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Lâadaptation Ă la sĂ©cheresse chez le pin maritime (Pinus pinaster Ait.) : patrons de diversitĂ© et diffĂ©renciation nuclĂ©otidiques de gĂšnes candidats et variabilitĂ© de caractĂšres phĂ©notypiques
DiplĂŽme : Dr. d'UniversiteLes changements climatiques annoncĂ©s risquent de constituer des pressions de sĂ©lection importantes sur des caractĂšres tels que la rĂ©sistance Ă la sĂ©cheresse, notamment pour des espĂšces forestiĂšres comme le pin maritime. Dans ce contexte, une question essentielle est de savoir si ces espĂšces pourront sâadapter suffisamment rapidement aux nouvelles conditions climatiques. Les objectifs de cette thĂšse Ă©taient dâĂ©valuer le potentiel adaptatif de populations naturelles de pin maritime pour des caractĂšres liĂ©s Ă la rĂ©sistance au dĂ©ficit hydrique, et dâidentifier des gĂšnes potentiellement impliquĂ©s dans la variation adaptative intra- et inter-populations. Pour y rĂ©pondre, la variabilitĂ© phĂ©notypique pour des caractĂšres de croissance, de biomasse, et dâefficience dâutilisation en eau (EUE) a Ă©tĂ© Ă©valuĂ©e dans un essai de populations naturelles provenant de milieux contrastĂ©s sur les plans climatiques et Ă©cologiques. Une grande variabilitĂ© phĂ©notypique a Ă©tĂ© mise en Ă©vidence entre performances moyennes des populations, et pour les valeurs relatives dâhĂ©ritabilitĂ©s et de corrĂ©lations entre biomasse et EUE estimĂ©es dans chaque population. Ces rĂ©sultats ont confirmĂ© le rĂŽle de la sĂ©lection dans lâadaptation locale du pin maritime, suggĂ©rant des stratĂ©gies de rĂ©ponses Ă un dĂ©ficit hydrique diffĂ©rentes selon les populations. Les patrons de diversitĂ© et diffĂ©renciation nuclĂ©otidiques de gĂšnes candidats Ă la rĂ©sistance au stress hydrique ont Ă©galement Ă©tĂ© Ă©tudiĂ©s. Certains gĂšnes sâĂ©cartent significativement de patrons dâĂ©volution neutre, avec des signatures cohĂ©rentes et complĂ©mentaires entre plusieurs mĂ©thodes, qui ont Ă©tĂ© interprĂ©tĂ©es en termes de scĂ©narios de sĂ©lection. LâhĂ©tĂ©rogĂ©nĂ©itĂ© de ces signatures entre gĂšnes candidats et entre populations pour certains gĂšnes, serait aussi cohĂ©rente avec un rĂŽle de la sĂ©lection naturelle plutĂŽt quâavec celui dâĂ©vĂšnements dĂ©mographiques qui auraient affectĂ© lâensemble du gĂ©nome de façon plus homogĂšne. Enfin, quelques associations remarquables ont Ă©tĂ© mises en Ă©vidence entre la variation de lâEUE entre populations et au sein des populations, et celle de marqueurs SNPs de gĂšnes de dĂ©hydrines, de lignification ou de formation de la paroi cellulaire. Ce travail ouvre ainsi des perspectives encourageantes pour la comprĂ©hension de lâarchitecture gĂ©nĂ©tique molĂ©culaire de lâadaptation Ă la sĂ©cheresse chez cette espĂšce
Associations entre polymorphisme de séquence de gÚnes candidats et caractÚres de qualité du bois
Lâadaptation Ă la sĂ©cheresse chez le pin maritime (Pinus pinaster Ait.) : patrons de diversitĂ© et diffĂ©renciation nuclĂ©otidiques de gĂšnes candidats et variabilitĂ© de caractĂšres phĂ©notypiques
Les changements climatiques annoncĂ©s risquent de constituer des pressions de sĂ©lection importantes sur des caractĂšres tels que la rĂ©sistance Ă la sĂ©cheresse, notamment pour des espĂšces forestiĂšres comme le pin maritime. Dans ce contexte, une question essentielle est de savoir si ces espĂšces pourront sâadapter suffisamment rapidement aux nouvelles conditions climatiques. Les objectifs de cette thĂšse Ă©taient dâĂ©valuer le potentiel adaptatif de populations naturelles de pin maritime pour des caractĂšres liĂ©s Ă la rĂ©sistance au dĂ©ficit hydrique, et dâidentifier des gĂšnes potentiellement impliquĂ©s dans la variation adaptative intra- et inter-populations. Pour y rĂ©pondre, la variabilitĂ© phĂ©notypique pour des caractĂšres de croissance, de biomasse, et dâefficience dâutilisation en eau (EUE) a Ă©tĂ© Ă©valuĂ©e