The pelagic copepods in the Strait of Dover (Eastern English Channel). A commented inventory 120 years after Eugène CANU

International audienceThis paper is a commented list of copepod species collected, using plankton nets, during a series of oceanologic cruises in the Strait of Dover (1975-2008). It follows in the footsteps the historic work first carried out by the French copepodologist Eugene Canu in 1888. It brings up-to-date the list carried out by Glacon (1975). A total of 35 species are listed here, some of which have to this day rarely been seen. The copepod diversity in the Eastern English Channel is oil the whole relatively low. The meroplanktonic form "Saphirella" (Scott, 1894) found in the Eastern English Channel and in the South of the North Sea and Eurytemora americana (Williams, 1906) found in the Dunkirk harbour are mentioned and described. Brief notes are given on ecological preferences of each species and their relative abundanc

Caractérisation bio-optique des eaux côtières en Manche Orientale pour l'estimation de la production primaire et le suivi des poussées phytoplanctoniques (application à la télédétection satellitaire "couleur de l'eau" en milieu côtier)

CALAIS-BU Sciences (621932101) / SudocSudocFranceF

Le Merlu du Golfe de Gascogne et de la Mer Celtique (Croissance, répartition spatiale et bathymétrique, écologie alimentaire et assemblages)

A ce jour, l'estimation du niveau du stock de merlu nord pose un certain nombre de difficultés du fait de la méconnaissance de ses paramètres de croissance. En décryptant l'évolution de la croissance chez les juvéniles (< 25 cm), il a été possible d'attester de l'uniformité ethnique du merlu évoluant dans le golfe de Gascogne et en mer Celtique, d'apprécier les taux de croissance aux différents groupe d'age et d'apporter un plus d'information sur : la répartition spatiale et bathymétrique ; l'écologie alimentaire et le comportement trophiqueBOULOGNE-BU Droit Lettres (621602101) / SudocPLOUZANE-Bibl.La Pérouse (290195209) / SudocSudocFranceF

Pioneers of plankton research: Eugène Canu (1864–1952)

International audienc

Recherche d'indicateurs de la qualité des écosystèmes côtiers (application aux nourriceries côtières et estuariennes des poissons plats)

