Improvement of the competitiveness on the sea bass (Argyrosomus regius) sector through genetic selection

[SPA] La corvina (Argyrosomus regius) es una especie con un amplio abanico geográfico de distribución que abarca todo el Mar Mediterráneo, y cuya producción se encuentra en aumento. Para poder conocer los principales factores productivos es interesante conocerla variación genética de la especie, aumentando nuestro nivel de conocimiento que va asociado a la crianza de la corvina en condiciones industriales, desde el punto de vista tecnológico, y genético. Las fases que conlleva la aplicación de un programa de mejora genética son el estudio de la variación de la población base, la determinación de la matriz de parentesco y la definición de los caracteres y objetivos de selección. Los caracteres a valorar serán, de crecimiento, y de la calidad integra del pez y de la carne. Actualmente no hay ningún programa de mejora genética en corvina, que nos permita tener una mejor caracterización fenotípica y genética, y un beneficio industrial en cuanto a una transferencia genética entre las empresas del sector. [ENG] The sea bass (Argyrosomus regius) is a species with a wide geographic range of distribution in the nature of the Mediterranean Sea, and whose production is increasing. In order to know the main productive factor, it is interesting to know the genetic variation of the species, increasing our level of knowledge that is associated with the raising of sea bass in industrial conditions, from the technological and genetic point of view. The phases involved in the application of a breeding program, as the population variation, the determination of the numerator relationship matrix (NRC) and the definition of the characteristics and objectives of the selection. The characteristics that will be valued are, growth rate, and the overall quality of the fish and its flesh. Nowadays there is not any sea bass breeding program, which allows us to have a better phenotypic and genetic characterization, and an industrial benefit in terms of genetic transfer among the sector companies.A la fundación Seneca por su apoyo económico tanto con la beca de doctorado como por el proyecto (Mejora de la competitividad del sector de la corvina a través de la selección genética (GENECOR)) y a la empresa Alevines del Sureste s.l. del Grupo Andromeda

Establishment of a sea bream (Sparus aurata) breeding program in the Region of Murcia

[SPA] La dorada es una especie que ocupa un papel importante dentro de la acuicultura española y cuya crianza se ha consolidado dentro del contexto europeo. A pesar de ello, su producción industrial presenta aun importantes inconvenientes como son la presencia de anomalías morfológicas desde edades muy tempranas o crecimientos no maximizados, entre otros. Para sobrellevar dichos inconvenientes las empresas llevan a cabo distintas actuaciones relacionadas con la alimentación, manejo de sus lotes, prevención de enfermedades e incluso la ubicación de sus instalaciones. Sin embargo, han sido muy escasas las estrategias que han implicado intervención genética sobre los núcleos de reproductores y por tanto, del estrato productivo, a través del desarrollo de programas de selección para caracteres de interés económicos para los piscicultores. Con este fin, el objetivo de la presente tesis es obtener alevines de dorada a partir de un lote de reproductores que se encuentran en el Instituto Español de Oceanografía, planta de Cultivos Marinos en la Azohía (Murcia), identificarlos individualmente con Passive Integrated Transponder, y criarlos bajo las mismas condiciones industriales de una empresa representativa de la Región (Servicios Atuneros del Mediterráneo). Esta población será analizada para caracteres de crecimiento y para otros caracteres escasamente tratados o desconocidos en dorada, como los de calidad de canal y de carne. [ENG] To overcome these drawbacks, companies carry out various actions related to food, handling their lots, preventing diseases and even the location of their facilities. However, the strategies that have involved genetic intervention on the breeding nuclei and, therefore, the productive stratum, have been very scarce and simple, through the development of selection programs for characters of economic interest for fish farmers.To this end, the objective of this thesis is to obtain seabream fingerlings from a batch of broodstock that are in the Spanish Institute of Oceanography, Marine Crops plant in the Azohía (Murcia), identify them individually with Passive Integrated Transponder, and raise them under the same industrial conditions of a company representative of the Region (Mediterranean Tuna Services). This population will be analyzed for growth characters and for other scarcely treated or unknown characters in gilthead bream, such as those of carcass and meat quality.A la Consejería de Agricultura, Agua y Medio Ambiente de la Región de Murcia (BORM 234, 7 octubre 2016) por su soporte económico. La realización de la presente tesis doctoral es continuación del proyecto “Desarrollo de un Programa Piloto de Mejora Genética en Dorada (Sparus aurata L.)” [9] http://www.progensa.eu, financiado por la Secretaria de la Junta Nacional Asesora de Cultivos Marinos (JACUMAR)

