Dual inhibition of HIV-1 replication by integrase-LEDGF allosteric inhibitors is predominant at the post-integration stage

BACKGROUND: LEDGF/p75 (LEDGF) is the main cellular cofactor of HIV-1 integrase (IN). It acts as a tethering factor for IN, and targets the integration of HIV in actively transcribed gene regions of chromatin. A recently developed class of IN allosteric inhibitors can inhibit the LEDGF-IN interaction. RESULTS: We describe a new series of IN-LEDGF allosteric inhibitors, the most active of which is Mut101. We determined the crystal structure of Mut101 in complex with IN and showed that the compound binds to the LEDGF-binding pocket, promoting conformational changes of IN which explain at the atomic level the allosteric effect of the IN/LEDGF interaction inhibitor on IN functions. In vitro, Mut101 inhibited both IN-LEDGF interaction and IN strand transfer activity while enhancing IN-IN interaction. Time of addition experiments indicated that Mut101 behaved as an integration inhibitor. Mut101 was fully active on HIV-1 mutants resistant to INSTIs and other classes of anti-HIV drugs, indicative that this compound has a new mode of action. However, we found that Mut101 also displayed a more potent antiretroviral activity at a post-integration step. Infectivity of viral particles produced in presence of Mut101 was severely decreased. This latter effect also required the binding of the compound to the LEDGF-binding pocket. CONCLUSION: Mut101 has dual anti-HIV-1 activity, at integration and post-integration steps of the viral replication cycle, by binding to a unique target on IN (the LEDGF-binding pocket). The post-integration block of HIV-1 replication in virus-producer cells is the mechanism by which Mut101 is most active as an antiretroviral. To explain this difference between Mut101 antiretroviral activity at integration and post-integration stages, we propose the following model: LEDGF is a nuclear, chromatin-bound protein that is absent in the cytoplasm. Therefore, LEDGF can outcompete compound binding to IN in the nucleus of target cells lowering its antiretroviral activity at integration, but not in the cytoplasm where post-integration production of infectious viral particles takes place

Comportement des PCB en milieu continental. Etude sur le bassin versant de la Seine

SIGLEINIST T 70820 / INIST-CNRS - Institut de l'Information Scientifique et TechniqueFRFranc

Endocrinair : contamination de l'air ambiant: Contamination de l’air ambiant par les perturbateurs endocriniens en Ile de France et caractérisation d’effets toxiques associés

National audienceEn Ile de France, la contamination permanente de l’air ambiant soulève de nouvelles interrogations quant à l’exposition de l’Homme à des perturbateurs endocriniens par cette voie et à la possibilité d’effets sur sa santé, même si ceux-ci sont à faible concentration (micropolluants). Ce qui constitue l’aspect innovant de ce programme, c’est la recherche de molécules semi-volatiles à l’état gazeux ou liées à des particules à l’extérieur et à l’intérieur de locaux (appartement, bureau, crèche)

Sources, transfert et devenir des phtalates sur le bassin versant de la Seine (caractérisation des dangers pour l'environnement et les écosystèmes)

Les phtalates sont des composés organiques générés par l industrie chimique, qui entrent dans la composition des matières plastiques. Leur production mondiale, estimée à 4.3 millions de tonnes, est dominée par le di-éthylhexyl phtalate (DEHP) inscrit sur la liste des substances prioritaires de la Commission Européenne (2000). Ces composés sont présents dans tous les compartiments de l environnement. Leur toxicité se traduit par effets cancérogènes, tératogènes et des perturbations endocriniennes. Leur usage e tant largement répandu, il est nécessaire de parvenir à une meilleure connaissance de leurs mécanismes de diffusion et de leur devenir dans notre environnement. Le principal objectif de cette étude a été de déterminer les différentes sources d émission de ces composés, en précisant leurs modalités de transport et les processus de contamination des écosystèmes. La première phase a consisté à quantifier les phtalates dans différents compartiments de l environnement du bassin versant de la Seine : eaux de surface, retombées atmosphériques, stations d épuration et organismes aquatiques. L importance du rôle du compartiment atmosphérique dans le transport des phtalates a ainsi été mise en évidence avec un maximum de contamination en milieu urbain. Dans les stations d épuration, l abattement maximum a été observé en sortie des bassins de décantation, confirmant l importance de la réduction de la charge solide dans l élimination des composés. L évolution des concentrations en phtalates dans la Seine à Paris et Poses, a démontré le rôle prépondérant du processus de ruissellement diffus dans les apports en contaminants à la rivière. Par contre, l évolution longitudinale des concentrations dans l eau de la Seine entre Paris et Poses, n a pas permis d identifier précisément la contribution directe des sources d apport industrielles. Dans la zone estuarienne de Poses à Honfleur, à partir du secteur de Caudebec qui est la zone la plus turbide, la concentration en DEHP a montré une évolution concomitante avec celle des matières en suspension. Dans les affluents de la zone estuarienne, les concentrations en DEHP ont été du même ordre que celles observées en Seine, excepté pour deux d entre eux plus contaminés, en relation avec des densités de population et d implantations d industrielles supérieures. L étude d un affluent secondaire de la Seine, l Iton, a montré l importance et la continuité des apports domestiques, avec des concentrations élevées dans la partie amont du bassin. Enfin, le niveau de contamination par les phtalates d organismes marins (mollusques et poissons) a été supérieur ( 6 : 3980 g.g-1 PS) à celui d organismes dulcicoles: ( 6 : 583 g.g-1 PS). La seconde phase à consisté en une estimation de l exposition humaine par la voie digestive (eau de boisson et aliments) et respiratoire (air intérieur et extérieur). Concernant la voie digestive, les eaux n ont pas montré de contamination significative et leur apport en phtalates est négligeable par rapport aux doses journalières tolérables européennes. L analyse des aliments a nécessité une phase préliminaire de mise au point qui a indiqué des concentrations plus importantes dans les aliments gras, en accord avec la littérature. Concernant la voie respiratoire, l air intérieur de locaux de travail (bureaux, laboratoire) a montré une contamination par les phtalates plus importante que l air extérieur, du fait la présence de matériaux pouvant être une source d émission.PARIS-BIUSJ-Sci.Terre recherche (751052114) / SudocSudocFranceF

