Vitioeno, un centre de ressources numériques pour la production de données scientifiques FAIR

Résumé INRAE et l’IFV ont mis en place un centre de ressources numériques ouvertes et librement accessibles, avec l’objectif d’aider et de faciliter la structuration et la qualification des données selon les principes FAIR. Ce centre de ressource pour l’aide à la gestion des données « Vitioeno » est disponible en ligne, en français et en anglais, à l’adresse https://vitioeno.mistea.inrae.fr/resource/app/. Il recense et donne un accès ouvert à différents types de ressources numériques existantes, en particulier des référentiels (matériel végétal et variables expérimentales), des documents téléchargeables de type protocoles, et des applications ou liens utiles

Résumé

Résum

A standard for sharing data from vineyard experiments

To facilitate the sharing and interoperability of data collected by many different experimenters and structures, a standardized description of the data acquisition context has been set in the form of a data schema. This data schema defines the entities and the attributes to describe them. This data schema is available online, under an open license CC0 1.0 Universal, with a user’s guide

PHIS, a plant science ontology-driven Phenotyping Hybrid Information System

International audiencePlant phenomics datasets are unprecedented resources for identifying and testing novel mechanisms and models. These datasets need to be reusable to the scientific community. Their analysis requires the understanding of relevant information on thousands of plants, sensors and events. The open-source Phenotyping Hybrid Information System (PHIS) is proposed for the smart management of plant phenotyping experimental data. It allows the unambiguous identification and management of all agronomical objects and traits in an experiment and establishes their relations thanks to semantics resources such as reference ontologies. PHIS deals with various experimental context, e.g. field and greenhouse conditions