Development of a new ultra sensitive real-time PCR assay (ultra sensitive RTQ-PCR) for the quantification of HBV-DNA

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Improved sensitivity of HBV-DNA tests is of critical importance for the management of HBV infection. Our aim was to develop and assess a new ultra sensitive in-house real-time PCR assay for HBV-DNA quantification (ultra sensitive RTQ-PCR).</p> <p>Results</p> <p>Previously used HBV-DNA standards were calibrated against the WHO 1^stInternational Standard for HBV-DNA (OptiQuant^®HBV-DNA Quantification Panel, Accrometrix Europe B.V.). The 95% and 50% HBV-DNA detection end-point of the assay were 22.2 and 8.4 IU/mL. According to the calibration results, 1 IU/mL equals 2.8 copies/mL. Importantly the clinical performance of the ultra sensitive real-time PCR was tested similar (67%) to the Procleix Ultrio discriminatory HBV test (dHBV) (70%) in low-titer samples from patients with occult Hepatitis B. Finally, in the comparison of ultra sensitive RTQ-PCR with the commercially available COBAS TaqMan HBV Test, the in-house assay identified 94.7% of the 94 specimens as positive versus 90.4% identified by TaqMan, while the quantitative results that were positive by both assay were strongly correlated (<it>r </it>= 0.979).</p> <p>Conclusions</p> <p>We report a new ultra sensitive real time PCR molecular beacon based assay with remarkable analytical and clinical sensitivity, calibrated against the WHO 1^stInternational standard.</p

Incidência de Doenças Metabólicas em Frangos de Corte no Sul do Brasil e Uso do Perfil Bioquímico Sanguíneo para o seu Estudo

Esse trabalho foi realizado em granjas de frangos de corte localizadas no estado do Paraná (sul do Brasil). Foram consideradas 450 granjas, perfazendo uma população total de 4,5 milhões de frangos em um período de 6 meses, durante o qual foram registradas a mortalidade total e as mortes devidas a síndromes metabólicas relacionadas com síndrome ascítica e síndrome de morte súbita, entre a 1ª e a 7ª semana de vida. A mortalidade total foi de 4,8%. Desse total, 12,9% foram registrados como mortos compatíveis com síndrome ascítica e 26,4% compatíveis com síndrome de morte súbita. O pico de mortalidade esteve na 5ª semana de idade para a síndrome ascítica e na 6ª semana para a síndrome de morte súbita. Discute-se que a síndrome de morte súbita pode estar incluindo morte súbita por stress calórico. Os perfis bioquímicos do soro sangüíneo mostraram que aves acometidas por sinais compatíveis com síndrome de morte súbita se caracterizaram por hiperproteinemia, hiperlipidemia, aumentos de ácido úrico, fósforo e magnésio. Nesse caso, o perfil revelou também um choque hipovolémico, além de acidose metabólica e distúrbios no metabolismo dos lipídios. O perfil dos frangos acometidos por sinais compatíveis com síndrome ascítica mostrou depressão do metabolismo energético, evidenciado por diminuição dos níveis de glicose, colesterol e triglicerídeos, além de hipoproteinemia e hipocalcemia