Comment on "CAWSES November 7-8, 2004, superstorm: Complex solar and interplanetary features in the post-solar maximum phase" by B. T. Tsurutani, E. Echer, F. L. Guarnieri, and J. U. Kozyra

Recently Tsurutani et al., (2008) (Paper 1) analyzed the complex interplanetary structures during 7 to 8 November, 2004 to identify their properties as well as resultant geomagnetic effects and the solar origins. Besides mentioned paper by Gopalswamy et al., (2006) the solar and interplanetary sources of geomagnetic storm on 7-10 November, 2004 have also been discussed in details in series of other papers. Some conclusions of these works essentially differ from conclusions of the Paper 1 but have not been discussed by authors of Paper 1. In this comment we would like to discuss some of these distinctions.Comment: Submitted for publication in Geophysical Research Letter

MSHA-like pili of non-toxigenic Vibrio cholerae strains

Aim. In this study, we set out to identify the homologues of genes from the msh-cluster in the genomes of non-toxigenic V cholerae, to perform the bioinformatics analysis of their products, as well as to study the adhesive properties of strains containing altered genes. Materials and methods. We analysed 17 clinical strains of non-O1/non-O139 V cholerae and 2 strains of the O1 serogroup isolated from water bodies. Genes belonging to the msh-cluster were identified in the whole genomes using the BLASTN 2.2.29 and BioEdit 7.2.5 programs. Gene translation, comparative analysis of their nucleotide sequences and the amino acid sequences of deduced products were performed using the Vector NTI Advance 11 (Invitrogen). Results and discusssion. In 18 out of the 19 studied genomes we identified gene clusters responsible for production of adhesion pili (mshH-Q) represented by diverse alleles, the majority of which differed from the prototype genes of the msh-cluster in nucleotide composition but had the same localization and arrangement. Only one strain had a cluster that was close to that of the prototype. A bioinformatics analysis of their deduced products indicated that the amino acid sequence of the major MshA pilus subunit is homologous to the prototype only in a short N-terminal region (1-41) while sharing no similarities with the rest of the sequence. Nevertheless, this protein, similar to VcfA described by Kuroki H. et al. (2001) and designated by us as MshA-like, retained a putative pilus domain. A similar pattern was observed in the minor subunits designated as MshC-like. Other minor subunits also retained their characteristic domains. All of the strains agglutinated human erythrocytes (group O) and chicken erythrocytes, and in isolates harboring modified mshA-like and mshC-like genes the reaction was not inhibited by mannose. Since most of the studied strains were isolated from hospitalized patients, it is possible that in non-toxigenic V. cholerae lacking the pathogenicity island VPI, MSHA-like pili may serve as a colonization factor of the human intestine, in contrast to VPI-positive strains. The obtained information provides a basis for experimental verification of this assumption

ОЦЕНКА ПОСЛЕДСТВИЙ АВАРИИ НА АЭС «ФУКУСИМА-1» НАСЕЛЕНИЕМ ДАЛЬНЕГО ВОСТОКА

The article analyzes the attitude of the population in the five regions of the Far East to the consequences of the accident at the Fukushimai nuclear power plant, as well as the issues of informing about the accident. The analysis of public opinion is based on the data obtained by anonymous questionnaire survey performed in November 2011. In spite of the rather active informing and objective information on the absence of the contamination, most of the population of the Russian Far East believes that radioactive contamination is presented in the areas of their residence, and the main cause of this contamination is the nuclear accident in Japan.В статье анализируется отношение населения пяти регионов Дальнего Востока к последствиям аварии на АЭС «Фукусима-1», а также к вопросам информирования о ней. Анализ общественного мнения основан на данных, полученных методом анонимного анкетированного опроса, проведенного в ноябре 2011 г. Несмотря на довольно активное информирование и объективные сведения об отсутствии загрязнений, большая часть населения российского Дальнего Востока считает, что радиоактивные загрязнения на территории их проживания имеются, и основной причиной этих загрязнений является авария на АЭС в Японии

