TP53, ATRX alterations, and low tumor mutation load feature IDH-wildtype giant cell glioblastoma despite exceptional ultra-mutated tumors

Background: Giant cell glioblastoma (gcGBM) is a rare morphological variant of IDH-wildtype (IDHwt) GBM that occurs in young adults and have a slightly better prognosis than "classic" IDHwt GBM. Methods: We studied 36 GBMs, 14 with a histopathological diagnosis of gcGBM and 22 with a giant cell component. We analyzed the genetic profile of the most frequently mutated genes in gliomas and assessed the tumor mutation load (TML) by gene-targeted next-generation sequencing. We validated our findings using The Cancer Genome Atlas (TCGA) data. Results: p53 was altered by gene mutation or protein overexpression in all cases, while driver IDH1, IDH2, BRAF, or H3F3A mutations were infrequent or absent. Compared to IDHwt GBMs, gcGBMs had a significant higher frequency of TP53, ATRX, RB1, and NF1 mutations, while lower frequency of EGFR amplification, CDKN2A deletion, and TERT promoter mutation. Almost all tumors had low TML values. The high TML observed in only 2 tumors was consistent with POLE and MSH2 mutations. In the histopathological review of TCGA IDHwt, TP53-mutant tumors identified giant cells in 37% of the cases. Considering our series and that of the TCGA, patients with TP53-mutant gcGBMs had better overall survival than those with TP53wt GBMs (log-rank test, P < .002). Conclusions: gcGBMs have molecular features that contrast to "classic" IDHwt GBMs: unusually frequent ATRX mutations and few EGFR amplifications and CDKN2A deletions, especially in tumors with a high number of giant cells. TML is frequently low, although exceptional high TML suggests a potential for immune checkpoint therapy in some cases, which may be relevant for personalized medicine

Desarrollo de lineamientos para la certificaci?n de sistemas sostenibles de producci?n ganadera

CATIE (Centro Agron?mico Tropical de Investigaci?n y Ense?anz

Evaluaci?n del grado de cumplimiento de la norma para ganader?a sostenible en diferentes tipolog?as de fincas en los municipios de Paiwas y R?o Blanco, Nicaragua

Ponencia presentada en: VII Congresso Latinoamericano de Sistemas Agroflorestais para a Producao Pecu?ria Sustent?velCon la finalidad de evaluar el grado de cumplimiento de la Norma para Sistemas Sostenibles de Producci?n Ganadera en diferentes tipolog?as de productores de R?o Blanco, Nicaragua, se realiz? una encuesta semiestructurada a 63 productores ganaderos de un total de 288 fincas que entregan la leche a Prolacsa Diana Ochoa, Claudia Sep?lveda, Muhammad Ibrahim, Adriana Chac?n, Gabriela Soto RESUMEN 2 La ganader?a se ha convertido en uno de los rubros de mayor importancia a nivel mundial. Sin embargo, la mayor parte de la producci?n pecuaria se ha transformado en extensiva ocasionando problemas ambientales. En Regiones como las de Centroam?rica, en los ?ltimos a?os se ha incrementado en m?s de un 10% el hato ganadero, pasando de 11.360.100 cabezas para el a?o 2000 a un total de 12.940.112 cabezas para el a?o 2007. Un caso particular tenemos en Nicaragua, en el a?o 2007, la poblaci?n bovina fue de 3.600.000 cabezas de ganado, siendo el pa?s de Centroam?rica , mediante esta encuesta se obtuvo informaci?n general de la finca, datos socioecon?micos y datos t?cnicos de la finca, con lo cual se realiz? un an?lisis de conglomerados utilizando tres variables: ?rea de la finca, producci?n, y hato ganadero. Como resultado de este an?lisis de conglomerados se obtuvo fincas peque?as, medianas y grandes, estad?sticamente diferentes (p<0,0001). Seguido de la tipificaci?n, se trabaj? con 7 fincas de cada conglomerado a las que se evalu? el cumplimiento de los 5 principios de la norma con sus respectivos criterios mediante observaci?n directa en campo. Los resultados mostraron que no existe diferencia significativa entre los diferentes grados de cumplimiento de la tipolog?a de fincas (p=0,2924). Sin embargo, las fincas peque?as y medianas presentaron mayor cumplimiento de criterios relacionados a la conservaci?n de los recursos naturales, lo que las convierte en fincas m?s sostenibles y con mayor potencial para acceder al sistema de certificaci?n de la Red de Agricultura Sostenibl

Beneficios financieros del aprovechamiento maderable sostenible en sistemas silvopastoriles de Esparza, Costa Rica

