A phenomics approach reveals interspecific differences in integrated developmental responses to chronic elevated temperatures

ABSTRACT Phenomics, high-dimensional organismal phenotyping, is advanced as a solution to quantifying complex developmental responses to elevated temperatures. ‘Energy proxy traits’ (EPTs) measure the phenotype as a spectrum of energy values across different temporal frequencies from pixel value fluctuations of video. Although they have proven effective in measuring the biology of complex and dynamic developing organisms, their utility in assessing environmental sensitivity of different species is untested. Using EPTs, we assess the relative thermal sensitivities of embryos of three species of freshwater snail with marked differences in their developmental event timings. Embryos of Lymnaea stagnalis, Radix balthica and Physella acuta were videoed hourly for the duration of their embryonic development at two temperatures: 20°C and 25°C. The video was used to calculate EPTs for the duration of their embryonic development, and during discrete physiological windows in development. Changes in energy spectra during development identified marked differences in thermal sensitivities between species, and suggest a relatively heightened sensitivity of gross rates of embryonic physiology and behaviour in embryos of R. balthica, developmental-window-specific thermal responses that reflect ontogenetic differences in observable physiologies, and temperature-induced changes in physiological event timing. EPTs enabled comparison of high-dimensional spectral phenotypes, providing a unique capability for assessing sensitivity continuously in developing individuals. Such integrative and scalable phenotyping is a prerequisite for improved understanding of the sensitivity of early life stages of different species.</jats:p

Daten wie Sand am Meer — Datenerhebung, -strukturierung, -management und Data Provenance für die Ostseeforschung

Das Datenmanagement für heterogene Umweltdaten wird am Beispiel verschiedener Projekte aus dem maritimen Umfeld gezeigt. Besonderer Schwerpunkt dabei sind eine Pipeline zur Integration heterogener Forschungsdaten, die Nachvollziehbarkeit der Daten (Data Provenance) und die Berücksichtigung temporaler Aspekte bei der Erhebung, Speicherung und Auswertung der Daten

Forschungsdatenmanagementkonzept für die deutsche Meeresforschung

Die deutsche Meeresforschung benötigt ein kollaboratives "Datenökosystem": Eine gemeinsam nutzbare, verteilte, leistungsstarke und stetig betriebene Forschungsdateninfrastruktur, um Information und Wissen zu sichern und Forschungsdaten für Nutzer*innen aus Wissenschaft, Behörden, Wirtschaft und Öffentlichkeit frei zugänglich zu machen. Eines der zentralen Ziele dieses Konzeptes besteht darin, die Vereinbarung zur Verknüpfung bewährter Forschungsdateninfrastrukturen einzelner DAM-Mitgliedseinrichtungen, zur Öffnung für die gesamte Deutsche Meeresforschung und zu einem gemeinsamen Betriebskonzept zu treffen. Dafür sollten sich die DAM-Mitgliedseinrichtungen auf ein Konzept verständigen, das ihre institutionelle Souveränität im Umgang mit Forschungsdaten wahrt und gleichzeitig auf die Vereinheitlichung von Prozessen und Mindeststandards hinwirkt