Genetic parameters for Photobacterium damselae subsp. piscicida resistance, immunological markers and body weight in gilthead seabream (Sparus aurata)

A challenge test for Photobacterium damselae subsp. piscicida (Phdp) resistance was carried out in two juvenile populations of gilthead seabream (Sparus aurata L.): F2_ATL and F0_MED. At 250 days post-hatching (dph), a fish plasma sample was collected to measure humoral immune markers (peroxidase activity, bactericidal activity, and IgM immunoglobulin levels), and at 272 dph fish were weighed and inoculated with bacteria Phdp. From that time onwards, surviving fish were recorded for nine days, and days to death was registered. Heritabilities for body weight and Phdp survival were moderate, although for days to death the heritability was low. Regarding humoral immune markers, for peroxidase activity it was moderate, and for IgM levels and for bactericidal activity it was low. Genetic correlations for body weight with Phdp survival and days to death were high and positive, while with peroxidase activity and IgM levels they tended to be positive, although these estimates were not accurate. Regarding genetic correlations between Phdp survival and humoral immune markers, they were very high, positive with peroxidase activity, and negative with IgM levels and bactericidal activity. Some humoral immune markers, particularly peroxidase activity, along with performance traits such as body weight and absence of deformities, are proposed to be included in a selective breeding program to raise fish that are capable of coping with diseasesThis project has received funding from the European Maritime and Fisheries Fund (EMFF) through the PROGENSA III project (Mejora de la Competitividad del Sector de la Dorada a Través de la Selección Genética, JACUMAR program), This study was also funded by Fondo Europeo Marítimo y de Pesca (FEMP) code PR.FEM.PPA201700.14. R.P. was supported by Universidad Politécnica de Cartagena Research Grant; A.V. was funded by a research scholarship fellow (Mejora de la Competitividad del Sector de la Dorada a Través de la Selección Genética, specialization scholarship); AV. was funded by a pre-doctoral research fellow (20,716/FPI/18. Fundación Séneca. Cofinanciado por grupo Andromeda. Región de Murcia (Spain)). Thanks to Javier Lopez Ales and M.A. Castaño Remeseiro for laboratory assistance

Development of the first microsatellite multiplex PCR panel for meagre (Argyrosomus regius), a commercial aquaculture species

In this study, a microsatellite-based multiplex PCR panel for meagre (Argyrosomus regius) was developed as a useful and single tool in parental assignment and population studies. Twenty-one specific and interspecific microsatellites from different aquaculture species of meagre (Argyrosomus regius), Japanese meagre (A. japonicus), red drum (Sciaenops ocellatus) and yellow meagre (Acoupa weakfish) were assessed for genetic variability, allelic range and genotype reliability. Finally, a SuperMultiplex for Argyrosomus regius (SMAr) was designed with only the best eight microsatellite markers. The panel assessment was performed using a batch of brood stock from one company and a sample of 616 offspring. It was possible to assign 95% of the offspring to a single pair of parents using the exclusion method. It is therefore considered an easy procedure, and a powerful and low-cost tool for parental assignment to support companies’ breeding programs and to exchange information between research groups.This research was funded by Fundación Séneca-Agencia de Ciencia y Tecnología de la Región de Murcia through the project “Mejora de la competitividad del sector de la corvina a través de la selección genética (GENECOR, 21002/PI/18)” in the call for grants for projects for the development of scientific and technical research by competitive groups, included in the Regional Program for the Promotion of Scientific and Technical Research (Action Plan 2018). A.V. was funded by a pre-doctora research fellowship (20716/FPI/18. Fundación Séneca. Cofinanciado por grupo Avramar S.L. Región de Murcia (Spain)). The Avramar S.L. group provided financial support and the use of its facilities for this study

