A resource for sustainable management:<i>De novo</i> assembly and annotation of the liver transcriptome of the Atlantic chub mackerel, <i>Scomber colias</i>

Mackerels represent a valuable fishery worldwide. Their ample geographic distribution and capture levels make them an insightful model to address stock management strategies in the context of global changes. Yet, and despite recent impressive genome and transcriptome sequencing efforts from teleost species, available resources from the Scombridae family are comparatively scarce. Here, we generated the first high-quality de novo assembly of the liver transcriptome of the Atlantic chub mackerel (Scomber colias). Through the use of RNA-Seq Illumina technology, 111,124,228 clean reads were obtained for the liver transcriptome. De novo assembly resulted in 93,731 transcripts with an N50 of 1462 bp. This dataset provides an important insight into the context of fisheries management. Keywords: RNA-Seq, Scombridae, Stock management, Atlantic chub mackerel, Live

Performance biologica de Acetochlor na cultura do milho.

Com o objetivo de estudar-se a performance do acetochlor (2 - cloro-N (etoximetil)-6-etil-0-acetoluidina) no controle de plantas daninhas na cultura do milho, variedade BR-105, foi instalado um experimento em um Latossolo Vermelho-Amarelo, no estado de Minas Gerais. Acetochlor foi aplicado isoladamente e em mistura com atrazine (20cloro-4-(etilamina)-6-(isopropilamina)-s-triazina) sendo ainda comparado ao alachlor (2-cloro-2-dietil-N-(metoximetil) acetanilida) em duas formulacoes (concentracao emulsionavel e microencapsulado). Foi possivel verificar-se uma significativa superioridade do acetochlor em relacao ao alachlor quanto ao controle de plantas daninhas, principalmente com relacao a Ageratum conyzoides que indica em maior proporcao na area experimental. Constatou-se ainda que o controle de plantas daninhas obtido pelo acetochlor, aplicado isoladamente, foi equivalente aos tratamentos que incluiam misturas com atrazina. Nao se verificaram diferencas significativas entre os tipos da formulacoes de alachlor estudadas ou entre as misturas de tanque e misturas prontas com atrazine incluidas no ensaio. Os maiores valores de producao de graos foram obtidos pelos tratamentos que incluiram misturas com atrazina, sendo que estes proporcionaram producoes superiores a testemunha mantida no limpo (4293 kg/ha)

Atributos de solo afetados pela aplicação de cinza calcítica e fosfato natural em ecossistema associado caíva.

RESUMO: O objetivo deste trabalho foi avaliar o desempenho agronômico de genótipos de milho com bases genéticas distintas na presença ou ausência de inoculação de sementes com Azospirillum brasilense e de adubação nitrogenada de cobertura. Os experimentos foram conduzidos em Papanduva e Campos Novos, SC, nos anos agrícolas 2011/12 e 2012/13, utilizando-se delineamento experimental de blocos completos casualizados, com três repetições, em esquema fatorial 8 x 2 x 2. Foram avaliados oito genótipos de milho com ou sem inoculação de A. brasilense e em duas doses de N em cobertura: 0 e 100kg.ha-1.Para produtividade de grãos nenhuma interação foi detectada entre inoculação e genótipos nem entre inoculação e adubação nitrogenada. Nos quatro experimentos, a inoculação não proporcionou incrementos significativos na produtividade de grãos, em diferentes genótipos, com e sem adubação nitrogenada de cobertura. ABSTRACT: The objective of this research was to evaluate the performance of maize genotypes in presence or absence of seed inoculation with A. brasilense and nitrogen fertilization. The experiments were carried out in Papanduva and Campos Novos, Santa Catarina State, Brazil, during 2011/12 and 2012/13 cropping seasons. The experimental design was a complete blocks with three replications in a 8x2x2 factorial scheme. Eight genotypes with different genetic bases were submitted to presence or absence of seed inoculation and two N topdressing rates (0 and 100 kg/ha). For grain yield, no interaction was detected between seed inoculation with A. brasilense and genotypes as well as between inoculation and nitrogen fertilization. The seed inoculation with A. brasilense did not provide significant increases in grain yield in different genotypes, with and without nitrogen fertilization

Linhagens de arroz irrigado da Embrapa Clima Temperado frente à toxidez por herbicida do grupo químico das imidazolinonas.

Este trabalho teve como objetivo avaliar cruzamentos entre plantas de arroz irrigado tolerantes e sensíveis a herbicidas do grupo químico das imidazolinas, através da avaliação de linhagens em geração F2

Avaliação do perfil fenotípico de caprinos brasileiros e africanos.

Resumo: Objetivou-se diferenciar populações caprinas brasileiras e cabo-verdianas (n=1084) por meio de descritores biométricos e comparação com raças comerciais. Foram avaliadas sete características de fêmeas adultas, através da estatística descritiva, análise de variância, teste de multicolinearidade, distância generalizada de Mahalanobis (D2) e algoritmo UPGMA. Após o teste de multicolinearidade foi identificada e descartada a variável profundidade torácica. O maior valor da D2 foi entre as populações Nambi e Mambrina (D2=93,78), e a menor D2 foi entre as cabras cabo-verdianas de Santo Antão e São Vicente (D2=0,41). O dendrograma colocou as raças Mambrina e Anglo-Nubiana a parte das demais. As cabras de Cabo Verde ficaram mais próximas das brasileiras de núcleos de conservação. As caboverdianas se agruparam segundo Barlavento e Sotavento. A eficácia da manutenção dos caprinos brasileiros em rebanhos de conservação nos faz preconizar tais iniciativas como ferramenta eficaz de manutenção dos recursos genéticos para potencial uso sustentável. Evaluation of the phenotypic profile of Brazilian and African goats. Abstract: The work aims was differentiate Brazilian goats populations of Cape Verdean (n = 1084) using biometric descriptors and comparison with commercial breeds. It was measured seven characteristics of female adult goats by using descriptive statistics, analysis of variance test multicollinearity, Mahalanobis distance (D2) and UPGMA algorithm. After testing of multicollinearity was identified and discarded the thoracic depth variable. The maximum value of D2 was between populations Nambi and Mambrina (D2 = 93.78), and the lower D2 was between the Cape Verdean goats of Santo Antão and São Vicente (D2 = 0.41). The dendrogram put the breeds Mambrina and Anglo-Nubian part of others. The goats of Cape Verde were closer to the Brazilian conservation nuclei. The Cape Verdean were made a group was Barlavento and Sotavento. The maintenance efficiency of the Brazilian goat herds conservation makes us valuate such initiatives as an effective tool for maintenance of genetic resources for potential use sustainable