Projet OSCREEN / Volet 2 : influence des paramètres environnementaux sur le stock d’Ostreopsis sp. macroalgal. Campagne été 2011.

Après avoir traité dans son volet 1 de la répartition géographique du stock d’Ostreopsis macroalgal, en région PACA, en Languedoc-Roussillon et en Corse, le projet OSCREEN a pour objectif dans son volet 2 de caractériser à partir de données spatialisées issues de modèles et d’imagerie satellitaire les conditions environnementales d’apparition des blooms de l’Ostreopsis macroalgal, afin de venir en appui à l’optimisation de réseaux d’alerte. La variabilité et les interférences multifactorielles empêchent de décrire des scénarii généralisables entre sites. Mais l’approche spatiale a permis de mettre en évidence le lien potentiel entre l’importance des blooms et les dessalures d’un site. Le travail suggère des pistes de recherches à développer.After determining, in its part 1, the geographical distribution of the macroalgal stock of Ostreopsis in the PACA region, Languedoc-Roussillon and Corsica, the OSCREEN project has for objective in its part 2 to characterize from spatial data producted by models and by satellite imagery the environmental conditions of appearance of the blooms of macroalgal Ostreopsis, to abut to the optimization of warning systems. Variability and multifactorial interferences prevent to describe generalized scenarios between sites. But the spatial approach has highlighted the potential link between the size of blooms and declines in salinity for a site. The work suggests paths for research to develop

Optimisation de la surveillance des masses d’eau DCE en Méditerranée. Utilisation de produits dérivés d’images satellites en complément du réseau de mesures in-situ

This study aims at showing the potential of « water colour » data derived from satellite imagery to optimise the monitoring of coastal waters within the WFD, with the French Mediterranean as a study area. The work is focused on one specific parameter, the surface chlorophyll-A (chl-a) concentration of which a monthly atlas for reference to “normal” values is provided, which consists of : (i) the monthly chl-a median computed from satellite data of 2003, 2004 and 2005 ; (ii) the integration in space of these values, represented by their average over the WFD water masses (except those of very small size) ; (iii) an indicator of the spatial variability of the chl-a through the spatial standard deviation within each water mass. Another important result is the characterisation of the ecological status of the WFD water masses by the 90th Percentile of the Chl-a concentration compared to a « good status threshold » as defined for the WFD for the Mediterranean. The study highlights the complementarity between in situ measured data, very local but precise and exhaustive, and the parameters accessible through satellite imagery that provide total coverage and allow to perform spatial analysis, and therefore to consider the notion of heterogeneity within water masses. This last aspect can have important implications in evaluating how the water masses were designed and in assessing the placement of the measuring points for a good representativity of the entire water massL’étude « optimisation » a pour but de montrer le potentiel des données « couleur de l’eau » dérivées d’imagerie satellitaire pour optimiser la surveillance des eaux côtières dans le cadre de la DCE, avec pour zone d’étude la Méditerranée française. Le travail est concentré sur un paramètre en particulier, la concentration de surface en chlorophylle-A (chl-a) dont on fournit un atlas mensuel pour référence à des valeurs normales et constitué de (i) la médiane mensuelle de la chl-a calculée sur des données satellites de 2003, 2004 et 2005 ; (ii) l’intégration dans l’espace de ces valeurs, concrétisée par leur moyenne pour chaque masse d’eau DCE (sauf celles de très petite taille) ; (iii) un indicateur de la variabilité spatiale de la chl-a au travers de l’écart type spatial au sein de chaque masse d’eau. Un autre résultat important est la caractérisation de l’état écologique des masses d’eau DCE par le Percentile 90 de la concentration Chl-a comparée au « seuil de bon état » défini pour la DCE sur la Méditerranée. L’étude fait ressortir la complémentarité entre données de mesures in situ, ponctuelles mais précises et exhaustives, et les paramètres accessibles par satellite qui offrent une couverture totale et permettent l’accès à une analyse spatiale, donc à une notion d’hétérogénéité au sein des masses d’eau. Ce dernier aspect peut avoir des implications importantes l’évaluation du découpage des masses d’eau et dans le bon placement des points de mesure pour une bonne représentation de l’ensemble d’une masse d’eau

Vérification des conditions de référence des eaux côtières de Corse. Utilisation de la plate-forme de modélisation

