Endothelial cell-glucocorticoid receptor interactions and regulation of Wnt signaling

Vascular inflammation is present in many cardiovascular diseases, and exogenous glucocorticoids have traditionally been used as a therapy to suppress inflammation. However, recent data have shown that endogenous glucocorticoids, acting through the endothelial glucocorticoid receptor, act as negative regulators of inflammation. Here, we performed ChIP for the glucocorticoid receptor, followed by next-generation sequencing in mouse endothelial cells to investigate how the endothelial glucocorticoid receptor regulates vascular inflammation. We identified a role of the Wnt signaling pathway in this setting and show that loss of the endothelial glucocorticoid receptor results in upregulation of Wnt signaling both in vitro and in vivo using our validated mouse model. Furthermore, we demonstrate glucocorticoid receptor regulation of a key gene in the Wnt pathway, Frzb, via a glucocorticoid response element gleaned from our genomic data. These results suggest a role for endothelial Wnt signaling modulation in states of vascular inflammation.</p

Aurora 2.0: A fluorogenic dye library for expanding the capability of protein-adaptive differential scanning fluorimetry (paDSF)

Differential Scanning Fluorimetry (DSF) is a biophysical assay that is used to estimate protein stability in vitro. In a DSF experiment, the increased fluorescence of a solvatochromatic dye, such as Sypro Orange, is used to detect the unfolding of a protein during heating. However, Sypro Orange is only compatible with a minority of proteins (\u3c 30 %), limiting the scope of this method. We recently reported that protein-adaptive DSF (paDSF) can partially solve this problem, wherein the protein is initially pre-screened against ∼300 chemically diverse dyes, termed the Aurora collection. While this approach significantly improves the number of targets amenable to DSF, it still fails to produce protein-dye pairs for some proteins. Here, we report the expansion of the dye collection to Aurora 2.0, which includes a total of 517 structurally diverse molecules and multiple new chemotypes. To assess performance, these dyes were screened against a panel of ∼100 proteins, which were selected, in part, to represent the most challenging targets (e.g. small size). From this effort, Aurora 2.0 achieved an impressive success rate of 94 %, including producing dyes for some targets that were not matched in the original collection. These findings support the idea that larger, more chemically diverse libraries improve the likelihood of detecting melting transitions across a wider range of proteins. We propose that Aurora 2.0 makes paDSF an increasingly powerful method for studying protein stability, ligand binding and other biophysical properties in high throughput

Serial imaging using [18F]Fluorodeoxyglucose positron emission tomography and histopathologic assessment in predicting survival in a population of surgically resectable distal oesophageal and gastric adenocarcinoma following neoadjuvant therapy

Background and objectives: We retrospectively evaluated the value of PET/CT in predicting survival and histopathological tumour-response in patients with distal oesophageal and gastric adenocarcinoma following neoadjuvant treatment. Methods: Twenty-one patients with resectable distal oesophageal adenocarcinoma and 14 with gastric adenocarcinoma between January 2002 and December 2011, who had undergone serial PET before and after neoadjuvant therapy followed by surgery, were enrolled. Maximum standard uptake value (SUVmax) and metabolic tumour volume were measured and correlated with tumour regression grade and survival. Results: Histopathological tumour response (PR) is a stronger predictor of overall and disease-free survival compared to metabolic response. ∆%SUVmax ≥70% was the only PET metric that predicted PR (82.4% sensitivity, 61.5% specificity, p = 0.047). Histopathological non-responders had a higher risk of death (HR 8.461, p = 0.001) and recurrence (HR 6.385, p = 0.002) and similarly in metabolic non-responders for death (HR 2.956, p = 0.063) and recurrence (HR 3.614, p = 0.028). Ordinalised ∆%SUVmax showed a predictive trend for OS and DFS, but failed to achieve statistical significance. Conclusions: PR was a stronger predictor of survival than metabolic response. ∆%SUVmax ≥70% was the best biomarker on PET that predicted PR and survival in oesophageal and gastric adenocarcinoma. Ordinalisation of ∆%SUVmax was not helpful in predicting primary outcomes