Inshore shallow waters and estuaries along much of the western coasts of France provide nursery areas, which have been identified as Essential Fish Habitat, for a wide variety of fish species and especially commercial flatfish. Worldwide increasing industrial development and human population growth have led to rise of environmental damages in the marine environment and human pressure on marine habitats keeps strong. This assertion is especially verified on coastal marine areas, particularly submitted to the adverse effects of anthropogenic disturbances. As damages to habitat quality are one of the most harmful means of slowing or preventing stock from recoveries, one of the main areas are emphasis in current fisheries ecological research is the conservation and enhancement of Essential Fish Habitats. The main goal of the study was to find suitable bioindicators measured on fish to assess the habitat quality of fish nurseries along the Eastern English Channel and Bay of Biscay coasts, with a focus on sites heavily impacted by human activities such as the important estuaries and harbour areas. Subsequently, biological indicators measured both at the individual (growth, size, condition) and population (density) levels were used to assess the biological performances of juvenile fishes and the habitat quality of different nursery areas. The results demonstrate that is necessary to use a pool of bioindicators to assess the quality of habitats as no single measure may provide an overall description of habitat quality. Concerning the habitat quality of the fish nurseries along the western coasts of France, the analyses point out the estuaries of Seine and Gironde where levels of contamination of coastal waters are especially high, and the combination of fish grawth performance and density significantly lower than in other nursery areas. Nevertheless, the results also suggest that it is more pertinent to work on a small spatial scale to increase the sensitivity and the usefulness of the bioindicators, especially to avoid problems related to geographical gradients and to estimate eventual differences due to anthropogenic perturbations on habitat at a local scale. The combination of several bioindicators measured on juvenile fishes appears to provide reliable quantitative indicators of the quality of habitat on the nursery grounds and notably to point out the disturbances in survival and growth in especially polluted areas. Hence, such indicators may contribute to improve assessment of environmental quality of essential fish habitats in the aim of a sustainable management of fisheries ressources.Les secteurs marins côtiers et estuariens du littoral français de Manche-Atlantique constituent des nourriceries pour les poissons et notamment les poissons plats. Ce sont des zones abritées qui jouent un rôle clé dans le succès du renouvellement des populations puisque les juvéniles viennent s'y alimenter et continuer leur croissance jusqu'à maturité sexuelle. En raison de leur situation géographique, les nourriceries sont soumises aux pressions anthropiques (rejets urbains, industriels, agricoles, aménagements côtiers...). Depuis quelques années, la caractérisation et la protection des habitats halieutiques essentiels sont considérées comme éléménts fondamentaux pour une gestion durable des ressources marines. Toutefois, les outils permettant d'apporter un diagnostic sur la fonctionnalité et la qualité de ces habitats restent à définir. Plusieurs indicateurs biologiques mesurés sur des juvéniles de poissons plats, à différents niveaux d'organisation biologique et répondant à différentes échelles de temps aux perturbations environnementales, ont donc été testés afin d'évaluer les performances biologiques des individus, puis la qualité de leurs nourriceries le long du littoral de Manche-Atlantique : (1) des indicateurs mesurés au niveau de l'individu (indices de croissance et de condition), (2) des indicateurs mesurés au niveau de la population (les densités des juvéniles). Les résultats démontrent la nécessité de coupler plusieurs indicateurs car aucun appliqué séparément n'apporte des informations suffisantes pour un diagnostic environnemental. Sur le littoral étudié, l'analyse des indicateurs testés met en évidence deux secteurs présentant des signes de perturbations et des habitats moins favorables pour les juvéniles de soles (Solea solea L.) : les estuaires de la Seine et de la Gironde. Il est néanmoins difficile de dissocier les causes naturelles des causes anthropiques en l'absence de plus de données environnementales, et donc de conclure définitivement sur l'influence des perturbations anthropiques sur la qualité des nourriceries dans ces esturaires. Les différentes approches spatiales ont permis de montrer que l'interprétation des indicateurs biologiques à grandes échelle reste délicate. Il semble, en effet, que les performances biologiques des juvéniles de sole soient influencées par des facteurs locaux propres à chaque habitat (chaque secteur de nourricerie), particulièrement en ce qui concerne la croissance, et notamment en terme de perturbations anthropiques. Celles-ci sont, en effet, localisées et ne semblent pas diffuser à l'échelle de la nourricerie entière. L'utilisation conjointe d'indicateurs de croissance, de condition et de densités semble pertinente pour évaluer la qualité des nourriceries de poissons. Néanmoins, tout diagnostic basé sur des indicateurs biologiques doit être complété par des mesures physico-chimiques de la qualité du milieu et/ou des biomarqueurs.BOULOGNE-BU Droit Lettres (621602101) / SudocSudocFranceF

Qualité du pool nutritif et nutrition des copépodes pélagiques en Manche orientale

Ce travail traite de l'aspect quantitatif et qualitatif des relations trophiques en Manche orientale entre le phytoplancton et les copépodes, au moyen de l'analyse par HPLC des pigments photosynthétiques. Une méthode d'extraction et de séparation des pigments, appliquée à l'analyse des contenus stomacaux des copépodes, a été élaborée. En parallèle, des comptages ont été effectués au microscope pour : déterminer la tailles des particules nutritives, estimer la part des hétérotrophes, et vérifier la validité des pigments marqueurs. L'analyse des prélèvements, effectués de 1995 à 1997, à la côte et au large de Boulogne sur mer, montre que la quantité et la qualité du pool nutritif fluctuent de façon importante à travers les saisons. Les diatomées microplanctoniques composent l'essentiel de la biomasse phytoplanctonique par rapport aux phytoflagellés essentiellement nanoplanctoniques...BOULOGNE-BU Droit Lettres (621602101) / SudocSudocFranceF

First record of the Asian copepod Pseudodiaptomus marinus Sato, 1913 (Copepoda: Calanoida: Pseudodiaptomidae) in the southern bight of the North Sea along the coast of France

