Chromatin disruption in the promoter of Bovine Leukemia Virus during transcriptional activation

Bovine leukemia virus expression relies on its chromatin organization after integration into the host cell genome. Proviral latency, which results from transcriptional repression in vivo, represents a viral strategy to escape the host immune system and likely allows for tumor progression. Here, we discriminated two types of latency: an easily reactivable latent state of the YR2 provirus and a ‘locked’ latent state of the L267 provirus. The defective YR2 provirus was characterized by the presence of nuclease hypersensitive sites at the U3/R junction and in the R/U5 region of the 5′-long terminal repeat (5′-LTR), whereas the L267 provirus displayed a closed chromatin configuration at the U3/R junction. Reactivation of viral expression in YR2 cells by the phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA) plus ionomycin combination was accompanied by a rapid but transient chromatin remodeling in the 5′-LTR, leading to an increased PU.1 and USF-1/USF-2 recruitment in vivo sustained by PMA/ionomycin-mediated USF phosphorylation. In contrast, viral expression was not reactivated by PMA/ionomycin in L267 cells, because the 5′-LTR U3/R region remained inaccessible to nucleases and hypermethylated at CpG dinucleotides. Remarkably, we elucidated the BLV 5′-LTR chromatin organization in PBMCs isolated from BLV-infected cows, thereby depicting the virus hiding in vivo in its natural host

Rôle des modifications post-traductionnelles du complexe IkB kinase (IKK) dans la cascade de signalisation NF-kB et applications thérapeutiques dans le traitement de l'infection par le HIV-1

Les facteurs de transcription de la famille Rel/NF-κB régulent l’expression d’un grand nombre de gènes impliqués dans les réponses immunitaires et inflammatoires ainsi que dans la régulation de la prolifération et de la survie cellulaire. Le caractère transitoire de l’activation de NF-κB est donc crucial pour poterger les cellules de l’autoxicité due à une trop forte expression des gènes cibles de ce facteur de transcription. Dans le cadre de notre thèse de doctorat, nous avons étudié les mécanismes moléculaires régulant la cinétique d’activation de NF-κB, en accordant une attention toute particulière au complexe kinase IKK, qui semble être le regulateur clef de l’activation de NF-κB. Nos résultats suggèrent que p300 pourrait réguler la durée d’activation des IKKs d’une part par acétylation directe, et d’autre part, indépendamment de son activité HAT, en stabilisant les IKKs et donc en prolongeant leur demie-vie et par conséquent leur activation.Certains virus utilisent la voie de signalisation NF-κB afin de promouvoir leur propre réplication. C’est le cas du virus HIV-1 (Human Immunodeficiency Virus type 1), qui contient dans son promoteur deux sites de liaison pour NF-κB. Notre laboratoire a précédemment montré que l’utilisation du TNFα en combinaison avec la TSA, active l’expression virale de manière synergique. L’administration combinée d’un activateur du facteur NF-κB et d’un inhibiteur de désacétylases pourrait, en présence d’une thérapie anti-HIV-1 efficace, être envisagée dans le but d’éliminer les cellules réservoirs infectées de manière latente. L’utilisation thérapeutique du TNFα ou de la TSA étant inenvisageable en raison de leur toxicité, nous avons étudié l’effet d’autres substances ayant un plus grand potentiel thérapeutique et nous avons apporté une preuve de principe du potentiel thérapeutique de la coadministration de plusieurs activateurs viraux (inhibiteurs de HDACs[HDACIs]+inducteurs de la voie NF-κB) pour réduire le pool des réservoirs cellulaires infectés de manière latente.Doctorat en Sciencesinfo:eu-repo/semantics/nonPublishe

Rôle des modifications post-traductionnelles du complexe IkB kinase (IKK) dans la cascade de signalisation NF-kB et applications thérapeutiques dans le traitement de l'infection par le HIV-1

Les facteurs de transcription de la famille Rel/NF-κB régulent l’expression d’un grand nombre de gènes impliqués dans les réponses immunitaires et inflammatoires ainsi que dans la régulation de la prolifération et de la survie cellulaire. Le caractère transitoire de l’activation de NF-κB est donc crucial pour poterger les cellules de l’autoxicité due à une trop forte expression des gènes cibles de ce facteur de transcription. Dans le cadre de notre thèse de doctorat, nous avons étudié les mécanismes moléculaires régulant la cinétique d’activation de NF-κB, en accordant une attention toute particulière au complexe kinase IKK, qui semble être le regulateur clef de l’activation de NF-κB. Nos résultats suggèrent que p300 pourrait réguler la durée d’activation des IKKs d’une part par acétylation directe, et d’autre part, indépendamment de son activité HAT, en stabilisant les IKKs et donc en prolongeant leur demie-vie et par conséquent leur activation.Certains virus utilisent la voie de signalisation NF-κB afin de promouvoir leur propre réplication. C’est le cas du virus HIV-1 (Human Immunodeficiency Virus type 1), qui contient dans son promoteur deux sites de liaison pour NF-κB. Notre laboratoire a précédemment montré que l’utilisation du TNFα en combinaison avec la TSA, active l’expression virale de manière synergique. L’administration combinée d’un activateur du facteur NF-κB et d’un inhibiteur de désacétylases pourrait, en présence d’une thérapie anti-HIV-1 efficace, être envisagée dans le but d’éliminer les cellules réservoirs infectées de manière latente. L’utilisation thérapeutique du TNFα ou de la TSA étant inenvisageable en raison de leur toxicité, nous avons étudié l’effet d’autres substances ayant un plus grand potentiel thérapeutique et nous avons apporté une preuve de principe du potentiel thérapeutique de la coadministration de plusieurs activateurs viraux (inhibiteurs de HDACs[HDACIs]+inducteurs de la voie NF-κB) pour réduire le pool des réservoirs cellulaires infectés de manière latente.Doctorat en Sciencesinfo:eu-repo/semantics/nonPublishe