Phenotypic and genetic components for growth, morphology, and flesh-quality traits of meagre (Argyrosomus Regius) reared in tank and sea cage

Meagre (Argyrosomus regius) plays an important role in the aquaculture system, with the potential for diversification of European aquaculture, and is characterized by its fast growth rate, low feed conversion ratio, and the high quality of the product. Focusing on the relevance of meagre, the aim of the study was to analyze growth performance, fish morphology, and flesh composition phenotypically and genetically to be considered as a strategy in a breeding program. For this purpose, 633 fish were raised in two different housing systems, in sea cages or in a continental tank, and when they reached harvest size, manual growth traits, automatic morphology by the image analysis program IMAFISH_ML, and flesh chemical composition (fat, protein, moisture, and collagen percentages) were measured. The fish reared in the cages showed a higher body weight and fillet fat percentage than those in the tank. Heritabilities for growth and morphology traits, and for fillet fat percentage were medium, revealing these traits as a possible selection criterion in a breeding program. Phenotypic and genetic correlations between growth and morphology traits were positive and high. Phenotypic correlations between growth or morphology traits with fillet fat percentage were positive and medium; genetic correlations were not estimated accurately.This research was funded by Fundación Séneca-Agencia de Ciencia y Tecnología de la Región de Murcia through the project “Mejora de la competitividad del sector de la corvina a través de la selección genética” (GENECOR, 21002/PI/18) in the call for grants for projects for the development of scientific and technical research by competitive groups, included in the Regional Program for the Promotion of Scientific and Technical Research (Action Plan 2018). A.V. was funded by a pre-doctoral research fellowship (20716/FPI/18. Fundación Séneca. Cofinanciado por grupo Avramar S.L. Región de Murcia (Spain))

Development of the first standardized panel of microsatellites PCR multiplex for meagre (Argyrosomus regius)

[SPA] La realización del panel de microsatélites fue llevada a cabo sobre una población de corvina (Argyrosomus regius) procedente de un lote de reproductores de la empresa Alevines del Sureste S.L. A los 220 días después de la eclosión, los peces fueron muestreados y, momento en el cual, se recogió una muestra de aleta caudal para la posterior extracción de ADN. El objetivo del presente proyecto es establecer un programa de mejora genética en corvina. Se trabajó con un lote de 100 individuos, con los que se comprobaron diversos marcadores microsatélites específicos e interespecíficos. Finalmente, 10 marcadores microsatélites formaron nuestro panel estandarizado para corvina, con una longitud de entre 70-270 pares de bases. [ENG] The microsatellite panel was carried out on a population of meagre (Argyrosomus regius) from a batch of broodstock from the Alevines del Sureste S.L. company, 220 days post-hatching, the fish were weighed and measured, at which time a sample was taken from the tail fin for subsequent DNA extraction. The objective of this project is to establish a breeding program in meagre. We worked with a batch of 100 individuals, with which they were verified in various specific and interspecific microsatellite markers. Finally, 10 microsatellite markers formed our standardized panel for meagre, with a length of between 70-270 base pairs.A la fundación SÉNECA+ Por la beca predoctoral 20716/FPI/18 y al proyecto GENECOR. Cofinanciado por grupo Avramar. Región de Murcia (Spain)

Justificación de las excepciones al Reglamento (CE) 1967/2006 en lo referente a luz de malla, así como de la distancia a costa y profundidad marina mínima para la pesca del chanquete en la Región de Murcia.

