Amostragem de indivíduos representativos em uma população de animais da raça Canchim aparentados e genotipados.

O objetivo neste estudo foi avaliar diferentes métodos para selecionar uma amostra de uma população contendo animais aparentados, representando estratos de famílias, de forma que os animais selecionados representem toda a população. Utilizaram-se duas fontes de informação para o estudo. A primeira foi o arquivo de pedigree (animal, pai e mãe) constituído de 6.801 animais da raça Canchim, sendo 400 animais genotipados . A segunda foi a matriz de parentesco constituída pelos coeficientes de parentesco dos 400 animais genotipados, organizados na forma de matriz, com os animais nas linhas e colunas e os correspondentes coeficientes de parentesco dentro da matriz (BOURDON, 2000)

The 3′ Region of the Chicken Hypersensitive Site-4 Insulator Has Properties Similar to Its Core and Is Required for Full Insulator Activity

Chromatin insulators separate active transcriptional domains and block the spread of heterochromatin in the genome. Studies on the chicken hypersensitive site-4 (cHS4) element, a prototypic insulator, have identified CTCF and USF-1/2 motifs in the proximal 250 bp of cHS4, termed the “core”, which provide enhancer blocking activity and reduce position effects. However, the core alone does not insulate viral vectors effectively. The full-length cHS4 has excellent insulating properties, but its large size severely compromises vector titers. We performed a structure-function analysis of cHS4 flanking lentivirus-vectors and analyzed transgene expression in the clonal progeny of hematopoietic stem cells and epigenetic changes in cHS4 and the transgene promoter. We found that the core only reduced the clonal variegation in expression. Unique insulator activity resided in the distal 400 bp cHS4 sequences, which when combined with the core, restored full insulator activity and open chromatin marks over the transgene promoter and the insulator. These data consolidate the known insulating activity of the canonical 5′ core with a novel 3′ 400 bp element with properties similar to the core. Together, they have excellent insulating properties and viral titers. Our data have important implications in understanding the molecular basis of insulator function and design of gene therapy vectors

Cost-effectiveness analysis of Vaborem in Carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) -Klebsiella pneumoniae infections in Italy

Background: Vaborem is a fixed dose combination of vaborbactam and meropenem with potent activity against target Carbapenem-resistant Enterobacterales (CRE) pathogens, optimally developed for Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC). The study aims to evaluate the cost-effectiveness of Vaborem versus best available therapy (BAT) for the treatment of patients with CRE-KPC associated infections in the Italian setting. Methods: A cost-effectiveness analysis was conducted based on a decision tree model that simulates the clinical pathway followed by physicians treating patients with a confirmed CRE-KPC infection in a 5-year time horizon. The Italian National Health System perspective was adopted with a 3% discount rate. The clinical inputs were mostly sourced from the phase 3, randomised, clinical trial (TANGO II). Unit costs were retrieved from the Italian official drug pricing list and legislation, while patient resource use was validated by a national expert. Model outcomes included life years (LYs) and quality adjusted life years (QALYs) gained, incremental costs, incremental cost- effectiveness ratio (ICER) and incremental cost-utility ratio (ICUR). Deterministic and probabilistic sensitivity analyses were also performed. Results: Vaborem is expected to decrease the burden associated with treatment failure and reduce the need for chronic renal replacement therapy while costs related to drug acquisition and long-term care (due to higher survival) may increase. Treatment with Vaborem versus BAT leads to a gain of 0.475 LYs, 0.384 QALYs, and incremental costs of €3549, resulting in an ICER and ICUR of €7473/LY and €9246/QALY, respectively. Sensitivity analyses proved the robustness of the model and also revealed that the probability of Vaborem being cost-effective reaches 90% when willingness to pay is €15,850/QALY. Conclusions: In the Italian setting, the introduction of Vaborem will lead to a substantial increase in the quality of life together with a minimal cost impact, therefore Vaborem is expected to be a cost-effective strategy compared to BAT

Associação de SNPs com características de carcaça em uma população da raça Canchim.

Resumo: Foram genotipados 400 animais Canchim que apresentavam fenótipos para área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS). Após o controle de qualidade, foi realizado análise de associação dos SNPs com AOL e EGS por meio da metodologia de RandomForest. Os 400 indivíduos foram também reamostrados 10 vezes formando grupos de 200 indivíduos mais representativos e menos aparentados. Foi criado um grupo de SNPs contendo apenas os SNPs que foram selecionados em todas as análises, considerados os SNPs mais robustos totalizando 197 SNPs para AOL e 162 SNPs para EGS. Após o ajuste de uma regressão selecionou-se um conjunto de 20 SNPs para AOL com R2=0,59 e um conjunto de 17 SNPs para EGS com R2=0,49. Esses SNPs ainda precisam ser validados para então serem utilizados para seleção assistida por marcadores moleculares.SBMA 2012

Associação de SNPs com características de carcaça em uma população da raça Canchim.

Foram genotipados 400 animais Canchim que apresentavam fenótipos para área de olho de lombo (AOL) e espessura de gordura subcutânea (EGS). Após o controle de qualidade, foi realizado análise de associação dos SNPs com AOL e EGS por meio da metodologia de RandomForest. Os 400 indivíduos foram também reamostrados 10 vezes formando grupos de 200 indivíduos mais representativos e menos aparentados. Foi criado um grupo de SNPs contendo apenas os SNPs que foram selecionados em todas as análises, considerados os SNPs mais robustos totalizando 197 SNPs para AOL e 162 SNPs para EGS. Após o ajuste de uma regressão selecionou-se um conjunto de 20 SNPs para AOL com R2=0,59 e um conjunto de 17 SNPs para EGS com R2=0,49. Esses SNPs ainda precisam ser validados para então serem utilizados para seleção assistida por marcadores moleculares