Genetic Factors that Determine the Meat Fatty Acids Composition

In relation the nutritional attributes of beef meat quality, the composition of fatty acid is important not only because it affects the meat palatability, but also it can affect the human health. The fatty acids harmful to human health have received attenuating attention in recent years. Some studies, with taurine breed, have shown that there is a genetic variation for the trait fatty acid profile of the meat and, therefore, the possibility of genetic improvement of this trait in beef cattle. Meantime, in zebu cattle, the genetic parameter estimates for fatty acid profile are scarce. Furthermore, the trait meat fatty acid profile is something difficult and costly to measure and for this kind of trait is indicated the use of genomic selection, which is a type of marker-assisted selection. The objective of this chapter is showing the genetic variability of meat fatty acid profile different cattle breeds and makes an approach of the implement models and methods that use genomic information to improve the fatty acid composition of beef meat

Associação entre polimorfismos de base única e precocidade sexual em fêmeas da raça Nelore

As características reprodutivas estão relacionadas à eficiência econômica e à produtividade dos sistemas de criação de bovinos. A idade ao primeiro parto (IPP) e a ocorrência de prenhez precoce (OP) são empregadas em sistemas de melhoramento genético com a finalidade de antecipar a vida reprodutiva dos animais. A medida (r²) de desequilíbrio de ligação (LD) é empregada em estudos de associação genômica, para detecção de marcadores genéticos e genes que influenciam características quantitativas (quantitative trait loci: QTL). O objetivo deste estudo foi determinar o grau de desequilíbrio de ligação no genoma de fêmeas da raça Nelore e verificar a existência de associações entre polimorfismos de base única (SNP) e as características IPP e OP, utilizando um painel de SNPs de alta densidade. Foram utilizadas 1.182 fêmeas da raça Nelore nascidas em 2007 e 2008, pertencentes à Agropecuária Jacarezinho LTDA. Foram formados 13 grupos de contemporâneas (GC) constituídos por fazenda, estação e ano de nascimento, com média de 90 animais por grupo. Para o estudo de associação genômica, foram excluídos SNPs que apresentaram frequência do alelo menor (MAF) inferior a 0,05 e animais com Call Rate menor que 0,90, totalizando 431.885 SNPs. Para as análises estatísticas, foi utilizado um modelo linear para IPP e um modelo de limiar para OP. Para a estimativa da significância das associações, em ambas as características, o modelo incluiu como efeitos fixos classificatórios, o GC e os SNPs. Para estimativa do efeito de substituição alélica, foi utilizado o mesmo modelo considerando os SNPs como covariável. A correção de Bonferroni foi aplicada para ajustar o limite de significância (1,16x10-7). A média de LD (r²) para todos os autossomos foi de 0,18, a uma distância média de 4,8 kb, e a média da MAF foi de 0,25 ± 0,13...Reproductive traits are related to economic efficiency and productivity of cattle systems. Age at first calving (AFC) and occurrence of early pregnancy (OP) are used in beef breeding programs in order to anticipate the reproductive life. The measure (r²) of linkage disequilibrium (LD) is used in genome wide association studies to detect genetic markers and genes affecting quantitative traits (QTL). The aim of this study was to determine the extent of LD in the genome of Nellore cattle, and examine associations between single nucleotide polymorphisms (SNP) and AFC and OP, using a panel of high-density SNPs. Data from 1.182 Nellore born in 2007 and 2008, belonging to Agropecuária Jacarezinho were used. A total of 13 contemporary groups (CG) consisting of farm, season and year of birth, with an average of 90 animals per CG were formed. For genomic-wide association, SNPs with minor allele frequency (MAF) below 0.05, and animals with Call Rate below 0.90 were excluded, totaling 431,885 SNPs. For the statistics analyses, a linear model was used for IPP and a threshold model was used for OP. To estimate the significance of the associations, for both traits, the model included the classificatory fixed effects of GC and SNPs (0,1, and 2). To estimate the allelic substitution effect, the same model was used, considering the SNP effects as covariable. The Bonferroni correction was applied to adjust the limit of significance (1.16 x10-7). The average r ² for all autosomes was 0.18 at a distance of 4.8 kb and the average MAF was 0.25 ± 0.13. The LD decreased as the distance between markers increased: 0.35 (1 kb) to 0.12 (100 kb). Eleven significant associations were detected in seven different chromosomes (BTA1, BTA4, BTA6, BTA11, BTA17, BTA21, and BTA22). Among these, seven SNPs were associated with AFC and four were linked to the OP. Three SNPs were significant for both traits... (Complete abstract click electronic access below

