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Desenvolvimento de um equipamento para estudo do crescimento de Escherichia coli sob condição de microgravidade simulada
A existĂŞncia e sobrevivĂŞncia dos microrganismos requer a habilidade de sentir e responder Ă s mudanças ambientais, incluindo mudanças nas caracterĂsticas fĂsicas do meio. A microgravidade e seus análogos sĂŁo um dos fatores que podem acarretar profundos efeitos no crescimento e desenvolvimento microbiano. Recentemente, diversos estudos demonstraram o papel chave da microgravidade na regulação da expressĂŁo gĂŞnica, na fisiologia e na patogenicidade dos microrganismos estudados. Diante da importância desses estudos e, ao mesmo tempo, da dificuldade de realizá-los no ambiente espacial, tornou-se necessário o desenvolvimento de equipamentos que pudessem ser utilizados em solo e que conseguissem simular algumas das caracterĂsticas fĂsicas que estĂŁo associadas Ă microgravidade. Assim, o presente trabalho, em parceria com professores e tĂ©cnicos do Instituto de FĂsica da UFRGS, apresenta dois objetivos: (1) a construção de um novo instrumento, capaz de simular a microgravidade, baseado nos mesmos princĂpios utilizados no “Rotating-Wall Vessel“(equipamento desenvolvido pela NASA), e que apresentasse um baixo custo para a sua produção; (2) a utilização desse equipamento para o estudo do crescimento de Escherichia coli em microgravidade simulada. O equipamento Ă©, essencialmente, uma forma de produzir uma cultura celular em suspensĂŁo constante. A partir de um prĂ©-inoculo de 108 cĂ©lulas/mL, a bactĂ©ria foi inoculada em doze frascos de vidro, de aproximadamente 30mL, completamente preenchidos com o meio de cultivo TSB (Caldo Soja TripticaseĂna). Seis frascos para o grupo controle e os outros seis, para amostra. Todos os frascos foram mantidos dentro da estufa bacteriolĂłgica, o grupo controle ficou parado (gravidade terrestre), ao passo que, os recipientes da amostra, foram colocados dentro do equipamento e mantidos em rotação com uma velocidade angular constante (microgravidade simulada). A partir da leitura da absorbância feita com um intervalo de 1 hora e 15 minutos, as curvas de crescimento para o grupo controle e o grupo amostral foram traçadas. AlĂ©m disso, a semeadura em placa contendo meio TSA (Agar Triptona de Soja) tambĂ©m foi realizada para contabilizar as Unidades Formadoras de ColĂ´nia. O mĂ©todo estatĂstico ANOVA (α= 0,05) foi aplicado para verificar a significância dos resultados encontrados. Segundo as análises estatĂsticas utilizadas, de acordo com a metodologia aplicada, nĂŁo houveram diferenças significativas nas mĂ©dias populacionais encontradas entre o grupo controle e o grupo amostral. O dispositivo construĂdo para esse trabalho, apesar de seguir os mesmo princĂpios fĂsicos do RWV, ainda carece de uma validação quanto a sua real capacidade de simular a microgravidade. Novas propostas para melhorar o equipamento estĂŁo sendo estudadas e, com o apoio do Instituto de FĂsica, novos testes poderĂŁo ser feitos para validar o aparato
Whole-genome sequencing-based characterization of Streptomyces sp. 6(4) : focus on natural product
We have sequenced the whole genome of Streptomyces sp. 6(4) isolated from tomato roots that presents antifungal activity against phytopathogenic fungi, mainly Bipolaris sorokiniana. The genome has almost 7Mb and 3368 hypothetical proteins that were analysed and characterized in Uniprot with the emphasis on biological compounds. Multilocus sequence typing (MLST) analyses were performed in an effort to characterize and identify this isolate, resulting in a new sequence type (ST), classified as ST64. Phenetic and phylogenetic trees were constructed to investigate Streptomyces sp. 6(4) evolution and sequence similarity, and the isolate is a strain closer to Streptomyces prasinus and Streptomyces viridosporus. It is known that the genus Streptomyces possess huge metabolic capacity with the presence of cryptic genes. These genes are usually present in clusters, which are responsible for the production of diverse natural products, mainly antibiotics. In addition, 6(4) showed 11 biosynthetic gene clusters through antiSMASH, including 3 polyketide synthase (PKS) and non-ribosomal peptide synthase (NRPS) type clusters