Robust estimation of bacterial cell count from optical density

Optical density (OD) is widely used to estimate the density of cells in liquid culture, but cannot be compared between instruments without a standardized calibration protocol and is challenging to relate to actual cell count. We address this with an interlaboratory study comparing three simple, low-cost, and highly accessible OD calibration protocols across 244 laboratories, applied to eight strains of constitutive GFP-expressing E. coli. Based on our results, we recommend calibrating OD to estimated cell count using serial dilution of silica microspheres, which produces highly precise calibration (95.5% of residuals <1.2-fold), is easily assessed for quality control, also assesses instrument effective linear range, and can be combined with fluorescence calibration to obtain units of Molecules of Equivalent Fluorescein (MEFL) per cell, allowing direct comparison and data fusion with flow cytometry measurements: in our study, fluorescence per cell measurements showed only a 1.07-fold mean difference between plate reader and flow cytometry data

Estudo morfométrico e morfológico da cicatrização após uso do laser erbium: YAG em tecidos cutâneos de ratos

Este trabalho analisa o efeito da reparação cutânea do laser erbium:yttrium aluminunn garnet (YAG) (Er:YAG) em pele de ratos através de estudo histológico e morfométrico. Tatuaram-se duas figuras no dorso de cada animal (n = 35), denominadas controle e experimento. Na figura experimento, aplicaram-se três passadas de laser Er:YAG com parâmetros padronizados. Cinco animais foram eutanasiados nos dias 0, 7, 14, 28, 56, 84 e 112 de pós-operatório. O estudo histológico demonstrou no dia 0 dano de ablação médio de 215,24 micrômetros (mm), sendo homogêneo com vaporização da epiderme e porções superficiais da derme. O dano térmico residual foi pequeno (média de 41,45mm), observando-se áreas onde estava praticamente ausente. A fibroplasia cicatricial já estava presente no dia 7 (média de 55,58mm), aumentando rapidamente até o dia 28 (média de 209,49mm), quando atingiu um platô e se manteve até o dia 112. Não houve sinais de processo inflamatório agudo no dia 7 e a reepitelização já estava completa. Concluiu-se que a aplicação de laser na pele de ratos induz reparação cutânea ao longo de 112 dias nas condições do experimento

Estudo morfométrico e morfológico da cicatrização após uso do laser erbium: YAG em tecidos cutâneos de ratos Morphometrical and morphological study of cicatricial effects caused by application of laser erbium: YAG on the skin of rats

Este trabalho analisa o efeito da reparação cutânea do laser erbium:yttrium aluminunn garnet (YAG) (Er:YAG) em pele de ratos através de estudo histológico e morfométrico. Tatuaram-se duas figuras no dorso de cada animal (n = 35), denominadas controle e experimento. Na figura experimento, aplicaram-se três passadas de laser Er:YAG com parâmetros padronizados. Cinco animais foram eutanasiados nos dias 0, 7, 14, 28, 56, 84 e 112 de pós-operatório. O estudo histológico demonstrou no dia 0 dano de ablação médio de 215,24 micrômetros (mm), sendo homogêneo com vaporização da epiderme e porções superficiais da derme. O dano térmico residual foi pequeno (média de 41,45mm), observando-se áreas onde estava praticamente ausente. A fibroplasia cicatricial já estava presente no dia 7 (média de 55,58mm), aumentando rapidamente até o dia 28 (média de 209,49mm), quando atingiu um platô e se manteve até o dia 112. Não houve sinais de processo inflamatório agudo no dia 7 e a reepitelização já estava completa. Concluiu-se que a aplicação de laser na pele de ratos induz reparação cutânea ao longo de 112 dias nas condições do experimento.<br>This study analyses the skin contracture effect of the erbium:YAG (Er:YAG) laser on the skin of rats by light microscopic histological and morphometrical evaluations. Two squares of back skin were precision tattooed on each of the animals (n = 35), that were termed control and experimental skin. The experimental skin was treated with three passes of the Er:YAG laser with standardized parameters. Five animals were killed and skin specimens were analyzed at 00, 07, 14, 28, 56, 84 and 112 days. Histologic examination demonstrated a mean of 215.24 micrometers ablative damage that was homogeneous with complete vaporization of the epidermis and superficial dermis. The residual thermal damage was small (mean of 41.45 micrometers) observing areas where it was absent. The cicatritial fibroplasy was present at day 07 (mean 55.58 micrometers) rising quickly until day 28 (mean of 209.49 micrometers) when it reaches a plateau and maintaining it until day 112. There are no signs of acute inflammatory process at day 07 and the reepithealization was complete at this day. This study revealed that the laser had induced shortening of the treated areas which persisted beyond the 112 days

Surgical reduction of the renal mass in rats: morphologic and functional analysis on the remnant kidney Redução cirúrgica da massa renal em ratos: análise funcional e morfológica do rim remanescente

