Identificação molecular de rinovírus humano em população infantil na região metropolitana de Porto Velho/RO

Dissertação apresentada ao Programa de Pós-graduação em Biologia Experimental – PGBIOEXP – do Núcleo de Saúde da Universidade Federal de Rondônia para obtenção do título de mestre. Orientadora: Dra. Deusilene Souza VieiraAs infecções respiratórias agudas (IRA) são as principais causas de infecções em crianças com menos de cinco anos. As IRA são causadas por diversos agentes etiológicos, sendo os agentes virais os principais causadores deste tipo de infecções. O Rinovírus humano (HRV) é um vírus de RNA, patógeno causador do resfriado comum capaz de desenvolver quadros infecciosos mais graves em crianças. O HRV está classificado em espécies A, B, e C que abrange 100 sorotipos diferentes. Este estudo teve por objetivo identificar o vírus HRV em população infantil atendida na região metropolitana de Porto-Velho/ Rondônia. A população de estudo consistiu em crianças de 0 a 6 anos de idade ambos sexos, que apresentaram sintomas clínicos de IRA. Foram coletadas 660 amostras biológicas de secreção nasofaringea por meio de um swab estéril conforme preconizado pelo Ministério da Saúde. Sendo selecionada para o presente estudo 304 amostras para isolamento viral a PCR qualitativa em tempo real utilizando o sistema Sybr Green. Do total de 304 amostras analisadas 26,3% (80/304) foram positivas para HRV. A presença do vírus foi detectada em todas as faixas etárias analisadas. Nas amostras positivas os sintomas mais freqüentes foram tosse, coriza, secreção pulmonar, obstrução nasal, síbilos, dispneia e febre apresentando frequencias superiores a 60%. O vírus HRV foi detectado durante todo o ano. Dentre os casos de coinfecções: 5 foram HRV + Adenovírus, 14 HRV + Streptococcus pneumoniae, 5 Adenovírus + Streptococcus pneumoniae e 1 caso de Adenovírus + Streptococcus pneumoniae + HRV. O HRV tem sido detectado em diversos estudos voltados para identificação etiológica em infecções respiratórias. Por meio deste trabalho foi possível afirmar a presença do mesmo na região norte do Brasil. Os dados obtidos enfatizam a importância da identificação da HRV, já que o conhecimento do agente causador deste tipo de infecção pode ajudar o prognóstico, favorecendo a prática correta terapêutica, evitando a prescrição desnecessária de antibióticos

Phylodynamic and Phylogeographic Analysis of Hepatitis Delta Virus Genotype 3 Isolated in South America

The hepatitis delta virus (HDV) is a globally distributed agent, and its genetic variability allows for it to be organized into eight genotypes with different geographic distributions. In South America, genotype 3 (HDV-3) is frequently isolated and responsible for the most severe form of infection. The objective of this study was to evaluate the evolutionary and epidemiological dynamics of HDV-3 over the years and to describe its distribution throughout this continent in an evolutionary perspective. While using Bayesian analysis, with strains being deposited in the Nucleotide database, the most recent common ancestor was dated back to 1964 and phylogenetic analysis indicated that the dispersion may have started in Brazil, spreading to Venezuela and then to Colombia, respectively. Exponential growth in the effective number of infections was observed between the 1950s and 1970s, years after the first report of the presence of HDV on the continent, during the Labrea Black Fever outbreak, which showed that the virus continued to spread, increasing the number of cases decades after the first reports. Subsequently, the analysis showed a decrease in the epidemiological levels of HDV, which was probably due to the implantation of the vaccine against its helper virus, hepatitis B virus, and serological screening methods implemented in the blood banks