Clinical diagnosis of COVID-19. A multivariate logistic regression analysis of symptoms of COVID-19 at presentation

Introduction The objective of this cross-sectional study was to describe the main symptoms associated with COVID-19, and their diagnostic characteristics, to aid in the clinical diagnosis. Methods An analysis of all patients diagnosed by RT-PCR for SARS-CoV-2 between April and May 2020 in Argentina was conducted. The data includes clinical and demographic information from all subjects at the time of presentation (n=67318, where 12% were positive for SARS-CoV-2). The study population was divided into four age groups: pediatric (0-17 years), young adults (18-44 years), adults (45-64 years), and elderly (65-103 years). Multivariate logistic regression was used to measure the association of all symptoms and to create a diagnostic model based on symptoms.Results Symptoms associated with COVID-19 were anosmia, dysgeusia, headache, low-grade fever,odynophagia, and malaise. However, the presentation of these symptoms was different between thedifferent age groups. In turn, at the time of presentation, the symptoms associated with respiratoryproblems (chest pain, abdominal pain, and dyspnea) had a negative association with COVID-19 or did not present statistical relevance. On the other hand, the model based on 16 symptoms, age and sex, presented a sensitivity of 80% and a specificity of 46%.Conclusions There were significant differences between the different age groups. Additionally, therewere interactions between different symptoms that were highly associated with COVID-19. Finally, our findings showed that a regression model based on multiple factors (age, sex, interaction between symptoms) can be used as an accessory diagnostic method or a rapid screening of suspected COVID-19 cases.Fil: Fleitas, Pedro Emanuel. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Paz, Jorge Augusto. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Económicas, Jurídicas y Sociales. Instituto de Estudios Laborales y del Desarrollo Económico; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Simoy, Mario Ignacio. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Cs.exactas. Departamento de Física. Instituto de Energias No Convencionales; Argentina. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto Multidisciplinario sobre Ecosistemas y Desarrollo Sustentable. Grupo de Ecología Matemática; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Investigaciones en Energía no Convencional. Grupo Vinculado al INENCO - Instituto de Investigaciones y Políticas del Ambiente Constituido | Universidad Nacional de Salta. Facultad de Cienicas Exactas. Departamento de Física. Instituto de Investigaciones en Energía no Convencional. Grupo Vinculado al INENCO - Instituto de Investigaciones y Políticas del Ambiente Constituido; ArgentinaFil: Vargas, Carlos. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Ciencias Económicas. Instituto de Investigación Estado, Territorio y Economía; ArgentinaFil: Cimino, Rubén Oscar. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Krolewiecki, Alejandro Javier. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Aparicio, Juan Pablo. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Cs.exactas. Departamento de Física. Instituto de Energias No Convencionales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentin

Strongyloides stercoralis and Trypanosoma cruzi coinfections in a highly endemic area in Argentina

