Diploid and tetraploid African Barbus (Osteichthyes, Cyprinidae) : on the coding of differential gene expression

Trois espèces du groupe des "petits" barbeaux d'Afrique de l'Ouest ont été analysés par électrophorèse des protéines enzymatiques afin d'estimer leur différenciation génétique. La comparaison avec une espèce de "grand" barbeau de la même région a montré que les "petits" barbeaux seraient diploïdes et les "grands" tétraploïdes. Ils constituent certainement deux lignées distinctes. Des arbres phénétiques (distances de Nei) et cladistiques (réseaux de compatibilité) du genre #Barbus$ sont proposés comprenant les trois espèces diploïdes africaines, deux espèces diploïdes d'Arabie et d'Asie du sud-est, une espèce tétraploïdes de France. Ces arbres présentent deux ensembles : les diploïdes d'un côté et les tétraploïdes de l'autre. Plusieurs méthodes de traitement des données sont proposées pour résoudre les difficultés dues au traitement simultané d'espèces à niveau de ploïdie différent. (Résumé d'auteur

Impacts génétiques des repeuplements en truites communes (Salmo trutta L.) sur les populations en place : cas du bassin de l'Orb (Hérault)

Depuis la fin du siècle dernier, pour pallier la réduction des populations de truites communes (Salmo trutta) liées aux activités humaines (pression de pêche, dégradation du milieu...), des pratiques de repeuplements se sont mises en place de façon plus ou moins généralisée. En région méditerranéenne, l'effet du repeuplement peut être suivi par électrophorèse des protéines, en particulier grâce à un locus diagnostique LDH-5* ; en effet, les souches de pisciculture, couramment utilisées, possèdent des fréquences élevées de l'allèle LDH-5*100, récemment apparu (ère quaternaire), alors que les populations naturelles ont conservé l'allèle LDH-5*105 méditerranéen ancestral. L'impact génétique des pratiques de repeuplement a été évalué sur trois populations du bassin de l'Orb, une sur le cours d'eau principal et les deux autres sur ses affluents. Tout le bassin de l'Orb est repeuplé depuis au moins une vingtaine d'années, mais avec des modalités différentes dans les zones échantillonnées. Malgré les déversements répétés, les populations naturelles échantillonnées possèdent de faibles fréquences de l'allèle 100 (3 à 14 % ) . L'impact génétique des déversements cumulés sur des décennies sur les populations de truites communes du bassin de l'Orb est donc faible

Variabilité génétique de Barbus meridionalis Risso (Cyprinidae) : une espèce quasi monomorphe

Barbus meridionalis a été échantillonné dans 5 petits cours d'eau de moyenne altitude dans les Pyrénées, le Massif Central et les Alpes. Le preferendum écologique de l'espèce est précisé. L'étude électrophorétique des allozymes de 34 locus a montré une absence quasi totale de polymorphisme . Les seules exceptions ont été observées dans le Tech (Pyrénées Orientales) où 3 locus sont polymorphes, et dans un ruisseau du Massif central où un allèle nul est présent. L'hypothèse d'un effet fondateur lié aux dernières glaciations est proposée pour expliquer ces observations

Stocking impact and allozyme diversity in brown trout from Mediterranean southern France

International audienceAnalysis of trout from 13 stations on the Mediterranean slopes of the French Pyrenees by 31 presumptive enzyme loci demonstrated the major impact of restocking programmes. Although the annual introgression resulting from these introductions was small, the accumulation of genes of Atlantic origin has resulted in a change in allele frequencies. Genetic disequilibria within and between loci exist. Introgression by genes of domestic (hatchery) origin varied from 0 to 77% among stations. Natural Mediterranean populations show no detectable geographical structure. There was a direct relation between the degree of introgression and heterozygosity. However, restocking could not explain all of the observed genetic disequilibria

Variabilité génétique de Barbus meridionalis Risso (Cyprinidae) : une espèce quasi monomorphe

Barbus meridionalis a été échantillonné dans 5 petits cours d'eau de moyenne altitude dans les Pyrénées, le Massif Central et les Alpes. Le preferendum écologique de l'espèce est précisé. L'étude électrophorétique des allozymes de 34 locus a montré une absence quasi totale de polymorphisme . Les seules exceptions ont été observées dans le Tech (Pyrénées Orientales) où 3 locus sont polymorphes, et dans un ruisseau du Massif central où un allèle nul est présent. L'hypothèse d'un effet fondateur lié aux dernières glaciations est proposée pour expliquer ces observations

Relative Reproductive success of males in polyandrous crosses of Barbus meridionalis (Cyprinidae) revealed by microsatellite genotyping

