Density Matrix Kinetic Equation Describing a Passage of Fast Atomic Systems Through Matter

The quantum-mechanical consideration of a passage of fast dimesoatoms through matter is given. A set of quantum-kinetic equations for the density matrix elements describing their internal state evolution is derived. It is shown that probabilistic description of internal dynamics of hydrogen-like atoms is impossible even at sufficiently low energies because of the ``accidental'' degeneracy of their energy levels.Comment: 12 pages, LATEX, submitted to J. Phys.

Direct calculation of the probability of pionium ionization in the target

We performed the first direct calculation of the probability of pionium (pi+pi- atom) ionization in the target. The dependence of the probability of pionium ionization in the target as a function of the pionium lifetime is established. These calculations are of interest of the DIRAC experiment at CERN, which aims to measure the pionium lifetime with high precision.Comment: 11 pages, 4 figures; submitted to "Physics of Atomic Nuclei" ("Yadernaya Fizika"

Final state interaction in kaons decays

The kaons decays to the pairs of charged and neutral pions are considered in the framework of the non-relativistic quantum mechanics. The general expressions for the decay amplitudes to the two different channels accounting for the strong interaction between pions are obtained. The developed approach allows one to estimate the contribution of terms of any order in strong interaction and correctly takes into account the electromagnetic interaction between the pions in the final state.Comment: 8 page

The isospin symmetry breaking effects in Ke4K_{e4} decays

The Fermi-Watson theorem is generalized to the case of two coupled channels with different masses and applied to final state interaction in $K_{e4}$ decays. The impact of considered effect on the phase of the $\pi\pi$ scattering is estimated and shown that it can be crucial for scattering lengths extraction from experimental data on $K_{e4}$ decays

Bioinformational analysis of Yersinia pseudotuberculosis IP32953 CRISPR/cas system

The results of this study include Yersinia pseudotuberculosis CRISPR/Cas system structure analysis. CRISPR/Cas system is a specific adaptive protection against heterogeneous genetic elements. The object of research was the complete genome of Y. pseudotuberculosis IP32953 (NC_006155). CRISPR/Cas system screening was performed by program modelling methods MacSyFinder ver. 1.0.2. CRISPR loci screening and analyzing were carried out by program package: CRISPR Recognition tool (CRT), CR1SP1: a CRISPR Interactive database, CRISPRFinder, and PilerCR. Spacer sequences were used in order to find protospacers in ACLAME, GenBank-Phage and RefSeq-Plasmid databases by BLASTn search algorithm. Protospacer sequences could be found in genomes of phages, plasmids and bacteria. In last case complete genomes of bacteria were analyzed by online-tool PHAST: PHAge Search Tool. Y. pseudotuberculosis IP329353 has CRISPR/Cas system that consists of one sequence of cas-genes and three loci. These loci are far away from each other. Locus YP1 is situated in close proximity to cas-genes. Protospacers were found in genomes of Y. pseudotuberculosis PB1/+, Y. intermedia Y228, Y. similis str. 228, Salmonella phage, Enterobacteria phage, Y. pseudotuberculosis 1P32953 plasmid pYV and plasmid of Y. pseudotuberculosis 1P31758. Thus, the combination of four program methods allows finding CRISPR/Cas system more precisely. Spacer sequences could be used for protospacer screening

The use of “probukol” preparation in complex treatment of the patients with the simple diabetic retinopathy

В последнее десятилетие отмечается рост сосудистых осложнений сахарного диабета, особенно в промышленно развитых странах. Одним из наиболее частых сосудистых осложнений диабета является ретинопатия, которая выявляется у 30-90 % больных. В последние годы появились работы, в которых авторы указывают на важную роль процессов перекисного окисления липидов в патогенезе диабетических ангиопатий, что явилось основанием включения в комплексную терапию сосудистых осложнений препаратов антиоксидантов. Учитывая выше изложенное, нами обследовано 43 больных с простой диабетической ретинопатией, которые на фоне традиционной терапии получали препарат антиоксидантного действия пробукол в суточной дозе 1 г в течение 1-го месяца. В результате проведенного лечения у обследованных больных повысились зрительные функции (острота зрения на 0,1-0,2; у 70% больных расширились границы суммарного поля зрения на 25-30° у 35 %). Анализ биохимических данных выявил достоверность снижения показателей липидного обмена, повышение антиоксидантной обеспеченности и снижение интенсивности ПОЛ. Наиболее выраженный защитный эффект препарат оказал в летне-осенний период, что обусловлено способностью препарата эффективно тормозить перекисные механизмы диабетических ретинопатий в период достаточного поступления алиментарных АО. Представленные результаты оценки защитных свойств пробукола свидетельствуют о перспективности его включения в комплексную терапию, диабетическую ретинопатию; The synthenic antioxidant of inderect action “Probukol” was used in complex treatment of the patients with the simple diabetic retinopathy. We examined 43 patients with the simple from of diabetic retinopathy, who were undergone antioxidant therapy. The received data allow to recommend “Probukol” preparation into complex treatment of the diabetic retinopathy patients

The use of antioxiodants in complex treatment of patients with simple diabetic retinopathy