This report comes within convention #2007 1742 between the Water Agency for Rhône, the Mediterranean and Corsica (AERM&C) and Ifremer, with the title “Verification of the reference conditions for coastal water in Corsica – Use of the modelling platform”. It consisted of an application for Corsica of the development implemented by Ifremer within the Mediterranean coastal modelling platform. This implements the MARS-3D hydrodynamic model of Ifremer on the Mediterranean which allows to simulate currents, height of water column, salinity and temperature. The model is operational and provides data accessible to the public on the MENOR zone (North west Mediterranean) with a 1,2 km resolution. These data were utilised to provide a hydrodynamic characterisation of the Corsican coastal water masses as defined for the European Water Framework Directive. They were the base for the computation of yearly and monthly water renewal rates in the water masses for the year 2006, considered as a reference year, thus giving an indication of their sensitivity to a possible contamination. These results are presented in cartographic format in a simplified reference atlas. Model outputs on the MENOR window have also started, in preliminary tests, to be utilised as data of initial conditions and conditions to the limits to implement the model over a Corsica window with a finer resolution of 400 meters that is expected to improve the precision of the representation of the coastal hydrodynamic processes.Ce rapport s’inscrit dans le cadre de la convention N° 2007 1742 entre l’Agence de l’Eau Rhône Méditerranée et Corse (AERM&C) et l’Ifremer, intitulée « Vérification des conditions de référence des eaux côtières Corse – Utilisation de la plate-forme de modélisation ». Elle consiste en une application concernant la Corse des développement réalisés par l’Ifremer dans le cadre de la plateforme de modélisation des courants côtiers en méditerranée. Celle-ci utilise le code de calcul MARS-3D de l’Ifremer sur la Méditerranée qui permet de simuler les courants, la hauteur d’eau, la salinité et la température. Le modèle est opérationnel et fournit des données accessibles au public sur la Zone MENOR (méditerranée Nord-Ouest), à 1,2 km de résolution. Ces données ont été utilisées pour fournir une caractérisation hydrodynamique de masses d’eau corses définies pour la Directive Européenne Cadre sur l’Eau. Elles ont fourni la base pour le calcul des temps de renouvellement annuel et mensuel des masses d’eau pour l’année 2006, considérée comme une année type, donnant ainsi une indication de leur sensibilité à une contamination éventuelle. Ces résultats sont présentés sous forme cartographique dans un atlas de référence simplifié. Les sorties du modèle sur l’emprise MENOR ont en outre été utilisées comme données de conditions initiales et conditions aux limites pour effectuer des simulations sur une fenêtre CORSE, avec une maille plus fine de 400 m qui devrait permettre, à moyen terme, d’affiner les résultats et refléter plus précisément les phénomènes hydrodynamiques côtiers

Suivi de la végétation en zone sèche par des produits d‘information dérivés de l‘imagerie spatiale

peer reviewe

Ostreopsis cf. ovata in the French Mediterranean coast: molecular characterisation and toxin profile

The presence of dinoflagellates of the genus Ostreopsis along Mediterranean coasts was first observed in 1972, in the bay of Villefranche-sur-Mer. However, over the past ten years, harmful events related to this benthic dinoflagellate have been reported in Italian, Spanish, Greek, French, Tunisian and Algerian coastal areas. In France, during a hot period in August 2006, cases of dermatitis and respiratory problems were registered in Marseille area. At that time, a link to the proliferation of Ostreopsis was highlighted for the first time in that area. A specific monitoring was designed and implemented in the summer 2007. Two strains of Ostreopsis cf. ovata, collected in 2008 from Villefranche-sur-Mer and Morgiret coastal waters and grown in culture, were identified by molecular analysis and studied to characterise their growth and toxin profile. Liquid chromatography-mass spectrometry (LC-MS/MS) indicated that both strains produced ovatoxin-a (OVTX-a) as the major component (ca. 90%), and traces of palytoxin (PLTX). Toxin content was determined at the end of the exponential growth phase with highest concentration of 55 pg.cell(-1) of OVTX-a and 2.5 pg.cell(-1) of PLTX

Le Référentiel Benthique Méditerranéen (REBENT MED)

The Mediterranean benthic network proposes an integrated approach in term of scientific research and monitoring networks dealing with benthic biocenosis in the Mediterranean Sea (French part) ; it gives a state of the art as well as future needs, regarding regulatory aspects and data storage.L’avant projet sommaire du REBENT Méditerranée propose une approche intégrée des recherches et surveillances portant sur les biocénoses benthiques en Méditerranée ; il dresse un état de l’art des connaissances en la matière ainsi que des besoins futurs, en ciblant sur l’écoute de la demande sociétale et des cadres de gestion, ainsi que la bancarisation des donnée