Etude sur les risques de contamination microbiologique des oursins

L’objet principal de cette étude est d’évaluer et suivre les niveaux de contamination des oursins dans un secteur identifié comme exposé aux sources de contamination microbiologique, afin de vérifier l’hypothèse selon laquelle les oursins, organismes brouteurs et non filtreurs, sont peu ou pas sensibles à la contamination microbiologique par rapport à des coquillages du groupe III.Les résultats des analyses montrent que pour cette zone classée A par arrêté préfectoral, les oursins, sont susceptibles d’être fortement contaminés lors de pollutions bactériologiques.La contamination peut être plus importante que dans les moules, organismes filtreurs

Faecal contamination of echinoderms: first report of heavy Escherichia coli loading of sea urchins from a natural growing area

Although little evidence existed to support that view, European countries and in particular France, have regarded echinoderms, including sea urchins, as low risk in terms of feacal contamination. It is hypothesized that the sea urchins mode of feeding, which is based on grazing and differs from bivalve molluscs, would prevent it from concentrating high levels of Escherichia coli. Here, we monitored E. coli levels in sea urchins (Paracentrotus lividus) and in filter-feeder mussels (Mytillus galloprovincialis), collected concurrently from the same natural area over a 1-year period to verify this assumption. Sea urchins were collected on the seafloor, whereas mussels were collected from the water column at a depth of 4 m. Our results showed heavy bacterial loading of sea urchins in a natural growing environment. Moreover, we highlighted that E. coli contamination of sea urchins could, in certain conditions, be higher than those detected in filter-feeding mussels collected at the same location. Finally, the results showed a significant correlation between rainfall and E. coli concentrations in sea urchins, suggesting that the bacterial safety of sea urchin could be linked to the quality of the surrounding water

A multitracer approach to assess the spatial contamination pattern of hake (Merluccius merluccius) in the French Mediterranean

International audienceChemical contamination levels and stable isotope ratios provide integrated information about contaminant exposure, trophic position and also biological and environmental influences on marine organisms. By combining these approaches with otolith shape analyses, the aim of the present study was to document the spatial variability of Hg and PCB contamination of the European hake (Merluccius merluccius) in the French Mediterranean, hypothesizing that local contaminant sources, environmental conditions and biological specificities lead to site-specific contamination patterns. High Hg concentrations discriminated Corsica (average: 1.36 ± 0.80 μg g(-1) dm) from the Gulf of Lions (average values<0.5 μg g(-1) dm), where Rhône River input caused high PCB burdens. CB 153 average concentrations ranged between 4.00 ± 0.64 and 18.39 ± 12.38 ng g(-1) dm in the Gulf of Lions, whatever the sex of the individuals, whereas the highest values in Corsica were 6.75 ± 4.22 ng g(-1) dm. Otolith shape discriminated juveniles and adults, due to their different habitats. The use of combined ecotracers was revealed as a powerful tool to discriminate between fish populations at large and small spatial scale, and to enable understanding of the environmental and biological influences on contamination patterns

Mercury in organisms from the Northwestern Mediterranean slope: Importance of food sources

Mercury (Hg) is a global threat for marine ecosystems, especially within the Mediterranean Sea. The concern is higher for deep-sea organisms, as the Hg concentration in their tissues is commonly high. To assess the influence of food supply at two trophic levels, total Hg concentrations and carbon and nitrogen stable isotope ratios were determined in 7 species (4 teleosts, 2 sharks, and 1 crustacean) sampled on the upper part of the continental slope of the Gulf of Lions (Northwestern Mediterranean Sea), at depths between 284 and 816 m. Mean Hg concentrations ranged from 1.30 ± 0.61 to 7.13 ± 7.09 μg g− 1 dry mass, with maximum values observed for small-spotted catshark Scyliorhinus canicula. For all species except blue whiting Micromesistius poutassou, Hg concentrations were above the health safety limits for human consumption defined by the European Commission, with a variable proportion of the individuals exceeding limits (from 23% for the Norway lobster Nephrops norvegicus to 82% for the blackbelly rosefish Helicolenus dactylopterus). Measured concentrations increased with increasing trophic levels. Carbon isotopic ratios measured for these organisms demonstrated that settling phytoplanktonic organic matter is not only the main source fueling trophic webs but also the carrier of Hg to this habitat. Inter- and intraspecific variations of Hg concentrations revealed the importance of feeding patterns in Hg bioaccumulation. In addition, biological parameters, such as growth rate or bathymetric range explain the observed contamination trends

