On the relevance of three genetic models for the description of genetic variance in small populations undergoing selection

International audienc

Ville et dynamique de l'offre de soins: Bobo-Dioulasso (Burkina Faso)

L'urbanisation dans les pays du sud expose les territoires urbains à des changements démographiques, économiques, sociaux et environnementaux qui renouvèlent les enjeux de santé. Au Burkina Faso, la politique sanitaire a pour but de rapprocher les populations des équipements de soins. Elle s'appuie sur de nouveaux découpages, les districts sanitaires et les communes, responsables depuis la communalisation intégrale, des structures de soins de base. La répartition de l'offre de soins à Bobo-Dioulasso, seconde ville du Burkina Faso, est observée en lien avec la croissance urbaine. A partir de la géolocalisation des équipements, leur répartition spatiale est étudiée : selon des ellipses de dispersion pour les périodes de création, selon la méthode du plus proche voisin et de l'indice de Ripley pour le statut. A la dispersion spatiale des structures publiques, guidée par la politique de soins, s'oppose la concentration spatiale du privé. Malgré les rythmes de création différents, l'équipement ne semble pas se faire en adéquation avec le rythme de croissance urbaine. (Résumé d'auteur

A dynamic deterministic model to evaluate breeding strategies under mixed inheritance

A dynamic deterministic model is proposed to study the combined use of an identified major gene and performance information for selection of traits expressed in one sex. The model considers simultaneously combined adult selection via within genotype thresholds, mating structures according to major genotypes and preselection of young males. The application given indicates that an optimum combination between performances and genotypic information yields better results, in terms of polygenic means, genotype frequencies and cumulated discounted genetic progress, than classical selection ignoring the genotype information. The greatest advantage of combined selection occurs for rare recessive alleles of large effect on phenotypes (up to +49 % for polygenic gains; +26 % for total genetic gain). Optimum within genotype proportions of selected individuals and mating structures vary with generations thus highlighting the value of a dynamic approach.Un modèle déterministe et dynamique est proposé pour étudier l’utilisation conjointe des performances et des génotypes à un locus majeur pour la sélection des caractères exprimés dans un sexe. Le modèle prévoit la sélection des adultes au-delà de seuils de performances intra-génotype, des accouplements en fonction des génotypes et la présélection de jeunes mâles sur leur génotype. L’application présentée indique que la combinaison optimale des performances et des génotypes permet d’obtenir des meilleurs résultats, en terme de moyennes polygéniques, de fréquences génotypiques et du progrès génétique actualisé et cumulé, que la sélection classique ignorant l’informationgénotypique. Les avantages de la sélection combinée sont plus importants quand l’allèle favorable est rare et récessif, les différences avec la sélection classique pouvant atteindre +49 % en gains polygéniques et +26 % en gain génétique total. Les taux optimaux de sélection intra-génotype et les structures d’accouplement optimales varient au cours des générations, confirmant l’intérêt de l’approche dynamique

Social and environmental malaria risk factors in urban areas of Ouagadougou, Burkina Faso

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Despite low endemicity, malaria remains a major health problem in urban areas where a high proportion of fevers are presumptively treated using anti-malarial drugs. Low acquired malaria immunity, behaviour of city-dwellers, access to health care and preventive interventions, and heterogenic suitability of urban ecosystems for malaria transmission contribute to the complexity of the malaria epidemiology in urban areas.</p> <p>Methods</p> <p>The study was designed to identify the determinants of malaria transmission estimated by the prevalence of anti-circumsporozoite (CSP) antibodies, the prevalence and density of <it>Plasmodium falciparum </it>infection, and the prevalence of malarial disease in areas of Ouagadougou, Burkina-Faso. Thick blood smears, dried blood spots and clinical status have been collected from 3,354 randomly chosen children aged 6 months to 12 years using two cross-sectional surveys (during the dry and rainy seasons) in eight areas from four ecological strata defined according to building density and land tenure (regular versus irregular). Demographic characteristics, socio-economic information, and sanitary and environmental data concerning the children or their households were simultaneously collected. Dependent variables were analysed using mixed multivariable models with random effects, taking into account the clustering of participants within compounds and areas.</p> <p>Results</p> <p>Overall prevalences of CSP-antibodies and <it>P. falciparum </it>infections were 7.7% and 16.6% during the dry season, and 12.4% and 26.1% during the rainy season, respectively, with significant differences according to ecological strata. Malaria risk was significantly higher among children who i) lived in households with lower economic or education levels, iii) near the hydrographic network, iv) in sparsely built-up areas, v) in irregularly built areas, vi) who did not use a bed net, vii) were sampled during the rainy season or ii) had traveled outside of Ouagadougou.</p> <p>Conclusion</p> <p>Malaria control should be focused in areas which are irregularly or sparsely built-up or near the hydrographic network. Furthermore, urban children would benefit from preventive interventions (e.g. anti-vectorial devices or chemoprophylaxis) aimed at reducing malaria risk during and after travel in rural areas.</p