A pervasive role of histone acetyltransferases and deacetylases in an NF-kappaB-signaling code.

Most nuclear factor-kappaB (NF-kappaB) inducers converge to activate the IkappaB kinase (IKK) complex, leading to NF-kappaB nuclear accumulation. However, depending on the inducer and the cell line, the subset of NF-kappaB-induced genes is different, underlining a complex regulation network. Recent findings have begun to delineate that histone and non-histone protein acetylation is involved, directly and indirectly, in controlling the duration, strength and specificity of the NF-kappaB-activating signaling pathway at multiple levels. Acetylation and deacetylation events, in combination with other post-translational protein modifications, generate an 'NF-kappaB-signaling code' and regulate NF-kappaB-dependent gene transcription in an inducer- and promoter-dependent manner. Indeed, the intricate involvement of histone acetyltransferases and histone deacetylases modulates both the NF-kappaB-signaling pathway and the transcriptional transactivation of NF-kappaB-dependent genes.Journal ArticleResearch Support, Non-U.S. Gov'tReviewinfo:eu-repo/semantics/publishe

Hidradenitis Suppurativa (HS) prevalence, demographics and management pathways in Australia: A population-based cross-sectional study

<div><p>Background</p><p>Hidradenitis Suppurativa (HS) is a painful, chronic inflammatory skin disease. Global estimates of prevalence vary between 0.03% and 4% of the population.</p><p>Our main aim was to determine HS prevalence in the Australian adult population focussing on the demographics, management pathways and diagnosis rate of individuals living with HS.</p><p>Methods</p><p>In this population-based cross-sectional study, 17,050 individuals representative of the Australian adult population were asked through face-to-face household interviews to answer a previously validated HS screening questionnaire with high diagnostic power. Individuals who screened positive were asked additional questions, including previous diagnosis of HS and number/type of physicians consulted regarding their condition.</p><p>Results</p><p>11,433 Australian residents answered the HS questionnaire, 88 screening positive for HS (0.77%; 95% CI 0.62–0.95). Considering the previously reported sensitivity (0.97) and positive predictive value (0.85) of the screening questionnaire, HS prevalence was estimated to be 0.67% (95% CI 0.53%-0.84%). 6 of 88 suspected HS individuals reported a pre-existing HS diagnosis (6.8%; 95% CI 3.2%-14.1%). 25.6% of the undiagnosed individuals suspected of having HS had not seen any clinicians regarding their boils; the remaining ones had consulted General Practitioners (96.7%), and clinicians from different specialties. Comparisons of individuals who screened positive for HS versus those who screened negative demonstrated statistically significant differences in gender (p = 0.0046), age (p<0.0001), BMI (p = 0.0307), smoking status (p<0.0001), employment status (p<0.0001) and income (p = 0.0321).</p><p>Conclusions</p><p>The prevalence of HS in Australia was estimated to be 0.67% (95% CI 0.53%-0.84%). The diagnosis rate amongst the suspected HS cases was low, which appeared to be due to a combination of patients not seeking help and decentralization of care. Individuals suspected of having HS were more likely to be females, young, obese, smokers, unemployed or at home duties and having lower annual personal income in comparison with individuals not suspected of having HS.</p></div

101. Chromatin disruption in the promoter of bovine leukemia virus during transcriptional activation

info:eu-repo/semantics/publishe

Experimental HS severity questionnaire.

<p>Experimental HS severity questionnaire.</p

Profile^a of Non-participants^a versus participants.

<p>Profile<a href="http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0200683#t007fn001" target="_blank">^a</a> of Non-participants<a href="http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0200683#t007fn001" target="_blank">^a</a> versus participants.</p

Location of boils in suspected HS individuals, total and by gender.

<p>Location of boils in suspected HS individuals, total and by gender.</p

Characteristics of the 7 confirmed cases of HS through physical examination among the 12 who attended the visit at the dermatologist.

<p>Characteristics of the 7 confirmed cases of HS through physical examination among the 12 who attended the visit at the dermatologist.</p