Background Strongyloidiasis and Chagas disease are endemic in northern Argentina. In this study we evaluate the association between S. stercoralis and T. cruzi infections in villages with diverse prevalence levels for these parasites. Further understanding in the relationship between these Neglected Tropical Diseases of South America is relevant for the design of integrated control measures as well as exploring potential biologic interactions. Methodology Community based cross-sectional studies were carried in different villages of the Chaco and Yungas regions in Argentina. Individuals were diagnosed by serology for S. stercoralis and T. cruzi. The association between S. stercoralis and T. cruzi, and between anemia and the two parasites was evaluated using two approaches: marginal (Ma) and multilevel regression (Mu). Results A total of 706 individuals from six villages of northern Argentina were included. A total of 37% were positive for S. stercoralis, 14% were positive for T. cruzi and 5% were positive for both. No association was found between infection with S. stercoralis and T. cruzi in any of the models, but we found a negative correlation between the prevalence of these species in the different villages (r =-0.91). Adults (> 15 years) presented association with S. stercoralis (Ma OR = 2.72; Mu OR = 2.84) and T. cruzi (Ma OR = 5.12; Mu OR = 5.48). Also, 12% and 2% of the variance of infection with S. stercoralis and T. cruzi, respectively, could be explained by differences among villages. On the other hand, anemia was associated with infection with S. stercoralis (Ma OR = 1.73; Mu OR = 1.78) and was more prevalent in adults (Ma OR = 2.59; Mu OR = 2.69). Conclusion We found that coinfection between S. stercoralis and T. cruzi is not more frequent than chance in endemic areas. However, the high prevalence for both parasites, raises the need for an integrated strategy for the control of STH and Chagas disease.Fil: Fleitas, Pedro Emanuel. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Floridia Yapur, Noelia Aldana del Rosario. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: Nieves, Elvia Ester. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Echazú, Adriana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Vargas, Paola Anahí. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Caro, Reynaldo Nicolás. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Aveldaño, Ramiro. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Lopez, Walter. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Fernandez, Mariana. Asociación para el Desarrollo Sanitario Regional; ArgentinaFil: Crudo, Favio. Asociación para el Desarrollo Sanitario Regional; ArgentinaFil: Cimino, Rubén Oscar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Krolewiecki, Alejandro Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentin

Seroprevalence of the strongyloides stercoralis infection in humans from yungas rainforest and gran chaco region from Argentina and Bolivia

The threadworm, Strongyloides stercoralis, is endemic in tropical and subtropical areas. Data on the prevalence and distribution of infection with this parasite species is scarce in many critical regions. We conducted a seroprevalence study of S. stercoralis infection in 13 locations in the Gran Chaco and Yungas regions of Argentina and Bolivia during the period 2010–2016. A total of 2803 human serum samples were analyzed by ELISA-NIE which has a sensitivity of 75% and specificity of 95%. Results showed that 551 (19.6%) of those samples were positive. The adjusted prevalence was 20.9%, (95% confidence interval (CI) 19.4%–22.4%). The distribution of cases was similar between females and males with an increase of prevalence with age. The prevalence in the different locations ranged from 7.75% in Pampa del Indio to 44.55% in Santa Victoria Este in the triple border between Argentina, Bolivia, and Paraguay in the Chaco region. Our results show that S. stercoralis is highly prevalent in the Chaco and Yungas regions, which should prompt prospective surveys to confirm our findings and the design and deployment of control measures.Fil: Cimino, Rubén Oscar. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Fleitas, Pedro Emanuel. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Fernández, Mariana. Asociación para el desarrollo sanitario regional; ArgentinaFil: Echazú, Adriana. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Juarez, Marisa del Valle. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Floridia Yapur, Noelia Aldana del Rosario. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: Cajal, Silvana Pamela. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Seijo, Alfredo. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Infecciosas "Dr. Francisco Javier Muñiz"; ArgentinaFil: Abril, Marcelo. Fundación Mundo Sano; ArgentinaFil: Weinberg, Diego. Fundación Mundo Sano; ArgentinaFil: Piorno, Pablo Emiliano. Asociación para el desarrollo sanitario regional; ArgentinaFil: Caro, Nicolás. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Vargas, Paola. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Gil, José Fernando. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Investigaciones en Energía no Convencional. Grupo Vinculado al INENCO - Instituto de Investigaciones y Políticas del Ambiente Constituido | Universidad Nacional de Salta. Facultad de Cienicas Exactas. Departamento de Física. Instituto de Investigaciones en Energía no Convencional. Grupo Vinculado al INENCO - Instituto de Investigaciones y Políticas del Ambiente Constituido; ArgentinaFil: Crudo, Favio. Asociación para el desarrollo sanitario regional; ArgentinaFil: Krolewiecki, Alejandro Javier. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentin

Correlación entre la prevalencia de uncinarias y strongyloides stercoralis: ¿Una nueva herramienta diagnóstica en salud pública?

