Single nucleotide polymorphism discovery in elite north american potato germplasm

BACKGROUND: Current breeding approaches in potato rely almost entirely on phenotypic evaluations; molecular markers, with the exception of a few linked to disease resistance traits, are not widely used. Large-scale sequence datasets generated primarily through Sanger Expressed Sequence Tag projects are available from a limited number of potato cultivars and access to next generation sequencing technologies permits rapid generation of sequence data for additional cultivars. When coupled with the advent of high throughput genotyping methods, an opportunity now exists for potato breeders to incorporate considerably more genotypic data into their decision-making. RESULTS: To identify a large number of Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) in elite potato germplasm, we sequenced normalized cDNA prepared from three commercial potato cultivars: 'Atlantic', 'Premier Russet' and 'Snowden'. For each cultivar, we generated 2 Gb of sequence which was assembled into a representative transcriptome of (~)28-29 Mb for each cultivar. Using the Maq SNP filter that filters read depth, density, and quality, 575,340 SNPs were identified within these three cultivars. In parallel, 2,358 SNPs were identified within existing Sanger sequences for three additional cultivars, 'Bintje', 'Kennebec', and 'Shepody'. Using a stringent set of filters in conjunction with the potato reference genome, we identified 69,011 high confidence SNPs from these six cultivars for use in genotyping with the Infinium platform. Ninety-six of these SNPs were used with a BeadXpress assay to assess allelic diversity in a germplasm panel of 248 lines; 82 of the SNPs proved sufficiently informative for subsequent analyses. Within diverse North American germplasm, the chip processing market class was most distinct, clearly separated from all other market classes. The round white and russet market classes both include fresh market and processing cultivars. Nevertheless, the russet and round white market classes are more distant from each other than processing are from fresh market types within these two groups. CONCLUSIONS: The genotype data generated in this study, albeit limited in number, has revealed distinct relationships among the market classes of potato. The SNPs identified in this study will enable high-throughput genotyping of germplasm and populations, which in turn will enable more efficient marker-assisted breeding efforts in potato

Changes of the landscape village of Bialka Tatrzanska from the development tourism

Prezentowane badania ukazują rozwój zainwestowania fragmentu miejscowości Białka Tatrzańska widziany przez pryzmat obowiązujących dokumentów planistycznych. Stałemu wzrostowi liczby turystów napływających tu w związku z rozwojem infrastruktury sportowo-rekreacyjnej, w tym stacji narciarskich, towarzyszy rozwój bazy noclegowej i innych usług towarzyszących. Rozwój turystyki we wsi związany jest ze wzrostem antropopresji na obszary o wysokich walorach przyrodniczych i krajobrazowych. Na przestrzeni lat nastąpiło zwiększenie intensywności zagospodarowania turystycznego analizowanego obszaru. Polityka przestrzenna gminy jest ważnym instrumentem tworzenia warunków do zrównoważonego rozwoju na poziomie lokalnym.Constant increase of number of tourists, development of tourist accommodation and services in the village of Białka result in an increased anthropopression on areas which have so far not been developed and which are characterised by high natural values. Spatial policy of the communes is an important element in the creation of sustainable development. The authorities of the commune of Bukowina Tatrzańska struggle with investors who want to introduce changes to the spatial policy. New areas meant for investment include large areas of agricultural land as well as of forest areas

Using the 3D computer scanning method in the environmental impact assessment

This article presents the possibilities of using computer scanning to design a location for a sewage treatment plan taking into account its impact on the landscape. The activities undertaken could constitute a part of the proceedings carried out in performing environmental impact assessments. Completion of the goal requires literary studies and the analysis of interdisciplinary studies, including planning, land and academic research. The research has been divided into several parts, of which the first one concerns, among other things, the analysis of the value of the natural environment in a given area and analysis of the planning documents in place. The land research consists of scanning the area for the sewage treatment plant using the 3D method. The collected data will constitute the basis for the possibility of using computer scanning to visualise the development in an area of high landscape value

Problems of local plan implementation in the range of comunication on rural areas

