Patolojik ultrason bulgulu fetuslarda PTPN11 gen analiz sonuçları

Hücre siklusunun düzenlenmesi, büyüme, farklılaşma, yaşlanma ve gelişmede önemli fonksiyonları olanRAS-MAPK yolağı genlerindeki mutasyonların yol açtığı hastalıklar Rasopati grubu olarak adlandırılır. Buhastalıklar fenotipik olarak örtüşen bir grup sendromu oluştururlar. Bunlar arasında en sıklıkla gözlenen(1:1000-1500) Noonan sendromu’ dur (NS). Bugüne kadar NS, 18 farklı gendeki otozomal dominantmutasyonlar ile ilişkilendirilmiştir. NS olguların ~%50 sinde PTPN11 geni mutasyonu saptanmaktadır.Yapılan prenatal çalışmalarda PTPN11 geninde mutasyonların 3, 7, 8 ve 13. ekzonda yığılma gösterdiğibildirilmektedir (Lee BH, J Pediatr. 2011).NS, prenatal ultrasonografide nukal kalınlık, kardiyak anomali, lenfatik sistem anomalileri (kistik higroma,plevral efüzyon, asit, vd), polihidramnios, kemik boyu kısalığı, böbrek anomalileri, makrosefali gibibulgular gösterebilir. Literatürde, kromozom anomalileri dışlanmış, NT bulgusu olan, olgu grubundaPTPN11 geni mutasyon oranı %2-3, lenfatik sistem anomalilerinde >%10 olarak verilmektedir.Bu çalışmada patolojik ultrason bulgusu olan, kromozom anomalisi dışlanmış 242 prenatal olguda PTPN11geni mutasyon oranları araştırıldı. Olguların 40’ ında genin tüm ekzonları (ekzon1-14), 202’sinde isesıklıkla mutasyon saptanan seçilmiş (ekzon 3, 4, 7, 8, 13 ve 14.) ekzonlar Sanger dizileme yöntemi ileincelendi. 5 olguda (%2,1) PTPN11 geninde seçilmiş ekzonlarda mutasyon saptandı. Mutasyon saptananolgularda çoklu ultrason bulguları mevcuttu.Kromozom anomalisi dışlanmış, ultrason bulguları nedeniyle Noonan spektrumu dışlanması planlananolgularda; PTPN11 geninin hedef ekzon mutasyon analizinin ilk aşamada Sanger dizileme ile, mutasyonsaptanmayan olgularda ise genin diğer ekzonları ve ilişkili diğer genlerin yeni nesil dizileme tekniği ileincelenmesinin prenatal tanıda genetik danışma ve gebeliğin klinik yönlendirilmesi açısından uygun biryaklaşım olacağını düşünmekteyiz.Anahtar Kelimeler: PTPN11, Patolojik USG, Noonan spektrum

Tüm Ekzom Dizilemenin Zayıf Noktaları

Tüm ekzom dizileme (TED), Tıbbi Genetik çalışmalarında patojenik varyant saptama ve ilişkiligen tanımlama amacı ile her geçen gün daha sıklıkla uygulanmaya başlamıştır. Klinik genetiktetanıya olan katkısının olgu gruplarına bağlı olarak %10 ile %60 arasında olduğubildirilmektedir. TED ile mutasyon saptanmamasında biyolojik (dokusal mozaisizm), tekniğindoğal limitler (derin intronik, regülatör ve intergenik bölgelerin kapsanmaması, büyük boyutlutranslokasyon, delesyon ve duplikasyonlar, UPD vd) ve yöntem içerikli sorunlar etkin roloynamaktadır. Bu çalışmada, patojenik varyant saptanmayan TED örneklerindeki olası teknikve yöntemsel kısıtlılıklar, uygulamanın başı olan kütüphane hazırlığından sonuç aşamasınakadar geçen süreç için araştırıldı ve ideal bir algoritma belirlenmeye çalışıldı.En başta gelen sorunlar kapsanmayan ekzonik bölgeler, yetersiz tekrar sayısı, varyant çağırmaparametrelerinin karşılanmaması olarak belirlendi.TED incelemesinde mutasyon saptanmayan örneklerde test verilerinin özellikle bu açılardantekrar değerlendirilmesi önemlidir

Genetik ve Multidisipliner Yaklaşımlar

Nefrotik sendrom (NS), nefrotik-düzeyde proteinüri, hipoalbuminemi, hiperlipidemi veödem bulgularıyla karakterize bir hastalıktır. Podositoloji ve genetik alanındaki gelişmeler NS’unmoleküler patolojisi konusundaki bilgilerimizi çoğaltmıştır. Çocuklardaki en yaygın formu nefrit vediğer ilişkili böbrek dışı bulguları olmaksızın gelişen primer (idiyopatik) NS’dur ve steroide duyarlıNS (SSNS) olarak tanımlanır. SSNS’ların %8-10’unda genetik köken saptandığı bildirilir. Dört haftalıksteroid tedavisine karşın proteinürisi devam eden olgulardaki durum ise steroide-dirençli NS(SRNS) olarak tanımlanır ve çoğu zaman monogenetiktir. Erişkin yaşlarda başlayan NS genel olarakoligogenik ve kompleks kalıtım gösterir. Günümüzde NS ile ilişkili >70 gen tanımlanmıştır.NS’ların sınıflandırılması, klinik prognoz konusunda bilgi edinilmesi ve immün baskılayıcı ajanlaraolası yanıtın değerlendirilmesinde genetik tanı çok önemlidir. Amacımız, NS’un genetik kökeniile ilgili güncel bilgi ve gelişmeleri aktarmaktır