Publisher Correction: Image Data Resource: a bioimage data integration and publication platform

n/

Publishing and sharing multi-dimensional image data with OMERO

Imaging data are used in the life and biomedical sciences to measure the molecular and structural composition and dynamics of cells, tissues, and organisms. Datasets range in size from megabytes to terabytes and usually contain a combination of binary pixel data and metadata that describe the acquisition process and any derived results. The OMERO image data management platform allows users to securely share image datasets according to specific permissions levels: data can be held privately, shared with a set of colleagues, or made available via a public URL. Users control access by assigning data to specific Groups with defined membership and access rights. OMERO’s Permission system supports simple data sharing in a lab, collaborative data analysis, and even teaching environments. OMERO software is open source and released by the OME Consortium at www.openmicroscopy.org

New positions of Didymosphenia geminata in Ropa and Biała Tarnowska rivers (Southern Poland)

W latach 2010-2011 badano zbiorowiska okrzemek w wodach Białej Tarnowskiej i Ropy. Stwierdzono obecność Didymosphenia geminata (Lyngbe) M. Schmidt na nowych stanowiskach na terenie Polski południowej. Na terenie Europy do niedawna występowała bardzo rzadko, zwłaszcza w zimnych, oligotroficznych wodach w górnych biegach potoków. Pojedyncze okazy tego gatunku występują w rzekach - Ropie i Białej. W sezonie wiosennym obserwowano go licznie w rzece Ropie poniżej zbiornika zaporowego "Klimkówka", gdzie tworzył maty i galaretowate styliki.Studied territory involved two rivers: the Ropa River and the Biała River, both having its sources in the Low Beskid. The Ropa River is the biggest left-bank inflow of the Wisłoka River, running on its all length through two mesoregions (the Low Beskid and the Gorlickie Depression, few geographical regions and two Provinces (the Małopolska Province and the Podkarpacie Province). The valley of the Biała Tarnowska River is the right-bank inflow of the Dunajec River, which spreads through the Central Beskidian Piedmont. Materials to researches were taken in 2010-2011, from waters of the Biała Tarnowska River and the Ropa River. The aim of the work was to indicate new studying posts on both rivers, on which the existence of D. geminata was stated and to carry out a taxonomic analysis of populations with a determination of environmental conditions in studied liquids. Didymosphenia geminata was stated in all studying post with an exception of the last one located on the Biała River. It existed in forms of individual specimen, mainly on rocks. It formed bigger populations only on the Ropa River below the dammed reservoir "Klimkówka" - was observed on stalks in the Spring and Autumn seasons, it also formed mats in the Spring season

Wpływ osadów ściekowych na plonowanie i wartość energetyczną nadziemnej biomasy topinamburu (Helianthus tuberosus L.)

The sewage treatment process is inherently associated with formation of sewage sludge, which has to be managed properly due to its properties. The paper presents a possibility of application of sewage sludge in the cultivation of Jerusalem artichoke as an energy crop. The experiment consisted in single application of sewage sludge pads with varied thickness under the sod-humic horizon of silty fallow soil. Physicochemical and chemical analyses of the sewage sludge and soil treated with the pads were carried out in accordance with legal guidelines. The results of the experiment were compared with the control, i.e. an object without the application of the sewage sludge pad. The paper presents the effect of the addition of sewage sludge on the yield and energy parameters (moisture and ash content, HHV, LHV) in the aboveground biomass of Jerusalem artichoke. The content of moisture and ash as well as HHV and LHV, i.e. biofuel parameters, were determined in accordance with Polish Standards. It was found that the yield of aboveground biomass of Jerusalem artichoke increased with the thickness of the sewage sludge pads and the yield potential of this plant increased with years. Additionally, the aboveground Jerusalem artichoke biomass was characterized by generally favorable energy parameters of biofuels, e.g. low moisture or ash content. The investigations have demonstrated that the application of sewage sludge can be a good alternative to mineral fertilization of energy crops.Proces oczyszczania ścieków nieodzownie związany jest z powstawaniem osadów ściekowych, które ze względu na swoje właściwości muszą być odpowiednio zagospodarowane. W pracy przedstawiono możliwość zastosowania osadów ściekowych w uprawie topinamburu, jako rośliny energetycznej. W doświadczeniu zastosowano osady ściekowe w formie wkładek o zróżnicowanej miąższości, aplikowane jednorazowo pod poziom darniowo-próchniczy gleby pyłowej. Analizy fizykochemiczne i chemiczne osadów ściekowych oraz gleby, na której zostały zastosowane, przeprowadzono zgodnie z wytycznymi uwzględnionymi w przepisach prawnych. Rezultaty otrzymanych wyników badań porównywano z kontrolą-bez wkładki osadów ściekowych. W pracy przedstawiono wpływ osadów ściekowych na plon oraz parametry energetyczne (zawartość wilgoci, popiołu, HHV, LHV) nadziemnej biomasy topinamburu. Zawartość wilgoci, popiołu oraz HHV i LHV, jako parametrów charakteryzujących biopaliwa, oznaczono zgodnie z Polskimi Normami. Stwierdzono, że plon nadziemnej biomasy topinamburu wzrastał wraz z miąższością zastosowanych wkładek osadów ściekowych, a potencjał plonotwórczy tej rośliny wzmagał się w latach badań. Ponadto stwierdzono, że nadziemna biomasa topinamburu charakteryzowała się generalnie korzystnymi parametrami energetycznymi, charakteryzującymi biopaliwa, takimi jak m.in. niska zawartość wilgoci czy popiołu. Na podstawie przeprowadzonych badań stwierdzono, że zastosowanie osadów ściekowych może być dobrą w stosunku do nawożenia mineralnego alternatywą, w nawożeniu roślin energetycznych