17 research outputs found
Risk of transmission of blood-derived pathogens by transfusion in Poland
Blood transfusion in Poland is the safest in history. High virological level of safety has been achieved mainly by improving not only the qualification of donors and methods used for donor screening, but also applying leukoreduction, pathogen reduction technology and grace period for serum.In this article, we discuss the improvement of the epidemic situation among blood donors for hepatitis B virus (HBV) and hepatitis C virus (HCV) and the increasing trend for HIV. Preliminary results of residual risk calculation for these pathogens are presented.Hepatitis E virus (HEV) and Babesia microti were considered as new factors potentially relevant for the safety of blood transfusion in our country. Due to evidence of West Nile virus (WNV) circulation in the ecosystem in Poland, it is also necessary to monitor the infections with this pathogen.In this article, it was emphasized that the reporting of all possible complications associated with transfusion and meticulous implementation of the look-back procedure play a key role for monitoring the risk of transmission of infectious agents by blood. It is especially important in view of the increasing epidemiological problems associated with emerging infectious agents
Diagnostyka molekularna SARS-CoV-2
Zakażenia nowym koronawirusem — SARS-CoV-2 — stały się w ostatnich miesiącachgłównym problemem epidemiologicznym oraz klinicznym na świecie, w tym Polsce w zakresiechorób zakaźnych. Niniejszy artykuł powstał na podstawie wystąpienia zaprezentowanegow trakcie webinaru zatytułowanego „Hematologia i transfuzjologia a COVID-19”, który odbyłsię w maju 2020 roku. Praca ma na celu przybliżenie procedury diagnostyki zakażenia nowymkoronawirusem. Zwrócono w niej uwagę na krytyczne dla jakości wykonywanych badańaspekty fazy przedanalitycznej oraz analitycznej, na które ma wpływ zarówno osoba zlecająca,jak i personel wykonujący badanie. Na podstawie aktualnego piśmiennictwa przedstawionotakże dalsze kierunki doskonalenia diagnostyki molekularnej SARS-CoV-2
Charakterystyka testu cobas® DPX przeznaczonego do badania dawców krwi na obecność DNA parwowirusa B19 (B19V) i RNA HAV przy użyciu analizatora cobas® 6800 oraz aparatu cobas p 680 firmy Roche
Introduction
The cobas DPX test for use on the cobas 6800 system, is real-time PCR test for the identification and quantitation of human parvovirus B19 (B19V) DNA and the detection of hepatitis A virus (HAV) RNA in human plasma. Optional component to the cobas 6800 system is the cobas p 680 instrument that creates pools from individual samples.
Aim
To evaluate the performance of cobas® DPX test and to demonstrate its ability to detect HAV and polymorphic forms of B19V during plasma testing. Sensitivity, correct identification of reactive donations and risk of false positive results was estimated.
Material and method
The analytical sensitivity of cobas® DPX test was assessed by testing dilutions of the WHO B19V Genotype 1-3 Reference Panels (09/110) and IS WHO RNA HAV (00/562) dilution panel. Six dilutions of each B19 panel were tested ranging from 31.6 IU/mL to 0.1 IU /mL of genotype 1, 2, 3 and six dilutions of RNA HAV panel ranging from 10-0,03 IU/ml (24 replicates/dilution). Detection and identification of reactive donations tested in minipools were evaluated by testing 767 negative and 1 high DNA B19V reactive donations in 8 pools.
Results
The 95% limits of detection [LOD] (95% confidence range) of the cobas® DPX test for DNA B19V were respectively: genotype 1 - 8.70 IU/mL (4.92-21.69), genotype 2 - 37.80 IU/ml (22.24 – 93.65), genotype 3 - 29.84 IU/ml (19.04-65.60) and for RNA HAV were: 0.82 IU/ml (0.49 -1.96). Results of the cobas® DPX test from samples analyzed in minipools were 100% concordant with the expected results. No false reactive or invalid results was observed during donation screening.
