Comparative genomic analysis of innate immunity reveals novel and conserved components in crustacean food crop species

Abstract Background Growing global demands for crustacean food crop species have driven large investments in aquaculture research worldwide. However, large-scale production is susceptible to pathogen-mediated destruction particularly in developing economies. Thus, a thorough understanding of the immune system components of food crop species is imperative for research to combat pathogens. Results Through a comparative genomics approach utilising extant data from 55 species, we describe the innate immune system of the class Malacostraca, which includes all food crop species. We identify 7407 malacostracan genes from 39 gene families implicated in different aspects of host defence and demonstrate dynamic evolution of innate immunity components within this group. Malacostracans have achieved flexibility in recognising infectious agents through divergent evolution and expansion of pathogen recognition receptors genes. Antiviral RNAi, Toll and JAK-STAT signal transduction pathways have remained conserved within Malacostraca, although the Imd pathway appears to lack several key components. Immune effectors such as the antimicrobial peptides (AMPs) have unique evolutionary profiles, with many malacostracan AMPs not found in other arthropods. Lastly, we describe four putative novel immune gene families, potentially representing important evolutionary novelties of the malacostracan immune system. Conclusion Our analyses across the broader Malacostraca have allowed us to not only draw analogies with other arthropods but also to identify evolutionary novelties in immune modulation components and form strong hypotheses as to when key pathways have evolved or diverged. This will serve as a key resource for future immunology research in crustacean food crops

Protocolo para Observação do Desenvolvimento Cognitivo e de Linguagem Expressiva (PODCLE) Protocol for Expressive Language and Cognition Development Observation (PELCDO)

OBJETIVO: O objetivo do presente estudo foi a proposição de protocolo para observação do desenvolvimento cognitivo e de linguagem expressiva, referente ao período sensório-motor e início do pré-operatório, que pudesse ser utilizado como instrumento de análise objetiva das realizações observadas em crianças, possibilitando assim, a localização e acompanhamento das mesmas nesse processo de construção. MÉTODOS: O Protocolo para Observação do Desenvolvimento Cognitivo e de Linguagem Expressiva (PODCLE) foi elaborado com base na literatura a respeito dos indicadores que caracterizam os estágios iniciais do desenvolvimento cognitivo e de linguagem expressiva, considerando-se o modelo proposto pela Epistemologia Genética. O Protocolo foi aplicado em crianças com desenvolvimento típico para verificação de sua viabilidade e levantamento de possíveis dúvidas ou dificuldades durante sua aplicação ou análise dos dados. Juízes foram utilizados para a seleção dos componentes deste Protocolo. RESULTADOS: O Protocolo é constituído por quatro quadros contendo os indicadores do desenvolvimento cognitivo e de linguagem expressiva em seus estágios iniciais, bem como a pontuação correspondente às realizações apresentadas pela criança. CONCLUSÃO: O Protocolo para Observação do Desenvolvimento Cognitivo e de Linguagem Expressiva apresentado neste estudo é uma proposta de sistematização da observação de dados longitudinais referentes ao desenvolvimento cognitivo e de linguagem expressiva, durante o período sensório-motor e início do pré-operatório. Tal Protocolo permite, não apenas a localização, como também o acompanhamento da criança em seu processo de construção do conhecimento e da linguagem expressiva nos estágios iniciais do desenvolvimento.<br>PURPOSE: The aim of the present study was to propose a protocol for the observation of expressive language and cognition development during sensorimotor and the beginning of pre-operatory periods that could be used as a tool for the objective analysis of children's productions, allowing the localization and follow-up of these children during this construction process. METHODS: The Protocol for Expressive Language and Cognition Development Observation (PELCDO) was based on literature concerning the indicators of early expressive language and cognition development. The PELCDO was applied in typically developing children, with the aim to verify its viability and to identify possible doubts or difficulties during its management or data analysis. Judges were used for the selection of the indicators of cognitive and expressive language development. RESULTS: The Protocol has four tables that comprise the indicators of early expressive language and cognition development, as well as its related score, according to the child's performance. CONCLUSION: The Protocol presented in this study is an attempt to systematize the observation of longitudinal data regarding language and cognition development, during the sensorimotor and beginning of pre-operatory periods. Such Protocol not only allows the child's localization, but also makes possible to follow the individual along the knowledge and language construction process on these early developmental stages

Tendências da aquisição lexical em crianças em desenvolvimento normal e crianças com Alterações Específicas no Desenvolvimento da Linguagem Trends on lexical acquisition in children within normal development and children with developmental language disorder

O objetivo do presente estudo foi descrever as semelhanças e diferenças encontradas ao longo da aquisição lexical por crianças em desenvolvimento normal e crianças com Alterações Específicas no Desenvolvimento da Linguagem (AEDL), por meio de um amplo levantamento bibliográfico em bases de dados (SciELO, Lilacs, PubMed, Web of Science, Dedalus), que abrangeu as últimas décadas de estudos na área. Os estudos selecionados, de natureza observacional ou experimental, mostraram grande variedade de achados relacionados ao desenvolvimento do vocabulário, abrangendo as tendências e variações e também outras habilidades envolvidas no processo de aquisição lexical. De maneira geral, os resultados sugerem que as alterações lexicais que constituem um dos marcos inicialmente observados em crianças com AEDL são justificadas por dificuldades observadas em habilidades e/ou características influenciadas ou diretamente relacionadas aos mecanismos envolvidos no processamento da informação, que comprometem a qualidade e a recuperação das representações fonológicas e semânticas correspondentes a um novo item lexical. Entretanto, vários estudos sugerem que situações ostensivas e de grande suporte contextual que enfoquem poucas novas palavras favorecem a aquisição lexical de crianças com AEDL.<br>The aim of the present study was to describe the similarities and differences found throughout lexical acquisition between normally developing children and children with developmental language disorder through an extensive literature review. The search was carried out in the databases SciELO, Lilacs, PubMed, Web of Science and Dedalus, and covered the last decades of studies in the area. The selected studies, of observational or experimental nature, showed great variability of findings related to vocabulary development, describing tendencies and variations, and also other abilities enrolled in the lexical acquisition process. Generally, the results suggest that the lexical difficulties that constitute one of the first alterations observed in children with developmental language disorder are justified by difficulties in abilities and/or characteristics influenced or directly related to mechanisms involved in information processing, which compromise the quality and the retrieval of phonological and semantic representations corresponding to a new lexical item. However, many studies suggest that ostensive situations and great contextual support emphasizing few novel words facilitate the lexical acquisition of children with developmental language disorder