Substances prioritaires DCE : Etude de détermination de facteurs de bioaccumulation (BAF) sur les mollusques en milieu marin

Pour permettre d’évaluer la qualité chimique des masses d’eau en utilisant les résultats de la surveillance opérée sur les bivalves via le ROCCH ou le RINBIO, il est nécessaire de transposer les seuils existants applicables dans les eaux marines en seuils « mollusques » et ainsi d’adapter les NQE eau marine (Normes de Qualité Environnementale) en VGE mollusques (Valeur Guide Environnementale). Cette adaptation nécessite d’utiliser des facteurs de conversion eau-biote : les facteurs de bioconcentration (BCF) ou les facteurs de bioaccumulation (BAF) spécifiques de couples substance-espèce. Les BAF sont les facteurs à privilégier autant que possible car plus représentatifs de ce qui se passe dans le milieu avec notamment la prise en compte des différentes voies d’exposition des organismes aquatiques aux contaminants, i.e. la voie directe (eau) et la voie trophique (ingestion de proies contaminées). Cette démarche de détermination de VGE mollusques est engagée par Ifremer - OFB depuis 2015, et plusieurs étapes ont été réalisées : proposition de VGE mollusques (1) sur la base de données existantes, élaboration d’une méthodologie de détermination de BAF pour les mollusques en milieu marin afin d’acquérir des données BAF terrain. Cette étude de détermination des BAF sur les mollusques en milieu marin a été conduite entre 2016 et 2019, elle concerne 27 substances prioritaires : 3 composés métalliques et 24 substances organiques. Sept sites ont été échantillonnés en parallèle sur les matrices eau marine et mollusques. Suivant les points, les mollusques échantillonnés étaient des moules sauvages (ou d’élevage) et / ou des moules encagés, et deux sites disposaient en plus d’huîtres encagées. Les concentrations dans l’eau marine ont été mesurées sur eau brute et / ou eau filtrée. En dépit des nombreuses difficultés logistiques rencontrées, cette étude souligne d’un point de vue technique, l’intérêt de la SBSE (Stir Bar Sorptive Extraction), pour la recherche de certaines substances organiques dans l’eau marine, la pertinence de rechercher ces substances sur eau brute mais également sur eau filtrée. Cette étude permet de disposer de résultats acquis en parallèle à la fois sur moules encagées, sur moules sauvages ou d’élevage et de mesurer des BAF pour 10 substances : Cd, Ni, Pb, anthracène, PBDE, DDT total, HCH, naphtalène, octylphénol, TBT, permettant d’affiner les VGE mollusques

Can shellfish be used to monitor SARS-CoV-2 in the coastal environment?

The emergence and worldwide spread of SARS-CoV-2 raises new concerns and challenges regarding possible environmental contamination by this virus through spillover of human sewage, where it has been detected. The coastal environment, under increasing anthropogenic pressure, is subjected to contamination by a large number of human viruses from sewage, most of them being non-enveloped viruses like norovirus. When reaching coastal waters, they can be bio-accumulated by filter-feeding shellfish species such as oysters. Methods to detect this viral contamination were set up for the detection of non-enveloped enteric viruses, and may need optimization to accommodate enveloped viruses like coronaviruses (CoV). Here, we aimed at assessing methods for the detection of CoV, including SARS-CoV-2, in the coastal environment and testing the possibility that SARS-CoV-2 can contaminate oysters, to monitor the contamination of French shores by SARS-CoV-2 using both seawater and shellfish. Using the porcine epidemic diarrhea virus (PEDV), a CoV, as surrogate for SARS-CoV-2, and Tulane virus, as surrogate for non-enveloped viruses such as norovirus, we assessed and selected methods to detect CoV in seawater and shellfish. Seawater-based methods showed variable and low yields for PEDV. In shellfish, the current norm for norovirus detection was applicable to CoV detection. Both PEDV and heat-inactivated SARS-CoV-2 could contaminate oysters in laboratory settings, with a lower efficiency than a calicivirus used as control. Finally, we applied our methods to seawater and shellfish samples collected from April to August 2020 in France, where we could detect the presence of human norovirus, a marker of human fecal contamination, but not SARS-CoV-2. Together, our results validate methods for the detection of CoV in the coastal environment, including the use of shellfish as sentinels of the microbial quality of their environment, and suggest that SARS-CoV-2 did not contaminate the French shores during the summer season

