Chronic treatment with Carvedilol improves ventricular function and reduces myocyte apoptosis in an animal model of heart failure

BACKGROUND: β-blocker treatment has emerged as an effective treatment modality for heart failure. Interestingly, β-blockers can activate both pro-apoptotic and anti-apoptotic pathways. Nevertheless, the mechanism for improved cardiac function seen with β-blocker treatment remains largely unknown. Carvedilol is a non-selective β-blocker with α-receptor blockade and antioxidant properties. We therefore studied the impact of the effects of carvedilol in an animal model of end-stage heart failure. RESULTS: To test whether chronic treatment with β-blockade decreases apoptosis, we treated myopathic turkeys with two dosages of carvedilol, 1 mg/kg (DCM(1)) and 20 mg/kg (DCM(20)), for four weeks and compared them to non-treated DCM animals (DCM(0)) and to control turkeys (CON). Echocardiographic measurements showed that non-treated DCM animals had a significantly lower fractional shortening (FS) when compared to CON (68.73 ± 1.37 vs. 18.76 ± 0.59%, p < 0.001). Both doses of carvedilol significantly improved FS (33.83 ± 10.11 and 27.73 ± 6.18% vs. 18.76 ± 0.59 % for untreated DCM, p < 0.001). DCM left ventricles were characterized by a higher percentage of apoptotic nuclei when compared to CON (5.64 ± 0.49 vs. 1.72 ± 0.12%, respectively p < 0.001). Both doses of carvedilol significantly reduced the number of apoptotic nuclei (2.32 ± 0.23% and 2.36 ± 0.26% 1 mg and 20 mg/kg respectively). CONCLUSIONS: Carvedilol improves ventricular function. Furthermore, treatment with carvedilol decreased the incidence of apoptosis in cardiac myocytes from failing hearts at both doses. These data suggest that the inhibition of apoptosis with carvedilol may lead to improvement in ventricular function and may underlie a beneficial effect of β-blockade independent of heart rate lowering effects

The use of passive seismological imaging in speleogenetic studies: an example from Kanaan Cave, Lebanon

Among many parameters that control the evolution of caves stands the volume of unconsolidated clay sediments generally produced by the alteration of the calcareous rocks. Here we introduce the use of a passive seismological imaging technique to investigate the clay deposits and estimate its total volume in a cave. Applied for the first time for speleogenesis studies, the HVSR (Horizontal / Vertical Spectral Ration) is a geophysical technique that can help better interpret cave geomorphology. We apply seismological spectral techniques (H/V ratio) on ambient noise vibrations to derive the clay volume, as well as its shape. This technique applied on the clay volume reveals some internal details, such as fallen blocks prior to the deposit accumulation and helps to understand deposit evacuation dynamics. The study focuses on the Kanaan Cave, located in Metn District, Lebanon, and reveals new stages related to the cave speleogenesis. This technique could be applied on ‘paragenetic’ caves where clay volume is frequently present in order to constrain the clay volume and reconstruct the buried floor shape of the cave, underneath the clay deposit

Bcl11a is essential for lymphoid development and negatively regulates p53

Transcription factors play important roles in lymphopoiesis. We have previously demonstrated that Bcl11a is essential for normal lymphocyte development in the mouse embryo. We report here that, in the adult mouse, Bcl11a is expressed in most hematopoietic cells and is highly enriched in B cells, early T cell progenitors, common lymphoid progenitors (CLPs), and hematopoietic stem cells (HSCs). In the adult mouse, Bcl11a deletion causes apoptosis in early B cells and CLPs and completely abolishes the lymphoid development potential of HSCs to B, T, and NK cells. Myeloid development, in contrast, is not obviously affected by the loss of Bcl11a. Bcl11a regulates expression of Bcl2, Bcl2-xL, and Mdm2, which inhibits p53 activities. Overexpression of Bcl2 and Mdm2, or p53 deficiency, rescues both lethality and proliferative defects in Bcl11a-deficient early B cells and enables the mutant CLPs to differentiate to lymphocytes. Bcl11a is therefore essential for lymphopoiesis and negatively regulates p53 activities. Deletion of Bcl11a may represent a new approach for generating a mouse model that completely lacks an adaptive immune system

Caractérisation des ARN régulateurs dépendants du système à deux composants CiaRH chez Streptococcus agalactiae

