New records of bats (Mammalia : Chiroptera) and karyotypes from Guinean Mount Nimba (West Africa)

New bats were recorded from various habitats on the Guinean side of Mount Nimba during two surveys in 2008 and coupled with a cytotaxonomic survey. A total of 152 specimens comprising 15 species in 12 genera from five families were collected, of which 13 individuals were karyotyped. The most numerous species was Rhinolophus guineensis followed by four fruit bats (Epomops buettikoferi, Lissonycteris angolensis, Roussettus aegyptiacus, Nanonycteris veldkampii). We confirm the presence of Hipposideros lamottei in the mine adits at 1500 m as well as the exceptional diversity of this habitat. First standard karyotypes are provided for Epomops buettikoferi and Nanonycteris intermedia. We also document for the first time karyotypes for West African populations of Mops thersites, Lissonycteris angolensis and Roussettus aegyptiacus, and cytogenetical comparisons with the existing literature are provided. We add five new species to the list of Guinean Nimba and two to the whole Nimba list (including Liberian side), which now stands at 42 species. This confirms the importance of Mount Nimba as a hotspot of diversity and the necessity to protect it.http://www.tandfonline.com/loi/tizo20hb2014Zoology and EntomologyMammal Research Institut

Seasonal variation of the diet of the Little Owl (Athene noctua) (Scopoli, 1769) in the extreme South-East of the Algerian Sahara (Djanet, Algeria)

From the autumn 2007 to the spring 2008, we studied the diet of the Little Owl Athene noctua in the area of Djanet, situated in the extreme South-East of Algeria. The analysis of 128 pellets enabled us to identify 80 species belonging to 6 classes, 12 orders and 32 families, preyed upon by this raptor. Considering the number of preys, insects (relative abundance, AR = 70.1 %) were dominant, followed by rodents (AR = 17.1 %) ; the most selected ones were Mesostena angustata (AR = 18.4 %) and Brachytrypes megacephalus (AR = 17.4 %). Insects dominated whatever the season (AR = 47 % in autumn, 79 % in winter, 63.6 % in spring). In terms of biomass, rodents were dominant with 9 species, two of them being new for the area. The Little Owl exihibit a diversified diet (E = 0.7) in this Algerian area of Central SaharaNous avons étudié de l'automne 2007 au printemps 2008 le régime alimentaire de la Chevêche d'Athéna (Athene noctua) dans la région de Djanet, située dans l'extrême sud-est de l'Algérie. L'analyse de 128 pelotes de réjection nous a permis de reconnaître 80 espèces-proies réparties en 6 clas-ses, 12 ordres et 32 familles. En nombre de proies, les Insectes (abondance relative, AR = 70,1 %) se sont avérés le plus consommés, suivis par les Rongeurs (AR = 17,1 %) ; les plus sélectionnés étaient Mesostena angustata (AR = 18,4 %) et Brachytrypes megacephalus (AR = 17,4 %). Les insectes dominèrent quelle que soit la saison (AR=47 % en automne, 79 % en hiver, 63,6 % au printemps). En termes de biomasse, les rongeurs dominaient avec 9 espèces dont deux nouvelles pour la région. La Chevêche d'Athéna a un régime alimentaire diversifié (E =0,7) dans cette région algérienne du Sahara central

Edaphic preferences and pullulation in Meriones shawii (Mammalia, Rodentia) in Tiaret region (Algeria).- In order to better control pullulations of M. shawii in cultivated fields in the Tiaret region

In order to better control pullulations of M. shawii in cultivated fields in the Tiaret region (Algeria), we studied the edaphic preferences of this rodent in two zones of low and high relative density of active burrows at the beginning of cereal tillering (March). By using index method to estimate relative abundance (census of active burrows) and pedological analysis of soil granulometry, rates of total and active CaCO3, organic matter and humidity, we searched for correlations between soil characteristics and abundance level. The level of the rodent population is higher when the amounts of sand and total CaCO3 in the soil are high and humidity less than 15 %. On the other hand, the abundance is low and even null when the amounts of clay, active CaC03 and humidity are high. Thus this study confirms for the first time in Algeria, in cultivated fields, M. shawii’s preference for low-humidity sandy soils with high total CaCO3 ; these soils would be more suitable to the species for digging out burrows, thence its higher abundance there. We found no clear relation between the organic matter rate in the soil and the pullulation level. Further studies are required for a better understanding of the role of irrigation and of the demographic cycle of M. shawii in order to better predict and control the relative population abundance of this rodent in the cereal fields. These results confirm recent works that highlighted the importance of edaphic factors to explain burrowing rodents’ pullulationsAfin de mieux contrôler les pullulations de Meriones shawii dans les champs cultivés de la région de Tiaret (Algérie), nous avons étudié les préférences édaphiques de ce rongeur dans deux zones, l'une de faible, l'autre de forte densité relative des terriers occupés à la période du début du tallage (mars). À l'aide de méthodes indiciaires (comptage du nombre de terriers actifs) et de méthodes pédologiques d'analyse de la granulométrie du sol, du pourcentage de CaCO3 total et actif, du taux de matière organique et d'humidité, nous avons recherché les corrélations entre nature du sol et niveau de pullulation. Les sols possédant des taux de sable et de CaCO3 total élevés mais des taux d'humidité inférieurs à 15 % sont corrélés significativement avec les nombres élevés de trous En revanche les taux d'argile, de CaC03 actif élevés et d'humidité supérieure à 15 % sont également très corrélés mais avec des nombres de trous faibles. Ainsi, les sols sableux, à faible humidité et avec un taux de calcaire total plus élevé seraient favorables à la construction de terriers par M. shawii, d'où un taux de pullulation plus élevé. Cette étude confirme pour la première fois en Algérie et en milieu cultivé, la nette préférence de M. shawii pour les sols à texture limonosablonneuse bien pourvus en calcaire total et à faible humidité. Il n'y a pas de relation nette entre le taux de matière organique du sol et le degré de pullulation. Par contre, il reste à tester le rôle de l'irrigation des sols et suivre le cycle démographique pour comprendre les pullulations de cette espèce. Ces résultats confirment cependant plusieurs travaux récents concernant l'importance du sol comme facteur explicatif de certaines pullulations de rongeurs creuseurs de terriers

Morphological, genetical and ecological discrimination of sympatric Coastal Guinea Mastomys (Mammalia : Rodentia) species (West Africa) : implications for health and agriculture

Cytogenetic and molecular tools have shown the existence of two sibling species of the multimammate rat in Coastal Guinea : M. erythroleucus and M. huberti from Mankoutan locality. Here we present the study of the unique population of M. huberti ever recorded in Guinea, distant from 350 km from the closest locality in Senegal and representing the southernmost point of the species’ disjunct distribution. In order to clarify its ecological preferences and define its degree of sympatry with M. erythroleucus, we have searched for morphological and morphometric criteria allowing reliable identification of the species in Coastal Guinea. Discriminant Factorial Analyses (DFA) were performed on external and skull measurements for respectively 108 and 106 previously genetically typed individuals. All discriminant analyses showed that the 100 % rate of good classification is never attained. Misclassifications of 55.6 % of the specimens were obtained in the field by using external fur colour and aspect whereas the error score ranged from 4.5 to 8 % by using DFA on external measurements. Furthermore, DFA on skull measurements gave 100 % of correct classification for M. huberti - which is characterized by a smaller size - against 96.97 % for M. erythroleucus. In the same time, we were able to define the local specific habitat of each species. In Mankountan, M. huberti is never found into houses but prefers wet rice fields, while M. erythroleucus is found both in houses and cultures as well as in wet rice fields where it is found in syntopy with M. huberti at the end of the dry season. In Yerende, a hundred kilometres from Mankoutan, we only caught M. erythroleucus both in houses and fields. This study once again highlights the importance of a deep taxonomic knowledge of small mammals’ diversity for sanitary and agricultural risks evaluation but also confirms the problems of identification encountered with rodent sibling species living in sympatryLes analyses cytogénétiques et moléculaires ont mis en évidence la présence de deux espèces jumelles de Mastomys en Guinée Maritime: M. ervthroleucus et M. huberti dans la localité de Mankoutan. Il s'agit de la première étude de la seule population de M. huberti rencontrée en Guinée située à 350 km de la population la plus proche du Sénégal, à l'extrémité Sud de l'aire de distribution disjointe de l'espèce. Afin de définir ses préférences écologiques, nous avons recherché des critères morphologiques et morphométriques pour identifier les deux espèces de Mastomys afin de mieux définir leur degré de sympa-trie. Des Analyses Factorielles Discriminantes (AFD) effectuées sur les caractères externes et crâniens de 108 et 106 individus ayant fait l'objet d'analyses moléculaires (cyt.b) et /ou cytogénétiques, provenant de deux localités proches, montrent que l'on ne peut jamais discriminer avec 100 % de certitude les spécimens en 'peau' et 'crâne'. Le taux d'erreur de détermination des deux espèces atteint 55,6 % pour la coloration et l'aspect du pelage sur le terrain, il oscille entre 4,5 et 8 % en AFD sur les mesures externes. Cependant avec les mesures crâniennes traitées par AFD, les M. huberti se distinguent à 100 % par une taille légèrement plus faible, contre 96,97 % chez M. erythroleucus. Parallèlement, nous avons pu préciser l'habitat spécifique aux deux espèces dans la même localité. Ainsi, à Mankountan, M. huberti n'est jamais rencontré dans les maisons et préfère les champs de riz inondés. M. erythroleucus est présent à la fois dans les maisons et dans les champs, quelquefois dans les rizières inondés où, à la fin de la saison sèche, il se retrouve en syntopie avec M. huberti. La localité de Yerendé située à 100 km de Mankountan n'a livré que des M. erythroleucus, présents à la fois dans les maisons et les champs. Cette étude montre l'importance d'une connaissance approfondie de la systématique et de la diversité des petits mammifères nuisibles pour l'évaluation des risques sanitaires et agricoles et confirme les difficultés d'identification morphologique des espèces jumelles chez les rongeurs

Régime alimentaire de Crocidura pachyura (Küster, 135) (Mammalia, Soricidae) dans plusieurs localités d’Algérie

Le régime alimentaire de Crocidura pachyura (Küster, 1835) a été étudié grâce à l’analyse des contenus stomacaux de 95 spécimens collectés sur le terrain de juin 2007 à septembre 2008 et de mars 2012 à mai 2014. Ces individus ont été collectés au moyen de pièges Sherman et de pots-enterrés dans 8 localités d’Algérie du Nord et du Centre, du niveau de la mer à 1390 m d’altitude (Tigzirt, Boukhalfa, Ouadias, El Misser, Darna, Tala Guilef, Zeralda et Reghaia). On trouve 99 proies différentes distribuées dans 7 taxons d’invertébrés (Clitellates, Nématelminthes, Gastropodes, Arachnides, Crustacés, Myriapodes et Insectes), un vertébré (Squamate) et des plantes indéterminées, notamment des graines. Les invertébrés représentent 77,05 % du régime alimentaire et les insectes sont les proies les plus fréquentes avec 54,3 %. Crocidura pachyura se nourrit de petites proies de taille inférieure à 17 mm (moyenne 4 mm) et la diversité des proies (indice de diversité de Shannon-Weaver) varie de 1,58 à 4,88 (moyenne de 2,4). La comparaison avec les travaux similaires effectués en Algérie et en Europe sur C. russula montre quelques différences de régime, surtout en ce qui concerne les proportions des proies Coleoptères, Hyménoptères et Diptères.Ecological information, including food habits, on African shrews is scarce. The aim of this study was to describe the diet of Crocidura pachyura (Küster, 1835) in Algeria. Its diet was studied by analysing stomach contents of 95 shrews collected in pitfall and Sherman traps, from June 2007 to September 2008 and from March 2012 to May 2014, in eight localities of North-Central Algeria, from the sea level until 1390 m (Tigzirt, Boukhalfa, Ouadias, El Misser, Darna, Tala Guilef, Zeralda and Reghaia). The diet was composed of 99 different prey taxa distributed in seven invertebrate classes (Clitellata, Nematelminthes, Gastropoda, Arachnida, Crustacea, Myriapoda and Insecta), one vertebrate (Squamata) and plants, particularly seeds. The most important components of the diet were invertebrates: their contribution was 77.05 % of the overall diet composition. Insects were the most frequent prey with 54.3 %. Crocidura pachyura feeds on small preys lower than 17 mm (average 4 mm) and the diversity index of Shannon-Weaver varied between 1.58 and 4.88 (average 2.4). Comparisons with similar studies in Algeria and Europe for C. russula showed some differences especially for Coleoptera, Hymenoptera and Diptera proportions

Hantavirus in African Wood Mouse, Guinea

Hantaviruses are rodentborne, emerging viruses that cause life-threatening human diseases in Eurasia and the Americas. We detected hantavirus genome sequences in an African wood mouse (Hylomyscus simus) captured in Sangassou, Guinea. Sequence and phylogenetic analyses of the genetic material demonstrate a novel hantavirus species, which we propose to name "Sangassou virus.

Mastomys natalensis and Lassa Fever, West Africa

PCR screening of 1,482 murid rodents from 13 genera caught in 18 different localities of Guinea, West Africa, showed Lassa virus infection only in molecularly typed Mastomys natalensis. Distribution of this rodent and relative abundance compared with M. erythroleucus correlates geographically with Lassa virus seroprevalence in humans

Shrews (Mammalia, Eulipotyphla) from a biodiversity hotspot, Mount Nimba (West Africa), with a field identification key to species

In this study, we collected 226 shrew specimens originating from 16 localities on the Guinean and Liberian sides of Mount Nimba. We surveyed all major vegetation zones from 400 to 1600 m above sea level (asl), including forest and savannah habitats. We recorded 11 species, whose identifications were confirmed by genetic analyses and classical morphometrics. Furthermore, we provide cytogenetic data for five of these species. The shrew community at Mount Nimba is composed of a mix of both savannah- and forest-dependent species, which is related to the peculiar position of Mount Nimba situated at the transition between lowland rainforest to the south and Guinean woodlands to the north. We recorded 11 species of shrews in syntopy in lowland rainforest, seven in edaphic savannah and mountain forest, and five in high-altitude savannah at 1600 m asl. Based on morphometric analyses, we show that these syntopic species separate along a size axis, allowing species to occupy different ecological niches, which we speculate allows them to access different food resources. We also highlight that Crocidura theresae Heim de Balsac, 1968 from Mount Nimba has a different karyotype from that described in Côte d’Ivoire. Finally, we develop a novel identification key for shrews from Mount Nimba using external characters and standard body measurements, allowing it to be used in the field on live specimens. In total 12 shrew species are now known from Mount Nimba, which highlights its exceptional position as a tropical African biodiversity hotspot.https://sciencepress.mnhn.fr/en/periodiques/zoosystemadm2022Mammal Research InstituteZoology and Entomolog