CLEMSite, a software for automated phenotypic screens using light microscopy and FIB-SEM

This work was supported by EMBL funds and by by the Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG, German Research Foundation) – Project number 240245660 – SFB 1129 (project Z2).In recent years, Focused Ion Beam Scanning Electron Microscopy (FIB-SEM) has emerged as a flexible method that enables semi-automated volume ultrastructural imaging. We present a toolset for adherent cells that enables tracking and finding cells, previously identified in light microscopy (LM), in the FIB-SEM, along with the automatic acquisition of high-resolution volume datasets. We detect the underlying grid pattern in both modalities (LM and EM), to identify common reference points. A combination of computer vision techniques enables complete automation of the workflow. This includes setting the coincidence point of both ion and electron beams, automated evaluation of the image quality and constantly tracking the sample position with the microscope’s field of view reducing or even eliminating operator supervision. We show the ability to target the regions of interest in EM within 5 µm accuracy while iterating between different targets and implementing unattended data acquisition. Our results demonstrate that executing volume acquisition in multiple locations autonomously is possible in EM.Publisher PDFPeer reviewe

Die Kultur- und Kreativwirtschaft in Bremen: Standortfaktoren, Wissensquellen und Kooperationen in der Bremer Software- und Werbewirtschaft

Auf der Kultur- und Kreativwirtschaft ruhen vielen Hoffnungen als Impulsgeber für eine positive Regionalentwicklung. Die Unternehmen der Kultur- und Kreativwirtschaft zeichnen sich einerseits durch teilweise bedeutende Beschäftigungszuwächse aus und sind deshalb aus wirtschaftspolitischer Perspektive besonders interessant. Andererseits benötigen sie besondere Standortfaktoren, die urban amenities, um sich erfolgreich entwickeln zu können. Der vorliegende Bericht zeigt die Bedeutung verschiedener Standortfaktoren für zwei besonders arbeitsmarktrelevante Branchen der Kultur- und Kreativwirtschaft auf. Im Fokus stehen hier die Software- und Werbewirtschaft. Es wird ein Überblick über die räumliche Verteilung beider Branchen in der Stadt Bremen gegeben. Weiterhin präsentiert die Studie die Bedeutung ausgewählter Standortfaktoren und deren Bewertung aus Sicht der Unternehmen und verdeutlicht branchenspezifische Unterschiede. Zusätzlich werden bedeutende Wissensquellen und Kooperationsbereiche der Bremer Software- und Werbewirtschaft identifiziert

Combination of Thermal and Mechanical Strategies to Compensate for Distortion Effects during Profile Grinding

This paper describes the investigations and the results of an analysis of distortion compensation processes for profile grinding. Steel workpieces often change their residual stress state due to machining in a seemingly uncontrolled matter. Furthermore, in research as well as in the industry, the accurate representation of shape deviations during the cutting of slim profiled workpieces and their deformation handling is a major challenge. In this paper, a valid predictive model, developed for the compensation of distortions resulting from the effect of a laser-based treatment and a deep rolling, was calibrated by experimental data. The numerical design of these strategies provided a model for predicting compensation parameters to minimize profile grinding distortions

Economics of Radiation Protection: Equity Considerations

Radiation protection, equity, economics of uncertainty, optimisation,