Sources et devenir des antibiotiques dans le bassin versant de la seine (première approche pour une évaluation des risques environnementaux)

La présence de résidus d antibiotiques dans les eaux de surface fait l objet d un intérêt croissant du fait de la possibilité d un impact néfaste sur la qualité et le fonctionnement des écosystèmes aquatiques. Par ailleurs, cette présence pourrait contribuer à l apparition de souches bactériennes antibio-résistantes et de ce fait représenter un risque pour la santé publique. Cette préoccupation est particulièrement d actualité dans le bassin de la Seine, qui supporte une forte pression anthropique, et qui utilise en Ile-de-France plus de 50 % d eau de surface pour l alimentation en eau potable. Après une première étape d élaboration d une procédure analytique permettant l étude de ces contaminants dans différentes matrices environnementales, la contamination de la Seine et de certains de ces affluents a été étudiée. Une présence ubiquiste de certaines molécules, des variations au cours du cycle hydrologique, et une prépondérance des rejets urbains en tant que source de contamination aux eaux de surface ont été mis en évidence. Néanmoins, un impact local non négligeable de la médecine vétérinaire, notamment par les antibiothérapies en pisciculture, a également pu être constaté. L étude du devenir de ces molécules au cours des traitements d épuration met en valeur des comportements différents en fonction des propriétés intrinsèques des molécules, des filières de traitements et des conditions de saturation du réseau d eau usées. Par ailleurs, les processus d élimination mis en évidence sur les molécules étudiées correspondent majoritairement à des mécanismes d adsorption, aboutissant à une contamination des boues urbaines, plutôt qu à une réelle dégradation des substances. Les composés les plus résistants aux traitements sont retrouvés dans les cours d eau récepteurs à des niveaux de concentrations de l ordre de la centaine de nanogrammes par litres. Les données d exposition obtenues dans cette étude s avèrent généralement bien plus faibles que les valeurs d écotoxicité publiées dans la littérature, mais celles-ci peuvent être atteintes localement, notamment au niveau des eaux usées hospitalières et urbaines, ainsi qu à proximité des élevages aquacoles, notamment dans les sédiments.PARIS-BIUSJ-Thèses (751052125) / SudocPARIS-BIUSJ-Sci.Terre recherche (751052114) / SudocSudocFranceF

Contribution du compartiment atmosphérique au transfert des HAP dans le bassin versant aval de la Seine (bilan à l'échelle de deux bassins versants expérimentaux)

PARIS-BIUSJ-Thèses (751052125) / SudocPARIS-BIUSJ-Sci.Terre recherche (751052114) / SudocSudocFranceF

Transferts des pesticides vers les eaux superficielles et l'atmosphère (caractérisation et modélisation sur le bassin versant de la Vesle)

L utilisation générale des pesticides sur les bassins versants agricoles est à l origine d une détérioration des eaux souterraines et superficielles. Ce travail de recherche avait pour objectifs de caractériser les différentes voies de transfert superficiel des pesticides vers les eaux de surface et le compartiment atmosphérique, et de déterminer leur importance respective à travers une démarche de modélisation sur le bassin de la Vesle. Des études de terrain ont été réalisées sur la contamination du compartiment atmosphérique (air ambiant et dépôts humides) et sur le transfert des pesticides par ruissellement et par infiltration à l aide de dispositifs expérimentaux. Parallèlement le modèle de transfert de pesticides, Phytodel, a été conçu puis développé sur le bassin de la Vesle. A terme, il pourra être utilisé pour identifier les pesticides à rechercher prioritairement lors de campagnes de mesures et comme outil d évaluation de la dispersion des pesticides dans l environnement.The global use of pesticides in agricultural basins has induced a deterioration of groundwater and surface water quality. This research work has focused upon the characterization of different surface transfer pathways of pesticides towards surface water and atmospheric compartments and of their relative importance through a modelling study on the Vesle basin. Firstly, field surveys were carried out to investigate contamination of the atmospheric compartment (ambient air and wet deposits) and transfer of pesticides by runoff and leaching using laboratory and field installations (plots and lysimeters). Secondly, the model of pesticide transfer, Phytodel, was designed and developed for the Vesle catchment. At longer term, this model could be used to identify pesticides in preference and priority to be investigated during sampling campaigns. It might also be used as a tool for evaluation of pesticide dispersion in various environmental compartments.PARIS-BIUSJ-Thèses (751052125) / SudocPARIS-BIUSJ-Sci.Terre recherche (751052114) / SudocSudocFranceF

Séparation aveugle d'un mélange convolutif de sources non linéaires par une approche hiérarchique

National audienc