МИРНЫЕ ЯДЕРНЫЕ ВЗРЫВЫ В АРХАНГЕЛЬСКОЙ ОБЛАСТИ И ОТНОШЕНИЕ НАСЕЛЕНИЯ К ИХ ПОСЛЕДСТВИЯМ

The article presents survey results for local population attitude to the issue of peaceful nuclear explosions (PNE) performed in the last century on the territory of the Arkhangelsk region. Complex radiationhygienic study showed the absence of radioactive contamination in the communities most close to PNE locations. The vast majority of most socially active groups of responding population groups do not experience anxiety, they feel safe, confident and full of hope. However, they are fully aware of radiation risks related to PNE consequences. The population is willing and ready to receive objective information about PNE consequences from sources which it trusts. Recommendations on informing the public about the PNE problem are given.В статье приводятся результаты изучения отношения местного населения к проблеме мирных ядерных взрывов (МЯВ), проведенных в 1971–1988 гг. на территории Архангельской области. Комплексное радиационно-гигиеническое исследование показало отсутствие радиоактивных загрязнений в местах проживания, наиболее близко расположенных к местам осуществленных МЯВ. Подавляющее большинство опрошенных наиболее социально активных групп населения не испытывают тревоги, чувствуют себя спокойными, уверенными в себе и полными надежд. Однако они высоко оценивают опасность радиационной обстановки в связи с последствиями МЯВ. Население хочет и готово принять объективную информацию о последствиях МЯВ из источников, которым оно доверяет. Даны рекомендации по вопросам информирования населения о проблеме МЯВ

ОТНОШЕНИЕ НАСЕЛЕНИЯ ТЮМЕНСКОЙ ОБЛАСТИ К ПОСЛЕДСТВИЯМ ПРОВЕДЕНИЯ МИРНОГО ЯДЕРНОГО ВЗРЫВА «ТАВДА»

The research of radiation-hygienic situation of the region neighboring the place of peaceful nuclear explosion «Tavda» showed the absence of the release of radionuclides to the surface. There were no any publications in local massmedia for the last 5 years. The most of the respondents are not aware of this explosion. They don’t show symptoms of radio anxiety about possible consequences of this explosion. The respondents are interested in information about possible influence of radiation on their health and protective measures from radiation. The adequate Recommendations have been developed for Federal Service for Surveillance on Consumer Rights protection and Human Well-being.В результате изучения радиационно-гигиенической обстановки в месте проведения мирного ядерного взрыва «Тавда» в Тюменской области установлено отсутствие выхода радионуклидов на поверхность. Изучение информированности населения об этом взрыве показало, что за последние 5 лет какие-либо публикации об этом взрыве в местных СМИ отсутствуют, а подавляющее большинство респондентов не знает о таком событии. Анкетирование групп населения вблизи места взрыва оказало, что у респондентов нет признаков выраженной радиотревожности по поводу возможных последствий взрыва. При низком уровне радиационно-гигиенических знаний опрошенные выразили интерес к получению сведений о влиянии радиации на здоровье и о мерах защиты от радиации. Для сотрудников органов Роспотребнадзора разработаны рекомендации по методам информационной работы с населением

ПРОБЛЕМЫ ИНФОРМИРОВАНИЯ НАСЕЛЕНИЯ О ПОСЛЕДСТВИЯХ МИРНЫХ ЯДЕРНЫХ ВЗРЫВОВ

The paper provides the results of a study of the local public attitude to the problem of peaceful nuclear explosions (PNE) which were carried out in the Ivanovo, Murmansk and Perm regions and in the Republic of Sakha (Yakutia) in the last century. An estimate of the mass media information regarding consequences of the PNEs is given. The study shows that the local citizens are ready to deal with reliable sources of objective information about consequences of the PNEs. The recommendations on information of the general public about PNE are presented.В статье приводятся результаты изучения отношения местного населения к проблеме мирных ядерных взрывов (МЯВ), проведенных в прошлом веке на территории Ивановской и Мурманской областей, Пермского края и Республики Саха (Якутия). Дана оценка публикаций, имеющихся в средствах массовой информации по вопросам последствий МЯВ. Проведенное исследование показало, что население хочет и готово принять объективную информацию о последствиях МЯВ от источников, которым оно доверяет. Даны рекомендации по вопросам информирования населения о проблеме МЯВ