Campagne SUCHIMED 2021. Surveillance de la contamination chimique en Méditerranée

SUCHIMED 2021 est la 10ème campagne de surveillance de la contamination chimique et de son évolution en Méditerranée. Elle a été bâtie comme une plateforme, support de différentes activités de surveillance et de recherche avec comme pilier principal le réseau RINBIO, qui consiste à réaliser une biosurveillance active par caging de moules. Sur le plan de la contamination chimique, les principaux résultats de cette campagne indiquent : ·         En Occitanie, o   la présence chronique de DDT depuis 20 ans ; o   la détection de marqueurs terrigènes (Mn, As) entre les embouchures de l’Aude et de l’Hérault à laquelle s’ajoute une contamination en HAP et TCE (Pt) des sédiments aux abords de Port-La-Nouvelle. ·         En PACA, o   un marquage en PCB entre le Rhône et Marseille (dans toutes les matrices) issus de sources multiples et sans évolution significative sur les 20 dernières années ; o   une contamination en HAP des sédiments de la zone industrialo-portuaire de Fos ; o   la présence de TBT à la station Carry-le-Rouet à une valeur supérieure à la concentration écologiquement acceptable (EAC) qui devra être confirmée lors de la prochaine campagne ; o   la détection aux abords de l’agglomération marseillaise d’éléments métalliques et de HAP dans les sédiments, et en partie dans le plancton, auxquels s’ajoutent les TCE au niveau du rejet de la STEP de Cortiou ; o   un marquage chronique en rade de Toulon de la colonne d’eau et des sédiments en PCB, HAP, métaux (Hg, Pb, Cu, TCE), PBDE et/ou composés organostanniques (TBT), sans tendance temporelle significative sur deux décennies pour les cinq premiers composés ; o   la détection aux abords du fleuve Var de Cr, Mn et Ni dans la colonne d’eau et de HAP dans les sédiments, une différence de contamination entre les matrices qui interroge sur l’origine de la matière organique ; o   un marquage en métaux (dont le Pb) et HAP en rade de Villefranche dans la colonne d’eau et le sédiment. ·         En Corse, o   une forte influence du fond géochimique de l’île (i.e. fortes teneur en Cr et Ni) sur les concentrations obtenues ; o   un marquage chronique de la colonne d’eau en Cu dans les ports de Porto-Vecchio et Bonifacio, qui apparait stable dans le temps, auquel s’ajoute pour ce dernier site la détection dans le sédiment de HAP, métaux (Hg, Pb, Zn) et dans une moindre mesure de PCB ; o   un marquage du sédiment du littoral bastiais en HAP et en TCE ; o   la détection de Pb et de TCE à l’embouchure du Golo ; la contamination du site de Canari en métaux (Cr et Ni dans la colonne d’eau, Cu dans le sédiment), et surtout une écotoxicité avérée qui semble être liée à ces éléments. La campagne 2021 a été l’occasion de mettre en évidence la faisabilité de la recherche d’effets sur les moules encagées à l’aide de biomarqueurs. Les marqueurs lysosomaux, moins sensibles aux différences de conditions trophiques, se sont avérés les plus à même de refléter l’état de stress général des organismes en lien avec leur contamination. L’étude des transferts trophiques semble confirmer la diminution de la plupart des éléments métalliques (Cr, Cu, Fe, Mn, Ni, le Pb) et des HAP, la bioamplification du Hg et des PCB, et enfin la bioaccumulation spécifique de certains éléments par certains organismes (e.g. As ou Zn par les moules, HAP par le plancton). Enfin, la campagne a mis en évidence la présence de micro et mésoplastiques sur la quasi-totalité des sites échantillonnés. Les valeurs de microplastiques mesurées sont concordantes avec la gamme des concentrations relevées en Méditerranée occidentale, avec une tendance à la réduction qui semble se dessiner au regard des données disponibles sur 10 ans