Conclusion
The cobas® DPX test on the cobas 6800 system allows to identify donations infected with HAV and genotypes 1-3 of B19V that could result contamination of plasma production pools with HAV and B19V beyond acceptable level (>104 IU/mL, according to recommendations). There was no significant risk of false results during evaluation procedure.Wstęp. Test cobas® DPX typu multiplex jest przeznaczony do badań dawców krwi w analizatorze cobas® 6800 fi rmy Roche. Wykorzystuje metodę real-time PCR i służy do ilościowego badania kwasu deoksyrybonukleinowego (DNA) parwowirusa B19 (B19V) oraz wykrywania kwasu rybonukleinowego RNA wirusa zapalenia wątroby typu A (HAV) w ludzkim osoczu. Opcjonalnym elementem systemu jest cobas p 680 — w pełni zautomatyzowane urządzenie pipetujące przeznaczone do pulowania pojedynczych próbek osocza. Cel. Celem badań była ocena przydatności testów cobas® DPX do prowadzenia badań w krwiodawstwie. Przeanalizowano między innymi czułość wykrywania markerów, poprawność identyfi kacji donacji zakażonych oraz ryzyko wystąpienia wyników fałszywych. Materiał i metody. Czułość analityczną określano, badając w 24 powtórzeniach każdą próbkę z panelu rozcieńczeń materiału referencyjnego Światowej Organizacji Zdrowia (WHO) genotypów B19V (09/110) — sześć rozcieńczeń genotypów 1–3 (31,6–0,1 IU/ml) oraz IS WHO RNA HAV (00/562) zawierających 10–0,03 IU/ml. Poprawność identyfi kacji zakażeń testem DPX oceniono, badając w ośmiu pulach 767 donacji, w tym jedną z wysoką wiremią B19V. Wyniki. Czułość analityczna testu cobas® DPX na poziomie 95% wykrywalności (LOD) (95-proc. przedział ufności) wyniosła 8,70 (4,92–21,69) IU/ml dla genotypu 1; 37,80 (22,24–93,65) IU/ml dla genotypu 2 i 29,84 (19,04–65,60) IU/ml dla genotypu 3 DNA B19V oraz 0,82 (0,49–1,96) IU/ml dla RNA HAV. Wyniki badań imitujących badania przeglądowe były zgodne z wynikami spodziewanymi. W trakcie oceny nie obserwowano wyników fałszywych. Wnioski. Badanie testem DPX wykonane na cobas® 6800 i p 680 pozwala prawidłowo identyfikować DNA-emię B19V, która może spowodować przekroczenie dopuszczalnego poziomu 104 IU B19V/ml w puli produkcyjnej składników osoczopochodnych. Równolegle prowadzone jest badanie RNA HAV. W badaniach nie stwierdzono istotnego ryzyka występowania wyników fałszywych
Development of chemical tools to monitor human Kallikrein 13 (KLK13) activity
Kallikrein 13 (KLK13) was first identified as an enzyme that is downregulated in a subset of breast tumors. This serine protease has since been implicated in a number of pathological processes including ovarian, lung and gastric cancers. Here we report the design, synthesis and deconvolution of libraries of internally quenched fluorogenic peptide substrates to determine the specificity of substrate binding subsites of KLK13 in prime and non-prime regions (according to the Schechter and Berger convention). The substrate with the consensus sequential motive ABZ-Val-Arg-Phe-Arg-ANB-NH2 demonstrated selectivity towards KLK13 and was successfully converted into an activity-based probe by the incorporation of a chloromethylketone warhead and biotin bait. The compounds described may serve as suitable tools to detect KLK13 activity in diverse biological samples, as exemplified by overexpression experiments and targeted labeling of KLK13 in cell lysates and saliva. In addition, we describe the development of selective activity-based probes targeting KLK13, to our knowledge the first tool to analyze the presence of the active enzyme in biological samples
Postrzeganie Internetu Rzeczy w zastosowaniach konsumenckich w kontekście różnic międzypokoleniowych
Celem artykułu była próba ustalenia, jak przedstawiciele różnych pokoleń postrzegają Internet Rzeczy (IoT) w zastosowaniach konsumenckich oraz czy pomimo wzrostu popularności aplikacji IoT różnice międzypokoleniowe w zakresie percepcji technologii i urządzeń Internetu Rzeczy są istotne. Międzypokoleniową analizę komparatywną przeprowadzono na podstawie własnego badania, zrealizowanego za pomocą ankiety internetowej (CAWI), na próbie 241 respondentów. W świetle uzyskanych wyników nie potwierdzono hipotezy zakładającej, iż przedstawiciele poszczególnych generacji różnią się istotnie w zakresie postrzegania użyteczności urządzeń Internetu Rzeczy w zastosowaniach konsumenckich. Nie potwierdzono także wpływu wieku jako zmiennej różnicującej postrzeganie możliwości zastosowania Internetu Rzeczy w różnych sektorach gospodarki
Silver and Copper Nanoparticles—An Alternative in Future Mastitis Treatment and Prevention?