PURPOSE: This study has analyzed the giochemical and morphological effects on the remmant kidney in rats which were submitted to progressive surgical ablation of renal mass. METHODS: Sixty Wistar male rats, weighing between 210 and 380g, were used and they were distributed in 3 groups of 20 animals each. The rats from the groups called 1, 2 and 3 were submitted to the surgical removal of renal tissue equivalent to &frac12;, 2/3 and 5/6 of the whole renal mass, respectively. Then the groups were subdivided into 2 subgroups and they were operated again within 24 hours (subgroups 1B, 2B and 3B) and within 8 weeks (subgroups 1C, 2C and 3C) for the removal of the remnant kidney. 24-hour urine and blood were collected to analyze serum creatinine, clearance of creatinine and proteinuria in the first surgical intervention and at the time of the re-operation. The remnant kidney was submitted to a macroscopic evaluation for the degree of hypertrophy and to the analysis of histology. RESULTS: There was a significant increase of the volume of the remnant kidney (164%) and glomerular sclerosis was present in 40% of the animals submitted to the ablation of 5/6 of renal mass. Functional alterations characterized by the increase of urinary excretion of proteins (50% in group 3), rise in the serum creatinine (261% subgroup 2B; 371% subgroup 3B, 118% subgroup 3C) and a significant reduction of the clearance of creatinine (control x subgroup 3C = 2,88 x 1,15 ml/min: p<0,05 were also observed. CONCLUSION: The compensatory renal hypertrophy, as well as the glomerular injury translated in the form of proteinuria and sclerosis, are closed related to the volume of the remnant kidney, thus they are more evident when a greater fraction of the renal tissue is excised.<br>OBJETIVO: O estudo analisou os efeitos bioquímicos e morfológicos sobre o rim remanescente em ratos submetidos à ablação cirúrgica progressiva da massa renal. MÉTODOS: Foram utilizados 60 ratos machos Wistar, pesando entre 210 e 380g, distribuídos em 3 grupos contendo 20 animais cada. Os ratos dos grupos denominados de 1,2 e 3 foram submetidos à remoção cirúrgica de tecido renal equivalente a &frac12;, 2/3 e 5/6 da massa renal total, respectivamente. Os grupos foram então subdivididos em 2 subgrupos e reoperados em 24 horas (subgrupos 1B, 2B, 3B) e em 8 semanas (subgrupos 1C, 2C, 3C) para remoção do rim remanescente. Foram obtidas coletas de urina de 24 horas e sangue para análise da creatinina sérica, depuração da creatinina e proteinúria na primeira intervenção cirúrgica e por ocasião da reoperação. O rim remanescente foi submetido à avaliação macroscópica do grau de hipertrofia e à análise histológica. RESULTADOS: Houve aumento significativo do volume do rim remanescente (164%) e presença de esclerose glomerular em 40% dos animais submetidos à ablação de 5/6 da massa renal. Alterações funcionais caracterizadas pelo aumento da excreção urinária de proteínas (50% no grupo 3), elevação dos níveis séricos da creatinina (261% subgrupo 2B; 371% subgrupo 3B; 118% subgrupo 3C) e redução significativa da depuração de creatinina (controle x subrupo 3C = 2,88 x 1,15ml/min :p<0,05) foram também observadas. CONCLUSÃO: A hipertrofia renal compensatória bem como a injúria glomerular traduzida sob a forma de proteinúria e esclerose estão intimamente relacionadas ao volume do rim remanescente, sendo, portanto, mais evidentes quando uma maior fração de tecido renal é extraída

Influence of nicotine on healing of vesical sutures in rabbits A influência da nicotina na cicatrização de suturas vesicais em coelhos

PURPOSE: To study the effects of nicotine on inflammatory cells, deposition of collagen and its interference on the strength of tissue in vesical sutures in rabbits. METHODS: Twenty New Zealand rabbits were used, randomized into two groups: group N, consisting of 10 animals, to which nicotine was administered in the dose of 2mg/kg of weight as a subcutaneous injection, diluted in 1ml of saline solution at 0.9% in a daily administration during the 28 days prior to the surgery; and group C, consisting of 10 animals, to which saline solution at 0.9% was administered in the same conditions and time intervals of the nicotine group. All the animals underwent cystotomy and suture of the bladder wall 28 days after the administration of nicotine or saline solution. The measurements were performed on the fourth and seventh day in each group after cystectomy and euthanasia of the animals. A fragment of bladder was removed and sent for a tensile strength test to evaluate the tissue strength and another fragment underwent a histological analysis of inflammatory process and deposition of collagen. RESULTS: There was a decrease of neutrophils on the fourth postoperative day (p=0.079) and an increase of plasmocytes on the seventh postoperative day (p=0.053) in the animals that were given nicotine, without statistical difference in relation to the control group. In the analysis of the proliferation of fibroblasts, deposition of collagen and tensile strength test, there was no statistical difference in relation to the control group. CONCLUSION: The administration of nicotine in rabbits did not influence the healing process of vesical suture in relation to the inflammatory cells, deposit of collagen and tissue strength of the suture.<br>OBJETIVO: Estudar os efeitos da nicotina sobre as células inflamatórias, deposição de colágeno e sua interferência sobre a força tecidual em suturas vesicais de coelhos. MÉTODOS: Foram utilizados 20 coelhos Nova Zelândia, divididos de maneira aleatória em dois grupos: grupo N, composto de 10 animais, no qual foi administrada nicotina na dose de 2mg/Kg de peso por via subcutânea, diluída em 1ml de solução fisiológica a 0,9% em 1 aplicação diária por 28 dias prévios à cirurgia; e grupo C, composto por 10 animais, no qual foi administrada solução fisiológica a 0,9% nas mesmas condições e intervalos de tempo do grupo nicotina. Todos os animais foram submetidos à cistotomia com sutura da parede vesical após 28 dias da administração de nicotina ou solução fisiológica. As aferições foram realizadas no 4º e 7º dia em cada grupo após cistectomia e eutanásia dos animais. Uma parte da bexiga foi submetida a teste de tração para avaliar a força tecidual da sutura e outro fragmento foi submetido à análise histológica de processo inflamatório e deposição de colágeno. RESULTADOS: Houve uma diminuição de neutrófilos no 4º dia pós-operatório (p=0,079) e aumento de plasmócitos no 7º dia após a cirurgia (p=0,053) nos animais que receberam nicotina, sem diferença estatística em relação ao grupo controle. Na análise de proliferação de fibroblastos, deposição de colágeno e teste de tração tecidual, não houve diferença estatística em relação ao grupo controle. CONCLUSÃO: A administração de nicotina em coelhos não influenciou no processo de cicatrização de sutura vesicais em relação às células inflamatórias, depósito de colágeno e força tecidual da sutura