International audienceStreptococcus agalactiae st la première cause d’infections néonatales humaines. Cette bactérie s’adapte à son environnement en modulant l’expression de ses gènes grâce aux ARN régulateurs pouvant eux mêmes être régulés par des systèmes à deux composants (TCS). Chez S. agalactiae, quatre ARN régulateurs potentiellement dépendants du TCS CiaRH ont précédemment été identifiés par RNAseq : Srn015, Srn024, Srn070 et Srn085. Les objectifs sont de démontrer l’implication de CiaRH dans l’expression de ces ARN, d’identifier une cible et la fonction biologique de Srn024. Cette étude a mis en évidence une régulation positive des quatre ARN par CiaRH et l’importance de la séquence promotrice TTTAAG-5N-TTTAAG dans la régulation de Srn024. Une analyse in silico a révélé une similarité de séquence entre Srn024 et l’ARNm sap, codant une pullulanase. Cette étude a démontré une régulation négative de cette cible par Srn024. La protéine Sap est connue pour être impliquée dans la dégradation des α-glucanes tel que le pullulane et dans la liaison aux cellules épithéliales cervicales humaines. Le mutant d’inactivation du gène sap empêche la croissance de S. agalactiae dans un milieu contenant comme seule source nutritive du pullulane. Ce mutant produit également moins de biofilm que la souche sauvage. Les mutants de délétion des gènes srn024 et ciaRH présentent une meilleure croissance en présence de pullulane et produisent plus de biofilm que la souche sauvage. Ces résultats suggèrent l’implication de Srn024 dans l’adaptation de S. agalactiae aux changements environnementaux et la formation de biofilm grâce à la régulation du gène sap

An Inventory of CiaR-Dependent Small Regulatory RNAs in Streptococci

International audienceBacteria adapt to the different environments encountered by rapid and tightly controlled regulations involving complex networks. A first line of control is transcriptional with regulators such as two-component systems (TCSs) that respond to physical and chemical perturbations. It is followed by posttranscriptional regulations in which small regulatory RNAs (sRNAs) may affect RNA translation. Streptococci are opportunistic pathogens for humans and farm animals. The TCS CiaRH is highly conserved among this genus and crucial in bacterial survival under stressful conditions. In several streptococcal species, some sRNAs belong to the CiaRH regulon and are called csRNAs for cia-dependent sRNAs. In this review, we start by focusing on the Streptococcus species harboring a CiaRH TCS. Then the role of CiaRH in streptococcal pathogenesis is discussed in the context of recent studies. Finally, we give an overview of csRNAs and their functions in Streptococci with a focus on their importance in bacterial adaptation and virulence

Srn024, un petit ARN nécessaire à la croissance bactérienne chez le pathogène <em>Streptococcus agalactiae</em>

National audienceIntroduction et objectif : Streptococcus agalactie est la cause majeure des infections néonatales humaines, mais aussi un pathogène émergent chez les adultes immunodéprimés. Sa capacité à coloniser différents hôtes montre son aptitude à s’adapter aux changements environnementaux, qui serait en partie due aux ARN régulateurs, très peu étudiés chez S. agalactie. L’ARN potentiellement régulateur Srn024 a été identifié par RNAseq mais sa fonction reste inconnue. Par ailleurs, il serait régulé par le système à deux composants CiaRH, qui semble impliqué dans différents processus tels que la formation de biofilm et l’antibiorésistance. L’objectif ici est d’identifier la fonction de Srn024 afin de mieux comprendre les réseaux de régulation bactériens sous le contrôle des ARN. Matériels et méthodes : La prévalence du gène srn024, identifié dans la souche S. agalactiae NEM316, première souche séquencée, a été étudiée dans 374 souches représentatives de la diversité génétique de l’espèce en utilisant des techniques de biologie moléculaire et des analyses in silico de génomes séquencés. Puis, un mutant de délétion de srn024 a été construit dans la souche NEM316. Différents phénotypes liés à CiaRH ont été recherchés dans la souche mutante : la formation de biofilm, la sensibilité aux antibiotiques et la croissance bactérienne. Résultats, discussion et conclusion : Srn024 est présent chez toutes les souches quelle que soit leur origine anatomique ou leur position phylogénétique. Le rôle biologique de Srn024 a été étudié en construisant un mutant NEM316∆srn024. Les concentrations minimales inhibitrices des différents antibiotiques testés sont identiques pour la souche sauvage et NEM316∆srn024. La formation du biofilm semble également similaire pour les deux souches. En revanche, un défaut de croissance de la souche mutante par rapport à la souche sauvage a été mis en évidence en milieu chimiquement défini (MCD) alors que ces deux souches ont une croissance identique en milieu Todd-Hewitt. Ces résultats semblent indiquer que l’ARN régulateur Srn024 permettrait à la bactérie de s’adapter en MCD. Des expériences de complémentation du phénotype de la souche mutante sont indispensables pour confirmer ces résultats. Des analyses plus poussées seront nécessaires pour comprendre le mécanisme d’adaptation de ce mutant à ce milieu