Strongyloides stercoralis y uncinarias, cuyas principales especies son Necator americanus y Ancylostoma duodenale, presentan coincidencias en sus características biológicas y epidemiológicas; la infección ocurre cuando las larvas que se encuentran en suelos contaminados con materia fecal penetran la piel intacta, presentan superposición geográfica y el rango de edad de los infectados es similar. Sin embargo, el diagnóstico de S. stercoralis es más desafiante que el de uncinarias, lo que contribuye a que la prevalencia de S. stercoralis sea desconocida y mayormente subestimada. Por lo tanto, nuestra hip´otesis es que la prevalencia de uncinarias (PUn), cuyo diagnóstico es más simple en el laboratorio, podría resultar predictiva de la prevalencia de S. stercoralis (PSt). El objetivo de este trabajo fue investigar la correlación de PUn con PSt. Se realizó una revisión sistemática de trabajos científicos publicados entre los a˜nos 2014 y 2018. Se efectuó una búsqueda en Pubmed, Embase, CAB, LILACS y sciELO con las palabras clave “Hookworm”“Ancylostoma”“Necator”“Strongyloides”“Uncinarias”y “Estrongyloides”. Dicha búsqueda brindo 400 citas. Estas fueron revisadas por dos revisores mediante un análisis de título y resumen. Se tuvieron en cuenta los siguientes criterios de inclusión: trabajos en humanos asintomáticos, diagnóstico parasitológico de referencia y PCR, edad, sexo y raza indistinta pero residentes del lugar, estudios epidemiológicos transversales con prevalencia basales de uncinarias y S. stercoralis. Se seleccionaron 147 trabajos que fueron analizados teniendo en cuenta el texto completo. Finalmente se confirmó la validez y disponibilidad de datos para 41 trabajos que reportaron 42 poblaciones distintas. Los datos se analizaron usando regresión lineal y la correlación de Pearson. Se consideró PUn como la variable independiente y PSt como variable dependiente. Se encontró una correlación significativa entre ambas prevalencias (Pearson = 0.73, P<0.0001), siendo ambas directamente proporcionales (r2= 0.53 P<0.0001). De esta manera, nuestros resultados sugieren que se podría estimar PSt con la función lineal PSt= 0.49x PUn+ 0.49. De confirmarse estos hallazgos con datos experimentales, esta ecuación podría sumarse como una herramienta de gran utilidad para determinar la Pst, y de este modo diseñar estrategias diagnósticas y terapéuticas que incluyan a S. stercoralis.Fil: Fleitas, Pedro Emanuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; ArgentinaFil: Socías, María Eugenia. University of British Columbia; Canadá. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Travacio, Marina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Cimino, Rubén Oscar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; ArgentinaFil: Krolewiecki, Alejandro Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaXXX Reunión de la Sociedad Argentina de ProtozoologíaResistenciaArgentinaSociedad Argentina de Protozoologí

Mapping the global distribution of Strongyloides stercoralis and hookworms by ecological niche modeling

Background: The WHO has established a control strategy for Strongyloides stercoralis in school-aged children as well as targets and to maintain control programs for Ascaris lumbricoides, Trichuris trichiura and hookworms. For an efficient development of control programs, it is necessary to know the target countries around the world, as well as the areas within each country where efforts should be focused. Therefore, maps that provide information on the areas at risk for soil-transmitted helminth (STH) infections on a national and sub-national scale would allow for a better allocation of resources. Methods: We used the ecological niche models MaxEnt and Kuenm R library to estimate the global distribution of S. stercoralis and hookworms. We used occurrence points of both species extracted from surveys of two literature reviews and from the Global Atlas of Helminth Infection database, together with 14 raster maps of environmental variables. Results: We obtained two raster maps with the presence probability of S. stercoralis and hookworm infections at a global level and then estimated the global population at risk to be 2.6 and 3.4 billion, respectively. The population at risk was also estimated at the country level using estimations for areas as small as 25 km2. A relationship was found between the probability of the presence of S. stercoralis and its prevalence, and a raster map was generated. Annual precipitation, annual temperature, soil carbon content and land cover were the main associated environmental variables. The ecological niches of Strongyloides stercoralis and hookworms had an overlap of 68%. Conclusions: Here we provide information that can be used for developing more efficient and integrated control strategies for S. stercoralis and hookworm infections. This information can be annexed to the study of other risk factors or even other diseases to assess the health status of a community.Fil: Fleitas, Pedro Emanuel. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Kehl, Sebastian Dario. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: López, Walter Rodrigo. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Travacio, Marina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Nieves, Elvia Ester. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Gil, José Fernando. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Investigaciones en Energía no Convencional. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Exactas. Departamento de Física. Instituto de Investigaciones en Energía no Convencional; ArgentinaFil: Cimino, Rubén Oscar. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; ArgentinaFil: Krolewiecki, Alejandro Javier. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentin

Diptera (Insecta: Pterygota) larvae as predators of Strongyloides stercoralis causing false negative stool cultures

A stool sample of a five-year-old boy with suspected STH infection arrived at the Laboratory of the Instituto de Investigaciones de Enfermedades Tropicales (IIET), National University of Salta in Oran, province of Salta, Argentina in 2017. Three Harada Mori were prepared, of which only one showed the presence of S. stercoralis. In the other two, the presence of an unknown larva was observed, which was later identified as an insect larva of the Diptera order. PCR analysis of the liquid medium of Harada Mori and Diptera larvae revealed presence of S. stercoralis DNA. These results, added to the predatory characteristics of the dipteran larvae, indicate that the S. stercoralis larvae were prey for these organisms, resulting in a negative diagnosis for S. stercoralis in the Harada Mori.Fil: Fleitas, Pedro Emanuel. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Acosta, Ximena Gisela del Milagro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Instituto para el Estudio de la Biodiversidad de Invertebrados; ArgentinaFil: Vargas, Paola A.. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Caro, Nicolas Dagoberto. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Krolewiecki, Alejandro Javier. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Nasser, Julio Rubén. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; ArgentinaFil: Cimino, Rubén Oscar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentin

Normatización de la técnica PCR-RFLP para el estudio de resistencia al albendazol en parásitos de importancia veterinaria en el Valle de Lerma, Salta

La producción ganadera es afectada por nematodos gastrointestinales que dañan la mucosa del abomaso e intestinos, afectando la absorción de nutrientes y la ganancia de peso. El albendazol (ABZ), se une a la beta-tubulina evitando la polimerización de dímeros de tubulina en microtúbulos conduciendo a la interrupción de funciones celulares y muerte de la larva. La resistencia a los antiparasitarios se define como la habilidad de una población de parásitos, para tolerar dosis de tóxicos que serían letales para la mayoría de individuos en una población normal (susceptible) de la misma especie. La resistencia de Haemonchus contortus hacia el ABZ está dada por una mutación puntual en el gen de la beta-tubulina, TTC a TAC en el codón 200 del gen. Dicha mutación introduce un sitio de restricción para la enzima TaaI. El objetivo del presente trabajo fue normatizar la técnica de PCR-RFLP para la determinación del genotipo del gen de la b-tubulina isotipo I de H. contortus asociado a la resistencia al ABZ en la región del Valle de Lerma, Salta. Se recolectaron larvas de H. contortus con sospecha de resistencia a ABZ provenientes de la localidad de Campo Quijano proporcionadas por el departamento de Sanidad Animal, INTA Salta. La extracción de ADN se realizó con fenol cloroformo. La técnica PCR-RFLP fue usada para detectar el SNP. Un pool de larvas (>25 larvas) de H. contortus fue utilizado para la estandarización de la técnica PCR RFLP, con el fin de luego realizarla sobre larvas individuales (LI) y determinar la frecuencia genotípica. Se Detectó el genotipo de resistencia al ABZ en el pool larvas, no así en LI, encontrándose dificultades para la extracción de ADN (28% PCR positivas en LI). Los resultados confirman que en la región está presente el gen de resistencia al ABZ en H. contortus. La PCR-RFLP es una herramienta valiosa para la detección de resistencia al ABZ en helmintos y podría ser implementada en los programas de control.Fil: Diaz, Juan Pablo. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; ArgentinaFil: Fleitas, Pedro Emanuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; ArgentinaFil: Olmos, Leandro Hipolito. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Salta. Estación Experimental Agropecuaria Salta; ArgentinaFil: Cafrune, Maria Mercedes. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Salta. Estación Experimental Agropecuaria Salta; ArgentinaFil: Aguirre, Daniel H.. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Salta. Estación Experimental Agropecuaria Salta; ArgentinaFil: Nasser, Julio Rubén. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; ArgentinaFil: Cimino, Rubén Oscar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; ArgentinaVIII Congreso de ParasitologíaCorrientesArgentinaAsociación Parasitológica Argentin