dans un essai de populations naturelles provenant de milieux contrastĂ©s sur les plans climatiques et Ă©cologiques. Une grande variabilitĂ© phĂ©notypique a Ă©tĂ© mise en Ă©vidence entre performances moyennes des populations, et pour les valeurs relatives dâhĂ©ritabilitĂ©s et de corrĂ©lations entre biomasse et EUE estimĂ©es dans chaque population. Ces rĂ©sultats ont confirmĂ© le rĂŽle de la sĂ©lection dans lâadaptation locale du pin maritime, suggĂ©rant des stratĂ©gies de rĂ©ponses Ă un dĂ©ficit hydrique diffĂ©rentes selon les populations. Les patrons de diversitĂ© et diffĂ©renciation nuclĂ©otidiques de gĂšnes candidats Ă la rĂ©sistance au stress hydrique ont Ă©galement Ă©tĂ© Ă©tudiĂ©s. Certains gĂšnes sâĂ©cartent significativement de patrons dâĂ©volution neutre, avec des signatures cohĂ©rentes et complĂ©mentaires entre plusieurs mĂ©thodes, qui ont Ă©tĂ© interprĂ©tĂ©es en termes de scĂ©narios de sĂ©lection. LâhĂ©tĂ©rogĂ©nĂ©itĂ© de ces signatures entre gĂšnes candidats et entre populations pour certains gĂšnes, serait aussi cohĂ©rente avec un rĂŽle de la sĂ©lection naturelle plutĂŽt quâavec celui dâĂ©vĂšnements dĂ©mographiques qui auraient affectĂ© lâensemble du gĂ©nome de façon plus homogĂšne. Enfin, quelques associations remarquables ont Ă©tĂ© mises en Ă©vidence entre la variation de lâEUE entre populations et au sein des populations, et celle de marqueurs SNPs de gĂšnes de dĂ©hydrines, de lignification ou de formation de la paroi cellulaire. Ce travail ouvre ainsi des perspectives encourageantes pour la comprĂ©hension de lâarchitecture gĂ©nĂ©tique molĂ©culaire de lâadaptation Ă la sĂ©cheresse chez cette espĂšce
Associations entre polymorphisme de séquence de gÚnes candidats et caractÚres de qualité du bois
Lâadaptation Ă la sĂ©cheresse chez le pin maritime (Pinus pinaster Ait.) : patrons de diversitĂ© et diffĂ©renciation nuclĂ©otidiques de gĂšnes candidats et variabilitĂ© de caractĂšres phĂ©notypiques
Les changements climatiques annoncĂ©s risquent de constituer des pressions de sĂ©lection importantes sur des caractĂšres tels que la rĂ©sistance Ă la sĂ©cheresse, notamment pour des espĂšces forestiĂšres comme le pin maritime. Dans ce contexte, une question essentielle est de savoir si ces espĂšces pourront sâadapter suffisamment rapidement aux nouvelles conditions climatiques. Les objectifs de cette thĂšse Ă©taient dâĂ©valuer le potentiel adaptatif de populations naturelles de pin maritime pour des caractĂšres liĂ©s Ă la rĂ©sistance au dĂ©ficit hydrique, et dâidentifier des gĂšnes potentiellement impliquĂ©s dans la variation adaptative intra- et inter-populations. Pour y rĂ©pondre, la variabilitĂ© phĂ©notypique pour des caractĂšres de croissance, de biomasse, et dâefficience dâutilisation en eau (EUE) a Ă©tĂ© Ă©valuĂ©e dans un essai de populations naturelles provenant de milieux contrastĂ©s sur les plans climatiques et Ă©cologiques. Une grande variabilitĂ© phĂ©notypique a Ă©tĂ© mise en Ă©vidence entre performances moyennes des populations, et pour les valeurs relatives dâhĂ©ritabilitĂ©s et de corrĂ©lations entre biomasse et EUE estimĂ©es dans chaque population. Ces rĂ©sultats ont confirmĂ© le rĂŽle de la sĂ©lection dans lâadaptation locale du pin maritime, suggĂ©rant des stratĂ©gies de rĂ©ponses Ă un dĂ©ficit hydrique diffĂ©rentes selon les populations. Les patrons de diversitĂ© et diffĂ©renciation nuclĂ©otidiques de gĂšnes candidats Ă la rĂ©sistance au stress hydrique ont Ă©galement Ă©tĂ© Ă©tudiĂ©s. Certains gĂšnes sâĂ©cartent significativement de patrons dâĂ©volution neutre, avec des signatures cohĂ©rentes et complĂ©mentaires entre plusieurs mĂ©thodes, qui ont Ă©tĂ© interprĂ©tĂ©es en termes de scĂ©narios de sĂ©lection. LâhĂ©tĂ©rogĂ©nĂ©itĂ© de ces signatures entre gĂšnes candidats et entre populations pour certains gĂšnes, serait aussi cohĂ©rente avec un rĂŽle de la sĂ©lection naturelle plutĂŽt quâavec celui dâĂ©vĂšnements dĂ©mographiques qui auraient affectĂ© lâensemble du gĂ©nome de façon plus homogĂšne. Enfin, quelques associations remarquables ont Ă©tĂ© mises en Ă©vidence entre la variation de lâEUE entre populations et au sein des populations, et celle de marqueurs SNPs de gĂšnes de dĂ©hydrines, de lignification ou de formation de la paroi cellulaire. Ce travail ouvre ainsi des perspectives encourageantes pour la comprĂ©hension de lâarchitecture gĂ©nĂ©tique molĂ©culaire de lâadaptation Ă la sĂ©cheresse chez cette espĂšce
