archive preparations that Hacettepe University Faculty of Medicine Department of Histology and Embryology has been carefully created for more than 50 years. This selection has been prepared with the common effort of our academic staff, research assistants and technicians. The purpose of the book is to guide medical and health sciences students while examining the original preparations under the microscope in the laboratory, to match the functional properties associated with the structure of healthy cells with histochemical staining properties. Each chapter in the book contains brief information of micrographs on the basis of organs, tissues and cells under the relevant technical title. In this edition; we would respectfully like to thank the founder of our department and the first woman dean of medical school of our country, Prof. İlhan Kerse and, all of our retired professors who greatly contributed to our education by showing us the way of science. We also thank our former heads of department Prof. Ülken Örs, Prof. Esin Aşan, Prof. Ayşe Nur Çakar, Prof. Attila Dağdeviren, Prof. Sevda Fatma Müftüoğlu and Prof. Fevziye Figen Kaymaz. On behalf of our department, we wish all our students sincere success.Histoloji ve Embriyoloji, tıp biliminin vazgeçilmez temel taşlarından birisini oluşturur. Tıbbın birçok preklinik ve klinik alanına esas oluşturan histoloji, hücre, doku ve organların mikroskop düzeyinde görsel bileşenlerini tanımlar. Beşinci genişletilmiş basımını yaptığımız bu kitap, Hacettepe Üniversitesi Tıp Fakültesi Histoloji ve Embriyoloji Anabilim Dalı’nın 50 yılı aşkın süredir özenle oluşturduğu arşiv preparatlarından derlenmiş mikrograf seçkisini öğrencilere sunmaktadır. Bu seçki, anabilim dalımız öğretim üyeleri, araştırma görevlileri ve teknisyenlerinin ortak emeği ile hazırlanmıştır. Kitabın amacı; tıp ve sağlık bilimleri öğrencilerine laboratuvarda bu preparatları mikroskop altında incelerken rehberlik etmek, sağlıklı hücrelerin yapıları ile ilişkili işlevsel özelliklerini, histokimyasal boyanma özellikleriyle eşleştirmelerini sağlamaktır. Kitaptaki her bölüm, ilgili teknik başlık ya da sisteme ait preparat mikrografları hakkında organ, doku, hücre temelinde kısa bilgiler vermektedir. Bu baskıda; anabilim dalımızın kurucusu ve ülkemizin ilk kadın tıp fakültesi dekanı Sn. Prof. Dr. İlhan Kerse başta olmak üzere, bizlere bilimin yolunu göstererek yetişmemize katkıda bulunan anabilim dalı başkanlarımız Sn. Prof. Dr. Ülken Örs, Sn. Prof. Dr. Esin Aşan, Sn. Prof. Dr. Ayşe Nur Çakar, Sn. Prof. Dr. Attila Dağdeviren, Sn. Prof. Dr. Sevda Fatma Müftüoğlu, Sn. Prof. Dr. Fevziye Figen Kaymaz’a ve tüm emekli hocalarımıza teşekkür ediyoruz. Anabilim dalımız adına tüm öğrencilerimize içten başarı dileklerimizle