Molecular identification of Leishmania spp. DNA from archived Giemsa-Stained slides of patients from Salta, Argentina

Cutaneous leishmaniasis is endemic in Salta province, which belongs to the northwest of Argentina. Leishmania spp. DNA from Giemsa-stained slides of up to 12 years in storage of patients from Salta was characterized through polymerase chain reaction (PCR) restriction fragment length polymorphism (RFLP). One hundred smears positive for microscopy, classified in a semiquantitative scale for amastigote density, were analyzed. Also, Leishmanin skin test (LST) results were included. DNA extraction was carried out applying lysis buffer with proteinase K, and then DNA was amplified with ribosomal internal transcribed spacer1primers. PCR products were digested with HaeIII enzyme. All PCR-positive smears (74/100) belonged to Viannia subgenus. A statistically significant, directly proportional relationship between semiquantitative microscopy and PCR results was detected. All patients had LST-positive results (induration ≥ 5 mm), and the smears of those with smaller induration (LST < 19 mm) gave a higher proportion of positive PCR results. This study determined that smear age did not affect PCR positivity, which allows retrospective analyzes and suggests smears might be useful for molecular complementary diagnosis. Because Leishmania (Viannia) braziliensis is the main circulating species in the study area, determining Viannia subgenus in all analyzed samples confirms previous findings. PCR positivity showed statistically significant differences according to semiquantitative microscopy, highlighting the importance of parasite burden in the diagnostic sensitivity of the method. Considering that smears of patients with smaller LST induration were more positive in PCR, a negative smear from patients with positive LST response, but <19mm, could actually represent a false-negative result.Fil: Almazán, María Cristina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Hoyos, Carlos Lorenzo. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: Krolewiecki, Alejandro Javier. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: Cajal, Silvana Pamela. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Copa, Griselda Noemi. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; ArgentinaFil: Fleitas, Pedro Emanuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Barroso, Paola Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: Marco, Jorge Diego. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Patología Experimental. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud. Instituto de Patología Experimental; ArgentinaFil: Nasser, Julio Rubén. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Gil, José Fernando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta. Instituto de Investigaciones en Energía no Convencional. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Exactas. Departamento de Física. Instituto de Investigaciones en Energía no Convencional; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentin

Molecular characterization of Leishmania DNA from archived giemsa-stained slides of patients from Salta, Argentina

