Insights from the genome of the biotrophic fungal plant pathogen Ustilago maydis

Ustilago maydis is a ubiquitous pathogen of maize and a well-established model organism for the study of plant-microbe interactions. This basidiomycete fungus does not use aggressive virulence strategies to kill its host. U. maydis belongs to the group of biotrophic parasites (the smuts) that depend on living tissue for proliferation and development. Here we report the genome sequence for a member of this economically important group of biotrophic fungi. The 20.5-million-base U. maydis genome assembly contains 6,902 predicted protein-encoding genes and lacks pathogenicity signatures found in the genomes of aggressive pathogenic fungi, for example a battery of cell-wall-degrading enzymes. However, we detected unexpected genomic features responsible for the pathogenicity of this organism. Specifically, we found 12 clusters of genes encoding small secreted proteins with unknown function. A significant fraction of these genes exists in small gene families. Expression analysis showed that most of the genes contained in these clusters are regulated together and induced in infected tissue. Deletion of individual clusters altered the virulence of U. maydis in five cases, ranging from a complete lack of symptoms to hypervirulence. Despite years of research into the mechanism of pathogenicity in U. maydis, no 'true' virulence factors had been previously identified. Thus, the discovery of the secreted protein gene clusters and the functional demonstration of their decisive role in the infection process illuminate previously unknown mechanisms of pathogenicity operating in biotrophic fungi. Genomic analysis is, similarly, likely to open up new avenues for the discovery of virulence determinants in other pathogens. ©2006 Nature Publishing Group.J.K., M. B. and R.K. thank G. Sawers and U. Kämper for critical reading of the manuscript. The genome sequencing of Ustilago maydis strain 521 is part of the fungal genome initiative and was funded by National Human Genome Research Institute (USA) and BayerCropScience AG (Germany). F.B. was supported by a grant from the National Institutes of Health (USA). J.K. and R.K. thank the German Ministry of Education and Science (BMBF) for financing the DNA array setup and the Max Planck Society for their support of the manual genome annotation. F.B. was supported by a grant from the National Institutes of Health, B.J.S. was supported by the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada and the Canada Foundation for Innovation, J.W.K. received funding from the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada, J.R.-H. received funding from CONACYT, México, A.M.-M. was supported by a fellowship from the Humboldt Foundation, and L.M. was supported by an EU grant. Author Contributions All authors were involved in planning and executing the genome sequencing project. B.W.B., J.G., L.-J.M., E.W.M., D.D., C.M.W., J.B., S.Y., D.B.J., S.C., C.N., E.K., G.F., P.H.S., I.H.-H., M. Vaupel, H.V., T.S., J.M., D.P., C.S., A.G., F.C. and V. Vysotskaia contributed to the three independent sequencing projects; M.M., G.M., U.G., D.H., M.O. and H.-W.M. were responsible for gene model refinement, database design and database maintenance; G.M., J. Kämper, R.K., G.S., M. Feldbrügge, J.S., C.W.B., U.F., M.B., B.S., B.J.S., M.J.C., E.C.H.H., S.M., F.B., J.W.K., K.J.B., J. Klose, S.E.G., S.J.K., M.H.P., H.A.B.W., R.deV., H.J.D., J.R.-H., C.G.R.-P., L.O.-C., M.McC., K.S., J.P.-M., J.I.I., W.H., P.G., P.S.-A., M. Farman, J.E.S., R.S., J.M.G.-P., J.C.K., W.L. and D.H. were involved in functional annotation and interpretation; T.B., O.M., L.M., A.M.-M., D.G., K.M., N.R., V. Vincon, M. VraneŠ, M.S. and O.L. performed experiments. J. Kämper, R.K. and M.B. wrote and edited the paper with input from L.-J.M., J.G., F.B., J.W.K., B.J.S. and S.E.G. Individual contributions of authors can be found as Supplementary Notes

Status quo and future challenges for the research infrastructure in the field of culture

The term "culture" is notorious for the multitude of its meanings. This expertise strictly focuses on culture in terms of the arts. We adopt a sociological as well as an economic perspective. Research questions are subdivided into three spheres of action: artistic production and its organization; the distribution and valuation of culture; and the consumption and reception of culture. The data requirements and the availability of adequate data vary substantively, depending on artistic branches (music, performing arts, etc.) and specific research questions. In order to make the empirical investigation of culture a flourishing field, we recommend the following improvements of the data infrastructure: firstly, comprehensive surveys of artists on the one hand and cultural consumption on the other hand should be carried out with the support of public funding; secondly, a national cultural statistic should be established, illuminating the size, impact and evolution of the cultural sector in comparative perspective; thirdly, the public availability of organization-level data as well as communal surveys on cultural production and consumption issues should be improved; fourthly, the transparency of existing data sources and their accessibility should be improved by archiving them centrally, e.g. at the ZA