International audienceThe presence of the demersal Asian copepod Pseudodiaptomus marinus is reported for the first time in the southern bight of the North Sea, in both Calais harbour and the coastal waters off Gravelines, France. This is the first record of P. marinus in the Atlantic Ocean sector and the North Sea area. The species was collected in January and October 2010, and in January, February and April 2011. The very low number of collected individuals (0.2 to 4.0 ind.m-3) and the capture of only two ovigerous females and of a few numbers of copepodid CV stages suggest that the species survives and actually reproduces in both sites but does not manage to develop an abundant population. The presence of P. marinus in Calais harbour and coastal waters of the southern North Sea supports recent observations of other Asian species in the same area and suggests a passive transport via ship's ballast water

Dynamique bactérienne en Manche orientale (relation avec les poussées de Phaeocystis globosa)

Ce travail porte sur la dynamique bactérienne en Manche orientale, depuis une approche écosystémique à l'application d'outils microbiens spécifiques. Il permet de mieux comprendre le rôle des bactéries, jusqu'alors peu étudiées en Manche orientale, dans les flux de matière et d'énergie, particulièrement en période de floraison printanière. Le premier objectif consistait à déterminer la réponse du bactérioplancton à la variabilité spatio-temporelle du milieu, à l'échelle (i) de l'écosystème au cours de deux années consécutives (2003/2004), (ii) saisonnière sur le site de Wimereux et (iii) journalière au cours de suivis Lagrangiens de masse d'eau. L'étude montre que les années 2003 et 2004 ont été très différentes en termes de fonctionnement trophique du réseau microbien. Par ailleurs, la diversité des paramètres de contrôle de la dynamique bactérienne (température, disponibilité en matières organiques, prédation) conditionne son caractère saisonnier. Sur un cycle journalier, l'application de deux méthodes de mesure de la production a permis une analyse plus précise des conditions de croissance bactérienne. Afin d'évaluer le rôle trophique du bactérioplancton, particulièrement lors des blooms de Phaeocystis globosa, les fractions cellulaires viables et actives du pool bactérien, responsables de l'activité mesurée, ont été estimées. Les abondances de ces cellules augmentent en réponse aux matières organiques accumulées pendant et après le bloom phytoplanctonique. Des mesures d'activité exo-enzymatique montrent une dégradation bactérienne significative des matières issues du bloom, et soulignent l'existence d'une étroite relation " trophique " entre bactéries et P. globosa.Bacterial dynamics (total, viable and active abundances, biomass and cell production, exo-enzymatic activities) was estimated in the eastern English Channel, from an ecosystemic approach to the use of specific microbial tools. It allows better understanding the role of heterotrophic bacteria, little studied in the eastern English Channel to date, in matter and energy fluxes, specially during phytoplankton bloom. The first aim was to determine the bacterial response to the space and time variability of the environmental conditions, at (i) the ecosystem scale during two consecutive years (2003/2004), (ii) the seasonal scale in Wimereux location and (iii) at the diurnal scale during Lagrangian drifts. This study highlights two different years in terms of microbial food web functioning. In addition, the diversity of factors controlling the bacterial dynamics (temperature, organic matter availability, grazing pressure) governs its seasonality. During a diurnal cycle, the use of two bacterial production methods allowed a more accurate and finer analyse of bacterial processes. In order to estimate the trophic role of bacterioplankton, particularly during the massive Phaeocystis globosa blooms, estimations of the bacterial viable and active cellular fractions, responsible for the bulk of bacterial activities, were made. Bacterial abundance significantly increased in response to organic matter accumulation during and after the bloom. Exo-enzymatic activities highlighted a significant bacterial degradation of the phytoplankton-derived organic matter, and emphasized the strong trophic relation linking bacteria and P. globosa.BOULOGNE-BU Droit Lettres (621602101) / SudocSudocFranceF

Etude de la dynamique des communautés phytoplanctoniques par microscopie et cytométrie en flux, en eaux côtière de la Manche orientale