Cutaneous leishmaniasis is endemic in the northwestern province of Salta in Argentina. Leishmania DNA from Giemsa-stained slides of up to 12 years in storage of patients from a University based reference center in Oran, Salta was characterized through PCR-Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP). One hundred smears from individuals with suspicious lesions and epidemiologic exposure plus microbiologic confirmation through positive microscopy were analyzed. The samples had been originally taken 2, 3, 5, 6 and 12 years prior to performing PCR-RFLP (20 samples from each year) and were maintained at room temperature in a tropical environment. All the cases were classified in a semiquantitative scale for amastigote density, and Leishmanin skin test (LST) results were included. DNA extraction was done applying lysis buffer with proteinase K, and then DNA was amplified with ribosomal internal transcribed spacer 1(ITS1) primers. PCR products were digested with HaeIII enzyme. All PCR positive smears (74/100) belonged to Viannia subgenus. A statistically significant directly proportional relationship between semiquantitative microscopy and PCR results was detected (p < 0.001). All patients had LST positive results (induration ≥ 5 mm), and the smears of those with positive but smaller induration (LST < 19 mm) had a higher proportion of positive PCR results. This study determined that smear age did not affect PCR positivity, which allows retrospective analyzes and suggests smears might be useful for molecular complementary diagnosis. Since Leishmania (Viannia) braziliensis is the main circulating species in the study area, determining Viannia subgenus in all analyzed samples confirms previous findings. PCR positivity showed statistically significant differences according to semiquantitative microscopy, highlighting the importance of parasite burden in the diagnostic sensitivity of the method. Considering that smears of patients with smaller LST induration were more positive in PCR, a negative smear from patients with positive LST response, but < 19 mm, could actually represent a false negative smear result.Fil: Almazán, María Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Krolewiecki, Alejandro Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Hoyos, Carlos Lorenzo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Cajal, Silvana Pamela. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Copa, Noemí Griselda. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Fleitas, Pedro Emanuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Barroso, Paola Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Marco, Jorge Diego. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Nasser, Julio Rubén. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Gil, José Fernando. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina67th Annual Meeting American Society of Tropical Medicine & HygieneNew OrleansEstados UnidosAmerican Society of Tropical Medicine & Hygien

Scope and limitations of a multiplex conventional PCR for the diagnosis of S. stercoralis and hookworms

Objectives: Describe the diagnostic characteristics of a conventional multiplex PCR for the diagnosis of S. stercoralis, N. americanus and Ancylostomas spp. Methods: Fecal samples were collected from a cross-sectional study in Oran department, Salta province, Argentina. The stool samples were analyzed using concentration-sedimentation, Harada Mori, McMaster, and Baermann techniques. DNA was extracted from 50 mg fecal sample using the FastPrep Spin Kit for Soil. Three pairs of primers were used for the amplification of three products of 101, 330, and 577 base pairs (bp) for S. stercoralis, N. americanus and Ancylostoma spp, respectively. The sensitivity and analytical specificity of multiplex PCR were evaluated, as well as the sensitivity and diagnostic specificity, using a composite standard and Bayesian approach. Results and Conclusions: Multiplex PCR did not present cross-reaction with other intestinal parasites, and the detection limit for multiplex PCR was between 2 and 20 pg of genomic DNA. In addition it presented a diagnostic sensitivity of 97.4% for S. stercoralis and 90.3% for hookworms with a specificity of 100% and 87.6%, respectively. PCR identified a higher proportion (p <0.01) of coinfections (15.3%) than microscopic techniques (3.5%). Also, multiplex PCR showed that there was a positive association between S. stercoralis and hookworms (odds ratio = 2.12). However, this association was due to N. americanus (odds ratio= 3.22), since no association was observed between S. stercoralis and Ancylostoma spp. Neither was an association observed between the two species of hookworms.Fil: Fleitas, Pedro Emanuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; ArgentinaFil: Vargas Flores, Paola Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Caro, Reynaldo Nicolás. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Almazán, María Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; ArgentinaFil: Echazú, Adriana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias de la Salud; ArgentinaFil: Juarez, Marisa del Valle. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Cajal, Silvana Pamela. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Krolewiecki, Alejandro Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; ArgentinaFil: Nasser, Julio Rubén. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; ArgentinaFil: Cimino, Rubén Oscar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Salta; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Facultad de Ciencias Naturales. Escuela de Biología. Cátedra de Química Biológica; Argentina. Universidad Nacional de Salta. Sede Regional Orán. Instituto de Investigación de Enfermedades Tropicales; Argentin