L'adaptation à la sécheresse chez le pin maritime (Pinus pinaster Ait.) (patrons de diversité et différenciation nucléotidiques de gÚnes candidats et variabilité de caractÚres phénotypiques)
Les changements climatiques annoncés risquent de constituer des pressions de sélection importantes sur des caractÚres tels que la résistance à la secheress, notamment pour des espÚces forestiÚres comme le pin maritime. Dans ce contexte, une question essentielle est de savoir si ces espÚces pourront s'adapter suffisamment rapidement aux nouvelles conditions climatiques. Les objectifs de cette thÚse étaient d'évaluer le potentiel adaptatif de populations naturelles de pin maritime pour des caractÚres liés à la résistance au déficit hydrique, et d'identifier des gÚnes potentiellement impliqués dans la variation adaptative intra- et inter-populations. Pour y répondre, la variabilité phénotypique pour des caractÚres de croissance, de biomasse, et d'efficience d'utilisation en eau (EUE) a été évaluée dans un essai de populations naturelles provenant de milieux contrastés sur les plans climatiques et écologiques. Une grande variabilité phénotypique a été mise en évidence entre performances moyennes des populations, et pour les valeurs relatives d'héritabilité et de corrélations entre biomasse et EUE estimées dans chaque population. Ces résultats ont confirmé le rÎle de la sélection dans l'adaptation locale du pin maritime, suggérant des stratégies de réponses à un déficit hydrique différentes selon les populations. Les patrons de diversité et différenciation nucléotidiques de gÚnes candidats à la résistance au stress hydrique ont également été étudiés. Certains gÚnes s'écartent significativement de patrons d'évolution neutre, avec des signatures cohérentes et complémentaires entre plusieurs méthodes, qui ont été interprétées en termes de scénarios de sélection. L'hétérogénéité de ces signatures entre gÚnes candidats et entre populations pour certains gÚnes, serait aussi cohérente avec un rÎle de la sélection naturelle plutÎt qu'avec celui d'évÚnements démographiques qui auraient affecté l'ensemble du génome de façon plus homogÚne. Enfin, quelques associations remarquables ont été mises en évidence entre la variaton de l'EUE entre populations et au sein des populations, et celles de marqueurs SNPs de gÚnes de déhydrines, de lignification ou de formation de la paroi cellulaire. Ce travail ouvre ainsi des perspectives encourageantes pour la compréhension de l'architecture génétique moléculaire de l'adaptation à la sécheresse chez cette espÚce.BORDEAUX1-BU Sciences-Talence (335222101) / SudocSudocFranceF
Adaptation des variétés de pin maritime aux évolutions du climat
Les avancĂ©es de la recherche concernant la durabilitĂ© du systĂšme de culture du pin maritime dans le massif des Landes de Gascogne, et plus particuliĂšrement lâadaptation de lâespĂšce au stress hydrique, dans le contexte des changements climatiques annoncĂ©s, sont prĂ©sentĂ©es ici. DiffĂ©rentes stratĂ©gies de sĂ©lection de variĂ©tĂ©s amĂ©liorĂ©es intĂ©grant les composantes de lâadaptation sont envisagĂ©es, notamment en exploitant la variabilitĂ© importante de lâespĂšce. Dâautre part, des recherches sont menĂ©es en amont du programme dâamĂ©lioration, sur les caractĂšres physiologiques de lâadaptation Ă la sĂ©cheresse chez le pin maritime (cavitation, efficience dâutilisation en eau) et sur les gĂšnes potentiellement impliquĂ©s dans cette adaptation, ouvrant des perspectives encourageantes pour la sĂ©lection de cette espĂšce.Research progress concerning sustainability of the maritime pine silviculture system in the Landes de Gascogne forests, especially addressing drought stress resistance in the context of climate change, are presented here. Different selection strategies for improved varieties involving adaptation traits are considered, for instance by exploiting the large variability of the species. Researches are carried on physiological traits of drought adaptation in maritime pine (cavitation, water use efficiency) and on genes likely to be involved in this adaptation, bringing encouraging prospects for the selection of this species
Adaptation des variétés de pin maritime aux évolutions du climat
Les avancĂ©es de la recherche concernant la durabilitĂ© du systĂšme de culture du pin maritime dans le massif des Landes de Gascogne, et plus particuliĂšrement lâadaptation de lâespĂšce au stress hydrique, dans le contexte des changements climatiques annoncĂ©s, sont prĂ©sentĂ©es ici. DiffĂ©rentes stratĂ©gies de sĂ©lection de variĂ©tĂ©s amĂ©liorĂ©es intĂ©grant les composantes de lâadaptation sont envisagĂ©es, notamment en exploitant la variabilitĂ© importante de lâespĂšce. Dâautre part, des recherches sont menĂ©es en amont du programme dâamĂ©lioration, sur les caractĂšres physiologiques de lâadaptation Ă la sĂ©cheresse chez le pin maritime (cavitation, efficience dâutilisation en eau) et sur les gĂšnes potentiellement impliquĂ©s dans cette adaptation, ouvrant des perspectives encourageantes pour la sĂ©lection de cette espĂšce.Research progress concerning sustainability of the maritime pine silviculture system in the Landes de Gascogne forests, especially addressing drought stress resistance in the context of climate change, are presented here. Different selection strategies for improved varieties involving adaptation traits are considered, for instance by exploiting the large variability of the species. Researches are carried on physiological traits of drought adaptation in maritime pine (cavitation, water use efficiency) and on genes likely to be involved in this adaptation, bringing encouraging prospects for the selection of this species
Adaptation des variétés de pin maritime aux évolutions du climat
Les avancĂ©es de la recherche concernant la durabilitĂ© du systĂšme de culture du pin maritime dans le massif des Landes de Gascogne, et plus particuliĂšrement lâadaptation de lâespĂšce au stress hydrique, dans le contexte des changements climatiques annoncĂ©s, sont prĂ©sentĂ©es ici. DiffĂ©rentes stratĂ©gies de sĂ©lection de variĂ©tĂ©s amĂ©liorĂ©es intĂ©grant les composantes de lâadaptation sont envisagĂ©es, notamment en exploitant la variabilitĂ© importante de lâespĂšce. Dâautre part, des recherches sont menĂ©es en amont du programme dâamĂ©lioration, sur les caractĂšres physiologiques de lâadaptation Ă la sĂ©cheresse chez le pin maritime (cavitation, efficience dâutilisation en eau) et sur les gĂšnes potentiellement impliquĂ©s dans cette adaptation, ouvrant des perspectives encourageantes pour la sĂ©lection de cette espĂšce.Research progress concerning sustainability of the maritime pine silviculture system in the Landes de Gascogne forests, especially addressing drought stress resistance in the context of climate change, are presented here. Different selection strategies for improved varieties involving adaptation traits are considered, for instance by exploiting the large variability of the species. Researches are carried on physiological traits of drought adaptation in maritime pine (cavitation, water use efficiency) and on genes likely to be involved in this adaptation, bringing encouraging prospects for the selection of this species