Culture

The term “culture” is notorious for its multitude of meanings. This advisory report strictly focuses on culture in terms of the arts. We adopt a sociological as well as an economic perspective. Research questions are subdivided into three spheres: artistic production and its organization; the distribution and valuation of culture; and the consumption and reception of culture. The data requirements and the availability of adequate data vary substantively, depending on artistic branches (music, performing arts, etc.) and specific research questions. In order to make the empirical investigation of culture a flourishing field, we recommend the following improvements in data infrastructure: first, comprehensive surveys of artists on the one hand, and cultural consumption on the other, should be carried out with the support of public funding; second, a national cultural statistic should be established, illuminating the size, impact, and evolution of the cultural sector in comparative perspective; third, the public availability of organization-level data as well as communal surveys on cultural production and consumption issues should be improved; fourth, the transparency of existing data sources and their accessibilit

Lebensstile in der Soziologie

Der Beitrag skizziert die Entstehungsgeschichte und die Probleme der Lebensstilforschung. Dabei werden unter anderem auch die Besonderheiten der deutschsprachigen im Vergleich zur internationalen Forschung hervorgehoben. Vor diesem Hintergrund werden eine Definition und eine Typologie der empirischen Konzeptualisierungen von Lebensstilen entwickelt. Insbesondere wird das Verhältnis zum Wertbegriff und zum Milieukonzept präzisiert. Im Anschluss werden die zukunftsweisenden Erträge der Beiträge zu diesem Band zur Erklärung von Lebensstilen, zur Bedeutung der angebotsseitigen Produktion von Lebensstilen und zu den Konsequenzen von Lebensstilen zusammengefasst. Es wird nicht nur eine Bilanz der Resultate gezogen, sondern es werden auch zentrale Fragen für die zukünftige Lebensstilforschung aufgeworfen

Sind Deutschschweizer altruistischer als Deutsche? Ein Vergleich des Konsums fair gehandelter Produkte in Deutschland und der Schweiz

Kooperatives und altruistisches, von sozialen Normen geleitetes Handeln ist ein klassisches Thema der Sozialwissenschaften. Der Beitrag knüpft an diese Thematik an, indem er eine spezifische Form des organisierten Altruismus in industrialisierten individualistischen Gesellschaften betrachtet. So ist festzustellen, dass Markthandeln immer stärker mit normativen Ansprüchen konfrontiert und zum Teil auch immer stärker durch normative Ansprüche geregelt wird. Der Aufsatz analysiert dieses Phänomen am Beispiel der Nachfrage nach fair gehandelten Produkten. Für diese zeigt sich, dass es deutliche Unterschiede im Konsumniveau zwischen verschiedenen Ländern gibt. Im Sinne eines „most similar design“ werden in dieser Studie die Unterschiede im Konsum fair gehandelter Lebensmittel für zwei benachbarte und vergleichsweise ähnliche Länder – der Bundesrepublik Deutschland und der Schweizerischen Eidgenossenschaft – untersucht. Ein solcher auf zwei Länder fokussierter Vergleich ermöglicht detaillierte Messungen der erklärenden Variablen. Die Analysen basieren auf Umfragedaten, die auf der Grundlage von Zufallsstichproben in Zürich und Köln gewonnen wurden. Die empirischen Resultate zeigen, dass vor allem die Verfügbarkeit von fair gehandelten Produkten und die persönliche Norm zum Kauf dieser Produkte die Länderunterschiede erklären, während das verfügbare Einkommen keinen Erklärungsbeitrag leistet

Was ist ein typischer Arbeiter? Stereotype über soziale Schichten

Akteure nehmen in Interaktionen immer wieder soziale Kategorisierungen von anderen Personen vor und aktivieren die entsprechenden Stereotypen über diese Kategorien. Sowohl in der Sozialpsychologie als auch in der Soziologie fokussiert allerdings die Forschung auf die Untersuchung askriptiver Sozialkategorien, während Konzepte wie Klasse und Schicht weitgehend ausgeblendet bleiben. In diesem Aufsatz wird argumentiert, dass diese Kategorien in der Bevölkerung weithin bekannt und mental zugänglich sind sowie in entsprechenden Situationen auch aktiviert werden. Damit sind sie auch für die Orientierung in alltäglichen Interaktionssituationen relevant. Auf der Grundlage einer Onlineumfrage wird demonstriert, dass die Stereotypkontraste zwischen verschiedenen sozialen Schichten vor allem durch sozioökonomische Merkmale sowie durch hochkulturelle Lebensstilmerkmale bestimmt werden, während Persönlichkeitsmerkmale eine geringere Bedeutung aufweisen