Stosownie do przepisów ustawy o samorządzie gminnym, sprawy gminnych dróg, ulic, mostów, placów oraz organizacji ruchu drogowego należą do zadań własnych gminy. Zarządcą dróg gminnych jest wójt (burmistrz, prezydent miasta). Zaliczenie drogi do kategorii dróg gminnych następuje w drodze uchwały rady gminy po zasięgnięciu opinii właściwego zarządu powiatu. Z budową i utrzymaniem dróg gminnych wiążą się duże koszty obciążające budżet gmin, związane m.in. z przejęciem terenów komunikacji publicznej za odszkodowaniem, budową drogi oraz bieżącym utrzymaniem drogi (naprawa nawierzchni, odśnieżanie). Działki gruntu wydzielone pod nowe drogi publiczne lub pod poszerzenie istniejących dróg publicznych stają się z mocy z prawa własnością podmiotów publicznoprawnych z dniem, w którym decyzja o podziale stała się ostateczna lub z dniem wejścia w życie uchwały rady gminy o scaleniu i podziale nieruchomości. Gmina powinna ponadto zapewnić dostępność komunikacyjną do terenów zainwestowanych lub planowanych do zabudowy w miejscowych planach zagospodarowania przestrzennego. W pracy przedstawiono problematykę związana z zadaniami gminy w odniesieniu do dróg gminnych, a następnie wskazano błędy w projektowaniu powiązań komunikacyjnych w planach miejscowych i sposoby ich naprawy.According to law regulations about communal council (government), public roads, streets, bridges, squares and road traffic are the duty of the commune as own tasks of commune . Village-mayor (mayor, city president) is an administrator (manager) of communal roads. Passing roads to proper category of municipal roads is followed by resolution of municipal council after consultation with apropriate district administration. Communal roads construction and communal roads maintenance imply large costs which charge the budget of commune. Costs related with communal roads are such as those associated with land of public transport overtaking (overtaking for compensation), construction of road and maintenance of road (e.g. pavement repair, snow removal, etc.). Parcels allocated for new public roads or for widening existing public roads become (according to law regulations) public bodies properties [with the date on which decision of property division became final or with the date of entry into force of the resolution of municipal council of land consolidation and division]. Besides, each commune should also guarantee communication availability for invested areas or areas planned for building in local plans of spatial development. The paper presents problems concerning commune tasks with reference to communal roads. Afterwards errors in designing of communication system in local plan of spatial development and manners of their repairing were presented in following paper

Prognosis of the financial impact of adoption of the plan in the range of realization of the technical infrastructure

Uchwalenie miejscowego planu zagospodarowania przestrzennego dla gminy lub jej części zobowiązuje władze gminy do realizacji przyjętych, w drodze uchwały, zapisów planu. Wśród szeregu wydatków, jakie jest zobowiązana ponieść gmina można wymienić m.in.: realizację infrastruktury technicznej należącej do zadań własnych gminy (sieć kanalizacyjna, sieć wodociągowa), realizację inwestycji drogowych, wykup terenów na cele publiczne związane z realizacją zadań własnych gminy oraz roszczenia właścicieli lub użytkowników wieczystych w przypadku obniżenia wartości nieruchomości na skutek ustaleń miejscowego planu zagospodarowania przestrzennego. Analizą objęto koszty realizacji planu miejscowego sporządzanego dla fragmentu wsi Pietrzykowice – Rybnica, w rejonie ul. Fabrycznej, w gminie Kąty Wrocławskie.The enactment of a local plan of spatial management for a commune or its part obliges the communal authorities to implement the decisions included in the plan. Among numerous expenses which a commune has to cover are such as: realization of the technical infrastructure the commune is in charge of (sewage system, water supply system), realization of road building and maintenance investments, buying off areas for public purposes related to realization of the commune’s own tasks and claims of owners or users of real estate in case its value is negatively affected by the local plan of spatial arrangement. The costs of realization of the local plan of spatial arrangement for the area of Pietrzykowice - Rybnica, in the commune of Kąty Wrocławskie

Computer-aided planning and spatial development

Praca ma na celu ukazanie możliwości wykorzystania skanera laserowego do ochrony ekosystemów na etapie podejmowania decyzji przestrzennych. Zastosowana laserowa technika automatycznego pomiaru pozwoliła w krótkim czasie uzyskać mierzalne, w pełni obiektywne modele punktowe terenu. Uzyskany skan przetworzono nakładając teksturę dla uzyskania modelu przestrzennego, a następnie wkomponowano elementy zagospodarowania w ich naturalnym otoczeniu. Sporządzona wizualizacja może być pomocna przy wyborze najkorzystniejszego wariantu zagospodarowania przestrzeni, w tym może także prowadzić do ochrony terenu przed jego zainwestowaniem i zarazem do pozostawienia go w formie niezmienionej. Dla potrzeb badań wspomagających ochronę ekosystemów diagnozowano dwa wybrane obiekty zlokalizowane w miejscowościach Sobótka (gm. Sobótka) i Maniów Mały (gm. Mietków). Badania terenowe przeprowadzono w latach 2011/2012 r. Ustalono, że zalesienie jednego z obszaru badań zgodnie z przyjętą polityką rozwoju przestrzennego przesłoni widok na koronę zapory Zbiornika Mietkowskiego.The aim of this work is to show the possibilities of using laser scanner in ecosystems preservation on the stage of making spatial planning decisions. The laser technique of automatic measurement enabled us to get measurable and fully objective spot elevation model very quickly. Received scan was converted into spatial model by adding texture and later on merging increments of development in their natural surroundings. The visualization created can be very helpful when choosing the best option of land development; moreover, it can help protecting the land from investments leaving it in its original shape. For the purpose of the research supporting ecosystems preservation, two chosen objects, located in Sobótka (Sobótka commune) and Maniów Mały (Mietków commune), were diagnosed. Field investigations were conducted in the years 2011-2012. It was concluded that the afforestation of one of the investigated area according to the existing regional policy would block the view on the Zbiornik Mietkowski dam coping