Диабетическая ретинопатия - наиболее частое со¬судистое осложнение СД, ведущее к снижению зри-тельных функций в 30- 90% случаев. В механизме развития диабетической ретинопа-тии (ДР)важную роль играет активация свободнора-дикального перекисного окисления липидов (СРПО), вызывающая повреждения стенки капилляров. Лече-ние таких больных является сложной задачей, и в на-стоящее время широко применяемая традиционная те¬рапия, включающая ангипротекторы, антикоагулян¬ты, сосудорасширяющие препараты, оказалась малоэффективной. В последние годы появились работы, свидетель-ствующие об успешном применении препаратов- ан-тиоксидантов. Учитывая выше изложенное, нами было обсле-довано 56 больных с простой ДР, в возрасте от 29 до 57лет, которые на фоне традиционной терапии полу¬чали комбинацию антиоксидантов, включающую то¬коферол а-ацетат в суточной дозе 0,2 г, кверцетин в суточной дозе 0,02 г и аскорбиновую кислоту в су¬точной дозе 0,2 г на протяжении полутора месяцев. Всем больным проводилась диодлазерная коа ляция сетчатки в несколько этапов. В результате проведенного лечения у обслед ванных больных повысились зрительные функции (с трота зрения на 20-25% у 40% больных, расшйр лись границы суммарного поля зрения на 15-20°у 65°, больных. Улучшение показателей гидро- и гемоди намики глаза наблюдалось в 35%. Анализ биохимических показателей выявил то" можение нарастания гликемии, липидемии и снижё ние уровня свободнорадикального перекисного от: пения липидов, а также содержания продуктов ауто¬окисления. Наиболее выраженный защитный эффект комби нации антиоксидантов проявлялся в зимне-весенний период, когда резко снижено поступление в организм алиментарных антиоксидантов. Представленные результаты оценки защитных свойств комбинации антиоксидантов на фоне прове-дения диодлазерной коагуляции сетчатки свидетелъ- свуют о перспективности их включения в комплекс-ную терапию простой диабетической ретинопатии; The composition of antioxidants with diod laser coagulation therapy was used in complex treatment of Ac patients with simple diabetic retinopathy. We examined 56 patients with the simple form of diabetic retinopathy, who had undergone antioxidant therapy with diod laser coagulation therapy. The proposed method of treatment of different forms of diabetic retinopathy with antioxidants give the highest protective effect according season of tne year

In silico сравнительный анализ crispr-систем штаммов Yersinia pseudotuberculosis, вызывающих различные клинические проявления псевдотуберкулёза

The aim of this research was to analyze and compare CRIPSR loci and cas-proteins of Yersinia pseudotuberculosis strains isolated in different territories from patients with various clinical manifestations of pseudotuberculosis.Materials and Methods. Complete genomes of Y. pseudotuberculosis IP329353 (NC_006155) and IP31758 (NC_009708) were obtained from NCBI Nucleotide Database. Strains were isolated from patients with gastroenteritis and systemic infection respectively. Search, identification, and analysis of CRISPR systems were carried out by onlinetools CRISPROne, CRISPRDetect, and CRISPRTarget.Results. Analyzed strains have CRISPR-Cas systems that include one set of cas-genes and arrays situated at the long distances from each other. We defined three CRISPR arrays in Y. pseudotuberculosis IP32953: array YP1 located near cas-genes, arrays YP2 and YP3. CRISPR-Cas system of Y. pseudotuberculosis IP31758 includes two arrays – YP1 and YP3. CRISPR systems do not share similar spacers.Conclusion. CRISPR systems of the analyzed strains differ in CRISPR loci and cas-protein structures that can be used as specific molecular marks of analyzed strains during the study of intra-species variability and evolution of Y. pseudotuberculosis.Цель: сравнить CRISPR-системы двух штаммов, выделенных на различных территориях от пациентов с разными клиническими проявлениями псевдотуберкулеза, и определить специфические различия в спейсерном составе и в структуре cas-белков.Материалы и методы: проанализированы полногеномные последовательности штаммов Y. pseudotuberculosis IP329353 (NC_006155) и IP31758 (NC_009708) различного географического происхождения, выделенные от больных с псевдотуберкулезом с симптомами гастроэнтерита и системными проявлениями инфекции соответственно. Поиск, идентификация и анализ CRISPR систем выполнены с использованием онлайн-приложений CRISPROne, CRISPRDetect и CRISPRTarget.Результаты: в геноме исследуемых штаммов обнаружены CRISPR-Cas системы, включающие один набор cas-генов и несколько CRISPR-локусов, значительно удаленных друг от друга. В геноме штамма Y. pseudotuberculosis IP329353 присутствует три локуса: YP1, находящийся в непосредственной близости от cas-генов, YP2 и YP3. CRISPR-Cas система Y. pseudotuberculosis IP31758 представлена только двумя кассетами: YP1 и YP3. CRISPR системы исследуемых штаммов не имеют одинаковых спейсеров.Заключение: CRISPR-Cas системы исследованных штаммов отличаются количеством CRISPR-локусов, их спейсерным составом и структурой cas-белков. Полученные результаты определяют перспективу использования CRISPR-локусов в качестве специфических молекулярных маркеров штаммов при изучении внутривидового разнообразия и эволюции Y. pseudotuberculosis

Detection of π+π−\pi^+\pi^-atoms with the DIRAC spectrometer at CERN

The goal of the DIRAC experiment at CERN is to measure with high precision the lifetime of the $\pi^+\pi^-$ atom ($A_{2\pi}$), which is of order $3\times10^{-15}$ s, and thus to determine the s-wave $\pi\pi$-scattering lengths difference $|a_{0}-a_{2}|$. $A_{2\pi}$ atoms are detected through the characteristic features of $\pi^+\pi^-$ pairs from the atom break-up (ionization) in the target. We report on a first high statistics atomic data sample obtained from p Ni interactions at 24 GeV/$c$ proton momentum and present the methods to separate the signal from the background.Comment: 19 pages, 12 figures, 1 tabl