Using microsatellite genotyping in Barbus meridionalis, we tried to assess the identity of fathers of progeny produced during four experimental polyandrous crosses involving the same four males and one or two females. The pooled analysis revealed that males had significantly different reproductive successes. We found no conspicuous causes explaining differential reproductive success in the behavioural data or in the physical characteristics of the males but a genetic determinism is the most parsimonious hypothesis to account for this variability. We argue that this conclusion is compatible with the hypothesis that the reproductive strategy of barbels, which involves large aggregations of males, is a result of sexual selection. This study provides guidelines for future interspecific crosses and constitutes the preliminary experiment of an investigation of the origin of a hybrid zone between Barbus barbus and Barbus meridionalis

Ubiquity of Sicyopterus lagocephalus (Teleostei: Gobioidei) and phylogeography of the genus Sicyopterus in the Indo-Pacific area inferred from mitochondrial cytochrome b gene

International audienceSicyopterus lagocephalus is a Gobiidae Sicydiinae (Teleostei) thought to inhabit Indo-Pacific island rivers from Comoros Islands in the Indian Ocean to Australs Islands (French Polynesia) in the Pacific Ocean. Its biological cycle comprises a marine planctonic larval phase of several months allowing it to migrate from island to island, but the other species of the genus, with such a larval stage, have generally a more restricted range and are often endemic. To understand the organisation of a species with such a wide distribution, mtDNA cytochrome b sequences were amplified for 55 specimens of this genus covering most of its distribution range together with six close endemic species and other gobiids used as outgroups. The main result is the confirmation of the ubiquity of S. lagocephalus that occurs over a range of 18,000 km in the Indian and Pacific Oceans. Two clades were identified within this species, one clustering most of French Polynesian haplotypes and the other clustering most of Mascarene (including Comoros) haplotypes. The overall pattern of distribution and phylogenetic relationship suggests that the lineages leading to endemic species originated earlier than S. lagocephalus. This latter seems to be a secondary migrant species, having colonised both Indian and Pacific Oceans with a few exceptions, situated at the border of the range (Madagascar, Marquesas, Rapa). According to the results, the phylogeny of the Sicyopterus group, the age of the different lineages and the past history of the colonisation of the Indo-Pacific islands are discussed

The genetic diversity of native, stocked and hybrid populations of marble trout in the Soca river, Slovenia

International audienceThe marble trout (Salmo marmoratus) is an endangered species in Slovenia (and in Italy, Croatia and Albania) because of hybridization resulting from intensive stocking. Eleven populations of trout from the Soca river basin (Slovenia) were analysed using 31 presumptive enzyme loci. Three European control samples representing the main European genotypes of brown trout were also analysed. This analysis confirmed the existence of extensive hybridization in the main river, resulting in an equal mixture of alleles belonging to marble trout, and Danubian and Atlantic brown trout (Salmo trutta). Despite the high level of introgression observed in the main Soca River, nearly pure populations of marble trout were found in the headwaters of five tributaries. The five stations with pure marble trout will be the basis of a rehabilitation programme. Hardy–Weinberg and linkage disequilibria were observed and hypotheses are discussed to explain this. A scenario for the colonization of the Adriatic region is proposed

Genetic homogeneity in eight freshwater populations of Sicyopterus lagocephalus, an amphidromous gobiid of La Réunion Island

International audienceIn the subfamily Sicydiinae of the family Gobiidae, the species Sicyopterus lagocephalus is one of the common amphidromous fish inhabiting island freshwaters in a large intertropical area, widespread from the Comoros archipelago to the Austral Islands. Eight of the main perennial rivers of La Réunion Island (Mascarene Islands) were sampled in 2000, in order to describe their population genetic structure. A total of 267 adult specimens of S. lagocephalus were screened for 14 enzymatic systems providing 15 presumptive loci, 11 of them being polymorphic. Four other loci were useful as diagnostic markers between S. lagocephalus and Cotylopus acutipinnis, a similar, closely related sympatric species. Both species constitute an economic resource locally called “bichique”. The focus of this study, S. lagocephalus, accounts for the majority of the bichique. The results clearly showed a genetic homogeneity among the eight samples (Fst tests). Within-samples tests (Fis) indicated, in general, a heterozygote deficiency. The multidimensional diagrams (CA) describe an overall structure composed of two main subgroups. This structure was not confirmed in a 2001 sampling. The interpretation of the results takes into account the biological life cycle of this species, characterized by a planktonic phase, from hatching to recruitment, followed by a freshwater life of the adults. All the samples in the survey belong to a single pool. However, the young fish entering the rivers are probably of complex origin. We did not find any isolation between rivers and this result should be considered when conservation measures are taken to prevent overfishing