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OpenABM-Covid19-An agent-based model for non-pharmaceutical interventions against COVID-19 including contact tracing
- Author
- Publication venue
- 'Public Library of Science (PLoS)'
- Publication date
- 12/07/2021
- Field of study
SARS-CoV-2 has spread across the world, causing high mortality and unprecedented restrictions on social and economic activity. Policymakers are assessing how best to navigate through the ongoing epidemic, with computational models being used to predict the spread of infection and assess the impact of public health measures. Here, we present OpenABM-Covid19: an agent-based simulation of the epidemic including detailed age-stratification and realistic social networks. By default the model is parameterised to UK demographics and calibrated to the UK epidemic, however, it can easily be re-parameterised for other countries. OpenABM-Covid19 can evaluate non-pharmaceutical interventions, including both manual and digital contact tracing, and vaccination programmes. It can simulate a population of 1 million people in seconds per day, allowing parameter sweeps and formal statistical model-based inference. The code is open-source and has been developed by teams both inside and outside academia, with an emphasis on formal testing, documentation, modularity and transparency. A key feature of OpenABM-Covid19 are its Python and R interfaces, which has allowed scientists and policymakers to simulate dynamic packages of interventions and help compare options to suppress the COVID-19 epidemic
Use of anticoagulants and antiplatelet agents in stable outpatients with coronary artery disease and atrial fibrillation. International CLARIFY registry
- Author
- A. L. R. Ng
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- Ch&apos
- Ch&apos
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- Chen X.
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- d&apos
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- Danchin N.
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- Sirazov I.
- Sirbu O.
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- Skonieczny M.
- Slaboszewska J.
- Slapikas R.
- Slapikiene O. B.
- Smirnova E.
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- Smith A.
- Smrckova E.
- Snikyte R.
- Soares L.
- Sobczyk D.
- Soin I.
- Sokn F. J.
- Sola Casado R.
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- Soleille H.
- Soltysiak M.
- Somsen G. A.
- Son W. K.
- Song L.
- Soosiwala I.
- Sopia R.
- Soriano Navarro C.
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- Soskin P.
- Sosner P.
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- Soto Ruiz M. I.
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- Spensieri D.
- Speth-Nitschke M.
- Spink D. R.
- Spinu C. M.
- Spitsina T.
- Sprott V.
- Sreenivasa Murthy L.
- Srinivasa Reddy K.
- Sriratanasathavorn C.
- Srivastava P.
- Srtumilenko N.
- Stadler P.
- Stanciulescu G.
- Stankevicius R.
- Stanley M.
- Starostina N.
- Stasiuk T.
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- Statescu C.
- Steeds R.
- Steg G.
- Steg P. G.
- Stelmakh I.
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- Sternthal P.
- Steurer G.
- Stevens A.
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- Strathmore N. F.
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- Suarez G.
- Sudnik J.
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- Suithichaiyakul T.
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- Van den Branden F.
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- Ziccarelli C.
- Ziehn P.
- Zimolag R.
- Zundorf P.
- Publication venue
- 'Public Library of Science (PLoS)'
- Publication date
- 01/01/2015
- Field of study
Chronic coronary syndromes without standard modifiable cardiovascular risk factors and outcomes: the CLARIFY registry
- Author
- AbardĂa Oliva F J
- Abdel Malak S
- Abdel Wahab H
- Abdul Kareem B B
- Abdul Rahim A A
- Abdul Wahab M Z
- Abdulkader Fuad
- Abdullah A S
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- Ćotocka E
- Ćugowski T
- Ć lapikas R
- Ć lapikienÄ O B
- Publication venue
- Oxford University Press
- Publication date
- 20/05/2024
- Field of study
Background and Aims:
It has been reported that patients without standard modifiable cardiovascular (CV) risk factors (SMuRFsâdiabetes, dyslipidaemia, hypertension, and smoking) presenting with first myocardial infarction (MI), especially women, have a higher in-hospital mortality than patients with risk factors, and possibly a lower long-term risk provided they survive the post-infarct period. This study aims to explore the long-term outcomes of SMuRF-less patients with stable coronary artery disease (CAD).
Methods:
CLARIFY is an observational cohort of 32 703 outpatients with stable CAD enrolled between 2009 and 2010 in 45 countries. The baseline characteristics and clinical outcomes of patients with and without SMuRFs were compared. The primary outcome was a composite of 5-year CV death or non-fatal MI. Secondary outcomes were 5-year all-cause mortality and major adverse cardiovascular events (MACEâCV death, non-fatal MI, or non-fatal stroke).
Results:
Among 22 132 patients with complete risk factor and outcome information, 977 (4.4%) were SMuRF-less. Age, sex, and time since CAD diagnosis were similar across groups. SMuRF-less patients had a lower 5-year rate of CV death or non-fatal MI (5.43% [95% CI 4.08â7.19] vs. 7.68% [95% CI 7.30â8.08], P = 0.012), all-cause mortality, and MACE. Similar results were found after adjustments. Clinical event rates increased steadily with the number of SMuRFs. The benefit of SMuRF-less status was particularly pronounced in women.
Conclusions:
SMuRF-less patients with stable CAD have a substantial but significantly lower 5-year rate of CV death or non-fatal MI than patients with risk factors. The risk of CV outcomes increases steadily with the number of risk factors