New records of Peters squirrel Sciurus oculatus (Peters 1863) for Michoacán and first molecular genotyping of the species

Capturamos tres ejemplares de la ardilla de Peters (Sciurus oculatus), especie listada en protección especial y endémica del centro de México. Las capturas ocurrieron en fragmentos de bosque de encino del municipio de Huandacareo, Michoacán. Con el registro de esta población se confirma la presencia actual de la especie en el estado, ya que su último registro es de 1986 de un ejemplar colectado en Contepec. La localidad de Huandacareo extiende la distribución conocida de la especie hacia el oeste en 48 km aproximadamente con respecto a su registro más reciente. Al revisar los pocos registros de la especie para el estado, se observó que el registro más occidental de la especie, el de Ziracuaretiro (cerca de Uruapan), no se incluyó en la delimitación de su distribución, por lo que el mapa de distribución conocida debe actualizarse incluyendo todas las localidades, lo que modificaría de forma importante su distribución. Revisando la base de datos de GeneBank, notamos la inexistencia de secuencias de ADN mitocondrial de S. oculatus. En este estudio presentamos las dos primeras secuencias del gen de citocromo b (cytb) provenientes de dos individuos de S. oculatus. Las secuencias fueron comparadas en análisis filogenético con ocho especies del género Sciurus disponibles en GeneBank. En el análisis de las secuencias y árbol de UPGMA que incluyó especies de Norteamérica y de Sudamerica, S. oculatus se agrupó con S. aestuans y S. stramineus de Sudamérica, siendo S. oculatus la especie basal. Es importante que en el futuro se investigue con mayor detalle la relación de la especie en el género Sciurus. Desde la perspectiva de  conservación debe evaluarse su distribución actual en el país. Actualmente se desconoce cuántas poblaciones existen en áreas protegidas de México. La población registrada en Huandacareo parece estar aislada y su hábitat rodeado de agricultura.We captured three individuals of Peter’s squirrel (Sciurus oculatus), species listed under special protection and endemic for central Mexico. The captures occurred on oak forest fragments from Huandacareo municipality, Michoacán. With the record of this population, we confirm the species actual presence for the state, because the last record corresponded to a specimen collected in Contepec in 1986. This locality extends the species known distribution to the west approximately in 48 km from its last known record. When we reviewed the species historical records for the state, we notice that the western-most record of the species, a record from Ziracuaretiro (near to Uruapan), was not included to outline the species global distribution, therefore we consider that the present distributional map should be updated including all the localities, which will modify its distribution considerably. After surveying the GeneBank international database, we noticed that mitocondrial DNA sequences from S. oculatus were inexistent. In this work we presented the first two cytochrome b gene (cytb) sequences from two S. oculatus individuals. The sequences were compared with eight species of the Sciurus genus available in GeneBank. In the sequences analysis and UPGMA tree, which included Sciurus species from NorthAmerica and South America, S. oculatus was clustered with S. aestuans and S. stramineus from South America, resulting S. oculatus the basal species. From the conservation perspective, the species actual presencein the historical localities should be verified. No protected areas in the country are known toinclude Sciurus oculatus populations, and the Huandacareo recorded population seems to be relatively isolated, and its habitat surrounded by agriculture

Nuevo registro de jaguar (Panthera onca), en el centro occidente de México

ResumenPresentamos nuevos registros de distribución del jaguar (Panthera onca) para la región conocida como Depresión del Bajo Balsas en Michoacán. Estos registros constituyen la evidencia más clara sobre su presencia para la zona de influencia de la Reserva de la Biosfera de Zicuirán-Infiernillo. Fortalecen la hipótesis que señala zonas de Michoacán como aptas para la presencia de la especie. Es posible que la presencia del jaguar se deba a que la zona es un corredor que permite la movilidad entre poblaciones de las sierras del occidente de México y la vertiente del Pacífico.AbstractWe recorded new distribution records of jaguar (Panthera onca) for the region known as the Lower Balsas Basin in Michoacán. These records constitute the clearest evidence of the species presence on the Biosphere Reserve of Zicuirán-Infiernillo influence area. These records strengthen the hypothesis that Michoacán presents suitable areas for the jaguar presence. Is possible that the occurrance of jaguar is because the area is a corridor that allows mobility between populations in the mountains of western Mexico and Pacific slope