Biofilm Formation in Streptococcus agalactiae Is Inhibited by a Small Regulatory RNA Regulated by the Two-Component System CiaRH

International audienceRegulatory small RNAs (sRNAs) are involved in the adaptation of bacteria to their environment. CiaR-dependent sRNAs (csRNAs) are controlled by the regulatory twocomponent system (TCS) CiaRH, which is widely conserved in streptococci. Except for Streptococcus pneumoniae and Streptococcus sanguinis, the targets of these csRNAs have not yet been investigated. Streptococcus agalactiae, the leading cause of neonatal infections, has four conserved csRNA genes, namely, srn015, srn024, srn070, and srn085. Here, we demonstrate the importance of the direct repeat TTTAAG-N5-TTTAAG in the regulation of these csRNAs by CiaRH. A 24-nucleotide Srn024-sap RNA base-pairing region is predicted in silico. The sap gene encodes a LPXTG-cell wall-anchored pullulanase. This protein cleaves a-glucan polysaccharides such as pullulan and glycogen present in the environment to release glucose and is involved in adhesion to human cervical epithelial cells. Inactivation of S. agalactiae pullulanase (SAP) leads to no bacterial growth in a medium with only pullulan as a carbon source and reduced biofilm formation, while deletion of ciaRH and srn024 genes significantly increases bacterial growth and biofilm formation. Using a new translational fusion vector, we demonstrated that Srn024 is involved in the posttranscriptional regulation of sap expression. Complementary base pair exchanges in S. agalactiae suggest that Srn024 interacts directly with sap mRNA and that disruption of this RNA pairing is sufficient to yield the biofilm phenotype of Srn024 deletion. These results suggest the involvement of Srn024 in the adaptation of S. agalactiae to environmental changes and biofilm formation, likely through the regulation of the sap gene. IMPORTANCE Although Streptococcus agalactiae is a commensal bacterium of the human digestive and genitourinary tracts, it is also an opportunistic pathogen for humans and other animals. As the main cause of neonatal infections, it is responsible for pneumonia, bacteremia, and meningitis. However, its adaptation to these different ecological niches is not fully understood. Bacterial regulatory networks are involved in this adaptation, and the regulatory TCSs (e.g., CiaRH), as well as the regulatory sRNAs, are part of it. This study is the first step to understand the role of csRNAs in the adaptation of S. agalactiae. This bacterium does not currently exhibit extensive antibiotic resistance. However, it is crucial to find alternatives before multidrug resistance emerges. Therefore, we propose that drugs targeting regulatory RNAs with Srn024-like activities would affect pathogens by reducing their abilities to form biofilm and to adapt to host niches

Srn024, un petit ARN nécessaire à la croissance bactérienne chez le pathogène Streptococcus agalactiae

poster + "pitch" de 90 secondes de présentation du posterStreptococcus agalactie est la cause majeure des infections néonatales humaines, mais aussi un pathogène émergent chez les adultes immunodéprimés. Sa capacité à coloniser différents hôtes montre son aptitude à s’adapter aux changements environnementaux, qui serait en partie due aux ARN régulateurs, très peu étudiés chez S. agalactie. L’ARN potentiellement régulateur Srn024 a été identifié par RNAseq mais sa fonction reste inconnue [1]. Par ailleurs, il serait régulé par le système à deux composants CiaRH, qui semble impliqué dans différents processus tels que la formation de biofilm et l’antibiorésistance [2]. L’objectif ici est d’identifier la fonction de Srn024 afin de mieux comprendre les réseaux de régulation bactériens sous le contrôle des ARN.La prévalence du gène srn024, identifié dans la souche S. agalactiae NEM316, première souche séquencée, a été étudiée dans 374 souches représentatives de la diversité génétique de l’espèce en utilisant des techniques de biologie moléculaire et des analyses in silico de génomes séquencés. Puis, un mutant de délétion de srn024 a été construit dans la souche NEM316. Différents phénotypes liés à CiaRH ont été recherchés dans la souche mutante : la formation de biofilm, la sensibilité aux antibiotiques et la croissance bactérienne.Srn024 est présent chez toutes les souches quelle que soit leur origine anatomique ou leur position phylogénétique. Le rôle biologique de Srn024 a été étudié en construisant un mutant NEM316Δsrn024. Les concentrations minimales inhibitrices des différents antibiotiques testés sont identiques pour la souche sauvage et NEM316Δsrn024. La formation du biofilm semble également similaire pour les deux souches. En revanche, un retard de croissance de la souche mutante par rapport à la souche sauvage a été mis en évidence en milieu chimiquement défini (MCD) alors que ces deux souches ont une croissance identique en milieu Todd-Hewitt. Ces résultats semblent indiquer que l’ARN régulateur Srn024 permettrait à la bactérie de s’adapter en MCD. Des expériences de complémentation du phénotype de la souche mutante sont indispensables pour confirmer ces résultats. Des analyses plus poussées seront nécessaires pour comprendre le mécanisme d’adaptation de ce mutant à ce milieu

