Analisis Gen Haemagglutinin pada Virus Campak Liar

Penyakit Campak disebabkan oleh virus campak yang termasuk genus Morbilivirus dan Family Paramyxoviridae. Penyakit campak masih menjadi masalah kesehatan karena masih ditemukan Kejadian Luar Biasa (KLB) di Indonesia. Salah satu penyebab terjadinya KLB tersebut diduga sebagaiakibat perbedaan antigenesitas antara strain vaksin yang digunakan dengan strain virus campak liar yang beredar di Indonesia. Penelitian ini bertujuan mendapatkan gambaran tentang karakteristik genetik gen Haemagglutinin virus campak liar yang ada di Indonesia. Spesimen yang digunakan sebanyak 27 isolat virus penyebab KLB dari 17 propinsi selama periode tahun 2003-2010. Isolat virus dilakukan pemeriksaan secara RT-PCR dan sekuensing dengan metode Sanger. Hasil sekuensing dianalisis dengan menggunakan perangkat lunak Bioedit 7.0 dan MEGA 4.0. Hasil penelitian didapatkan perbedaan 10 asam amino antara virus campak strain vaksin CAM-70 dan virus campak liar pada posisi D416N; K424T; V451M; N455T; V466I; I473T; F476L; Y481S atau Y481N; H495N; G505D. Kesimpulan penelitian ini adalah terdapat perbedaan karakteristik genetik antara virus campak liar di Indonesia berbeda dengan strain virus vaksin CAM-70.Kata kunci : Campak, Analisis Molekuler, Hemagglutinin, CD46AbstractMeasles is caused by virus belonging to the genus Morbilivirus and Family Paramyxoviridae. Measles is still a public health problem because outbreak of measles still found in Indonesia. Outbreak is suspected as a result of differences in antigenicity between vaccine strains used with wild-type measles virus strains circulating in Indonesia. This study aims to get genetic characteristics of wild-type measles virus haemagglutinin gene in Indonesia. The specimens were used 27 viral isolates from 17 provinces period 2003-2010. Viral isolates examined by RT-PCR and sequencing with Sanger method. Sequencing analysis were conducted using Bioedit 7.0 and MEGA 4.0 software. The results showed 10 amino acid differences between the vaccine strain measles virus CAM-70 and wild-type measles virus in position D416N; K424T; V451M; N455T; V466I; I473T; F476L; Y481S or Y481N; H495N; G505D. Conclusion: There is a difference between the genetic characteristics of wild-type measles virus in Indonesia and vaccine strain CAM-70.Keywords : Measles, Molecular Analisys, Haemagglutinin, CD4

Uji Saring Antigen dan Antibodi Hepatitis C Virus pada Darah Donor

According to the data from Central Blood Transfusion Unit, the prevalence of hepatitis C virus (HCV) in blood donors in Indonesia and especially Jakarta in 2012 were 0.39% and 0.36% respectively. Screening of blood donor may reduce the risk of HCV transmission. Aim of this study was to know the sensitivity and specificity of the antigen-antibody serology A local of test compared to Nucleic Acid Test (NAT), should 99.8 % sensitivity and 95% specificity. 135 samples were included, 35 samples NAT HCV positive and 100 samples negative. These samples will be screened by Chemiluminescent Microparticle Immunoassay (CMIA) anti HCV, HCV Ag-Ab by enzyme linked immunosorbent assays (ELISA) and if there were differences results of NAT HCV, HCV CMIA and ELISA HCV Ag-Ab, the samples were examined using immunoblot HCV. Of the 135 samples, the Ag-Ab ELISA against 35 HCV RNA positive samples showed positive results also, but at 100 HCV RNA negative samples, the results showed 3 reactive and 97 non reactive. Moreover, the 35 HCV RNA positive samples were tested by anti-HCV CMIA showing the reactive results on 35 samples and in 100 HCV RNA negative samples, the results showed 11 reactive and 89 non reactive. Sensitivity of CMIA and NAT was 100%, specificity 89%. Sensitivity of Ag-Ab ELISA and NAT was 100% and specificity 97%. We concluded that the analysis of HCV by ELISA meets the standard criteria for screening of donor blood but not for CMIA.Keywords : Hepatitis C, Anti-HCV, HCV Ab-Ag, NATAbstrakBerdasarkan data dari Unit Transfusi Darah Pusat, prevalensi hepatitis C virus (HCV) pada darah donor di Indonesia dan Jakarta pada khususnya tahun 2012 adalah 0,39% dan 0,36%. Uji saring darah donor dapat menurunkan risiko tertular HCV. Penelitian ini bertujuan mengetahui sensitivitas dan spesifisitas pemeriksaan serologi antigen-antibodi yang memenuhi standard metoda NAT, sensitivitas 99,8% dan spesifisitas 95%. Pemeriksaan 135 darah donor, terdiri dari 35 positif dan 100 negatif dengan NAT HCV, yang diuji saring anti-HCV dengan CMIA, Ab-Ag HCV dengan ELISA dan bila ada perbedaan hasil antara NAT HCV, CMIA HCV dan ELISA Ag-Ab HCV, maka dilakukan pemeriksaan menggunakan imunoblot HCV. Dari 135 sampel, hasil ELISA Ag-Ab HCV terhadap 35 sampel positif RNA HCV juga menunjukkan hasil positif pada seluruhnya, tetapi pada 100 sampel negatif RNA HCV terdapat 3 sampel reaktif dan 97 non reaktif. Hasil pemeriksaan CMIA anti-HCV pada 35 sampel positif RNA HCV menunjukkan reaktif pada 35 sampel dan pada 100 sampel negatif RNA HCV terdapat 11 reaktif dan 89 non reaktif. Sensitivitas CMIA dengan NAT HCV 100%, spesifisitasnya 89%. Sensitivitas ELISA dengan NAT HCV 100%, spesifisitasnya 97%. Kesimpulan dari penelitian adalah pemeriksaan Antigen-Antibodi HCV ELISA memenuhi kriteria standar untuk digunakan sebagai uji saring darah donor sedangkan pemeriksaan Antibodi HCV CMIA tidak memenuhi kriteria standar sebagai uji saring darah donor.Kata kunci : Hepatitis C, Anti-HCV, Ab-Ag HCV, NA