Patrones de distribución de felinos silvestres (Carnívora: Felidae) en el trópico seco del Centro-Occidente de México

El estado de Michoacán se caracteriza por presentar una importante heterogeneidad ambiental, en términos de clima, topografía y tipos de vegetación, que incluyen al bosque tropical seco que se encuentra en peligro de extinción a nivel mundial. Algunos trabajos mencionan la presencia de las seis especies de felinos que habitan en México, para la región; sin embargo, la evidencia para apoyar estos trabajos es escasa, por lo que llenar esta falta de información es especialmente crítico en el caso de especies o hábitats amenazados. El objetivo de este estudio fue sistematizar la información y analizar los patrones de distribución de los felinos en el estado de Michoacán, dentro del centro-occidente de México. Realizamos una revisión de la información bibliográfica y contenida en bases de datos sobre la presencia de felinos en esta región. Asimismo, realizamos trabajo de campo que en el curso de diez años donde se aplicaron distintos métodos para detectar la presencia de especies de felinos (recorrido de senderos para obtener evidencia directa e indirecta de la presencia de las especies, trampas cámara y entrevistas). Localizamos 29 registros de presencia en literatura y bases de datos. Por otra parte acumulamos un total de 1 107.5 km de transectos recorridos y 8 699 días/cámara-trampa. A través de este esfuerzo de muestreo, generamos 672 registros de presencia de las seis especies. Lynx rufusfue la especie con menos registros totales (n = 3) y cuya distribución contrastó más con la del resto de las especies. La especie con más registros fue Leopardus pardalis(n = 343). En general, el 89% de los registros de felinos se obtuvieron por debajo de los 1 000 msnm. En promedio, la temperatura media anual y la precipitación anual donde se ubicaron los registros fue de 24 °C y 1 040 mm respectivamente. La especie que mostro un patrón más claro en términos de temperatura y precipitación fue L. rufus(15.8 ± 1.3°C y 941 ± 171 mm). De acuerdo con el dendrograma resultante del análisis de conglomerados de las combinaciones de ecorregiones y tipos de vegetación se logró distinguir cinco grupos. Este estudio permite tener un panorama más completo de los patrones de distribución de los felinos en una región de importante contraste ambiental y sujeto a un fuerte impacto por las actividades humanas. Asimismo, los datos generados en este estudio pueden ayudar a profundizar nuestro entendimiento de la relación que existe entre la distribución de especies de felinos y las características del ambiente y servir como base para el desarrollo de estrategias de conservación local y regional

Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (4th edition)

In 2008, we published the first set of guidelines for standardizing research in autophagy. Since then, this topic has received increasing attention, and many scientists have entered the field. Our knowledge base and relevant new technologies have also been expanding. Thus, it is important to formulate on a regular basis updated guidelines for monitoring autophagy in different organisms. Despite numerous reviews, there continues to be confusion regarding acceptable methods to evaluate autophagy, especially in multicellular eukaryotes. Here, we present a set of guidelines for investigators to select and interpret methods to examine autophagy and related processes, and for reviewers to provide realistic and reasonable critiques of reports that are focused on these processes. These guidelines are not meant to be a dogmatic set of rules, because the appropriateness of any assay largely depends on the question being asked and the system being used. Moreover, no individual assay is perfect for every situation, calling for the use of multiple techniques to properly monitor autophagy in each experimental setting. Finally, several core components of the autophagy machinery have been implicated in distinct autophagic processes (canonical and noncanonical autophagy), implying that genetic approaches to block autophagy should rely on targeting two or more autophagy-related genes that ideally participate in distinct steps of the pathway. Along similar lines, because multiple proteins involved in autophagy also regulate other cellular pathways including apoptosis, not all of them can be used as a specific marker for bona fide autophagic responses. Here, we critically discuss current methods of assessing autophagy and the information they can, or cannot, provide. Our ultimate goal is to encourage intellectual and technical innovation in the field