Para desarrollar la investigaci?n se realiz? un inventario de los brinzales, latizales y fustales encontrados en 135 potreros activos de 57 fincas ganaderas de Esparza, Costa Rica. Se encontr? un total de 6.549 fustales, 1.047 latizales y 2.509 brinzales de regeneraci?n natural pertenecientes a 32 familias, 54 g?neros y 63 especies arb?reas. El 66% de las especies (42 especies) fueron catalogadas como de uso maderable. Tambi?n, se encontr? un volumen promedio de 19,23 m3 ha-1 y una cobertura arb?rea de 12,44% ha-1, en donde el tama?o de las fincas (peque?as, medianas y grandes) no tuvo influencia en el volumen y cobertura arb?rea reportada. Por otro lado, se observ? que debido a la excesiva regulaci?n que existe en Costa Rica para la solicitud de tr?mites de aprovechamientos maderables, en la actualidad los ganaderos no se ven atra?dos a incorporar la producci?n de ?rboles maderables en sus potreros y por lo tanto, no se garantiza la permanencia de varias especies a futuro. Sin embargo, para aquellas fincas que cuenten con una densidad mayor o igual a 18 fustales ha-1 la actividad es rentable desde los primeros a?os. Si se utilizara un sistema de pagos por incentivos para el manejo de regeneraci?n natural o si se vendiera la madera en patio de aserradero la actividad se volver?a rentable para todas las fincas, pudiendo tener densidades de hasta seis fustales por ha-1 en un inicio, con la salvedad de que un 20% de estos deben tener un dap mayor a 30 cm.An inventory of seedlings, saplings and taper was made for 135 active paddocks of 57 cattle farms in Esparza, Costa Rica. A total of 6549 commercial sized trees, 1047 saplings and 2509 seedlings were found in natural regeneration belonging to 32 families, 54 genera and 63 species of trees. Sixty six percent of all the species (42 species) were classified for timber use. An average volume of 19.23 m3 ha-1 and a canopy cover of 12.44% ha-1 were found, where farm size (small, medium and large) had no influence on the reported volume and tree cover. On the other hand, it was found that due to excessive regulation in Costa Rica for the application of timber harvesting procedures, at present farmers are not attracted to the production of timber trees in their paddocks and therefore there is no guarantee of the permanence of various species in the future. However, for those farms which have a density greater than or equal to 18 commercial sized trees ha-1, the activity is profitable from an early age. If an incentive payment system for management of natural regeneration of trees could be used, or if timber could be sold at sawmills, the activity becomes profitable for all farms, and may have densities up to 6 per ha-1 commercial sized trees initially, except that 20% of these should have a greater than 30 cm dbh.CATIE (Centro Agron?mico Tropical de Investigaci?n y Ense?anza

An?lisis de medidas que implementadas por productores ganaderos durante un periodo de verano prolongado en Guanacaste, Costa Rica

Ponencia presentada en: VII Congresso Latinoamericano de Sistemas Agroflorestais para a Producao Pecu?ria Sustent?velEn las ?ltimas d?cadas, los efectos del cambio clim?tico han ocasionado ?pocas secas cada vez m?s extensas y/o periodos de lluvias m?s cortos para la regi?n del Pacifico Norte de Costa Rica. Estudios indican que la mayor?a de eventos extremos secos en esa regi?n se encuentran asociados al fen?meno meteorol?gico de El Ni?o (ENOS). Para el presente estudio, se tom? como referencia el periodo comprendido entre junio del 2009 y abril del 2010 por presentarse un verano seco muy prolongado (8 meses) debido a ENOS, lo que origin? un d?ficit de agua de hasta un 35% seg?n reportes del Instituto Meteorol?gico Nacional de Costa Rica(IMN). Para esto, los sistemas de producci?n se vieron en la necesidad de emplear diferentes medidas de adaptaci?n. Tres sistemas de fincas fueron identificados: 1) fincas de producci?n intensiva; uso de bancos forrajeros, pasturas mejoradas y bebederos, 2) fincas de producci?n semi intensiva; con uso de bancos forrajeros y bebederos 3) fincas con producci?n extensiva; con bajo o nulo uso de bancos forrajeros, pasturas mejoradas y bebederos. Las variables que m?s explicaron la funci?n de descarga o salida de animales por parte de los productores como ajuste en la carga animal en orden de significancia fueron la implementaci?n de bancos forrajeros (P=0.0007), pasturas mejoradas de alta densidad arb?rea (P=0.0016) y la disponibilidad que tienen los animales hacia sus bebederos (P=0.0032)

Percepci?n y medidas de adaptaci?n al cambio clim?tico implementadas en ?poca seca por productores de leche en R?o Blanco y Paiwas, Nicaragua

Ponencia presentada en: VII Congresso Latinoamericano de Sistemas Agroflorestais para a Producao Pecu?ria Sustent?velNicaragua por efecto de la sequ?a est? siendo afectada, lo que ha tra?do consigo problemas de disminuci?n de la oferta de forraje, predominio de explotaciones ganaderas; adem?s, consecuencias como la baja producci?n de leche por vaca y tama?o del hato. Frente a la problem?tica ocasionada por las sequias, existen propuestas de adaptaci?n que contemplan esencialmente el fortalecimiento de las capacidades institucionales, protecci?n de zonas de recarga para mejorar la infiltraci?n, para el fomento de la reforestaci?n; y, principalmente pr?cticas silvopastoriles. En este estudio se caracterizaron las fincas ganaderas de producci?n lechera en R?o Blanco y Paiwas, Nicaragua, con el fin de analizar la percepci?n, efectos y estrategias de adaptaci?n de los ganaderos al cambio clim?tico. Los resultados indican que existen dos sistemas de producci?n: convencionales (69,6%) y silvopastoriles (30,4%); adem?s, en la zona de estudio los ganaderos que aplican SC y SSP, tienen la misma percepci?n del cambio ocurrido en el clima (p>0,05). Las medidas que aplican los ganaderos con SSP, est?n principalmente la implementaci?n de bancos forrajeros (100%), disminuci?n de quemas (80%), presencia de ?rboles dispersos en potreros (100%), protecci?n de r?os y quebradas, y la b?squeda de capacitaci?n, mientras que los ganaderos con SC, es la b?squeda de animales resistentes a las sequias (91,84%)