Wplyw uzytkowania zlewni na zanieczyszczenie wod rzecznych na przykladzie Narwi i jej doplywow. Czesc III. Fosfor

W latach 1997-2003 prowadzono badania wpływu użytkowania terenu zlewni na zawartość fosforu w wodach Narwi i wybranych jej dopływów. Stwierdzono, iż wzrost stężenia fosforu w wodach rzecznych powodują: intensywne rolnictwo, spływy zanieczyszczeń komunalnych i spływy ścieków burzowych. Odpływ fosforu ogólnego wynosił średnio 1,06 kg rocznie z 1 ha zlewni ze zróżnicowaniem od 0,42-1,29 kg. Stężenie fosforu ogółem w wodach wynosiło 0,42 mg·dm⁻³ z wahaniami od 0,16-0,92 mg·dm⁻³. Fosfor fosforanowy stanowiły średnio 64% ogólnej zawartości fosforu w wodach. Najniższe stężenia fosforu w wodach stwierdzono wiosną (średnio 0,27 mg P·dm⁻³ ), a najwyższe w okresie letnim, gdy odpływ ze zlewni przewyższał bioakumulację. Najwyższe stężenia i odpływy fosforu stwierdzono w zlewniach rolniczych (Rozoga, Ruż, Orz), mniejsze w zlewni leśnej (Omulew) oraz mieszanych (Biebrza i górna Narew), a najniższy w zlewni rolniczo-leśnej z jeziorami (Pisa). Odpływ fosforu z wodami rzecznymi był 3-krotnie wyższy od odpływu z opadami w zlewniach rolniczych, podczas gdy w zlewniach rolniczo-leśnych był 1,5-krotny. Istotny wpływ na odpływ fosforu ze zlewni, obok szaty roślinnej, miały właściwości gleby, w tym skład granulometryczny. Dlatego z piaszczystej zlewni Omulwi, mimo że zaliczono ją do leśnych, odpływ był większy niż ze zlewni rolniczo-leśnych.The influence of land use on phosphorus contents in water of the Narew river as well as its main tributaries, was studied in the period of 1997-2003. The research showed the increase of P concentrations resulted from intensive agriculture, municipal waste waters outflow and rainfall runoff. The average annual outflow of total phosphorus from 1 ha of basin area amounted to 1.06 kg (range of 0.42-1.29 kg·ha⁻¹). Average concentration of total phosphorus was 0.42 (range 0.16-0.92 mg·dm⁻³). Phosphate phosphorus amounted to 64% total P content in the tested water. The lowest concentrations were observed in spring (0.27 mg P·dm⁻³), whereas the highest in the summer, when the outflow exceeded bioaccumulation. Highest P concentrations and loads were stated in agricultural river basins (the Rozoga, Ruż, Orz), lower in forested (Omulew) and mixed (Biebrza and upper Narew) basins whereas the lowest values characterized agricultural- forested basins with the lakes (Pisa). The outflow of phosphorus with river water on agricultural areas was 3-times higher in comparison to its outflow with rain water; in case of agricultural-forested basin it was 1.5 times higher, respectively. An important factor limiting P outflow from the basins were soil properties especially grained structure. Thus, the sandy of basin Omulew river, although forested, showed the higher outflow than the agricultural-forested river basins

Wplyw uzytkowania zlewni na zanieczyszczenie wod rzecznych na przykladzie Narwi i jej doplywow. Czesc II. Azot mineralny

