A deeper look into the biodiversity of the extremely acidic copahue volcano-río agrio system in Neuquén, Argentina

The Copahue volcano-Río Agrio system, on Patagonia Argentina, comprises the naturally acidic river Río Agrio, that runs from a few meters down the Copahue volcano crater to more than 40 km maintaining low pH waters, and the acidic lagoon that sporadically forms on the crater of the volcano, which is studied for the first time in this work. We used next-generation sequencing of the 16S rRNA gene of the entire prokaryotic community to study the biodiversity of this poorly explored extreme environment. The correlation of the operational taxonomic units (OTUs)s presence with physicochemical variables showed that the system contains three distinct environments: the crater lagoon, the Upper Río Agrio, and the Salto del Agrio waterfall, a point located approximately 12 km down the origin of the river, after it emerges from the Caviahue lake. The prokaryotic community of the Copahue Volcano-Río Agrio system is mainly formed by acidic bacteria and archaea, such as Acidithiobacillus, Ferroplasma, and Leptospirillum, which have been isolated from similar environments around the world. These results support the idea of a ubiquitous acidic biodiversity; however, this highly interesting extreme environment also has apparently autochthonous species such as Sulfuriferula, Acidianus copahuensis, and strains of Acidibacillus and Alicyclobacillus.Fil: López Bedogni, Germán Agustín. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; ArgentinaFil: Massello, Francisco Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; ArgentinaFil: Giaveno Filippa, Maria Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigación y Desarrollo en Ingeniería de Procesos, Biotecnología y Energías Alternativas. Universidad Nacional del Comahue. Instituto de Investigación y Desarrollo en Ingeniería de Procesos, Biotecnología y Energías Alternativas; ArgentinaFil: Donati, Edgardo Ruben. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; ArgentinaFil: Urbieta, María Sofía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentin

Physiologic versatility and growth flexibility as the main characteristics of a novel thermoacidophilic Acidianus strain isolated from Copahue geothermal area in Argentina

A novel thermoacidophilic archaeal strain has been isolated from three geothermal acidic hot springs in Copahue, Argentina. One of the most striking characteristic of ALE1 isolate is its metabolic versatility. It grows on sulphur, tetrathionate, iron (II) and sucrose under aerobic conditions, but it can also develop under anaerobic conditions using iron (III) or sulphur as electron acceptors and sulphur or hydrogen as electron donors autotrophically. A temperature of 75 °C and a pH between 2.5 and 3.0 are strain ALE1 optimal growth conditions, but it is able to oxidise iron (II) even at pH 1.0. Cells are irregular cocci surrounded by a regularly arrayed glycoprotein layer (S-layer). Phylogenetic analysis shows that strain ALE1 belongs to the family Sulfolobaceae in the class Thermoprotei, within the phylum Crenarchaeota. Based on 16S rRNA gene sequence similarity on NCBI database, ALE1 does not have closely related relatives, neither in culture nor uncultured, which is more surprising. Its closest related species are strains of Acidianus hospitalis (91 % of sequence similarity), Acidianus infernus (90 %), Acidianus ambivalens (90 %) and Acidianus manzanensis (90 %). Its DNA base composition of 34.5 %mol C+ G is higher than that reported for other Acidianus species. Considering physiological and phylogenetic characteristics of strain ALE1, we considered it to represent a novel species of the genus Acidianus (candidatus "Acidianus copahuensis"). The aim of this study is to physiologically characterise this novel archaea in order to understand its role in iron and sulphur geochemical cycles in the Copahue geothermal area and to evaluate its potential applications in bioleaching and biooxidation.Fil: Giaveno Filippa, Maria Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Patagonia Norte. Instituto de Investigación y Desarrollo en Ingeniería de Procesos, Biotecnología y Energías Alternativas; ArgentinaFil: Urbieta, María Sofía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico la Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales (i); ArgentinaFil: Ulloa, José Ricardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Patagonia Norte. Instituto de Investigación y Desarrollo en Ingeniería de Procesos, Biotecnología y Energías Alternativas; ArgentinaFil: Toril, Elena. Instituto Nacional de Técnica Aeroespacial. Centro de Astrobiología; EspañaFil: Donati, Edgardo Ruben. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico la Plata. Centro de Investigación y Desarrollo En Fermentaciones Industriales (i); Argentin

