Desenvolvimento de um equipamento para estudo do crescimento de Escherichia coli sob condição de microgravidade simulada

A existência e sobrevivência dos microrganismos requer a habilidade de sentir e responder às mudanças ambientais, incluindo mudanças nas características físicas do meio. A microgravidade e seus análogos são um dos fatores que podem acarretar profundos efeitos no crescimento e desenvolvimento microbiano. Recentemente, diversos estudos demonstraram o papel chave da microgravidade na regulação da expressão gênica, na fisiologia e na patogenicidade dos microrganismos estudados. Diante da importância desses estudos e, ao mesmo tempo, da dificuldade de realizá-los no ambiente espacial, tornou-se necessário o desenvolvimento de equipamentos que pudessem ser utilizados em solo e que conseguissem simular algumas das características físicas que estão associadas à microgravidade. Assim, o presente trabalho, em parceria com professores e técnicos do Instituto de Física da UFRGS, apresenta dois objetivos: (1) a construção de um novo instrumento, capaz de simular a microgravidade, baseado nos mesmos princípios utilizados no “Rotating-Wall Vessel“(equipamento desenvolvido pela NASA), e que apresentasse um baixo custo para a sua produção; (2) a utilização desse equipamento para o estudo do crescimento de Escherichia coli em microgravidade simulada. O equipamento é, essencialmente, uma forma de produzir uma cultura celular em suspensão constante. A partir de um pré-inoculo de 108 células/mL, a bactéria foi inoculada em doze frascos de vidro, de aproximadamente 30mL, completamente preenchidos com o meio de cultivo TSB (Caldo Soja Tripticaseína). Seis frascos para o grupo controle e os outros seis, para amostra. Todos os frascos foram mantidos dentro da estufa bacteriológica, o grupo controle ficou parado (gravidade terrestre), ao passo que, os recipientes da amostra, foram colocados dentro do equipamento e mantidos em rotação com uma velocidade angular constante (microgravidade simulada). A partir da leitura da absorbância feita com um intervalo de 1 hora e 15 minutos, as curvas de crescimento para o grupo controle e o grupo amostral foram traçadas. Além disso, a semeadura em placa contendo meio TSA (Agar Triptona de Soja) também foi realizada para contabilizar as Unidades Formadoras de Colônia. O método estatístico ANOVA (α= 0,05) foi aplicado para verificar a significância dos resultados encontrados. Segundo as análises estatísticas utilizadas, de acordo com a metodologia aplicada, não houveram diferenças significativas nas médias populacionais encontradas entre o grupo controle e o grupo amostral. O dispositivo construído para esse trabalho, apesar de seguir os mesmo princípios físicos do RWV, ainda carece de uma validação quanto a sua real capacidade de simular a microgravidade. Novas propostas para melhorar o equipamento estão sendo estudadas e, com o apoio do Instituto de Física, novos testes poderão ser feitos para validar o aparato

Whole-genome sequencing-based characterization of Streptomyces sp. 6(4) : focus on natural product

We have sequenced the whole genome of Streptomyces sp. 6(4) isolated from tomato roots that presents antifungal activity against phytopathogenic fungi, mainly Bipolaris sorokiniana. The genome has almost 7Mb and 3368 hypothetical proteins that were analysed and characterized in Uniprot with the emphasis on biological compounds. Multilocus sequence typing (MLST) analyses were performed in an effort to characterize and identify this isolate, resulting in a new sequence type (ST), classified as ST64. Phenetic and phylogenetic trees were constructed to investigate Streptomyces sp. 6(4) evolution and sequence similarity, and the isolate is a strain closer to Streptomyces prasinus and Streptomyces viridosporus. It is known that the genus Streptomyces possess huge metabolic capacity with the presence of cryptic genes. These genes are usually present in clusters, which are responsible for the production of diverse natural products, mainly antibiotics. In addition, 6(4) showed 11 biosynthetic gene clusters through antiSMASH, including 3 polyketide synthase (PKS) and non-ribosomal peptide synthase (NRPS) type clusters