Co-limitation towards lower latitudes shapes global forest diversity gradients

The latitudinal diversity gradient (LDG) is one of the most recognized global patterns of species richness exhibited across a wide range of taxa. Numerous hypotheses have been proposed in the past two centuries to explain LDG, but rigorous tests of the drivers of LDGs have been limited by a lack of high-quality global species richness data. Here we produce a high-resolution (0.025° × 0.025°) map of local tree species richness using a global forest inventory database with individual tree information and local biophysical characteristics from ~1.3 million sample plots. We then quantify drivers of local tree species richness patterns across latitudes. Generally, annual mean temperature was a dominant predictor of tree species richness, which is most consistent with the metabolic theory of biodiversity (MTB). However, MTB underestimated LDG in the tropics, where high species richness was also moderated by topographic, soil and anthropogenic factors operating at local scales. Given that local landscape variables operate synergistically with bioclimatic factors in shaping the global LDG pattern, we suggest that MTB be extended to account for co-limitation by subordinate drivers

Антибиотикорезистентность культур Enterococcus spp., выделенных от промышленной птицы в 2013–2016 гг. в хозяйствах Российской Федерации, и детекция у них генов резистентности к ванкомицину

Rationale: Enterococci are the leading cause of a number of nosocomial and community-acquired human diseases. In the last decade, these pathogens are becoming resistant to antibacterials, including vancomycin. Multidrug-resistant enterococci have been also isolated from agricultural animals in many countries worldwide, which raises concern of scientists because of possible horizontal transfer of resistance genes. Aim: To assess antibacterial sensitivity of Enterococcus spp. isolates collected from the poultry in the Russian Federation from 2013 to 2016, and to identify vancomycin-resistance genes in their genomes. Materials and methods: Eighty-seven enterococci isolates belonging to E.  faecalis (n = 47, 54%), E.  faecium (n = 25, 28.7%) and other species (n = 15, 17.2%) were collected from clinical samples of 297 heads of poultry (liver, lungs, heart, spleen, contents of the nasal and sinus cavities) from 17  poultry farms of the Northwest, Central, Volga, Ural and Southern Federal districts of the Russian Federation. Sensitivity of enterococci to antibacterials was determined by disk-diffusion and broth microdilution methods. Vancomycin resistance genes van was detected by polymerase chain reaction with specific primers. Results: Most enterococci isolates were resistant to erythromycin (74/87, 85.1%), gentamicin (70/87, 80.5%), ceftriaxone (61/87, 70.1%), ciprofloxacin (56/87, 64.4%), tetracycline (57/87, 65.5%), and rifampicin (48/87, 55.2%), fewer ones to trimethoprim (38/87, 43.7%), ampicillin (28/87, 32.2%), linezolid (15/87, 17.2%) and chloramphenicol (5/87, 5.7%). The vanC type genes (vanC1 and vanC2/3) were identified in 10  isolates. Vancomycin minimal inhibitory concentrations for these isolates were 2 to 8  mg/L. E. faecium with vanC1 gene was isolated from poultry probably for the first time ever. Conclusion: Commercial poultry in the Russian poultry farms is an important reservoir and source of antibiotic-resistant enterococci populations, including enterococci carrying vanC1 and vanC2/3 vancomycin resistance genes. Актуальность. Энтерококки – ведущая причина ряда внутрибольничных и  внебольничных заболеваний человека. В  последнее десятилетие эти патогены приобретают устойчивость к  антибактериальным препаратам, в  том числе к  ванкомицину. Энтерококки с  множественной лекарственной устойчивостью выделяются также от сельскохозяйственных животных во многих странах мира, что вызывает настороженность ученых из-за возможного горизонтального переноса генетических детерминант резистентности. Цель  – определить чувствительность к  антибактериальным препаратам изолятов Enterococcus spp., выделенных от промышленной птицы в  Российской Федерации в  2013–2016  гг., детектировать в  их геномах гены устойчивости к  ванкомицину. Материал и  методы. Восемьдесят семь изолятов энтерококков, принадлежащих к  E.  faecalis (n = 47, 54%), E.  faecium (n = 25, 28,7%) и  другим видам (n = 15, 17,2%), выделены из клинических образцов 297  голов промышленной птицы (печень, легкие, сердце, селезенка, содержимое пазух носовых синусов) из 17  птицеводческих хозяйств Северо-Западного, Центрального, Приволжского, Уральского и  Южного федеральных округов Российской Федерации. Чувствительность энтерококков к антимикробным препаратам определяли диско-диффузионным методом и  методом микроразведений в  бульоне. Гены устойчивости к  ванкомицину (van) выявляли методом полимеразной цепной реакции со специфичными праймерами. Результаты. Большинство изолятов энтерококков были устойчивы к  эритромицину (74  из 87, 85,1%), гентамицину (70 из 87, 80,5%), цефтриаксону (61 из 87, 70,1%), ципрофлоксацину (56 из 87, 64,4%), тетрациклину (57 из 87, 65,5%) и рифампицину (48 из 87, 55,2%), а также к триметоприму (38 из 87, 43,7%), ампициллину (28 из 87, 32,2%), линезолиду (15  из 87, 17,2%) и  хлорамфениколу (5 из 87, 5,7%). У 10 изолятов были обнаружены гены типа vanC (vanC1 и vanC2/3). Минимальные подавляющие концентрации ванкомицина для этих изолятов составили 2–8 мг/л. Выделение от птицы и  идентификация изолята E.  faecium с  геном vanC1, по всей вероятности, является первым в  мировой практике. Заключение. Промышленная птица птицефабрик Российской Федерации – важный резервуар и источник антибиотикорезистентных популяций энтерококков, в том числе энтерококков с генами ванкомицинрезистентности vanC1 и vanC2/3.