Competitive interaction between two aquatic hyphomycete species and increase in leaf litter breakdown

Aquatic hyphomycete species produce large numbers of conidia which rapidly colonize the leaf litter that falls into rivers during autumn. Our objective was to understand how a species which produces many fewer conidia than another in laboratory conditions can nevertheless be codominant in a natural setting. In microcosm studies with two pioneer dominant species, Flagellospora curvula and Tetrachaetum elegans, inoculated on alder leaves, we first verified that the ratio of the conidium production of both species (6 to 7:1) was inverse to that of individual conidial masses (1:7) as previously described. Calculating the percentage of leaf mass loss that corresponds to 1 mg of conidial mass produced, the combination of the two species produced 2.9-fold more loss than the mean of each species. By contrast, the reproductive biomasses of F. curvula and T. elegans were 5.2- and 2.6-fold lower, respectively. As a result, the conidium production of F. curvula in the combination was only 3.2-fold that of T. elegans instead of 6- to 7-fold in pure culture. In a mixed culture of the two species, T. elegans conidia had a high germination potential (>90%) whereas the proportion of germinated F. curvula conidia was only 50%. Moreover, T. elegans reduced the area on which F. curvula could grow on poor and rich solid media. These results indicate that the dominance of F. curvula conidia in the river may be partly controlled by T. elegans and suggest that a negative interaction between microfungi may have a positive effect on the ecosystem functioning

Utilisation du biofilm comme indicateur fonctionnel pour la caractérisation et la surveillance des cours d'eau : développement et validation de dispositifs de détection et de mesure de la croissance de biofilms in situ (capteurs biofilms)

Les biofilms de rivière constituent un modèle de biofilms original intégrant une forte composante de microorganismes photosynthétiques. Comme d'autres, ce modèle a permis d'explorer les propriétés des biofilms (dynamique de colonisation, relation avec l'hydrodynamique) et doit continuer à alimenter les recherches actuelles sur les biofilms et les organismes qui les composent (électro-activité, ). Leur étude peut s'enrichir des techniques développées pour d'autres biofilms (capteurs, mesure d'épaisseur) comme nous l'avons constaté dans le cadre de ce projet. Pour plusieurs raisons, ces biofilms peuvent représenter des outils d'évaluation de la qualité de la rivière et d'aide à la décision en matière de gestion. Par exemple, au cours de leur développement, à l'interface entre l'eau et le lit de la rivière, ces biofilms intègrent des flux d'eau et d'éléments dissous importants. Dans le cas de contaminants toxiques organosolubles, leur accumulation peut notamment se produire dans la matrice d'exopolymères extracellulaires. Les microorganismes du biofilm sont alors localement exposés à des concentrations plus fortes en toxiques. La mise en oeuvre de descripteurs, comme la présence d'individus déformés par l'action tératogène du toxique, permet une détection précoce de la présence de toxiques dans un système aquatique. Au niveau des populations, les espèces de diatomées, organismes constitutifs du biofilm à un endroit donné reflètent la qualité du milieu. Des indices (IPS, DAIPo,) basés sur la composition de l'assemblage de diatomées permettent d'évaluer cette qualité de façon relativement représentative d'un cours d'eau à l'autre. A l'échelle du biofilm enfin, les flux d'éléments dissous, nutritifs ou contaminants, ont un impact sur la vitesse de colonisation du support. La mesure de cette vitesse d'accrétion peut donc constituer un indicateur de la qualité du milieu signalant certaines atteintes au milieu comme l'eutrophisation ou une contamination. Ceci justifie la recherche de moyens de détection automatisés du développement de ces biofilms qui sont à la fois témoins et acteurs du fonctionnement de la rivière, afin de progresser vers l'acquisition d'un outil de surveillance de l'état de santé des rivières