Análise genética de escores visuais e suas relações com o peso de fêmeas à idade adulta na raça Nelore

Dados de 79.884 animais da raça Nelore foram utilizados para estimar parâmetros genéticos e avaliar as relações entre os escores de conformação, precocidade e musculatura obtidos à desmama e ao sobreano e o peso das fêmeas à idade adulta. Utilizou-se o método da máxima verossimilhança restrita, em análise multicaracterísticas, com modelo que incluiu os efeitos genéticos aditivos direto e residual, como aleatórios, e os efeitos fixos de grupo de contemporâneos e, como covariáveis, a idade do animal à pesagem e a idade da mãe ao parto (exceto para o peso das fêmeas à idade adulta). Os grupos contemporâneos à desmama foram definidos pelas variáveis: sexo, rebanho, ano e mês de nascimento, grupo de manejo ao nascimento e à desmama. Na definição de grupo contemporâneo ao sobreano também foi incluída a variável grupo de manejo ao sobreano. Para o peso das fêmeas à idade adulta, o grupo de contemporâneos foi composto por rebanho, ano de nascimento, grupo de manejo ao sobreano, ano e estação da pesagem. Os efeitos genético materno e de ambiente permanente materno também foram incluídos no modelo para análise dos escores de conformação, precocidade e musculatura à desmama. As estimativas de herdabilidade direta obtidas foram 0,18 ± 0,02 para o escore de conformação; 0,21 ± 0,01 para o escore de precocidade; 0,22 ± 0,01 para o escore de musculatura à desmama e 0,24 ± 0,01 para o escore de conformação; 0,27 ± 0,01 para o escore de precocidade; e 0,26 ± 0,01 para o escore de musculatura ao sobreano e 0,42 ± 0,02 para o peso das fêmeas à idade adulta. As correlações genéticas estimadas entre os escores visuais medidos à desmama e ao sobreano foram positivas, variando de média a alta magnitude (0,56 ± 0,03 a 0,85 ± 0,01). Por outro lado, as correlações genéticas estimadas entre os escores visuais e o peso das fêmeas à idade adulta foram positivas e moderadas, variando de 0,21 ± 0,03 a 0,35 ± 0,03. Os resultados obtidos indicam que a seleção de animais com maiores escores visuais, principalmente ao sobreano, deve promover aumento do peso das fêmeas à idade adulta.Data from 79,884 Nellore breed animals were used to estimate genetic parameters and to evaluate the relationships among scores of conformation, precocity and musculature obtained at weaning and after yearling ages and weight of mature females. It was used the restricted maximum likelihood method in a multi-trait analysis with the model that included direct additive genetic and residual effects, as random effects, and the fixed effects of contemporary group and, as covariables, animal age at weighing and age of dam at calving (except for weight of females at adult age). Contemporary groups at weaning were defined by the variables: sex, herd, year and month of birth, and management group at birth and weaning. For definition of contemporary group at yearling, it was also included the variable management group at yearling. For female weight at mature age, contemporary group was composed of herd, year of birth, management group at yearling, weighing year and season. Maternal genetic and maternal permanent environment effects were also included in the model for analyses of scores of conformation, precocity and muscularity at weaning. The direct herdability estimates obtained were the following: 0.18 ± 0.02 for conformation at weaning score, 0.21 ± 0.01 for precocity at weaning score, 0.22 ± 0.01 for muscularity at weaning score, 0.24 ± 0.01 for conformation at yearling score, 0.27 ± 0.01 for precocity at yearling score, and 0.26 ± 0.01 for muscularity score at yearling and 0.42 ± 0.02 for mature female weight. Genetic correlations estimated among visual scores measured at weaning and after yearling were positive, ranging from intermediate to high magnitude (0.56 ± 0.03 to 0.85 ± 0.01). on the other hand, genetic correlations estimated between visual scores and mature female weight were positive and intermediate, ranging from 0.21 ± 0.03 to 0.35 ± 0.03. The results obtained indicate that selection of animals with higher visual scores, mainly at yearling age, may promote an increase on mature female weight