Genetic evaluation for productive traits in endangered Portuguese Malhado de Alcobaça pig

Malhado de Alcobaça (MA) is a swine breed from center west Portugal, recognized in 2003. Herdbook (LGMA) has information of >17,000 animals (1985-2022). It´s a very endangered breed with only 244 sows, 18 boars and 12 breeders. Within the scope of MA’s genetic conservation plan, for genetic evaluation, genetic parameters and fixed effects were estimated for birth weight (PN), for adjusted weight at 30 d (P30) and at 90 d (P90). Pedigree records (n=16,883) and weighing records (nPN=9,198; nP30=5,799; nP90=2,429) from LGMA of 362 litters were compiled. Genetic parameters and fixed effects, genetic values and precisions were predicted for PN, P30 and P90, through BLUP, with a mixed model including fixed effects of breeder × year of birth, season of birth, sex, age of mother (linear / quadratic effect) and as random effects genetic value of animal, maternal genetic effect and permanent environmental effect of litter. Fixed effects of prolificacy and number of weaned piglets were included as covariates, respectively, in PN and P30/P90 analyses. Mean values for PN 1.32±0.28 kg, 7.16±1.6 kg P30 and 34.1±6.4 kg P90 were recorded. For PN, P30 and P90, respectively, a heritability for direct effects of 0.170±0.156, 0.145±0.161 and 0.293±0.175; a maternal heritability of 0.084±0.109, 0.124±0.173 and 0.250±0.186 and a genetic correlation between direct and maternal effects of -0.344, -0.524 and -0.174 was estimated. Permanent environmental effect of litter was 0.395±0.056 PN, 0.403±0.086 P30 and 0.129±0.047 P90. In fixed effects, a superiority was observed for males of +0.031 kg PN, +0.046 kg P30 and +0.201 P90. Breeder × year effect showed maximum differences of 0.93, 5.21 and 19.25 kg for PN, P30 and P90, respectively, with Spring being the best season of birth. Sow age at farrowing had a quadratic effect for all traits. For each increase of 1 piglet in prolificacy, PN, P30 and P90 were reduced by 4, 7 and 58 g, respectively.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Parâmetros genéticos e avaliação genética de características morfofuncionais do burro de Miranda

Apresentação oralO Burro de Miranda é uma das duas raças asininas autóctones portuguesas, que está atualmente incluída num programa de conservação e melhoramento genético. O objetivo deste estudo foi realizar a estimativa de parâmetros genéticos e a avaliação genética para as características morfofuncionais do Burro de Miranda: Altura ao Garrote (AltG), Andamentos (An), Cabeça e Pescoço (CP), Conjunto de Formas (CF), Espádua e Garrote (EG), Garupa (Ga), Membros (Me), Pelagem (Pe), Pontuação Total (PT) e Tronco (Tr). Utilizaram-se 5685 registos genealógicos e 825 a 863 dados morfofuncionais de Burros de Miranda nascidos entre 1982 e 2021, num total de 224 criadores. As estimativas dos parâmetros genéticos foram obtidas por máxima verosimilhança restrita, através do BLUP – Modelo Animal, em análises univariadas com o programa MTDFREML. O modelo animal utilizado incluiu os efeitos fixos do criador de origem, do ano de nascimento, do género, efeito linear e quadrático da idade à classificação e efeito linear da consanguinidade individual e, como efeitos aleatórios, o valor genético direto e o erro residual. As estimativas do valor da heritabilidade foram altas para a AltG (0.611 cm) e Pe (0.665 pontos), intermédias para a CP (0.216 pontos) e reduzidas para a PT, An, Tr e CF (0.027, 0.083, 0.114 e 0.153 pontos). Foram ainda estimadas as tendências genéticas da AltG, An, CP, CF, Pe, PT e Tr, por regressão do valor genético de cada característica no ano de nascimento. De um modo geral as tendências genéticas para os caracteres avaliados foram positivas, mas muito reduzidas (entre 0.0003 pontos/ano nos An e 0.0034 cm/ano na AltG). Este trabalho contribuiu para a implementação da avaliação genética nesta raça. A disponibilização dos resultados obtidos aos criadores de Burros de Miranda e poderá vir a facilitar a escolha dos futuros reprodutores e agilizar a seleção para determinadas características.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Raça suína Malhado de Alcobaça – avaliação genética 2023

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Raça equina Lusitana – avaliação genética 2023

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Susceptibility of adult female Aedes aegypti (Diptera: Culicidae) to the entomopathogenic fungus Metarhizium anisopliae is modified following blood feeding

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>The mosquito <it>Aedes aegypti</it>, vector of dengue fever, is a target for control by entomopathogenic fungi. Recent studies by our group have shown the susceptibility of adult <it>A. aegypti </it>to fungal infection by <it>Metarhizium anisopliae</it>. This fungus is currently being tested under field conditions. However, it is unknown whether blood-fed <it>A. aegypti </it>females are equally susceptible to infection by entomopathogenic fungi as sucrose fed females. Insect populations will be composed of females in a range of nutritional states. The fungus should be equally efficient at reducing survival of insects that rest on fungus impregnated surfaces following a blood meal as those coming into contact with fungi before host feeding. This could be an important factor when considering the behavior of <it>A. aegypti </it>females that can blood feed on multiple hosts over a short time period.</p> <p>Methods</p> <p>Female <it>A. aegypti </it>of the Rockefeller strain and a wild strain were infected with two isolates of the entomopathogenic fungus <it>M. anisopliae </it>(LPP 133 and ESALQ 818) using an indirect contact bioassay at different times following blood feeding. Survival rates were monitored on a daily basis and one-way analysis of variance combined with Duncan's <it>post-hoc </it>test or Log-rank survival curve analysis were used for statistical comparisons of susceptibility to infection.</p> <p>Results</p> <p>Blood feeding rapidly reduced susceptibility to infection, determined by the difference in survival rates and survival curves, when females were exposed to either of the two <it>M. anisopliae </it>isolates. Following a time lag which probably coincided with digestion of the blood meal (96-120 h post-feeding), host susceptibility to infection returned to pre-blood fed (sucrose fed) levels.</p> <p>Conclusions</p> <p>Reduced susceptibility of <it>A. aegypti </it>to fungi following a blood meal is of concern. Furthermore, engorged females seeking out intra-domicile resting places post-blood feeding, would be predicted to rest for prolonged periods on fungus impregnated black cloths, thus optimizing infection rates. It should be remembered that lowered susceptibility was only a temporary phenomenon and this may not necessarily occur when mosquitoes are infected with other fungal isolates. These results may have implications for field testing of entomopathogenic fungi by our group and further studies should be carried out to better understand the insect-fungus interaction.</p

