Phylogenetic analyses of the Fusarium graminearum species complex isolated from soybean in Argentina and Brazil

Soybean is one of the most economically important crops in Argentina and Brazil. However, there is limited information on the biodiversity of the FGSC from soybean as compared to other crops of large-scale growing such as wheat and maize. A phylogenetic recognition of the Fusarium graminearum species complex (FGSC) isolated from soybean in Argentina and Brazil was performed in order to identify species responsible for trichothecene production. Sequences of genes encoding for the partial translation elongation factor, the 3-O-acetyltransferase and a putative reductase were analysed by the Maximum Parsimony method. Although the present study has focused on a limited number of isolates, this is the first report that provides evidence of the presence of at least four species within the FGSC associated with soybean in Argentina: F. graminearum sensu stricto, F. cortaderiae, F. meridionale and F. boothii. In addition, F. graminearum sensu stricto was detected for the first time among Brazilian isolates from soybean.Fil: Chiotta, María Laura. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; ArgentinaFil: Alaniz Zanon, Maria Silvina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; ArgentinaFil: Giaj Merlera, Guillermo. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; ArgentinaFil: Tessmann, D.. UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ (UEM);Fil: Barros, Germán Gustavo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Chulze, Sofia Noemi. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentin

Diversity of black Aspergilli isolated from raisins in Argentina: Polyphasic approach to species identification and development of SCAR markers for Aspergillus ibericus

Aspergillus section Nigri is a heterogeneous fungal group including some ochratoxin A producer species that usually contaminate raisins. The section contains the Series Carbonaria which includes the toxigenic species Aspergillus carbonarius and nontoxigenic Aspergillus ibericus that are phenotypically undistinguishable. The aim of this study was to examine the diversity of black aspergilli isolated from raisins and to develop a specific genetic marker to distinguish A. ibericus from A. carbonarius. The species most frequently found in raisins in this study were Aspergillus tubingensis (35.4%) and A. carbonarius (32.3%), followed by Aspergillus luchuensis (10.7%), Aspergillus japonicus (7.7%), Aspergillus niger (6.2%), Aspergillus welwitschiae (4.6%) and A. ibericus (3.1%). Based on inter-simple sequence repeat (ISSR) fingerprinting profiles of major Aspergillus section Nigri members, a sequence-characterized amplified region (SCAR) marker was identified. Primers were designed based on the conserved regions of the SCAR marker and were utilized in a PCR for simultaneous identification of A. carbonarius and A. ibericus. The detection level of the SCAR-PCR was found to be 0.01. ng of purified DNA. The present SCAR-PCR is rapid and less cumbersome than conventional identification techniques and could be a supplementary strategy and a reliable tool for high-throughput sample analysis.Fil: Giaj Merlera, Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Muñoz, S.. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Coelho, I.. Universidade Federal Rural Do Rio de Janeiro; BrasilFil: Cavaglieri, Lilia Reneé. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Torres, Adriana Mabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Reynoso, Maria Marta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentin

Producción de enzimas hidrolíticas por Aspergillus sección Nigri en presencia de hidroxianisol butilado y propilparabeno en medio de cultivo de agar con extracto de cacahuete

Background In the last years, food grade antioxidants are used safely as an alternative to traditional fungicides to control fungal growth in several food and agricultural products. Aims In this work, the effect of butylated hydroxyanisole (BHA) and propyl paraben (PP) on two hydrolytic enzyme activity (β-d-glucosidase and α-d-galactosidase) by Aspergillus section Nigri species under different water activity conditions (aW; 0.98, 0.95 and 0.93) and incubation time intervals (24, 48, 72 and 96 h) was evaluated on peanut-based medium. Methods The activity of two glycosidases, β-d-glucosidase and α-d-galactosidase, was assayed using as substrates 4-nitrophenyl-β-d-glucopyranosido and 4-nitrophenyl-α-d-galactopyranosido, respectively. The enzyme activity was determined by the increase in optical density at 405 nm caused by the liberation of p-nitrophenol by enzymatic hydrolysis of the substrate. Enzyme activity was expressed as micromoles of p-nitrophenol released per minute. Results The major inhibition in β-d-glucosidase activity of A. carbonarius and A. niger was found with 20 mmol l−1 of BHA or PP at 0.98 and 0.95 aW, respectively, whereas for α-d-galactosidase activity a significant decrease in enzyme activity with respect to control was observed in A. carbonarius among 5 to 20 mmol l−1 of BHA or PP in all conditions assayed. Regarding A. niger, the highest percentages of enzyme inhibition activity were found with 20 mmol l−1 of BHA or PP at 0.95 aW and 96 h. Conclusions The results of this work provide information about the capacity of BHA and PP to inhibit in vitro conditions two of the most important hydrolytic enzymes produced by A. carbonarius and A. niger species.Antecedentes En los últimos años, para controlar el crecimiento fúngico, en lugar de los fungicidas tradicionales, tanto en la industria alimentaria como en los productos agrícolas se utilizan antioxidantes como aditivos alimentarios bien tolerados y sin riesgos de efectos adversos. Objetivos En el presente estudio, en un medio de cultivo con cacahuete, se examinó el efecto de hidroxianisol butilado (BHA) y propilparabeno (PP) sobre la actividad de 2 enzimas hidrolíticas (β-d-glucosidasa y α-d-galactosidasa) producidas por especies de Aspergillus sección Nigri, en función de diferentes valores de actividad de agua del sustrato (aW; 0,98, 0,95 y 0,93) y tiempos de incubación (24, 48, 72 y 96 h). Métodos La actividad de las 2 glucosidasas (β-d-glucosidasa y α-d-galactosidasa) se evaluó usando como sustrato 4-nitrofenil-β-d-glucopiranósido y 4-nitrofenil-α-d-galactopiranósido, respectivamente. La actividad enzimática se determinó mediante el aumento de la densidad óptica a 405 nm provocado por la liberación de p-nitrofenol, resultado de la hidrólisis enzimática del sustrato. La actividad enzimática se expresó como micromoles de p-nitrofenol liberado por minuto. Resultados La mayor inhibición en la actividad de β-d-glucosidasa de Aspergillus carbonarius y Aspergillus niger se observó con 20 mmol l−1 de BHA o PP a 0,98 y 0,95 aW, respectivamente. Comparado con el control, en A. carbonarius se detectó una disminución significativa de la actividad de α-d-galactosidasa con 5–20 mmol l−1 de BHA o PP en todas las condiciones examinadas. Con respecto a A. niger, los porcentajes mas elevados de inhibición enzimática se observaron con 20 mmol l−1 de BHA o PP a 0,95 aW y un tiempo de incubación de 96 h. Conclusiones Los resultados del presente estudio proporcionan información sobre la capacidad de BHA y PP para inhibir dos de las enzimas más importantes producidas por las especies A. carbonarius y A. niger.Fil: Barberis, Carla Lorena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Landa, Maria Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Barberis, Mauricio Gastón. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Giaj Merlera, Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Dalcero, Ana Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Magnoli, Carina Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentin

Trichothecene genotype and genetic variability of Fusarium graminearum and F. cerealis isolated from durum wheat in Argentina

Fusarium head blight (FHB) is one of the most important fungal diseases affecting wheat worldwide and it is caused mainly by species within the Fusarium graminearum species complex (FGSC). This study evaluated the presence of FGSC in durum wheat from the main growing area in Argentina and analyzed the trichothecene genotype and chemotype of the strains isolated. Also, the genetic variability of the strains was assayed using ISSR markers. Molecular analysis revealed that among the strains isolated and identified morphologically as F. graminearum, there were 14 strains identified as F. cerealis. Also, it revealed that durum wheat grains were mostly contaminated by F. graminearum, being this the only species reported so far, within the FGSC, affecting durum wheat in Argentina. Analysis of molecular variance (AMOVA) indicated a high genetic variability within rather than between F. graminearum populations. All F. graminearum strains presented 15ADON genotype and were able to produce DON while all F. cerealis strains presented the NIV genotype and most of them were able to produce this toxin. The finding of F. cerealis in durum wheat grains indicates the need for investigating if this fungus is the responsible for the NIV contamination found in wheat in Argentina.Fil: Palacios, Sofia Alejendra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Giaj Merlera, Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Erazo, Jessica Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Reynoso, Maria Marta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Farnochi, Maria Cecilia. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Torres, Adriana Mabel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentin

Development of amplified fragment length polymorphism (AFLP)-derived specific primer for the detection of Fusarium solani aetiological agent of peanut brown root rot

Aims: The objective of this work was to design an amplified fragment length polymorphism (AFLP)-derived specific primer for the detection of Fusarium solani aetiological agent of peanut brown root rot (PBRR) in plant material and soil. Methods and Results: Specific primers for the detection of the pathogen were designed based on an amplified region using AFLPs. The banding patterns by AFLPs showed that isolates from diseased roots were clearly distinguishable from others members of the F. solani species complex. Many bands were specific to F. solani PBRR, one of these fragments was selected and sequenced. Sequence obtained was used to develop specific PCR primers for the identification of pathogen in pure culture and in plant material and soil. Primer pair FS1/FS2 amplified a single DNA product of 175 bp. Other fungal isolates occurring in soil, included F. solani non-PBRR, were not detected by these specific primers. The assay was effective for the detection of pathogen from diseased root and infected soils. Conclusions: The designed primers for F. solani causing PBRR can be used in a PCR diagnostic protocol to rapidly and reliably detect and identify this pathogen. Significance and Impact of the Study: These diagnostic PCR primers will aid the detection of F. solani causing PBRR in diseased root and natural infected soils. The method developed could be a helpful tool for epidemiological studies and to avoid the spread of this serious disease in new areas.Fil: Casasnovas, F.. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; ArgentinaFil: Fantini, Emanuel Nicolás. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Palazzini, Juan Manuel. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Giaj Merlera, Guillermo. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Chulze, Sofia Noemi. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Reynoso, Maria Marta. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Torres, Adriana Mabel. Universidad Nacional de Río Cuarto. Facultad de Ciencias Exactas, Fisicoquímicas y Naturales. Departamento de Microbiología e Inmunología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin