Investigation of the functions of candidate miRNAs in camptothecin-induced apoptosis in human cells

Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Molecular Biology and Genetics, Izmir, 2012Includes bibliographical references (leaves: 20-22)Text in English; Abstract: Turkish and Englishix, 22 leavesMicroRNAs are non-coding 19-25nt long, small RNAs that regulate expression of about 30% of human genes by inhibiting mRNA translation or inducing its degradation. MicroRNAs play important role in cell growth, differentiation, apoptosis. miRNAs regulate apoptosis by targeting genes involved in apoptotic pathway as a pro or anti-apoptotic genes. This study has aimed to identify whether candidate miRNAs ( miR-17* and miR-425) have a regulatory role in camptothecin induced apoptosis or not in Human cells and Hela cells that derived from cervical cancer were used as a model cell line. These candidates were selected based on deep sequencing data that showed some miRNAs differentially expressed after camptothecin treatment as compared with non-treated control group. To show candidate miRNAs whether have a role or not in regulation of camptothecin induced apoptosis, first Hela cells were transfected with candidate miRNAs then candidate miRNA over-expressed cells were treated with camptothecin eventually level of apoptosis was measured by flow cytometry and the results were evaluated by comparing miRNA over-expressed cell group with un-transfected control group. Active caspase-3 level also was measured by using flow cytometry and the data showed miR-17* and miR-425 function as pro-apoptotic regulator in camptothecin induced apoptosis in Hela cells

Yeterlik İndeksi: Özel Gereksinimli Küçük Çocukların Gelişimsel İşlevlerinin Değerlendirilmesi

Bu çalışma bebek ve küçük çocukların gelişimsel işlevlerini değerlendirmek üzere geliştirilen Yeterlik İndeksini (Yİ) Türkçeye çevirerek Türkçe formun psikometrik özelliklerini incelemek amacıyla gerçekleştirilmiştir. Yİ ile çocukların işlevleri, İşitme (Duyma-Sağ ve Sol), Davranış (Uygun Olmayan Davranış ve Sosyal Beceriler), Zihinsel İşlevler (Düşünme ve Akıl Yürütme), Amaçlı İletişim (Diğerlerini Anlama ve Onlarla İletişim Kurma), Uzuvlar (Elleri, Kolları ve Bacakları–Sağ ve Sol-Kullanma), Güç (Kas Gücü), Bütün Olarak Fiziksel Sağlık (Genel Sağlık), Gözler (Görme-Sağ ve Sol) ve Yapısal Durum (Şekil, Vücut Şekli ve Yapı) olmak üzere 9 alanda değerlendirilmektedir. Öğretmen, anne ya da klinisyen her bir alan için çocukların işlevini 1=normal, 6=çok yetersiz olmak üzere dereceler. İndeksin Türkçeleştirme (Yİ-T) çalışmalarının tamamlanmasının ardından, okul öncesi kurumlara devam eden, özel gereksinimli (ÖG) ve normal gelişen (NG) toplam 120 çocuğun gelişimsel işlevleri, hem anneleri hem de öğretmenleri tarafından indeks kullanılarak değerlendirilmiştir. Çalışmanın bulgularına göre, a) NG ve ÖG çocukların Yİ-T her maddesinden aldıkları puanlar arasında anlamlı fark bulunmaktadır, b) farklı yetersizlik gruplarındaki çocuklar ile aynı tanısı olan iki çocuğun da gelişimsel işlev profillerinde farklılık ortaya çıkmaktadır, c) aracın iç tutarlığı, annelerle öğretmenlerin puanları arasındaki uyum ve verilerin kararlılığı kabul edilebilir düzeydedir. Ülkemizde, ÖG küçük çocukların gelişimsel işlevlerinin yetersizlik tanılarından bağımsız olarak, anne ve öğretmenler tarafından Yİ-T ile değerlendirilmesinin, bu çocuklar için iki grubun ortak amaçları doğrultusunda müdahale programları hazırlanmasını ve program etkilerinin değerlendirilmesini kolaylaştıracağı düşünülmektedir

Otizmli Çocukların Sosyal Becerilerinin Değerlendirilmesi

Bu araştırmanın amacı Otizm Sosyal Beceriler Profili Türkçe Formu’nu (OSBP-T) kullanarak otizmli çocukların sosyal becerilerinin farklı değişkenler (değerlendiren kişi, cinsiyet, yaş, eğitime başlama yaşı, otizmin derecesi, tanı, kardeşe sahip olma) açısından değerlendirilmesidir. Araştırmada nedensel-karşılaştırma yöntemi kullanılmıştır. Araştırmanın verileri altı-17 yaş arası 208 otizmli çocuğun anne-babası ve öğretmenlerinin OSBP-T’yi doldurması yoluyla toplanmıştır. Verilerin analizi sonucunda, araştırma grubundaki çocukların OSBP-T toplam puan ve alt ölçeklerinden aldıkları puanların değerlendiren kişi, otizmin derecesi ve tanılarına göre anlamlı düzeyde farklılaştığı cinsiyetlerine, yaşlarına, eğitime başlama yaşlarına ve kardeşe sahip olmaya göre ise farklılaşmadığı görülmüştür. Araştırma bulguları var olan alanyazın çerçevesinde tartışılmıştır

Investigation of the functions of candidate miRNAs in camptothecin-induced apoptosis in human cells

Thesis (Master)--Izmir Institute of Technology, Molecular Biology and Genetics, Izmir, 2012Includes bibliographical references (leaves: 20-22)Text in English; Abstract: Turkish and Englishix, 22 leavesMicroRNAs are non-coding 19-25nt long, small RNAs that regulate expression of about 30% of human genes by inhibiting mRNA translation or inducing its degradation. MicroRNAs play important role in cell growth, differentiation, apoptosis. miRNAs regulate apoptosis by targeting genes involved in apoptotic pathway as a pro or anti-apoptotic genes. This study has aimed to identify whether candidate miRNAs ( miR-17* and miR-425) have a regulatory role in camptothecin induced apoptosis or not in Human cells and Hela cells that derived from cervical cancer were used as a model cell line. These candidates were selected based on deep sequencing data that showed some miRNAs differentially expressed after camptothecin treatment as compared with non-treated control group. To show candidate miRNAs whether have a role or not in regulation of camptothecin induced apoptosis, first Hela cells were transfected with candidate miRNAs then candidate miRNA over-expressed cells were treated with camptothecin eventually level of apoptosis was measured by flow cytometry and the results were evaluated by comparing miRNA over-expressed cell group with un-transfected control group. Active caspase-3 level also was measured by using flow cytometry and the data showed miR-17* and miR-425 function as pro-apoptotic regulator in camptothecin induced apoptosis in Hela cells