Level of Retinol Deposit and Cervical Cancer

Objective: To analyze level of retinol deposit sufficiency in the natural history of cervical cancer. Methods: Serum retinol level was measured by ELISA from peripheral blood of subjects with normal cervix, cleared and persistent high risk human papilloma virus (HR-HPV) subclinical infection, and cervical cancer who fulfilled the inclusion and exclusion criteria. The study was held in Dr. Cipto Mangunkusumo and Fatmawati Hospital, Jakarta, within 2 years (August 2013- 2015). Blood was taken twice, consisting of post-8-hour fasting blood and 2 hours after 6000 IU retinyl palmitate oral administration. Results: Of 47 total samples, sufficient level of retinol deposit in normal cervix, cleared and persistent HR-HPV subclinical infection, and cervical cancer group was 85.0% (reference), 75.0% (OR 1.89), 33.3% (OR 11.33), and 75% (OR 1.89); respectively. Statistically, there was no significant difference from sufficiency level of retinol deposit between normal cervix and clearance HR-HPV subclinical infection (p=0.628), normal cervix and persistent HR-HPV subclinical infection (p=0.078), normal cervix and cervical cancer (p=0.433), cervical cancer and clearance HR-HPV subclinical infection (p=1.000), cervical cancer and persistent HR-HPV subclinical infection (p=0.430), persistent and clearance HR-HPV subclinical infection group (p=0.740). Conclusion: This study proves that normal cervix group has the highest level of retinol deposit sufficiency; however, it cannot be stated that cervical cancer group has less sufficiency level. Persistent HR-HPV subclinical infection group has the lowest level of retinol deposit (OR 11.33). There is no association between sufficient level of retinol deposit and clearance of HR-HPV. [Indones J Obstet Gynecol 2017; 5-1: 46-54] Keywords: cervical cancer, HR-HPV clearance, retinol deposi

Deteksi Acinetobacter Baumannii Multiresisten Obat Penghasil Biofilm Menggunakan Pewarnaan Berbasis Crystal Violet

Pendahuluan: Kasus infeksi terkait biofilm merupakan masalah besar pada dunia kesehatan karena sifat kekebalannya terhadap antibiotik dan respon imun, terutama pada kasus infeksi kronik akibat Acinetobacter baumannii. Saat ini terdapat berbagai metode deteksi pembentukan biofilm, namun pemeriksaan tersebut belum dilakukan secara rutin karena berbagai keterbatasan. Oleh karena itu, perlu dilakukan optimasi metode deteksi biofilm menggunakan bahan yang rutin tersedia di laboratorium serta mengukur proporsi sampel yang mengandung bakteri penghasil biofilm Metode: Desain penelitian ini adalah uji eksperimental. Pada penelitian ini dilakukan pengembangan deteksi pembentukan biofilm menggunakan metoda tabung microcentrifuse tube 1,5 ml berbahan polypropylene dengan zat warna berbasis crystal violet konsentrasi 0,1% dan 1%. Optimasi yang dilakukan meliputi media biakan, lama inkubasi, inokulum bakteri yang digunakan serta bahan pembilas. Isolat bakteri Pseudomonas aeruginosa ATCC 10145, A. baumannii ATCC 19606 dan Staphylococcus aureus ATCC 25923 digunakan sebagai kontrol positif dan kontrol negatif pemeriksaan yang dilakukan. Hasil: Pemeriksaan optimasi yang dilakukan, diperoleh kondisi optimal pembentukan biofilm menggunakan media Luria Bertani dengan besar inokulum 1 sengkelit penuh, lama inkubasi 30 jam dan pewarnaan dilakukan menggunakan crystal violet 0,1% serta bahan pembilas berupa PBS steril. Proporsi pembentukan biofilm pada A. baumannii multiresisten obat sebesar 55,3%. Kesimpulan: Metode deteksi pembentukan biofilm menggunakan metode tabung polypropylene yang dimodifikasi dan pewarnaan zat warna crystal violet 0,1% merupakan metode deteksi yang mudah dikerjakan, reproducible dan efisien, sehingga dapat dilakukan di laboratorium mikrobiologi klinik sederhana. Proporsi bakteri penghasil biofilm adalah lebih dari 50% A. baumannii resisten multiobat