Dynamiques temporelles de la diversité variétale du manioc (Manihot esculenta Crantz) dans deux bassins de culture en République du Congo

Le manioc constitue l'aliment de base de la population congolaise. Il est majoritairement cultivé au sein d'exploitations familiales pour lesquelles la diversité variétale est un facteur majeur d'adaptation aux changements. Pourtant, la façon dont les productrices mobilisent cette diversité au cours du temps est méconnue. Cette étude caractérise donc les dynamiques de la diversité cultivée dans deux bassins de production, entre 2007 et 2012, à partir d'enquêtes auprès de 300 ménages. La diversité variétale des exploitations a été caractérisée à partir d'inventaires au champ basés sur les noms vernaculaires. Le niveau de diversité des exploitations, des villages et des sites, ainsi que la composition des portefeuilles variétaux, ont été comparés entre les deux années. De plus, la comparaison qualitative de ces inventaires avec ceux des années 1970 a permis d'établir quelles variétés étaient cultivées aux deux époques. Enfin, les causes d'abandon et d'adoption des variétés évoquées par les productrices lors des enquêtes ont été synthétisées. Le niveau de diversité est resté stable entre 2007 et 2012 ; en revanche, les portefeuilles variétaux des villages ont subi des transformations importantes et l'intensité de ces transformations varie entre les villages. À plus long terme (40 ans), on observe que certaines variétés ont été maintenues malgré les changements ayant touché les systèmes agricoles. L'influence des différents processus impliqués dans ces dynamiques est discutée. (Résumé d'auteur

Assessment of the genetic diversity of the Tunisian citrus rootstock germplasm

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Citrus represents a substantial income for farmers in the Mediterranean Basin. However, the Mediterranean citrus industry faces increasing biotic and abiotic constraints. Therefore the breeding and selection of new rootstocks are now of the utmost importance. In Tunisia, in addition to sour orange, the most widespread traditional rootstock of the Mediterranean area, other citrus rootstocks and well adapted to local environmental conditions, are traditionally used and should be important genetic resources for breeding. To characterize the diversity of Tunisian citrus rootstocks, two hundred and one local accessions belonging to four facultative apomictic species (<it>C. aurantium</it>, sour orange; <it>C. sinensis</it>, orange; <it>C. limon</it>, lemon; and <it>C. aurantifolia</it>, lime) were collected and genotyped using 20 nuclear SSR markers and four indel mitochondrial markers. Multi-locus genotypes (MLGs) were compared to references from French and Spanish collections.</p> <p>Results</p> <p>The differentiation of the four varietal groups was well-marked. The groups displayed a relatively high allelic diversity, primarily due to very high heterozygosity. Sixteen distinct MLGs were identified. Ten of these were noted in sour oranges. However, the majority of the analysed sour orange accessions corresponded with only two MLGs, differentiated by a single allele, likely due to a mutation. The most frequent MLG is shared with the reference sour oranges. No polymorphism was found within the sweet orange group. Two MLGs, differentiated by a single locus, were noted in lemon. The predominant MLG was shared with the reference lemons. Limes were represented by three genotypes. Two corresponded to the 'Mexican lime' and 'limonette de Marrakech' references. The MLG of 'Chiiri' lime was unique.</p> <p>Conclusions</p> <p>The Tunisian citrus rootstock genetic diversity is predominantly due to high heterozygosity and differentiation between the four varietal groups. The phenotypic diversity within the varietal groups has resulted from multiple introductions, somatic mutations and rare sexual recombination events. Finally, this diversity study enabled the identification of a core sample of accessions for further physiological and agronomical evaluations. These core accessions will be integrated into citrus rootstock breeding programs for the Mediterranean Basin.</p