Srn024, un petit ARN impliqué dans l’adaptation du pathogène Streptococcus agalactiae à son environnement

International audienceIntroduction et objectifs : Streptococcus agalactiae est la première cause d’infections néonatales humaines et un pathogène opportuniste pour plusieurs hôtes. Afin de survivre et coloniser l’hôte, la bactérie s’adapte à son environnement en modulant l’expression de ses gènes. Les petits ARN (sRNA), impliqués dans cette régulation, peuvent eux-mêmes être régulés par les systèmes à deux composants (TCS). Chez S. agalactiae, quatre sRNA ont été identifiés par RNAseq : Srn015, Srn024, Srn070 et Srn085 [1]. Des prédictions bio-informatiques indiquent que ces sRNA, nommés csRNA, seraient régulés par le TCS CiaRH [2]. Les objectifs de ce travail sont de prouver le rôle de CiaRH dans l’expression de ces sRNA et d’identifier une cible de Srn024, afin de mieux comprendre les réseaux de régulation bactériens.Matériels et méthodes : Pour prouver l’appartenance de ces sRNA au régulon CiaR, leur expression a d’abord été quantifiée par fusions transcriptionnelles dans les souches NEM316WT, NEM316ΔciaRH et NEM316ΔciaRH::ciaRHin situ. La séquence promotrice TTTAAG-5N-TTTAAG de Srn024, qui semble indispensable à la régulation des sRNA par la protéine CiaR, a été mutée afin d’évaluer par fusion transcriptionnelle l’impact de ces mutations sur l’expression de Srn024.Des prédictions bio-informatiques ont été réalisées pour identifier les cibles potentielles de Srn024. La régulation traductionnelle des gènes cibles par Srn024 a été évaluée dans NEM316WT, NEM316Δsrn024 et NEM316Δsrn024::srn024 in situ à l’aide d’un plasmide de fusion traductionnelle construit au laboratoire.Résultats, discussion et conclusion : Les fusions transcriptionnelles ont permis de mettre en évidence une régulation positive des quatre sRNA par le TCS CiaRH. De plus, les mutations réalisées dans la séquence promotrice TTTAAG-5N-TTTAAG montrent que cette séquence est indispensable pour la régulation de Srn024 par CiaR. Les analyses bio-informatiques ont permis d’identifier l’ARNm Gbs1288 comme cible potentielle de Srn024 (-17,17 ∆g). La fusion traductionnelle a montré une régulation négative de cette cible par Srn024. Gbs1288 est une pullulanase produite en présence de pullulane et de glycogène dans la souche COH1. Cependant, cette protéine n’est pas exprimée en présence de glucose [3]. Ces résultats semblent indiquer que S. agalactiae s’adapte aux sources nutritives disponibles dans son environnement par le biais de Srn024

Is COVID-19 incriminated in new onset type 2 diabetes mellitus in Lebanese adults?

Abstract Background The effects of COVID-19 on the organism are still being investigated, especially after the transformation of this virus from a respiratory disease in its first appearance to a multi-organ disease that can affect nearly all systems and organs including the endocrinological system. The objective of the study was to find an association between COVID-19 infection and new onset type 2 diabetes in Lebanese adults. Methods A retrospective case–control study (2019–2022) included 200 subjects, 100 cases with new onset diabetes and 100 controls recruited from endocrinology clinics in rural and suburban located regions of Lebanon. Univariate and multivariate logistic regression were performed. Results Older age (aOR = 1.07; 95% CI 1.03–1.12), higher BMI (aOR = 1.32; 95% CI 1.17–1.48), having been infected with COVID-19 (aOR = 2.38; 95% CI 1.001–5.68) and having a family history of diabetes (aOR = 11.80; 95% CI 4.23–32.87) were significantly associated with higher odds of having new onset type 2 diabetes after adjusting for multiple risk factors. Conclusion In addition to the traditional risk factors for developing type 2 diabetes, a recent COVID-19 infection was associated with the new onset DM in our study. Subsequently screening for diabetes should be strongly recommended for patients post COVID-19 infection