Estudo de diversidade entre populações de cabras SRD com base em dados biométricos.

Objetivou-se analisar recursos genéticos disponíveis e sua diversidade através de dados biométricos de caprinos sem raça definida (SRD) para discernimento genético entre populações das diferentes mesorregiões e microrregiões do Ceará..

Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e frequentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias.

Foi simulado um genoma de 3.000 centimorgans de comprimento considerando uma única característica quantitativa, governada por 800 locos com dois alelos por loco. Segundo a estrutura genômica proposta, foram simulados 1.500 machos e 1.500 fêmeas que formaram a população-base. A partir da população-base foram formadas duas populações iniciais, uma grande e outra pequena. Dois tipos de estruturas de heterogeneidade de variâncias foram inseridos nas populações iniciais: heterogeneidade de variância genética aditiva e heterogeneidade de variâncias genética aditiva e ambiental. Para obtenção destas estruturas, foram feitos descartes estratégicos dos valores genéticos aditivos e ambientais de acordo com o tipo de heterogeneidade e o nível de variabilidade desejada: alta, média ou baixa. Os componentes de variância foram estimados por meio da metodologia Bayesiana via Amostragem de Gibbs e pelo método REML. Para a metodologia Bayesiana, foram utilizados três níveis de informação a priori: não-informativo, pouco informativo e informativo. Os métodos comparados apresentaram resultados semelhantes quando priors não-informativos foram utilizados e as populações de tamanho grande, de modo geral, apresentaram melhores estimativas. Para as populações pequenas, as análises realizadas considerando os níveis de variabilidade separadamente apresentaram maiores problemas, em virtude do pequeno tamanho das subpopulações formadas. Observou-se, para a metodologia Bayesiana, que o aumento no nível de informação a priori influenciou positivamente as estimativas dos componentes de variância, principalmente para as populações pequenas. Portanto, na presença de heterogeneidade de variâncias, as metodologias se comportam de forma semelhante. Entretanto, para populações pequenas a metodologia Bayesiana conduz a melhores estimativas quando informações adicionais estão disponíveis.Suplemento

Estimação de componentes de variância sob influência de genes de efeito principal, comparando-se metodologias Baynesiana e clássica sob diferentes cenários.

Quatro diferentes tipos de população foram simulados com o objetivo de verificar a influência de genes de efeito principal e do tamanho da população na estimação de componentes de variância sob seleção. A estimação foi realizada por meio da utilização e comparação das metodologias clássica e Bayesiana (a Bayesiana com três níveis de informação a priori). As metodologias REML e Bayesiana com prior não-informativo, em geral, produziram resultados bastante semelhantes. Em populações cuja característica é governada por genes de efeito principal, as estimativas dos componentes de variância genética aditiva foram pouco acuradas, exceto quando se utilizou metodologia Bayesiana com prior informativo. A inclusão das informações de parentesco e dos registros de todos os indivíduos até a população-base mostrou-se necessária, exceto para populações grandes cuja característica é governada por elevado número de genes

Genetic evaluation of Alpine goats using different milk control intervals.

The objective of this study was to compare the results of genetic evaluations by using different milk control intervals to reduce the cost of milk yield controls without harming the quality of genetic evaluation of the animals. We analyzed test day milk yield data from the Goat Sector of Universidade Federal de Viçosa

Diversidade biométrica entre populações caprinas no Brasil e no Marrocos.

O objetivo neste trabalho foi analisar o discernimento genético entre 12 populações caprinas (n=796) por meio de dados biométricos e de análises estatísticas. Mensurou-se altura de cernelha (AC), altura da maçã do peito ao chão (AP) e comprimento de orelha de cabras adultas. A profundidade torácica foi calculada (AC-AP). Foi adotada a distância euclidiana média padronizada e o método Unweighted Pair Group Method With Arithmetic Mean (UPGMA). O coeficiente de correlação cofenética apresentado pelo dendrograma (CCC = 0,82), denota que o método UPGMA contribuiu para a interpretação fidedigna da divergência dos grupos genéticos caprinos. Os resultados obtidos com este método permitem preconizá-lo para trabalhos futuros que venham a incluir um maior número de variáveis biométricas, de indivíduos e de populações

Análise de componentes principais no estudo da diversidade genética de caprinos.

Analisou-se dados biométricos de raças exóticas Toggenbourg, Saanen, Anglonubiana, Alpina e Boer. No Marrocos, foram amostrados caprinos locais Drâa, Zagora e Rhâali. Mensurou-se altura de cernelha (AC), altura da maçã do peito ao chão (AP) e comprimento de orelha (CO). A profundidade torácica foi calculada (AC-AP) e foram estabelecidos índices entre duas medidas corporais. As variáveis foram submetidas à análise de componentes principais (ACP) através do programa SAS v. 9.0. Do total de sete componentes, os dois primeiros foram suficientes para acumular 74,87% da variância total dos dados. Na representação gráfica da distribuição dos indivíduos, observou-se que Toggebourg, Saanen e Alpina ocuparam apenas os quadrantes esquerdos e Zagora apenas nos quadrantes direitos. Drâa ocupou os quadrantes superiores. Apresentaram menos identidade as populações de Rhâali, Boer e Anglo-nubiana, cujos indivíduos se dispersaram entre ambos os quadrantes inferiores e o superior direito. Estes resultados estão de acordo com o histórico e a distribuição geográfica das raças, alertam para a necessidade de outros estudos sobre os caprinos marroquinos. Os resultados da ACP foram consistentes, permitindo preconizá-la como uma técnica auxiliar em estudos futuros

Aspectos genéticos e ambientais da curva de lactação de vacas da raça Guzerá.