Transparent goby fishing is an artisanal, traditional and sustainable fishery with a high economic impact for the small gear sector of the Region of Murcia. The morphological and ecological characteristics of the target species require the use of fishing gear and slaughter maneuvers not permitted in Regulation 1967/2006. For this reason, the European Commission was asked for certain exceptions for this fishery and a Management Plan was implemented. After 3 periods of exception and after 11 years of application of the Management Plan for the transparent goby fishery in the Region of Murcia, the present work demonstrates and justifies, based on the scientific data obtained in the monitoring plan, the need to the exception to Regulation (EC) 1967/2006 in relation to mesh size as well as distance to coast and minimum sea depth.La pesca del chanquete es una pesquería artesanal, tradicional y sostenible con un elevado impacto económico para el sector de artes menores de la Región de Murcia. Las características morfológicas y ecológicas de la especie objetivo exigen el uso de un arte de pesca y unas maniobras de faenado no permitidas en el Reglamento 1967/2006. Por tal motivo, se solicitó a la Comisión Europea determinadas excepciones para esta pesquería en lo referente a luz de malla, así como de la distancia a costa y profundidad marina mínima, implementándose un Plan de Gestión. Después de 3 periodos de excepción y tras 11 años de aplicación del Plan de Gestión de la pesca del chanquete en la Región de Murcia, el presente trabajo demuestra y justifica, en base a los datos científicos obtenidos en el plan de monitorización, la necesidad de la excepción al Reglamento (CE) 1967/2006 en lo referente a luz de malla, así como de la distancia a costa y profundidad marina mínima

Efectos de la extracción de chaetomorpha linum y ulva spp sobre el estado ecológico del mar menor durante la primavera y verano de 2022

El Mar Menor a diferencia de otras lagunas costeras es de carácter oligotrófico y en las últimas décadas derivado de presiones agrícolas y urbanas, y una planificación litoral de escasa integración ambiental han desencadenado episodios eutróficos que el sistema ha intentado controlar mediante proliferaciones de medusas, algas, fitoplancton y zooplancton, en un intento de favorecer el sistema de producción primaria de arriba-abajo. El Gobierno de la Región de Murcia durante 2022 realiza una retirada de las algas con el fin de evitar la putrefacción y descomposición en zonas someras que generan fangos, y minimizando la incorporación de nutrientes desde el sediment

Definición del objetivo económico y de selección en la explotación convencional de ganado porcino, estudio a nivel de granja y control de calidad de la canal y de la carne en dos genotipos comerciales / Emilio María Dolores Pedrero ; director Antonio Muñoz Luna.

Tesis-Universidad de Murcia.Consulte la tesis en: BCA. GENERAL. ARCHIVO UNIVERSITARIO. T.M.-964.Consulte la tesis en: BCA. GENERAL. Fac. Veterinaria. Sala de estudio. Tesis-V 57

Assessment of risk transmission virus diseases across of food used to feed bluefin tuna (Thunnus thynnus)

El engorde de atún rojo es una actividad económica de gran importancia en el contexto de la acuicultura nacional, especialmente para el área mediterránea. La alimentación se realiza exclusivamente mediante carnada compuesta por ejemplares completos de peces de pequeños pelágicos y moluscos cefalópodos como el calamar. La cantidad de carnada necesaria para alimentar a estos animales es muy considerable, ya que se estima entre el 2 y el 10% del peso corporal de los atunes. La D. G. de Ganadería y Pesca, dentro programa Piloto de Vigilancia Epidemiológica en Animales Acuáticos en aguas interiores de la Región de Murcia iniciado en el 2006, establece la realización de una serie de controles regulares sobre la carnada utilizada en la granjas de atunes del Litoral de Murcia. El objetivo es valorar de forma práctica la posibilidad de transmisión de enfermedades víricas a la fauna silvestre local y al resto de granjas de acuicultura situadas en la zona. En el presente trabajo se reflejan los resultados de los 4 años de este programa de vigilancia.ABSTRACT: The fattening of bluefin tuna is a very important economic activity for Spanish aquaculture, and mainly for the Mediterranean area. The feeding is supplied exclusively by bait consisting of complete copies of small pelagic fish and cephalopods like squid. The amount of bait needed to feed these animals is very considerable, since it is estimated between 2 and 10%. The D. G. Livestock and Fisheries within Epidemiological Surveillance Pilot Program in Aquatic Animal Inland Murcia Region started in 2006, provides for the realization of a series of regular checks on the bait used on tuna farms in Murcia´s coast. The objective is to evaluate in a practical way possible transmission of viral diseases to the local wildlife and the rest of aquaculture farms located in the area. In this paper reflects the results of the first four years of this monitoring program