Relative renal function estimate by renal scintigraphy with 99mTc-DMSA: influence of attenuation correction methods

Introdução – A estimativa da função renal relativa (FRR) através de cintigrafia renal (CR) com ácido dimercaptossuccínico marcado com tecnécio-99 metaestável (99mTc-DMSA) pode ser influenciada pela profundidade renal (PR), atendendo ao efeito de atenuação por parte dos tecidos moles que envolvem os rins. Dado que raramente é conhecida esta mesma PR, diferentes métodos de correção de atenuação (CA) foram desenvolvidos, nomeadamente os que utilizam fórmulas empíricas, como os de Raynaud, de Taylor ou de Tonnesen, ou recorrendo à aplicação direta da média geométrica (MG). Objetivos – Identificar a influência dos diferentes métodos de CA na quantificação da função renal relativa através da CR com 99mTc-DMSA e avaliar a respetiva variabilidade dos resultados de PR. Metodologia – Trinta e um pacientes com indicação para realização de CR com 99mTc-DMSA foram submetidos ao mesmo protocolo de aquisição. O processamento foi efetuado por dois operadores independentes, três vezes por exame, variando para o mesmo processamento o método de determinação da FRR: Raynaud, Taylor, Tonnesen, MG ou sem correção de atenuação (SCA). Aplicou-se o teste de Friedman para o estudo da influência dos diferentes métodos de CA e a correlação de Pearson para a associação e significância dos valores de PR com as variáveis idade, peso e altura. Resultados – Da aplicação do teste de Friedman verificaram-se diferenças estatisticamente significativas entre os vários métodos (p=0,000), excetuando as comparações SCA/Raynaud, Tonnesen/MG e Taylor/MG (p=1,000) para ambos os rins. A correlação de Pearson demonstra que a variável peso apresenta uma correlação forte positiva com todos os métodos de cálculo da PR. Conclusões – O método de Taylor, entre os três métodos de cálculo de PR, é o que apresenta valores de FRR mais próximos da MG. A escolha do método de CA influencia significativamente os parâmetros quantitativos de FRR.ABSTRACT: Introduction – The estimate of relative renal function (RRF) through scintigraphy with dimercaptosuccinic acid labelled with Technetium-99 metastable (99mTc-DMSA) may be influenced by kidney depth (KD), due to attenuation by soft tissue surrounding the kidneys. Considering that rarely this KD is known, several methods for attenuation correction (AC) have been developed, namely those using empirical formulae, such as Raynaud, Taylor or Tonnesen methods, or by direct calculation of the geometric mean (GM). Objectives – To identify the influence of different AC methods on RRF estimate by scintigraphy with 99mTc-DMSA and to evaluate the respective KD variability. Methods: Thirty-one patients were referred for 99mTc-DMSA scintigraphy and underwent the same acquisition protocol. Processing was performed by 2 independent operators, three times per exam, changing for the same processing the methods for the FRR determination: Raynaud’s method, Taylor’s method, Tonnesen´s method, GM and without AC (WAC). Friedman’s test was used to identify the influence of the different AC methods on RRF estimate and Pearson’s correlation test was used to evaluate the association and significance between KD and the variables age, weight and height. Results – Friedman’s test indicated that there were significant differences between methods (p=0.000), except for WAC/Raynaud, Tonnesen/GM and Taylor/GM (p=1.000) comparisons, for both kidneys. Pearson’s test showed a strong positive correlation between weight and the three methods of KD estimation. Conclusions – Taylor’s method, regarding the three methods of KD calculation, is the closest to GM. The choice of the attenuation correction method influences significantly the quantitative parameters of FRR

Raça equina Garrana – avaliação genética 2023

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Avaliação genética da raça equina garrana

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Analysis of genetic structure of portuguese sheep populations from churro branch

A diversidade e estrutura genética foram estudadas em seis raças portuguesas do grupo Churro (Badana, Galega Bragançana, Galega Mirandesa, Mondegueira, Churra da Terra Quente e Algarvia), e na raça exótica Assaf, com um conjunto de 20 microssatélites. Os dados foram analisados com a metodologia bayesiana implementada pelo software STRUCTURE. A variabilidade genética observada sugere a existência de quatro populações ancestrais na sua origem. As raças Assaf e Algarvia estão bem identificadas com populações ancestrais distintas, o que resultará do seu distanciamento geográfico relativamente às restantes raças. As outras raças Churras, cuja área de exploração é o Norte de Portugal, mostram um grau de diferenciação reduzido, e resultam de duas populações ancestrais que contribuem em maior ou menor proporção para cada raça, o que indica que provavelmente terá existido fluxo de genes entre estas raças