O conhecimento das relações genéticas entre os parâmetros da curva de lactação e a produção de leite é importante para a seleção de vacas e de touros. Os registros de produção de leite de 583 vacas da raça Guzerá, filhas de 165 reprodutores, foram usados para estimação dos parâmetros da curva de lactação em dois modelos matemáticos. As informações referentes às produções de leite foram obtidas usando-se a base de dados extraída do Arquivo Zootécnico Nacional, mantido na Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa Gado de Leite). As análises foram efetuadas usando-se o sistema MTDFREML, sob modelo animal que incluiu os efeitos fixos de rebanho-ano-estação de parto e, como covariável, a idade da vaca ao parto, com termos linear e quadrático. Como efeitos aleatórios foram incluídos animal, efeito permanente de ambiente e erro. As estimativas de correlações genéticas entre a produção de leite total, a produção inicial e a taxa de declínio da produção foram de 0,55 e 0,86 e de -0,19 e 0,38, respectivamente, para cada modelo matemático estudado. Para as duas últimas características, estas estimativas foram de 0,45 e 0,75, indicando que vacas com maiores produções iniciais apresentaram declínios mais acentuados da produção de leite ao longo do período de lactação. As correlações genéticas entre a produção de leite em 305 dias e os parâmetros do modelo seguiram a mesma tendência, em magnitude e sinal, às da produção de leite total. De acordo com os resultados, pode-se inferir que a seleção para a produção de leite total resulta em acréscimo na produção inicial e mudanças inexpressivas na taxa de declínio da produção de leite, não alterando a forma da curva de lactação. As correlações de ordem entre as classificações dos valores genéticos preditos foram altas e positivas (0,68 e 0,74), sugerindo que os indivíduos com os maiores valores genéticos para produção inicial de leite seriam também aqueles com maiores valores para produção de leite total

Genetic evaluation for persistency of lactation in Holstein cows using a random regression model.

A model for analyzing test day records including both fixed and random coefficients was applied to the genetic evaluation of first lactation data for Holstein cows. Data comprising 87045 test-day milk yield records from calving between 1997 and 2001 from Holstein herds in 10 regions of the Brazilian state of Minas Gerais. Six persistency of lactation measures were evaluated using breeding values obtained by random regression analyses. The Wilmink function was used to model the additive genetic and permanent environmental effects. Residual variance was constant throughout lactation. Ranking for animals did not change among criteria for persistency measurements, but ranking changes were observed when the estimated breeding value (EBV) for persistency of lactation was contrasted with those estimated for 305-day milk yield (305MY). The rank correlation estimates for persistency of lactation and 305MY were practically the same for sire and cows, and ranged from -0.45 to 0.69. The EBVs for milk yield during lactation for sires producing daughters with superior 305MY indicate genetic differences between sires regarding their ability to transmit desirable persistency of lactation traits. This suggests that selection for total lactation milk yield does not identify sires or cows that are genetically superior in regard to persistency of lactation. Genetic evaluation for persistency of lactation is important for improving the efficiency of the milk production capacity of Holstein cows

Estimation of genetic parameters for test-day milk yield in holstein cows using a random regression model.

Test-day milk yield records of 11,023 first-parity Holstein cows were used to estimate genetic parameters for milk yield during different lactation periods. (Co)variance components were estimated using two random regression models, RRM1 and RRM2, and the restricted maximum likelihood method, compared by the likelihood ratio test. Additive genetic variances determined by RRM1 and additive genetic and permanent environmental variances estimated by RRM2 were described, using the Wilmink function. Residual variance was constant throughout lactation for the two models. The heritability estimates obtained by RRM1 (0.34 to 0.56) were higher than those obtained by RRM2 (0.15 to 0.31). Due to the high heritability estimates for milk yield throughout lactation and the negative genetic correlation between test-day yields during different lactation periods, the RRM1 model did not fit the data. Overall, genetic correlations between individual test days tended to decrease at the extremes of the lactation trajectory, showing values close to unity for adjacent test days. The inclusion of random regression coefficients to describe permanent environmental effects led to a more precise estimation of genetic and non-genetic effects that influence milk yield

Persistency in lactation – a review

Persistency in lactation can be defined as the capacity of a cow to maintain her milk yield after reaching the maximum level early lactation. Several studies document the existence of genetic differences among animals for persistency in lactation. Four different approaches to measuring this trait are found in the literature, these being based in: 1)ratios between of partial, total or other yields during the lactation, 2)variation based on test-day milk yields, 3)mathematical lactation curve models and 4)breeding values obtained through random coefficients of the random regression models. However, at present the procedure most used involves random regression models in analyses that consider the test-day milk yield. Use of those models improves the accuracy of the genetic evaluations and allows to predicting the breeding value of the animals in different periods of lactation. Persistency in lactation is directly related with economical aspects of daring, since its improvement con contribute to reduction of production costs. The economical importance of lactation persistency in lactation relates to four components: 1) health cost; 2) feed costs; 3) reproductive performance; and 4) milk production per lactation. For these reasons various studies have indicates that selection for this trait would be advantageous