Les zones côtières contribuent de manière importante à la production primaire des océans. Le compartiment phytoplanctonique y joue un rôle prépondérant de par sa position de producteur primaire à la base des réseaux trophiques, mais également en terme de diversité, étant capable d intégrer et/ou de refléter les changements environnementaux qui s opèrent à court, moyen et long terme. Le but de ce travail a été de caractériser la dynamique phytoplanctonique en eaux côtières, en utilisant une technique traditionnelle (la microscopie) et une technique d analyse automatise e des propriétés optiques individuelles des cellules, la cytométrie en flux. L écosystème de la Manche orientale a été choisi comme site atelier, se caractérisant par un important hydrodynamisme et des efflorescences massives de Phaeocystis globosa. Le principal objectif a consisté en l étude de la variabilité temporelle des communautés phytoplanctoniques allant du long au court terme, à l aide de résolutions temporelles différentes, dans le but d appréhender leur relation avec les facteurs responsables de la variabilité observée. Une première échelle interannuelle sur le long-terme (1992-2007) a permis d appréhender les principaux changements saisonniers ainsi que les tendances majeures de variabilité des espèces les plus représentées. Une seconde échelle saisonnière sur le moyen terme a permis d étudier le compartiment phytoplanctonique au cours de la période productive printanière de trois années consécutives (2005-2007), afin de mieux comprendre certains mécanismes régissant les efflorescences micro-algales. Une troisième échelle réalisée au cours de quatre moments différents du bloom printanier en 2007 a permis de suivre la dynamique à plus court terme de groupes cellulaires. Au cours de ces différentes études, des assemblages d espèces indicatrices ont été identifiés en fonction de leur occurrence et de leur diversité morphologique visant à définir des groupes fonctionnels. En particulier, les morphotypes de Phaeocystis globosa dont la diversité des formes de vie conditionne son succès dans le milieu, ont été analysés dans ce sens. Une fréquence d échantillonnage appropriée à chaque échelle d observation a été utilisée, allant de prélèvements mensuels à des prélèvements journaliers. L abondance, la biomasse et la diversité phytoplanctoniques ont été dans un premier temps estimées par microscopie. Cependant, dans le cadre de l étude à court terme, il s est avéré utile d appliquer une méthodologie alternative à la microscopie. La cytométrie en flux est une technique développée pour l énumération des cellules individuelles, identifiées à partir de l analyse de leurs propriétés optiques (diffusion et fluorescence). L analyse des cellules phytoplanctoniques y est alors facilitée par l autofluorescence des pigments photosynthétiques. L appareil utilisé (CytoSense Benchtop CytoBuoy ) est spécialement adapté à la détection et l énumération des cellules phytoplanctoniques entre 1 m et 800 m. Cette méthode a nécessité une mise au point et a permis d effectuer des mesures reproductibles de durée inférieure à 10 min. Des groupes d espèces voire des espèces ou stades de vie ont été identifiés à la fois manuellement et en système semi-automatisé, sur la base de leurs propriétés optiques similaires.BOULOGNE-BU Droit Lettres (621602101) / SudocSudocFranceF

Succession of primary producers and micrograzers in a coastal ecosystem dominated by Phaeocystis globosa blooms

The community structures and succession of phytoplankton, protozooplankton and copepods were studied from February 2007 to July 2009 in a coastal area of the eastern English Channel subject to Phaeocystis globosa blooms. While diatom blooms preceded P. globosa blooms each year, the community structure and stock of heterotrophic protists appeared to be related to the dominant P. globosa life cycle stages. In 2007, the dominance of large colonies (> 100 mu m, up to 316 mu g C L(-1)), which resulted in a high biomass of healthy free cells (up to 132 mu g C L(-1)), accompanied high spirotrich ciliate stocks (up to 58 mu g C L(-1)) and high abundances of the copepods Acartia clausi and Temora longicornis (up to 11 ind. L(-1)). In 2008, the bloom which lasted a shorter period of time was dominated by large colonies (up to 328 mu g C L(-1)) and fewer free cells (up to 98 mu g C L(-1)). This corresponded with a lower abundance of grazers, with stocks of heterotrophic protists and copepods 1.6 times and 2.2 times lower, respectively. In 2009, the P. globosa bloom was again dominated by large colonies and < 100 mu m diatoms. This corresponded to a dominance of heterotrophic dinoflagellates among the protists (62% of the total heterotrophic protist biomass) and Acartia clausi (55% of the copepod abundance). Overall, heterotrophic dinoflagellates appeared to be likely the most important group of phytoplankton grazers