Análises morfométrica e morfológica das alterações cutâneas após uso do laser Nd-YAG em tecidos palpebrais humanos Cutaneous changes morphometrical and histological analysis after the use of laser Nd-YAG in human eyelid tissue

O uso do laser neodymium-yttrium-aluminium-garnet (Nd-YAG) como instrumento auxiliar para o rejuvenescimento propiciou um refinamento da técnica tradicional. Tal procedimento mostra resultados satisfatórios com relação ao aprimoramento técnico e à recuperação pós-operatória. OBJETIVO: Evidenciar as alterações histológicas e morfométricas encontradas na pálpebra de humanos após aplicação do laser Nd-YAG e comparar com a pele normal. MATERIAL E MÉTODO: Nove pacientes do sexo feminino foram submetidas à aplicação do laser Nd-YAG em região palpebral direita. A pálpebra esquerda correspondeu à área controle, livre de qualquer tipo de procedimento. Foram realizadas várias aplicações do laser Nd-YAG, sendo que, no último dia, foi realizada biópsia palpebral bilateralmente. Os critérios morfométricos avaliados foram: medida da espessura da epiderme, da área subepidérmica livre de lesão, da zona de degeneração do colágeno e da espessura total da derme. RESULTADOS: Nas áreas submetidas à aplicação do laser Nd-YAG, a espessura média da epiderme foi de 33,53 micrômetros (µm) e a da pele normal foi de 29,61µm (p = 0,1099). A média da medida da área subepidérmica livre de lesão, no lado direito, foi de 40,93µm, e de 36,27µm (p = 0,1373) no esquerdo. A espessura da região de degeneração do colágeno na pálpebra que recebeu tratamento com laser teve média de 293,54µm, enquanto que na pálpebra normal ela foi de 292,22µm (p = 0,4835). No lado onde se aplicou o laser Nd-YAG, a espessura total da derme teve uma média de 681,48µm e, no lado livre de procedimento, 664,14µm (p = 0,3492). DISCUSSÃO E CONCLUSÕES: Apesar da diferença clínica observada após tratamento de lesões de envelhecimento em pálpebra de humanos com o uso do laser Nd-YAG, nota-se que não houve diferença histológica ou morfométrica após tal procedimento.<br>The use of laser Neodymium-Yttrium-Aluminium-Garnet (Nd-YAG) as an auxiliary tool on rejuvenation provided a refining of the traditional technique. This laser procedure show satisfactory results with technical improvement and postoperatory recovery. OBJECTIVES: The aim of this study is to show the histological and morphometrical changes found in human eyelid tissue after the use of laser Nd-YAG and its comparision to the normal structure. MATERIAL AND METHODS: Nine female patients underwent laser Nd-YAG application on their right eyelid. The left eyelid was taken by control-tissue, free of any kind of procedure. It was made many applications of the laser and on the last day, it was made a bilateral biopsy. The morphometrical criteria appraised were: epidermal denseness measure, subepidermal area free of injury, colagen degeneration and total dermal density. RESULTS: In those areas whose underwent laser the epidermal measure was of 33,53 micrometers (µm) and on the normal tissue, was of 29.61µm (p = 0.1099). The subepidermal measure was, on average, of 40.93µm on right side and of 36.27µm on left side (p = 0.1373). The colagen degeneration measure on the right side was of 293.54µm and on the left side was of 292.22µm (p = 0.4835). On the procedure site, the total dermal measure was of 681,48µm and on the free site, it was of 664.14µm (p = 0.3492). DISCUSSION AND CONCLUSIONS: Despite the clinical changes observed after laser Nd-YAG therapy, there were neither histological nor morphometrical significative changes