Short communication: An association analysis between one missense polymorphism at the SREBF1 gene and milk yield and composition traits in goats

Sterol regulatory element binding transcription factor 1 (SREBF1) regulates the expression of genes involved in the biosynthesis of fatty acids and cholesterol. Herewith, we have sequenced the near-complete coding region and part of the 3?UTR of the goat SREBF1 gene. In doing so, we have detected a missense c.353CT polymorphism causing a proline to leucine substitution at position 118 (P118L). An association analysis with milk composition traits recorded in MurcianoGranadina goats only revealed a statistical tendency linking SREBF1 genotype and milk omega-3 fatty acid content. The lack of significant associations suggests that the P118L substitution does not involve a functional change.Le facteur de transcription de´nomme´ Sterol regulatory element binding transcription factor 1 (SREBF1) re´gule l’expression des ge`nes implique´s dans la biosynthe`se des acides gras et du choleste´rol. Dans cette e´tude, nous avons se´quence´ la quasi-totalite´ de la re´gion codante et une partie du la re´gion 3?UTR du ge`ne SREBF1 de la che`vre. Ce travail, nous a permis d’identifier un polymorphisme non-synonyme c.353CT causant la substitution d’une Proline en Leucine a` la position 118. L’e´tude d’association avec la composition du lait enregistre´e en che`vres Murciano-Granadina, a re´ve´le´ seulement une tendance statistique reliant SREBF1 ge´notype et l’acide gras ome´ga-3 du lait. L’absence d’associations significatives sugge`re que la substitution P118L n’implique pas un changement fonctionnel

Analyse d’association entre un polymorphisme non synonyme dans le gène SREBF1 et la production et la composition laitières chez les chèvres.

[EN]: Sterol regulatory element binding transcription factor 1 (SREBF1) regulates the expression of genes involved in the biosynthesis of fatty acids and cholesterol. Herewith, we have sequenced the near-complete coding region and part of the 3′UTR of the goat SREBF1 gene. In doing so, we have detected a missense c.353C>T polymorphism causing a proline to leucine substitution at position 118 (P118L). An association analysis with milk composition traits recorded in Murciano-Granadina goats only revealed a statistical tendency linking SREBF1 genotype and milk omega-3 fatty acid content. The lack of significant associations suggests that the P118L substitution does not involve a functional change.[FR]: Le facteur de transcription dénommé Sterol regulatory element binding transcription factor 1 (SREBF1) régule l'expression des gènes impliqués dans la biosynthèse des acides gras et du cholestérol. Dans cette étude, nous avons séquencé la quasi-totalité de la région codante et une partie du la région 3′UTR du gène SREBF1 de la chèvre. Ce travail, nous a permis d'identifier un polymorphisme non-synonyme c.353C> T causant la substitution d'une Proline en Leucine à la position 118. L’étude d'association avec la composition du lait enregistrée en chèvres Murciano-Granadina, a révélé seulement une tendance statistique reliant SREBF1 génotype et l'acide gras oméga-3 du lait. L'absence d'associations significatives suggère que la substitution P118L n'implique pas un changement fonctionnel.This research was funded by projects AGL2007-66161-C02-01 and AGL2007-66161-C02-02. A. Zidi received fellowships of the Spanish Agency of International Cooperation and Development and of the Centre for Research in Agrigenomics (CRAG). Arianna Manunza received a postdoctoral fellowship from the Centre for Research in Agrigenomics (CRAG).Peer reviewe