МикроРНК, ВПЧ-ИНФЕКЦИЯ И ЦЕРВИКАЛЬНЫЙ КАНЦЕРОГЕНЕЗ: МОЛЕКУЛЯРНЫЕ АСПЕКТЫ И ПЕРСПЕКТИВЫ КЛИНИЧЕСКОГО ИСПОЛЬЗОВАНИЯ

Cervical cancer is one of the most common cancers of the female reproductive system and a leading cause of mortality in women worldwide. Epidemiologic and experimental data have clearly demonstrated a causal role of Human Papillomavirus in cervical carcinogenesis. Determination of HPV DNA of high carcinogenic risk is relevant screening tool to identify patients with an increased risk of cervical neoplasia. However, the positive predictive value of such an analysis is not high enough. Analysis of additional indicators of infection (viral load, the ratio of episomal and integrated forms of the virus, the duration of its persistence) can be used to improve the diagnostic and prognostic value of HPV testing. In the last decade, studies have shown that HPV induces specific changes in miRNA profile of the infected cell, which reflect the phasing of the disease and may have diagnostic / prognostic value. This review summarizes the current understanding of cellular changes in the profile of microRNAs, caused by infection with HPV, given the known examples of microRNA involvement in cervical carcinogenesis and the perspectives of the possible use of microRNAs as biomarkers in the diagnosis of cervical cancer.Рак шейки матки (РШМ) является одним из самых распространенных онкологических заболеваний женской репродуктивной системы и одной из лидирующих причин женской онкологической смертности. Эпидемиологические и экспериментальные данные достоверно доказывают ключевую роль вируса папилломы человека (ВПЧ) в патогенезе РШМ. Определение ДНК ВПЧ высокого канцерогенного риска является актуальным скрининговым методом для выявления пациенток с повышенным риском развития цервикальной неоплазии. Однако положительная предсказательная ценность такого анализа недостаточно высока. Анализ дополнительных показателей инфекционного процесса (вирусная нагрузка, соотношение эписомальной и интегрированной форм вируса, длительность его персистенции) может быть использован для повышения диагностической и прогностической значимости ВПЧ-тестирования. В исследованиях последнего десятилетия показано, что ВПЧ индуцирует специфические изменения профиля микроРНК инфицированной клетки, которые отражают этапность заболевания и могут иметь диагностическое / прогностическое значение. В обзоре кратко изложены современные представления об изменениях профиля клеточных микроРНК, вызываемых инфицированием ВПЧ эпителия шейки матки, приведены известные примеры участия микроРНК в цервикальном канцерогенезе и обозначены перспективы возможного использования микроРНК в качестве биомаркеров в диагностике РШМ.

EVALUATION OF EXPRESSION OF 4 MIRNAS IN CYTOLOGICAL SAMPLES AS AN ADDITIONAL METHOD OF CERVICAL CANCER DIAGNOSIS

Introduction. Cervical cancer is the 4th most common cancer among women. The main screening method for cervical cancer is cytological examination of the cervical epithelium. This method allows to evaluate the level of cervical dysplasia (malignant potential) but it has several limitations and flaws. Development and implementation of new methods of molecular and genetic analysis in clinical practice can increase informational value of the traditional cytological examination and therefore objectivity in choosing treatment options.Objective is to develop and verify a new method of differential diagnosis of severe intraepithelial dysplasia and invasive cervical cancer.Materials and methods. The method is based on analysis of small non-coding RNA molecules (miRNAs) extracted from the material of traditional Pap smears. Based on literature search, 18 “marker” microRNA molecules were chosen and their expression levels were estimated in 166 samples of Pap smears from cervical canals with different cytological diagnoses. The analysis was performed using reverse transcription polymerase chain reaction.Results. Estimation of ratios between expression levels of miRNA pairs: 126/375; 20а/375; 126/145 allows to differentiate with high confidence borderline states of severe intraepithelial dysplasia and invasive cervical carcinoma (coefficients of quantitative interpretation of the error curve were 0.8, 0.75, 0.72, respectively).Conclusions. Analysis of miRNAs in Pap smear samples is a promising additional method of cervical cancer diagnosis. The method is objective and can be proposed as a supporting technique in cases when cytological examination doesn’t allow to differentiate between borderline pathological states of the cervical epithelium. Implementation of the method in clinical practice requires methodological optimization and additional validation using more clinical material

Radioactive elements in the environment

Indicated role of natural radioactive elements (U, Th) in geospherical layers and various environmental components is discussed. Induced radionuclide problems are examine