Nowadays, mastitis is one of the biggest problems in breeding dairy cattle. Treatment of this disease with conventional antibiotics is ineffective because many pathogens are resistant. Researchers have therefore been forced to look for new solutions, and metal nanoparticles (NPs) have been found to be the most appropriate agents. This study uses commercially available silver (AgNPs) and copper (CuNPs) nanoparticles and synthetized silver–copper nanoparticles (AgCuNPs) to evaluate the effect of these NPs on human and bovine mammary cells. The effect of AgNPs, CuNPs, and AgCuNPs on pathogen species commonly involved in udder inflammation (e.g., Staphylococcus aureus and Escherichia coli) was also established. The results show that commercially available NPs were of good quality and did not have a toxic effect on mammary gland tissue. AgNPs, CuNPs, and AgCuNPs also influenced or decreased the viability of pathogens. Therefore, the presented data suggest that metal NPs could be used in mastitis prevention and treatment in the future. However, the presented preliminary results require further in vivo analysis
SARS-CoV-2 molecular diagnostics
The new coronavirus — SARS-CoV-2 infections have recently become the main epidemiological and clinical challenge worldwide (Poland included). This article is based on the presentation entitled “Hematology and transfusion medicine and COVID-19” given/conferred during the webinar in May 2020. The aim was to introduce the procedure for diagnosing the new coronavirus infection. The procedure highlights the aspects of the pre-analytical and analytical phase that are critical for the quality of the performed tests and affected by both the commissioning and test-performing personnel. On the basis of current literature, further recommendations for the improvement of molecular diagnostics of SARS-CoV-2 are also presented
Silver and Copper Nanoparticles as the New Biocidal Agents Used in Pre- and Post-Milking Disinfectants with the Addition of Cosmetic Substrates in Dairy Cows
Mastitis is one of the most common issues for milk producers around the world. Antibiotic therapy is often ineffective, and therefore, scientists must find a new solution. The aim of this paper is to estimate the influence of common and well-known cosmetic substrates and mixtures of nanoparticles (NPs) and cosmetic substrates on the viability of frequently occurring mastitis pathogens, Escherichia coli (E. coli) and Staphylococcus aureus (S. aureus). The obtained results suggest that only collagen + elastin and glycerine influenced and increased bacteria viability. In case of the rest of the cosmetic substrates, the viability of E. coli and S. aureus was decreased, and the results were statistically significant (p ≤ 0.01). Prepared pre-dipping and dipping mixtures decrease (p ≤ 0.01) the viability of the mentioned pathogens. The obtained results of the in vitro analysis are very promising. In the next step, prepared mixtures should be tested in different herd conditions if they can be used in mastitis prevention or decrease the number of subclinical mastitis cases. Furthermore, these mixtures could become an interesting alternative for organic milk production where conventional preparations and antibiotics are forbidden. However, further analysis, especially on the influence of prepared mixtures on other bacteria species and, algae, fungi, are necessary