W latach 1997-2003 przeprowadzono badania, mające na celu określenie jakościowych i ilościowych zmian dokonujących się w chemizmie wód Narwi i wybranych jej dopływów, jako skutku oddziaływań gospodarczych. Stwierdzono, że na wzrost stężenia oraz wielkości ładunku azotu wpływają: wzrost udziału terenów użytkowanych rolniczo, dopływ zanieczyszczeń komunalnych i spływy ścieków burzowych. Najniższe stężenia form azotu w wodach wystąpiły latem (średnio: 0,013 N·NO₂ 0,387 N-NO₃ i 0,309 N-NH₄ mg·dm⁻³), a najwyższe w porze zimowej. Zawartość N-NO₃ była o 71%, a N-NH₄ o 30% wyższa w stosunku do pory letniej. Odpływ azotu ze zlewni rolniczych (Orzą, Ruża i Rozogi) był o 68% wyższy od najniższego w zlewni rolniczo-leśnej z jeziorami (Pisy). We wszystkich badanych zlewniach dokonała się akumulacja azotu (w < 1). Istotny wpływ na wielkość odpływu składnika miała szata roślinna, właściwości gleby (skład granulometryczny) oraz struktura użytkowania zlewni, która warunkowała również formy występowania azotu w wodach rzecznych.The studies aimed at quantification and qualification of changes in water chemistry of the Narew river and its chosen tributaries as affected by human economic activities were conducted within 1997-2003. It was found that the increase in nitrogen concentrations and loads resulted from extended share of cropland areas, the inflow of municipal sewage and rain water runoff. The lowest concentrations of nitrogen compounds in water were observed in summer (0.013 mg N-NO₂·dm⁻³, 0.387 mg N-NO₃·dm⁻³ and 0.309 mg N-NH₄·dm⁻³), whereas the highest in the winter season. The content of N-NO₃ was higher by 71% and N- NH₄ by 30%, in comparison to the summer. The N outflow from agricultural areas (Orz, Ruż, Rozoga) was higher by 68% than the lowest outflow from the rural-forest basin with the lakes (Pisa). Accumulation of N was stated (w < 1) in all of the studied basins. The nitrogen outflow was significantly affected by vegetation cover, soil properties (texture) as well as the structure of land use, conditioned also N forms in river water

Wplyw uzytkowania zlewni na zanieczyszczenie wod rzecznych na przykladzie Narwi i jej doplywow. Czesc I. Wskazniki tlenowe

W pracy przedstawiono wybrane wyniki oceny jakości wód rzecznych w systemie Narwi. Badania te stanowią integralną część szerokiego projektu badawczego, którego celem było określenie wpływu użytkowania zlewni na transport substancji rozpuszczonych w wodach Narwi i wybranych jej dopływów. W pracy dokonano (a) rozpoznania środowiska przyrodniczego zlewni oraz źródeł dostawy substancji chemicznych do wód płynących; (b) analizy mechanizmów odpływu wód i substancji rozpuszczonych w warunkach zróżnicowanej gospodarki agrarnej oraz (c) określenia jakościowych i ilościowych zmian dokonujących się w chemizmie wód jako skutku warunków istniejących w badanych zlewniach. Przedstawione w pracy jakościowe charakterystyki są efektem procesów, które rządzą zasilaniem koryta rzecznego w systemie o zróżnicowanych warunkach przyrodniczych oraz rolniczej działalności człowieka. Występujące zmiany jakości wody wzdłuż profilu podłużnego Narwi są rezultatem bezpośrednich dostaw zanieczyszczeń oraz z systemów niższych rangą taksonomiczną. Ze względu na średnią zawartość wskaźników ogólnego zanieczyszczenia substancjami organicznymi (BZT₅, ChZT) jakość wód Narwi oraz dopływów (Biebrzy, Pisy, Rozogi i Omulwi) różnicowała się od I (bardzo dobrej) do IV (niezadowalającej) klasy jakości.Paper presented chosen results of the water quality assessment in the Narew river system. The study is an integral part of the wide research project aimed at the affect of land use on the transfer of dissolved substances with the Narew river and its tributaries. The paper contains: (a) recognition of natural environment of the basin and sub-basins and the sources of chemical substances entering flowing water; (b) analyses of outflows mechanisms of water and dissolved substances under conditions of diversified agricultural management; (c) seasonal changes in quality and quantity of water resulted from individual characteristics of the basins. Presented data concerning water quality are affected by the processes of riverbed supply with water under diversified environmental conditions and human agricultural activity. The changes in water quality occurring downstream the longitudinal profile of Narew river resulted from direct contamination, as well as from the water systems of lower taxonomical level. Due to average content of organic pollutants (BOD₅, COD), the water quality of Narew river and its tributaries (Biebrza, Pisa, Rozoga, Omulew) ranged from the Ist class of water purity (very good) to the IVth class (unsatisfactory)