The influence of two thermophilic consortia on troilite (FeS) dissolution

Dissolution of a natural troilite by thermophilic consortia collected from two hot springs placed in Copahue geothermal region (Neuquen - Argentina) and later enriched in specific media for sulphur-oxidisers is reported in this paper. The enrichment was carried out at a temperature (65 °C) far away from those measured in the original hot springs (40.5 °C and 87 °C) in order to analyse the flexibility of the consortia to keep viability under other temperature conditions. Different microscopic techniques (SEM, TEM, fluorescence microscopy) allowed the partial characterisation of the cultures used as inocula in the bioleaching experiments. Results show that, as other metal sulphides, troilite dissolution can be strongly catalysed by sulphur (and iron) wild oxidising microorganisms present in the consortia from Copahue hot springs. According to our results, the addition of sulphur increased the bioleaching rate although the troilite dissolution is not limited by such addition because sulphur is in situ generated by chemical oxidation. Iron solubilised from troilite was partially precipitated mainly as jarosite. An additional and interesting result of our studies indicates that natural consortia can have a wide thermal flexibility and there are some strains among them - especially archaeas from Sulfolobales genus - that are able to survive at temperatures far away from the ones registered in the place where they were collected. © 2010 Elsevier B.V.Fil: Giaveno Filippa, Maria Alejandra. Universidad Nacional del Comahue. Facultad de Ingeniería; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Pettinari, Gisela Roxana. Universidad Nacional del Comahue. Facultad de Ingeniería; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Gonzalez Toril, Elena. Consejo Superior de Investigaciones Cientificas. Instituto Nacional de Tecnica Aeroespacial.; EspañaFil: Aguilera, A.. Consejo Superior de Investigaciones Cientificas. Instituto Nacional de Tecnica Aeroespacial.; EspañaFil: Urbieta, María Sofía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; ArgentinaFil: Donati, Edgardo Ruben. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentin

Metagenome-derived draft genome sequence of acidithiobacillus ferrooxidans RV1 from an abandoned gold tailing in neuquén, Argentina

In this work we report the metagenome-derived draft genomic sequence of an enrichment culture dominated by A. ferrooxidans obtained from an airlift bioreactor inoculated with the microbial consortium recovered from the “Relave Viejo” tailing. The genome of this culture was assembled de-novo and by reference, generating a consensus assembly of 3.0 Mb. On the basis of 16S rRNA (100 % identity), average nucleotide identity analysis (99.33% identity) and in silico DNA-DNA hybridization against A. ferrooxidans ATCC 23270T (97.9%), the recovered genome is confirmed to pertain to A. ferrooxidans species. Comparative genomics results are presented to uncover the genetic traits of the variant surviving lime treatment and to further explore the genomic diversity of these model iron oxidizing species.Fil: Ulloa, José Ricardo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigación y Desarrollo en Ingeniería de Procesos, Biotecnología y Energías Alternativas. Universidad Nacional del Comahue. Instituto de Investigación y Desarrollo en Ingeniería de Procesos, Biotecnología y Energías Alternativas; ArgentinaFil: Moya Beltrán, Ana. Fundación Ciencia & Vida; ChileFil: Issotta, Francisco. Fundación Ciencia & Vida; ChileFil: Nuñez, Harold. Fundación Ciencia & Vida; ChileFil: Covarrubias, Paulo C.. Fundación Ciencia & Vida; ChileFil: Donati, Edgardo Ruben. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; ArgentinaFil: Quatrini, Raquel. Fundación Ciencia & Vida; ChileFil: Giaveno Filippa, Maria Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto de Investigación y Desarrollo en Ingeniería de Procesos, Biotecnología y Energías Alternativas. Universidad Nacional del Comahue. Instituto de Investigación y Desarrollo en Ingeniería de Procesos, Biotecnología y Energías Alternativas; Argentin