5 research outputs found
Assemblage de génomes bactériens séquencés par NGS - Comparaison d’outils et choix de paramètres
National audience● Les Méthodes de Séquençage de Nouvelle Génération (NGS) permettent de séquencer rapidement et à faible coût de nouvelles souches. → multiplication des outils d’assemblage de NGS (très nombreuses lectures courtes) + évolution rapide des techniques de séquençage. → nécessité de comparer les diverses stratégies d'assemblage sur un jeu de données commun. ● Objectifs de l’étude : → comparer deux stratégies d'assemblage des régions spécifiques. → évaluer diverses méthodes de nettoyage des lectures (l’assembleur de novo choisi ne prenant pas en compte la qualité des données). → déterminer la couverture minimale suffisante lors d’études de détection de nouveaux gènes
Assemblage de génomes bactériens séquencés par NGS - Comparaison d’outils et choix de paramètres
National audience● Les Méthodes de Séquençage de Nouvelle Génération (NGS) permettent de séquencer rapidement et à faible coût de nouvelles souches. → multiplication des outils d’assemblage de NGS (très nombreuses lectures courtes) + évolution rapide des techniques de séquençage. → nécessité de comparer les diverses stratégies d'assemblage sur un jeu de données commun. ● Objectifs de l’étude : → comparer deux stratégies d'assemblage des régions spécifiques. → évaluer diverses méthodes de nettoyage des lectures (l’assembleur de novo choisi ne prenant pas en compte la qualité des données). → déterminer la couverture minimale suffisante lors d’études de détection de nouveaux gènes
Assemblage de génomes bactériens séquencés par NGS - Comparaison d’outils et choix de paramètres
National audience● Les Méthodes de Séquençage de Nouvelle Génération (NGS) permettent de séquencer rapidement et à faible coût de nouvelles souches. → multiplication des outils d’assemblage de NGS (très nombreuses lectures courtes) + évolution rapide des techniques de séquençage. → nécessité de comparer les diverses stratégies d'assemblage sur un jeu de données commun. ● Objectifs de l’étude : → comparer deux stratégies d'assemblage des régions spécifiques. → évaluer diverses méthodes de nettoyage des lectures (l’assembleur de novo choisi ne prenant pas en compte la qualité des données). → déterminer la couverture minimale suffisante lors d’études de détection de nouveaux gènes
The MCL1 inhibitor S63845 is tolerable and effective in diverse cancer models
Avoidance of apoptosis is critical for the development and sustained growth of tumours. The pro-survival protein myeloid cell leukemia 1 (MCL1) is overexpressed in many cancers, but the development of small molecules targeting this protein that are amenable for clinical testing has been challenging. Here we describe S63845, a small molecule that specifically binds with high affinity to the BH3-binding groove of MCL1. Our mechanistic studies demonstrate that S63845 potently kills MCL1-dependent cancer cells, including multiple myeloma, leukaemia and lymphoma cells, by activating the BAX/BAK-dependent mitochondrial apoptotic pathway. In vivo, S63845 shows potent anti-tumour activity with an acceptable safety margin as a single agent in several cancers. Moreover, MCL1 inhibition, either alone or in combination with other anti-cancer drugs, proved effective against several solid cancer-derived cell lines. These results point towards MCL1 as a target for the treatment of a wide range of tumours